MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	AATCA	2	10	4443	4452	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_006570	ATGGT	2	10	4477	4486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006570	ATTAA	2	10	4629	4638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006570	TAGCT	2	10	5904	5913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_006570	AAAGA	2	10	8698	8707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006570	CTTTT	2	10	14499	14508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_006570	GATTT	2	10	21871	21880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006570	ATTTT	2	10	22304	22313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006570	ATTAA	2	10	24591	24600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006570	GATTT	2	10	46139	46148	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006570	TTGGT	2	10	46340	46349	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006570	GATAG	2	10	47038	47047	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006570	TTAAT	2	10	47441	47450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006570	AATTT	2	10	59575	59584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006570	AAACT	2	10	85571	85580	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_006570	TTTAT	2	10	88685	88694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006570	GTTTT	2	10	92917	92926	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006570	AATGT	2	10	96724	96733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006570	AATAT	2	10	96753	96762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006570	TTGAT	2	10	105641	105650	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006570	GTATG	2	10	134986	134995	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006570	GGTGT	2	10	136228	136237	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006570	CTAGT	2	10	147822	147831	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_006570	TTTAT	2	10	168728	168737	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006570	AATGT	2	10	182237	182246	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006570	TTTTA	2	10	187079	187088	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006570	TAAAT	2	10	195440	195449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006570	ATGTA	2	10	200245	200254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006570	TTATC	2	10	200255	200264	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_006570	TTTAT	2	10	202348	202357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006570	TAATG	2	10	202382	202391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006570	TAAAG	2	10	203729	203738	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006570	CTTTT	2	10	218636	218645	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_006570	AAAGC	2	10	241771	241780	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_006570	TAAAC	2	10	242152	242161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_006570	AATAA	2	10	244912	244921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006570	TCAAG	2	10	250208	250217	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_006570	GCTAG	2	10	251104	251113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_006570	CTATA	2	10	254119	254128	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_006570	TATTT	2	10	254735	254744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006570	CTATA	2	10	260966	260975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_006570	AAAAT	2	10	270367	270376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006570	ATAAA	2	10	270945	270954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006570	AATAA	2	10	271098	271107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006570	TTATT	2	10	278410	278419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006570	ATTTT	2	10	287206	287215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006570	AGCAA	2	10	288701	288710	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_006570	TTTAT	2	10	288960	288969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006570	ATACG	2	10	289524	289533	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_006570	TTAAG	2	10	293831	293840	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006570	AGATT	2	10	293925	293934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006570	AAAAC	2	10	300483	300492	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_006570	AAAAT	2	10	319330	319339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006570	TAATA	2	10	337679	337688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006570	ATTTT	2	10	342354	342363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006570	ATTTC	2	10	351071	351080	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_006570	AGAAA	2	10	352177	352186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006570	TCAAT	2	10	352822	352831	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_006570	CTTTT	2	10	357044	357053	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006570	CCAAG	2	10	358555	358564	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_006570	GTAAA	2	10	376864	376873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006570	TAAGA	2	10	378801	378810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006570	ATTGA	2	10	381064	381073	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006570	TTTCT	2	10	381709	381718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_006570	TAATT	2	10	383565	383574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006570	TGAAA	2	10	396314	396323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006570	TAATT	2	10	401077	401086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006570	TTTTA	2	10	409003	409012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006570	AGTTA	2	10	409022	409031	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006570	TTAAC	2	10	436338	436347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_006570	CAAGA	2	10	441779	441788	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_006570	AGTGT	2	10	441902	441911	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006570	TTTAA	2	10	444812	444821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006570	TCTCT	2	10	454496	454505	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_006570	AACTT	2	10	459270	459279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006570	TTTTC	2	10	481387	481396	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_006570	AAACT	2	10	501108	501117	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_006570	ATTAT	2	10	508991	509000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006570	ATTTA	2	10	509008	509017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006570	CTAGG	2	10	513726	513735	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_006570	ATTTG	2	10	518615	518624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006570	TTTGT	2	10	521740	521749	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006570	ACAAA	2	10	524719	524728	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_006570	ATTTA	2	10	527344	527353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006570	ATTAT	2	10	532838	532847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006570	ACTAA	2	10	545152	545161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_006570	TAATT	2	10	549282	549291	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006570	ATTAG	2	10	550400	550409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006570	AAGAA	2	10	552558	552567	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006570	AGCTA	2	10	562787	562796	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_006570	GTATT	2	10	570118	570127	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006570	AACAA	2	10	575176	575185	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_006570	ATTTG	2	10	583901	583910	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006570	GTTTT	2	10	587544	587553	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006570	TTTTA	2	10	599242	599251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006570	TTGAT	2	10	600650	600659	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006570	CTTTT	2	10	604700	604709	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006570	TAAAA	2	10	604840	604849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006570	TATCT	2	10	605109	605118	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_006570	AAGAA	2	10	605635	605644	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006570	AACAA	2	10	605672	605681	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_006570	TTATA	2	10	611947	611956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006570	ATTTT	2	10	612163	612172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006570	TAGAA	2	10	617444	617453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006570	GATAT	2	10	618784	618793	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006570	TTTTA	2	10	619784	619793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006570	TAATT	2	10	638685	638694	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006570	CTTTT	2	10	650244	650253	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_006570	TAATA	2	10	662029	662038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006570	ATAAA	2	10	677196	677205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006570	TATAA	2	10	678225	678234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006570	ATTTT	2	10	680629	680638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006570	TATTT	2	10	681160	681169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006570	TTATA	2	10	687958	687967	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006570	TTGAT	2	10	689671	689680	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006570	CTGCT	2	10	689785	689794	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_006570	CCAAG	2	10	689996	690005	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_006570	ATTTA	2	10	691812	691821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006570	AATAA	2	10	691906	691915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006570	TATCT	2	10	712463	712472	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_006570	TTAAT	2	10	717641	717650	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006570	GAAAA	2	10	725029	725038	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006570	AGGTG	2	10	737395	737404	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006570	CAAAT	2	10	737456	737465	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_006570	TAGTT	2	10	748925	748934	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006570	TTAGA	2	10	750323	750332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006570	ATAAA	2	10	754408	754417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006570	AACTT	2	10	758806	758815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_006570	ATTTA	2	10	760844	760853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006570	AATCA	2	10	762912	762921	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_006570	TAATT	2	10	763579	763588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006570	TAAAC	2	10	768243	768252	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_006570	AAATC	2	10	768613	768622	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_006570	TTTTG	2	10	773571	773580	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006570	ATTTT	2	10	774038	774047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006570	AAATA	2	10	780442	780451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006570	TATTT	2	10	792847	792856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006570	ATTAT	2	10	793718	793727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006570	TTATT	2	10	794016	794025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006570	AAATG	2	10	795139	795148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006570	ATAGT	2	10	795373	795382	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006570	AAATT	2	10	802459	802468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006570	TATAT	2	10	824786	824795	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006570	TAAAA	2	10	832081	832090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006570	ATATT	2	10	833439	833448	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006570	TAAAT	2	10	834469	834478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006570	AATAT	2	10	835041	835050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006570	ATTTA	2	10	852266	852275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006570	AATCT	2	10	856667	856676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_006570	AATAA	2	10	1021061	1021070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_006570	TAAAT	2	10	1022924	1022933	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_006570	TAATT	2	10	1071073	1071082	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_006570	GTGTA	2	10	1071137	1071146	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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359	NC_006570	TAAAC	2	10	1877094	1877103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
360	NC_006570	TAGCA	2	10	1882417	1882426	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.