MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_006570	GTTTTA	2	12	8663	8674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006570	ATGATA	2	12	30291	30302	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006570	TCCATG	2	12	46938	46949	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006570	TTTATA	2	12	85246	85257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006570	TAGTGC	2	12	135500	135511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_006570	ATTTTT	2	12	136158	136169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006570	TCCACA	2	12	164726	164737	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006570	TGTTTT	2	12	182269	182280	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006570	ATTTCC	2	12	200164	200175	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006570	TAAAGA	2	12	210879	210890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006570	TTTCAT	2	12	220377	220388	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_006570	ATCGCT	2	12	225070	225081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_006570	TATAAA	2	12	225270	225281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006570	ACCTTA	2	12	235396	235407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006570	TTTAAA	2	12	254773	254784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006570	TTATAA	2	12	271779	271790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006570	TAAGTA	2	12	278281	278292	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006570	ATAAAT	2	12	278695	278706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006570	ATTTTT	2	12	319404	319415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006570	TTTTGT	2	12	319921	319932	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006570	CGGTGC	2	12	358217	358228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006570	TGGGCT	2	12	359330	359341	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_006570	TAAGTT	2	12	364999	365010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006570	TAAAAT	2	12	384937	384948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006570	ATTTTT	2	12	385516	385527	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006570	AAGTTA	2	12	404468	404479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006570	AAATAT	2	12	441039	441050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006570	AAAAGT	2	12	447683	447694	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006570	TAGAAT	2	12	460682	460693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006570	AAAATC	2	12	501126	501137	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_006570	ACAAGC	2	12	516889	516900	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006570	AAAAAT	2	12	518928	518939	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006570	ATTAGA	2	12	536781	536792	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006570	TAGCTA	2	12	540885	540896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_006570	TAAATG	2	12	544556	544567	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006570	AAAAAC	2	12	545172	545183	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_006570	ACAGCC	2	12	549198	549209	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_006570	ATTTAG	2	12	551871	551882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006570	GATATT	2	12	552419	552430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006570	TATAAT	2	12	557772	557783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006570	AGTTAT	2	12	579430	579441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006570	TATTTT	2	12	592276	592287	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006570	GATTTA	2	12	593003	593014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006570	TTTGAT	2	12	601006	601017	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006570	TAAATA	2	12	611155	611166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006570	CTTATA	2	12	611175	611186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_006570	GATGTT	2	12	662288	662299	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006570	ATATTT	2	12	662939	662950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006570	TTATAT	2	12	679660	679671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006570	CATTAG	2	12	680701	680712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_006570	TTTACT	2	12	687285	687296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_006570	TTAGTT	2	12	702359	702370	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006570	TTTAAA	2	12	710417	710428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006570	AAATAA	2	12	724626	724637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006570	GCTTTA	2	12	733966	733977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_006570	CATAAA	2	12	738106	738117	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_006570	CATATT	2	12	762434	762445	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_006570	TATCAA	2	12	762827	762838	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_006570	TTTGAT	2	12	799158	799169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006570	TGTATA	2	12	822867	822878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006570	TAGTTT	2	12	865941	865952	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006570	TTAGAT	2	12	873856	873867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006570	TATAGC	2	12	876104	876115	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_006570	ATATTT	2	12	876492	876503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006570	ATTGAT	2	12	891659	891670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006570	AGTAAC	2	12	930847	930858	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_006570	AGTAAT	2	12	942716	942727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006570	TTAAAT	2	12	951897	951908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006570	TAATTA	2	12	978163	978174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006570	TATTAA	2	12	978965	978976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006570	AGATTT	2	12	996556	996567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006570	TAATCT	2	12	998902	998913	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_006570	ATTTTT	2	12	1006682	1006693	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006570	TATTTA	3	18	1010410	1010427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006570	AAATGG	2	12	1010663	1010674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006570	ATTTGG	2	12	1041615	1041626	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006570	TAATAC	2	12	1042757	1042768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_006570	AATTTT	2	12	1057822	1057833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006570	AATCAA	2	12	1062322	1062333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_006570	CTAAAG	2	12	1072700	1072711	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_006570	TTTAAC	2	12	1073014	1073025	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_006570	CTCTCA	2	12	1074809	1074820	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_006570	CAAAGT	2	12	1075968	1075979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_006570	AAATTA	2	12	1084680	1084691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006570	TCCATC	2	12	1089554	1089565	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_006570	TGATAT	2	12	1098981	1098992	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006570	AATTTG	2	12	1109008	1109019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006570	TCTAAA	2	12	1109192	1109203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_006570	ACAAGT	2	12	1114197	1114208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_006570	TAATGT	2	12	1114465	1114476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006570	ATTAAT	2	12	1114643	1114654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006570	TATCAA	2	12	1115431	1115442	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_006570	AACTAA	2	12	1131746	1131757	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_006570	AAATTA	2	12	1150211	1150222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006570	AAATAT	2	12	1166130	1166141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006570	TTTTTG	2	12	1175679	1175690	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006570	CTGCAA	2	12	1189895	1189906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006570	TACCTG	2	12	1191682	1191693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_006570	ATTTTA	2	12	1204216	1204227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006570	CAAAAT	2	12	1205592	1205603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_006570	GCATCA	2	12	1228450	1228461	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006570	CTTTTT	2	12	1228814	1228825	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_006570	ATTTCA	2	12	1308578	1308589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_006570	CTTATT	2	12	1310882	1310893	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_006570	TACTAT	2	12	1313245	1313256	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_006570	TTTAAA	2	12	1323933	1323944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006570	ATACAA	2	12	1331968	1331979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_006570	TTTTGT	2	12	1353907	1353918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006570	TATAAA	2	12	1357212	1357223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006570	TTATTT	2	12	1360135	1360146	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006570	ATTTCA	2	12	1375697	1375708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_006570	CTTATT	2	12	1378001	1378012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_006570	TTTATT	2	12	1405380	1405391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006570	TTTATC	2	12	1405779	1405790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_006570	TGGATA	2	12	1406148	1406159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006570	AAAGCT	2	12	1406431	1406442	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_006570	TTTGCT	2	12	1406443	1406454	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_006570	TAACTA	2	12	1408239	1408250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_006570	TCTTAG	2	12	1425197	1425208	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_006570	AAGTTT	2	12	1425267	1425278	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006570	GCTATG	2	12	1426833	1426844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_006570	TAACAT	2	12	1454242	1454253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_006570	AATCAA	2	12	1461197	1461208	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_006570	ATAAAA	2	12	1462527	1462538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006570	ATTTTT	2	12	1463033	1463044	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006570	CATTAA	4	24	1483088	1483111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_006570	AATCCA	2	12	1487219	1487230	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006570	ATACAA	2	12	1489787	1489798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_006570	TGTTAT	2	12	1570648	1570659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006570	GCATTT	2	12	1572493	1572504	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_006570	CTTAAT	2	12	1606668	1606679	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_006570	ATGAAA	2	12	1609673	1609684	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006570	AATATA	2	12	1627232	1627243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006570	TAAATT	2	12	1627714	1627725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006570	AGATTA	2	12	1648502	1648513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_006570	GTTTTA	2	12	1708005	1708016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.