MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 91069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020054	TTC	2	6	148	153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833392
2	NC_020054	GAA	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833392
3	NC_020054	CGC	2	6	204	209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833392
4	NC_020054	TGG	2	6	245	250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833392
5	NC_020054	CAC	2	6	294	299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833392
6	NC_020054	CGT	2	6	407	412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833392
7	NC_020054	GGC	2	6	477	482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833392
8	NC_020054	TGA	2	6	512	517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833392
9	NC_020054	CGG	2	6	522	527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833392
10	NC_020054	CGA	2	6	711	716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833392
11	NC_020054	AGA	2	6	731	736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833392
12	NC_020054	ACC	2	6	773	778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833392
13	NC_020054	CGA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833392
14	NC_020054	CAC	2	6	879	884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833392
15	NC_020054	CAT	2	6	921	926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833392
16	NC_020054	AGA	2	6	929	934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833392
17	NC_020054	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833392
18	NC_020054	GTG	2	6	1027	1032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833392
19	NC_020054	CCG	2	6	1059	1064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833392
20	NC_020054	ACG	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833392
21	NC_020054	TGG	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833392
22	NC_020054	ACA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833392
23	NC_020054	GGT	2	6	1215	1220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833392
24	NC_020054	CGG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833392
25	NC_020054	AGA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833392
26	NC_020054	GCT	2	6	1553	1558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833393
27	NC_020054	CCG	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833393
28	NC_020054	CCT	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833393
29	NC_020054	ACC	2	6	1830	1835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833393
30	NC_020054	GCA	2	6	1862	1867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833393
31	NC_020054	CCG	2	6	1921	1926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833393
32	NC_020054	CCG	2	6	1928	1933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833393
33	NC_020054	CGC	2	6	2039	2044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833393
34	NC_020054	CGT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833393
35	NC_020054	TTA	2	6	2489	2494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833394
36	NC_020054	GCC	2	6	2519	2524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833394
37	NC_020054	TCG	2	6	2598	2603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833394
38	NC_020054	CAG	2	6	2615	2620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833394
39	NC_020054	AAG	2	6	2637	2642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833394
40	NC_020054	TCG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833394
41	NC_020054	TCG	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833394
42	NC_020054	TAG	2	6	2820	2825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833394
43	NC_020054	TCC	2	6	2928	2933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833394
44	NC_020054	CAA	2	6	3118	3123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833394
45	NC_020054	CGG	2	6	3130	3135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833394
46	NC_020054	TGA	2	6	3139	3144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833394
47	NC_020054	CGG	2	6	3204	3209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833394
48	NC_020054	CGT	2	6	3221	3226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833394
49	NC_020054	ACG	2	6	3234	3239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833394
50	NC_020054	CTG	2	6	3390	3395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833395
51	NC_020054	GTT	2	6	3429	3434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833395
52	NC_020054	CGG	2	6	3506	3511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833395
53	NC_020054	CTT	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833395
54	NC_020054	CGT	2	6	3567	3572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833395
55	NC_020054	CAC	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833395
56	NC_020054	GCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833395
57	NC_020054	AGC	2	6	3994	3999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833395
58	NC_020054	GTG	2	6	4087	4092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833395
59	NC_020054	TGA	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833395
60	NC_020054	CAG	2	6	4299	4304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833395
61	NC_020054	GCC	3	9	4561	4569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833396
62	NC_020054	TGA	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833396
63	NC_020054	AGC	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833397
64	NC_020054	GCT	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833397
65	NC_020054	CAT	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833397
66	NC_020054	GCC	2	6	5477	5482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833397
67	NC_020054	CGC	2	6	5529	5534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833397
68	NC_020054	GGT	2	6	5554	5559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833397
69	NC_020054	TGC	2	6	5571	5576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833397
70	NC_020054	CAA	2	6	5587	5592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833397
71	NC_020054	CGA	2	6	5614	5619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833397
72	NC_020054	ACC	2	6	5669	5674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833397
73	NC_020054	CTT	2	6	5689	5694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833397
74	NC_020054	ACG	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833397
75	NC_020054	TGC	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833397
76	NC_020054	CTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833397
77	NC_020054	CAA	3	9	5776	5784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833397
78	NC_020054	CAG	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833397
79	NC_020054	AGA	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833397
80	NC_020054	CCT	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833397
81	NC_020054	CTG	2	6	5975	5980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833397
82	NC_020054	CAG	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833397
83	NC_020054	AAG	2	6	6045	6050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833397
84	NC_020054	CGG	2	6	6063	6068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833397
85	NC_020054	GAA	2	6	6074	6079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833397
86	NC_020054	CGC	2	6	6089	6094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833397
87	NC_020054	TGG	2	6	6159	6164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833397
88	NC_020054	CCG	2	6	6237	6242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833397
89	NC_020054	GGC	2	6	6250	6255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833397
90	NC_020054	ACC	2	6	6257	6262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833397
91	NC_020054	CGT	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833397
92	NC_020054	GTC	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833397
93	NC_020054	TGG	2	6	6336	6341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833397
94	NC_020054	GTT	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833397
95	NC_020054	GCT	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833398
96	NC_020054	CAA	2	6	6628	6633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833398
97	NC_020054	ACC	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833398
98	NC_020054	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833398
99	NC_020054	GGC	2	6	6775	6780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
100	NC_020054	CGG	2	6	6788	6793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
101	NC_020054	CGG	2	6	6817	6822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
102	NC_020054	GGC	2	6	6824	6829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
103	NC_020054	CTG	2	6	7063	7068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833398
104	NC_020054	GAT	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833398
105	NC_020054	TCA	2	6	7214	7219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833398
106	NC_020054	CAA	2	6	7248	7253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833398
107	NC_020054	CAA	2	6	7314	7319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833398
108	NC_020054	CGG	2	6	7376	7381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
109	NC_020054	GGC	2	6	7388	7393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
110	NC_020054	TAC	2	6	7411	7416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833398
111	NC_020054	GGC	2	6	7483	7488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833398
112	NC_020054	TAC	2	6	7600	7605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833398
113	NC_020054	GTC	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833398
114	NC_020054	CAA	2	6	7665	7670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833398
115	NC_020054	CAA	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833398
116	NC_020054	ACA	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833398
117	NC_020054	TCT	2	6	7778	7783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833398
118	NC_020054	ACG	2	6	7787	7792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833398
119	NC_020054	TCG	2	6	7807	7812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833398
120	NC_020054	CCT	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436833398
121	NC_020054	TGG	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833399
122	NC_020054	TTC	2	6	8123	8128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833399
123	NC_020054	GTT	2	6	8152	8157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833399
124	NC_020054	TTG	2	6	8175	8180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833399
125	NC_020054	CTT	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833399
126	NC_020054	TGC	2	6	8217	8222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833399
127	NC_020054	GAC	3	9	8223	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833399
128	NC_020054	AAC	2	6	8244	8249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833399
129	NC_020054	GAT	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833399
130	NC_020054	GAA	2	6	8288	8293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833399
131	NC_020054	CAG	3	9	8294	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833399
132	NC_020054	GAA	2	6	8303	8308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833399
133	NC_020054	GAC	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833399
134	NC_020054	CGG	2	6	8341	8346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833399
135	NC_020054	CGG	2	6	8361	8366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833399
136	NC_020054	ATA	2	6	8480	8485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436833400
137	NC_020054	GCG	2	6	8503	8508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833400
138	NC_020054	ATC	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833400
139	NC_020054	AGC	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833400
140	NC_020054	TCG	2	6	8654	8659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833400
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142	NC_020054	CAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833400
143	NC_020054	GTT	2	6	8920	8925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833400
144	NC_020054	TAA	2	6	9006	9011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436833400
145	NC_020054	CGT	2	6	9087	9092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833400
146	NC_020054	TGT	2	6	9123	9128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833400
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150	NC_020054	CCG	2	6	9608	9613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833401
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152	NC_020054	GAT	2	6	9649	9654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833401
153	NC_020054	TGT	2	6	9666	9671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833401
154	NC_020054	CCG	2	6	9915	9920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833401
155	NC_020054	CGA	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833401
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157	NC_020054	CAA	3	9	10456	10464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833402
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159	NC_020054	ATC	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833402
160	NC_020054	TGC	2	6	10637	10642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833402
161	NC_020054	GCG	2	6	10728	10733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833402
162	NC_020054	GCC	2	6	10753	10758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833402
163	NC_020054	GCT	2	6	10800	10805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833402
164	NC_020054	CTG	2	6	10819	10824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833402
165	NC_020054	CAG	2	6	10845	10850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833402
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169	NC_020054	GCT	4	12	10941	10952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833402
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172	NC_020054	CTG	2	6	11053	11058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833402
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242	NC_020054	ATC	2	6	15831	15836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833407
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246	NC_020054	CCG	2	6	16045	16050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833407
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248	NC_020054	ACC	2	6	16296	16301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833408
249	NC_020054	ATG	2	6	16324	16329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833408
250	NC_020054	AAG	2	6	16398	16403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833408
251	NC_020054	GTT	2	6	16425	16430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833408
252	NC_020054	AGC	2	6	16468	16473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833408
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254	NC_020054	GCA	2	6	16631	16636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833408
255	NC_020054	AGC	2	6	16658	16663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833408
256	NC_020054	GCC	2	6	16751	16756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833408
257	NC_020054	GCC	2	6	16761	16766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833408
258	NC_020054	GCC	2	6	16771	16776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833408
259	NC_020054	ACT	2	6	16798	16803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833408
260	NC_020054	CGA	2	6	16838	16843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833408
261	NC_020054	TGC	2	6	16849	16854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833408
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263	NC_020054	AGG	2	6	16930	16935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833408
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280	NC_020054	GTG	2	6	18054	18059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833409
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282	NC_020054	TCG	2	6	18114	18119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833409
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284	NC_020054	GCG	2	6	18258	18263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833409
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378	NC_020054	GCG	2	6	24791	24796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833416
379	NC_020054	CGG	2	6	24859	24864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833416
380	NC_020054	CCG	2	6	24913	24918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833416
381	NC_020054	GAA	2	6	25049	25054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833416
382	NC_020054	TCA	2	6	25062	25067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833416
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386	NC_020054	AGT	2	6	25454	25459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833417
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488	NC_020054	GGC	2	6	34480	34485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833426
489	NC_020054	GCT	2	6	34575	34580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833426
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497	NC_020054	TTG	2	6	35196	35201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833427
498	NC_020054	TGT	3	9	35281	35289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833427
499	NC_020054	GGC	2	6	35308	35313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833427
500	NC_020054	TGG	2	6	35413	35418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833427

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