MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 317

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	AGCTA	2	10	19518	19527	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_007880	TTAAT	2	10	20759	20768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007880	TGATT	2	10	20946	20955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007880	ATTTT	2	10	26362	26371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007880	CTGTA	2	10	36739	36748	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007880	TTATC	2	10	37026	37035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007880	TATTT	2	10	55939	55948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007880	ATTAT	2	10	55969	55978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007880	AATTT	2	10	56973	56982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007880	GATAA	2	10	61525	61534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007880	ATTTT	2	10	64439	64448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007880	CTAAA	2	10	66085	66094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007880	AAAGT	2	10	71726	71735	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007880	GCCCT	2	10	75855	75864	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_007880	TTTGG	2	10	77725	77734	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007880	ACTTT	2	10	77766	77775	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_007880	ATTTT	2	10	84961	84970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007880	AGTTA	2	10	85085	85094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007880	TAAAA	2	10	92828	92837	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007880	GAATA	2	10	126283	126292	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007880	GATTT	2	10	133911	133920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007880	TTTTA	2	10	136929	136938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007880	TATAG	2	10	139915	139924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007880	AAAAT	2	10	141440	141449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007880	ATTTT	2	10	158676	158685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007880	AAATA	2	10	173127	173136	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007880	TATAG	2	10	173742	173751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007880	CTAGC	2	10	176759	176768	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_007880	CTTGA	2	10	177655	177664	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_007880	TTAAG	2	10	190617	190626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007880	AGATT	2	10	190711	190720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007880	AAAAC	2	10	197268	197277	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_007880	AAAAT	2	10	216040	216049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007880	TAATA	2	10	234384	234393	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007880	ATTTT	2	10	239058	239067	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007880	ATTTC	2	10	247774	247783	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007880	AGAAA	2	10	248839	248848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007880	TCAAT	2	10	249473	249482	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_007880	CTTTT	2	10	253696	253705	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_007880	TAATT	2	10	256542	256551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007880	AGTTT	2	10	257518	257527	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007880	TTTGA	2	10	266043	266052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007880	TGATC	2	10	307919	307928	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007880	TAATT	2	10	308633	308642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007880	TATTT	2	10	309133	309142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007880	ATTTA	2	10	314723	314732	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007880	AATCT	2	10	319124	319133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007880	ACTAC	2	10	319902	319911	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_007880	GCGAT	2	10	327989	327998	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_007880	GCTTG	2	10	328931	328940	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_007880	TATCT	2	10	340371	340380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007880	AGATA	2	10	342464	342473	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007880	AATCT	2	10	351025	351034	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007880	ATTTA	2	10	356924	356933	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007880	ATTTT	2	10	356939	356948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007880	TAGTT	2	10	362333	362342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007880	TTAGA	2	10	362562	362571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007880	GATTT	2	10	364411	364420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007880	TTTAG	2	10	373648	373657	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007880	AGTTA	2	10	377497	377506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007880	CTGTC	2	10	386200	386209	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_007880	TTTAT	2	10	388747	388756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007880	AATAA	2	10	394957	394966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007880	TGTTA	2	10	415212	415221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007880	TTTTA	2	10	415226	415235	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007880	TAAAT	2	10	415272	415281	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007880	GAATA	2	10	417304	417313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007880	TAATT	2	10	421903	421912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007880	TGAAA	2	10	435653	435662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007880	TAATT	2	10	440416	440425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007880	TTTTA	2	10	450347	450356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007880	AGTTA	2	10	450366	450375	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007880	TTAAC	2	10	477683	477692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007880	TTTAA	2	10	484599	484608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007880	GTTTG	2	10	502289	502298	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007880	CAATT	2	10	502300	502309	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007880	AATGA	2	10	505013	505022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007880	TAGAT	2	10	505025	505034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007880	AAGCA	2	10	506777	506786	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_007880	ACTAT	2	10	506934	506943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_007880	AAATT	2	10	506979	506988	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007880	GATAA	2	10	513747	513756	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007880	TTCTT	2	10	520058	520067	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_007880	GTAAA	2	10	525904	525913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007880	ATTTA	2	10	539754	539763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007880	TAATG	2	10	545601	545610	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007880	ATTTG	2	10	546323	546332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007880	AACTT	2	10	546904	546913	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007880	ATTTT	2	10	547035	547044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007880	ACTAA	2	10	548921	548930	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007880	AGTTA	2	10	558715	558724	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007880	ATTTA	2	10	559100	559109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007880	TTTAG	2	10	560892	560901	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007880	AATTT	2	10	595640	595649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007880	TAAGT	2	10	596783	596792	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007880	AATTA	2	10	606031	606040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007880	TTTTA	2	10	611455	611464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007880	TAAAG	2	10	617989	617998	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007880	AATCA	2	10	625543	625552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_007880	AACTA	2	10	628073	628082	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007880	TATTT	2	10	633554	633563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007880	AAAGT	2	10	634549	634558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007880	AGTAG	2	10	636274	636283	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007880	TTAAA	2	10	662727	662736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007880	TAAAT	2	10	662746	662755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007880	ATAGC	2	10	670515	670524	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_007880	ATTTA	2	10	680912	680921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007880	ATAAA	2	10	693580	693589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007880	TTATA	2	10	693611	693620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007880	TAATA	2	10	695632	695641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007880	TAGTT	2	10	699097	699106	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007880	TAAAT	2	10	712078	712087	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007880	AAAAT	2	10	714683	714692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007880	GATTT	2	10	720763	720772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007880	TATAA	2	10	721660	721669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007880	TGTTT	2	10	723560	723569	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007880	ATATA	2	10	725300	725309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007880	CAAAA	2	10	732874	732883	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_007880	AAATT	2	10	748412	748421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007880	ACTAA	2	10	748444	748453	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007880	CATTG	2	10	749786	749795	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007880	AAATA	2	10	759899	759908	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007880	TCTAC	2	10	762153	762162	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_007880	TTTGA	2	10	762753	762762	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007880	AACAA	2	10	765543	765552	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_007880	AATGG	2	10	765632	765641	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007880	CCAAT	2	10	766588	766597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_007880	AATCA	3	15	768118	768132	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_007880	CAGTT	2	10	768428	768437	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007880	CAAAA	2	10	779695	779704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_007880	ATTTT	2	10	780406	780415	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007880	GTATA	2	10	788872	788881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007880	AATTA	2	10	799718	799727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007880	GTTAA	2	10	801498	801507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007880	CTAAA	2	10	801951	801960	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_007880	AAGTT	2	10	803199	803208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007880	AATGA	2	10	822481	822490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007880	ATTGG	2	10	823775	823784	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007880	CTTTT	2	10	823860	823869	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007880	ATATA	2	10	823917	823926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007880	TTATA	2	10	837665	837674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007880	ATTTT	2	10	837881	837890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007880	TAGAA	2	10	844019	844028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007880	TAATT	2	10	865710	865719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007880	GTTTT	2	10	866446	866455	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007880	CTTTT	2	10	877271	877280	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_007880	ATCAG	2	10	886239	886248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_007880	TATAA	2	10	904817	904826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_007880	CAAAT	2	10	1748684	1748693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_007880	AGCTT	2	10	1749912	1749921	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
290	NC_007880	ATTTA	2	10	1771199	1771208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_007880	AAAGA	2	10	1781287	1781296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_007880	AAGTC	2	10	1788170	1788179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
293	NC_007880	TTTAT	2	10	1800678	1800687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_007880	TATTT	2	10	1802655	1802664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_007880	AAACA	2	10	1808216	1808225	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
296	NC_007880	ATTGA	2	10	1825105	1825114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_007880	AAAAG	2	10	1826150	1826159	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_007880	CTTTA	2	10	1841052	1841061	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_007880	TTACA	2	10	1842396	1842405	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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317	NC_007880	TACTT	2	10	1895862	1895871	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.