MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 4989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	GCGG	2	8	42	49	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008278	CCCA	2	8	367	374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008278	CCGC	2	8	386	393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008278	CGGC	2	8	2413	2420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008278	CCAC	2	8	2607	2614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008278	GAGC	2	8	2767	2774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008278	CCGC	2	8	2826	2833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_008278	CGGC	2	8	5960	5967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008278	CGGC	2	8	5985	5992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008278	TGGC	2	8	8406	8413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008278	CGGC	2	8	11972	11979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008278	CGCC	2	8	12077	12084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_008278	GCCC	2	8	12157	12164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008278	GTCC	2	8	12211	12218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008278	ACGG	2	8	12903	12910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008278	GTGC	2	8	14199	14206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008278	CGGG	2	8	14360	14367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008278	CCCG	2	8	17025	17032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_008278	GCCG	2	8	17160	17167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008278	CGGA	2	8	17204	17211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008278	CCCG	2	8	18030	18037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_008278	CGGG	3	12	18851	18862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008278	CGGC	2	8	18945	18952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008278	CCGG	2	8	19005	19012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008278	TCCG	2	8	23131	23138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008278	CGGC	2	8	23241	23248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008278	CCGG	2	8	23260	23267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008278	GCGT	2	8	23274	23281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008278	GACC	2	8	23382	23389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008278	CCGG	2	8	24673	24680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008278	CGTG	2	8	24722	24729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008278	CCGT	2	8	24811	24818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008278	TCCA	2	8	24825	24832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008278	CGGG	2	8	24973	24980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008278	GGCC	2	8	25327	25334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008278	ACCA	2	8	25603	25610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008278	GCCC	2	8	25645	25652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
38	NC_008278	CACG	2	8	26679	26686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008278	CGGC	2	8	26731	26738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008278	GCCG	2	8	26739	26746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008278	TCCC	2	8	26809	26816	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_008278	CCCT	2	8	26937	26944	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_008278	CCGG	2	8	28834	28841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008278	GTTC	2	8	29012	29019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008278	CGCC	2	8	30352	30359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_008278	CGGT	2	8	30489	30496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008278	GCCT	2	8	30517	30524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008278	TGAG	2	8	30952	30959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008278	GGCG	2	8	31675	31682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008278	CGGC	2	8	31813	31820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008278	GGTC	2	8	31821	31828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008278	GCCG	2	8	36496	36503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008278	CCCG	2	8	36504	36511	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_008278	CCGC	2	8	38756	38763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008278	TTAC	2	8	42012	42019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008278	TGAT	2	8	45199	45206	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008278	GGCT	2	8	46860	46867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008278	GGCG	2	8	46868	46875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008278	GGCA	2	8	46885	46892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008278	TTCC	2	8	49452	49459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008278	CGGG	2	8	49486	49493	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008278	CCGG	2	8	49495	49502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008278	CGGC	2	8	49517	49524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008278	CCGA	2	8	55194	55201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008278	CGCT	2	8	60809	60816	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008278	CGGC	2	8	64087	64094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008278	GGCC	2	8	71073	71080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008278	GCGG	2	8	73163	73170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008278	GTGC	2	8	74277	74284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008278	CGCC	2	8	74307	74314	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_008278	CGAT	2	8	78129	78136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008278	CGAT	2	8	78144	78151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008278	GCCT	2	8	81827	81834	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008278	CCCA	2	8	87454	87461	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
75	NC_008278	CTTA	2	8	87601	87608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008278	ACCG	2	8	88499	88506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008278	CAGC	2	8	89823	89830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008278	AGGG	2	8	89886	89893	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008278	TCGA	2	8	89910	89917	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008278	GTCG	2	8	90003	90010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008278	CCCG	2	8	97500	97507	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008278	GCCC	2	8	97622	97629	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008278	CGGG	2	8	97700	97707	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008278	GCCG	2	8	97755	97762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008278	TCCC	2	8	97999	98006	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_008278	ACGA	2	8	98560	98567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008278	TGCG	2	8	98569	98576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008278	GACG	2	8	98604	98611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008278	GCCC	2	8	98646	98653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_008278	GCCC	2	8	98879	98886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_008278	GTCG	2	8	98940	98947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008278	CGGC	2	8	99110	99117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008278	GGCG	2	8	99171	99178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008278	CGGC	2	8	101773	101780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008278	GATC	2	8	102235	102242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008278	CTGG	2	8	102253	102260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008278	CCCA	2	8	102365	102372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_008278	GCCG	2	8	107667	107674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008278	GTCG	2	8	107922	107929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008278	CGGG	2	8	108513	108520	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008278	CGTC	2	8	110060	110067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008278	GGCA	2	8	110155	110162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008278	ACAG	2	8	110250	110257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008278	CTGC	2	8	114193	114200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008278	GCCG	2	8	115153	115160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008278	GGCC	2	8	120347	120354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008278	GCCG	2	8	122745	122752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008278	GACG	2	8	123019	123026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008278	CGGG	2	8	123820	123827	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008278	GGAG	2	8	128827	128834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008278	CCGG	2	8	132001	132008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008278	GCCG	2	8	133055	133062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008278	GGAC	2	8	134194	134201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008278	GCGG	2	8	134271	134278	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008278	TGCG	2	8	134331	134338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008278	CGCC	2	8	135514	135521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_008278	GCCG	2	8	135831	135838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008278	CGGC	2	8	135905	135912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008278	CGGG	2	8	135924	135931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008278	CCGG	2	8	137387	137394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008278	GTCC	2	8	139425	139432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008278	CCGA	2	8	142206	142213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008278	CGGT	2	8	145796	145803	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008278	GCGG	2	8	145804	145811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008278	ACCG	2	8	145865	145872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008278	GCGG	2	8	148954	148961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008278	GGCG	2	8	157504	157511	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008278	GCGG	2	8	157668	157675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008278	GCCG	2	8	159826	159833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008278	TACC	2	8	162001	162008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008278	CCGG	2	8	162286	162293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008278	CCGC	2	8	162326	162333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_008278	CCGC	2	8	162347	162354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_008278	TCCG	2	8	164598	164605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008278	CGCC	2	8	164693	164700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_008278	GGCG	2	8	167061	167068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008278	GTAC	2	8	167550	167557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008278	GCCG	2	8	172220	172227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008278	GGTC	2	8	172301	172308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008278	CGGC	2	8	173739	173746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008278	GCCG	2	8	175585	175592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008278	GGCC	2	8	177409	177416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008278	GCCG	2	8	177532	177539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008278	CGGC	2	8	177634	177641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008278	CCGG	2	8	177755	177762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008278	CGTC	2	8	177803	177810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008278	CCCA	2	8	178185	178192	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
148	NC_008278	CCGC	2	8	178328	178335	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_008278	CGGC	2	8	178981	178988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_008278	GGTG	2	8	178989	178996	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008278	AGCG	2	8	179069	179076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008278	TCGA	2	8	181507	181514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_008278	GCTG	2	8	183767	183774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_008278	GACC	2	8	184128	184135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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