MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis FSC198 chromosome

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008245	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008245	GTTTTA	2	12	8679	8690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008245	ATGATA	2	12	30307	30318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008245	TCCATG	2	12	46954	46965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008245	TTTATA	2	12	85262	85273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008245	TAGTGC	2	12	135516	135527	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008245	ATTTTT	2	12	136174	136185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008245	TCCACA	2	12	164742	164753	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008245	TGTTTT	2	12	182285	182296	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008245	ATTTCC	2	12	200180	200191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008245	TAAAGA	2	12	210895	210906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008245	TTTCAT	2	12	220393	220404	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008245	ATCGCT	2	12	225086	225097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008245	TATAAA	2	12	225286	225297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008245	ACCTTA	2	12	235412	235423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008245	TTTAAA	2	12	254789	254800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008245	TTATAA	2	12	271795	271806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008245	ATAAAT	2	12	278711	278722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008245	ATTTTT	2	12	319357	319368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008245	TTTTGT	2	12	319874	319885	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008245	CGGTGC	2	12	358170	358181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008245	TGGGCT	2	12	359283	359294	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008245	TAAGTT	2	12	364952	364963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008245	TAAAAT	2	12	384890	384901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008245	ATTTTT	2	12	385469	385480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008245	AAGTTA	2	12	404421	404432	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008245	AAATAT	2	12	440992	441003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008245	AAAAGT	2	12	447636	447647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008245	TAGAAT	2	12	460635	460646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008245	AAAATC	2	12	501079	501090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008245	ACAAGC	2	12	516842	516853	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008245	AAAAAT	2	12	518881	518892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008245	ATTAGA	2	12	536734	536745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008245	TAGCTA	2	12	540838	540849	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008245	ATTTAG	2	12	551824	551835	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008245	GATATT	2	12	552372	552383	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008245	TATAAT	2	12	557725	557736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008245	AGTTAT	2	12	579383	579394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008245	TATTTT	2	12	592229	592240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008245	GATTTA	2	12	592956	592967	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008245	TTTGAT	2	12	600959	600970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008245	TAAATA	2	12	611108	611119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008245	CTTATA	2	12	611128	611139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008245	GATGTT	2	12	662241	662252	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008245	ATATTT	2	12	662892	662903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008245	TTATAT	2	12	679613	679624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008245	CATTAG	2	12	680654	680665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008245	TTTACT	2	12	687238	687249	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008245	TTAGTT	2	12	702312	702323	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008245	TTTAAA	2	12	710370	710381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008245	AAATAA	2	12	724579	724590	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008245	GCTTTA	2	12	733919	733930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008245	CATAAA	2	12	738059	738070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008245	TTTGAT	2	12	799111	799122	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008245	TGTATA	2	12	822820	822831	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008245	TAGTTT	2	12	865894	865905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008245	TTAGAT	2	12	873809	873820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008245	TATAGC	2	12	876057	876068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008245	ATATTT	2	12	876445	876456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008245	ATTGAT	2	12	891612	891623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008245	AGTAAC	2	12	930800	930811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008245	AGTAAT	2	12	942669	942680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008245	TTAAAT	2	12	951850	951861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008245	TAATTA	2	12	978116	978127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008245	TATTAA	2	12	978918	978929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008245	AGATTT	2	12	996509	996520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008245	TAATCT	2	12	998855	998866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008245	ATTTTT	2	12	1006635	1006646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008245	TATTTA	3	18	1010363	1010380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008245	AAATGG	2	12	1010616	1010627	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008245	ATTTGG	2	12	1041568	1041579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008245	TAATAC	2	12	1042710	1042721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008245	AATTTT	2	12	1057775	1057786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008245	AATCAA	2	12	1062275	1062286	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008245	TTTAAC	2	12	1072967	1072978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008245	CTCTCA	2	12	1074762	1074773	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008245	CAAAGT	2	12	1075921	1075932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008245	AAATTA	2	12	1084633	1084644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008245	TGATAT	2	12	1098934	1098945	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008245	AATTTG	2	12	1108961	1108972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008245	TCTAAA	2	12	1109145	1109156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008245	ACAAGT	2	12	1114150	1114161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008245	TAATGT	2	12	1114418	1114429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008245	ATTAAT	2	12	1114596	1114607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008245	TATCAA	2	12	1115384	1115395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008245	AACTAA	2	12	1131699	1131710	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008245	AAATTA	2	12	1150164	1150175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008245	AAATAT	2	12	1166083	1166094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008245	TTTTTG	2	12	1175632	1175643	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008245	CTGCAA	2	12	1189848	1189859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008245	TACCTG	2	12	1191635	1191646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008245	ATTTTA	2	12	1204169	1204180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008245	CAAAAT	2	12	1205545	1205556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008245	GCATCA	2	12	1228403	1228414	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008245	CTTTTT	2	12	1228767	1228778	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008245	ATTTCA	2	12	1308419	1308430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008245	CTTATT	2	12	1310723	1310734	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008245	TACTAT	2	12	1313086	1313097	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008245	TTTAAA	2	12	1323774	1323785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008245	ATACAA	2	12	1331809	1331820	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008245	TTTTGT	2	12	1353748	1353759	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008245	TATAAA	2	12	1357053	1357064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008245	TTATTT	2	12	1359976	1359987	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008245	ATTTCA	2	12	1375538	1375549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008245	CTTATT	2	12	1377842	1377853	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008245	TTTATT	2	12	1405221	1405232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008245	TTTATC	2	12	1405620	1405631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008245	TGGATA	2	12	1405989	1406000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008245	AAAGCT	2	12	1406272	1406283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008245	TTTGCT	2	12	1406284	1406295	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008245	TAACTA	2	12	1408080	1408091	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008245	AAAAAT	2	12	1424301	1424312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008245	TCTTAG	2	12	1425038	1425049	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008245	AAGTTT	2	12	1425108	1425119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008245	GCTATG	2	12	1426674	1426685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008245	TAACAT	2	12	1454083	1454094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008245	AATCAA	2	12	1461038	1461049	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008245	ATAAAA	2	12	1462368	1462379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008245	ATTTTT	2	12	1462874	1462885	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008245	CATTAA	4	24	1482929	1482952	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008245	AATCCA	2	12	1487060	1487071	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008245	ATACAA	2	12	1489628	1489639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008245	TGTTAT	2	12	1570489	1570500	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008245	GCATTT	2	12	1572334	1572345	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008245	CTTAAT	2	12	1606509	1606520	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008245	ATGAAA	2	12	1609514	1609525	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008245	AATATA	2	12	1627073	1627084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008245	TAAATT	2	12	1627555	1627566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008245	AGATTA	2	12	1648343	1648354	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008245	TTCCCA	2	12	1657901	1657912	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008245	CTTCTA	2	12	1677847	1677858	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008245	TTATAA	2	12	1679263	1679274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008245	GTTTTT	2	12	1682368	1682379	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008245	CATACT	2	12	1706523	1706534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008245	GTTTTA	2	12	1707846	1707857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008245	ACTTAT	2	12	1722886	1722897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_008245	ATCACC	2	12	1728104	1728115	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008245	AACCTT	2	12	1736108	1736119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_008245	ATTTCA	2	12	1768873	1768884	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_008245	CTTATT	2	12	1771177	1771188	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_008245	TTTATT	2	12	1798556	1798567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008245	TTTATC	2	12	1798955	1798966	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_008245	TGGATA	2	12	1799324	1799335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008245	AAAGCT	2	12	1799607	1799618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_008245	TTTGCT	2	12	1799619	1799630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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148	NC_008245	CACCAT	2	12	1823238	1823249	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008245	GTAATA	2	12	1830587	1830598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008245	AATATC	2	12	1864036	1864047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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152	NC_008245	AAAAAG	2	12	1866553	1866564	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008245	ATAAAA	2	12	1874685	1874696	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008245	TAGATA	2	12	1876406	1876417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008245	TTAATT	2	12	1885423	1885434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008245	ACCTGG	2	12	1888193	1888204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.