MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 123422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020054	GGC	2	6	177524	177529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833533
3502	NC_020054	GGCG	2	8	177543	177550	0 %	0 %	75 %	25 %	436833533
3503	NC_020054	GTG	2	6	177551	177556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436833533
3504	NC_020054	GAG	2	6	177610	177615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833533
3505	NC_020054	CCGA	2	8	177616	177623	25 %	0 %	25 %	50 %	436833533
3506	NC_020054	CAA	2	6	177651	177656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833533
3507	NC_020054	AGG	2	6	177668	177673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833533
3508	NC_020054	AGA	2	6	177675	177680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833533
3509	NC_020054	CCAC	2	8	177731	177738	25 %	0 %	0 %	75 %	436833533
3510	NC_020054	ACGCCT	2	12	177803	177814	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	436833533
3511	NC_020054	GAC	2	6	177831	177836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833533
3512	NC_020054	ACT	2	6	177914	177919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833533
3513	NC_020054	CGA	2	6	177936	177941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833533
3514	NC_020054	CAT	2	6	177987	177992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833533
3515	NC_020054	GGC	2	6	178022	178027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833533
3516	NC_020054	GCCA	2	8	178038	178045	25 %	0 %	25 %	50 %	436833533
3517	NC_020054	A	6	6	178051	178056	100 %	0 %	0 %	0 %	436833533
3518	NC_020054	CGA	2	6	178217	178222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3519	NC_020054	CGC	2	6	178291	178296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833534
3520	NC_020054	AGG	2	6	178354	178359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833534
3521	NC_020054	GCT	3	9	178454	178462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3522	NC_020054	GCT	2	6	178511	178516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3523	NC_020054	GACC	2	8	178517	178524	25 %	0 %	25 %	50 %	436833534
3524	NC_020054	GGCCG	2	10	178539	178548	0 %	0 %	60 %	40 %	436833534
3525	NC_020054	ATT	2	6	178566	178571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436833534
3526	NC_020054	GGCTTT	2	12	178584	178595	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	436833534
3527	NC_020054	GCA	2	6	178610	178615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3528	NC_020054	CCAA	2	8	178642	178649	50 %	0 %	0 %	50 %	436833534
3529	NC_020054	CGG	2	6	178700	178705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833534
3530	NC_020054	GCA	2	6	178742	178747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3531	NC_020054	GGC	2	6	178792	178797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833534
3532	NC_020054	GCA	2	6	178856	178861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3533	NC_020054	GGC	2	6	178952	178957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833534
3534	NC_020054	GC	3	6	178999	179004	0 %	0 %	50 %	50 %	436833534
3535	NC_020054	CGA	2	6	179024	179029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3536	NC_020054	GCT	2	6	179030	179035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3537	NC_020054	GTC	2	6	179075	179080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833534
3538	NC_020054	CG	3	6	179188	179193	0 %	0 %	50 %	50 %	436833534
3539	NC_020054	GCG	2	6	179256	179261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833534
3540	NC_020054	GAA	2	6	179265	179270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833534
3541	NC_020054	GCTC	2	8	179279	179286	0 %	25 %	25 %	50 %	436833534
3542	NC_020054	CTT	2	6	179300	179305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833534
3543	NC_020054	CCGCT	2	10	179310	179319	0 %	20 %	20 %	60 %	436833534
3544	NC_020054	CAC	3	9	179344	179352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833535
3545	NC_020054	TCG	2	6	179360	179365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833535
3546	NC_020054	GAA	2	6	179394	179399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833535
3547	NC_020054	GCG	2	6	179586	179591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833535
3548	NC_020054	TCGA	2	8	179726	179733	25 %	25 %	25 %	25 %	436833535
3549	NC_020054	ATC	2	6	179746	179751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833535
3550	NC_020054	T	7	7	179774	179780	0 %	100 %	0 %	0 %	436833535
3551	NC_020054	GCAG	2	8	179811	179818	25 %	0 %	50 %	25 %	436833535
3552	NC_020054	ACCC	2	8	179873	179880	25 %	0 %	0 %	75 %	436833535
3553	NC_020054	GCC	2	6	180056	180061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3554	NC_020054	CCG	2	6	180069	180074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3555	NC_020054	CCA	2	6	180078	180083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833536
3556	NC_020054	GCC	2	6	180113	180118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3557	NC_020054	GCT	2	6	180170	180175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3558	NC_020054	GCC	3	9	180182	180190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3559	NC_020054	G	7	7	180210	180216	0 %	0 %	100 %	0 %	436833536
3560	NC_020054	CCG	2	6	180228	180233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3561	NC_020054	CATAGC	2	12	180292	180303	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436833536
3562	NC_020054	CCA	2	6	180318	180323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833536
3563	NC_020054	CGC	2	6	180328	180333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3564	NC_020054	GAA	2	6	180476	180481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436833536
3565	NC_020054	CCG	3	9	180525	180533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3566	NC_020054	TAG	2	6	180540	180545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833536
3567	NC_020054	CCA	2	6	180560	180565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833536
3568	NC_020054	GCC	2	6	180585	180590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3569	NC_020054	CGGGTT	2	12	180665	180676	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	436833536
3570	NC_020054	CTG	2	6	180764	180769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3571	NC_020054	AGCC	2	8	180821	180828	25 %	0 %	25 %	50 %	436833536
3572	NC_020054	CCG	2	6	180841	180846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3573	NC_020054	GCT	2	6	180889	180894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3574	NC_020054	GTC	2	6	180903	180908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3575	NC_020054	GGGCA	2	10	180917	180926	20 %	0 %	60 %	20 %	436833536
3576	NC_020054	TCG	2	6	181029	181034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3577	NC_020054	TCGG	2	8	181074	181081	0 %	25 %	50 %	25 %	436833536
3578	NC_020054	GCA	2	6	181129	181134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3579	NC_020054	AACC	2	8	181179	181186	50 %	0 %	0 %	50 %	436833536
3580	NC_020054	TGA	2	6	181210	181215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833536
3581	NC_020054	TGT	2	6	181245	181250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833536
3582	NC_020054	GCT	2	6	181276	181281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3583	NC_020054	CGT	2	6	181309	181314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3584	NC_020054	CCG	2	6	181330	181335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833536
3585	NC_020054	AGC	2	6	181338	181343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3586	NC_020054	GTC	2	6	181379	181384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833536
3587	NC_020054	GTTG	2	8	181401	181408	0 %	50 %	50 %	0 %	436833536
3588	NC_020054	GGA	2	6	181456	181461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436833536
3589	NC_020054	ATG	2	6	181479	181484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833536
3590	NC_020054	TGT	2	6	181747	181752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833537
3591	NC_020054	CGG	2	6	181756	181761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833537
3592	NC_020054	TGCC	2	8	181775	181782	0 %	25 %	25 %	50 %	436833537
3593	NC_020054	CGA	2	6	181802	181807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3594	NC_020054	CAG	2	6	181880	181885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3595	NC_020054	CCGA	2	8	181893	181900	25 %	0 %	25 %	50 %	436833537
3596	NC_020054	TTCG	2	8	181925	181932	0 %	50 %	25 %	25 %	436833537
3597	NC_020054	CGT	2	6	181969	181974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3598	NC_020054	GCGGG	2	10	182019	182028	0 %	0 %	80 %	20 %	436833537
3599	NC_020054	CAC	2	6	182039	182044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833537
3600	NC_020054	TCA	2	6	182121	182126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833537
3601	NC_020054	CAG	2	6	182132	182137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3602	NC_020054	ATC	2	6	182138	182143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833537
3603	NC_020054	CGG	2	6	182152	182157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833537
3604	NC_020054	CTG	2	6	182201	182206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3605	NC_020054	CG	3	6	182218	182223	0 %	0 %	50 %	50 %	436833537
3606	NC_020054	TGA	2	6	182248	182253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833537
3607	NC_020054	CGT	2	6	182281	182286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3608	NC_020054	TCGG	2	8	182319	182326	0 %	25 %	50 %	25 %	436833537
3609	NC_020054	CCA	2	6	182417	182422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833537
3610	NC_020054	CGA	2	6	182426	182431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3611	NC_020054	CGCC	2	8	182503	182510	0 %	0 %	25 %	75 %	436833537
3612	NC_020054	GCG	2	6	182556	182561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436833537
3613	NC_020054	CCG	2	6	182572	182577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833537
3614	NC_020054	CGT	2	6	182626	182631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3615	NC_020054	CGGG	2	8	182649	182656	0 %	0 %	75 %	25 %	436833537
3616	NC_020054	GCC	2	6	182680	182685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833537
3617	NC_020054	CACC	2	8	182686	182693	25 %	0 %	0 %	75 %	436833537
3618	NC_020054	CAGATC	2	12	182696	182707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	436833537
3619	NC_020054	CCGG	2	8	182772	182779	0 %	0 %	50 %	50 %	436833537
3620	NC_020054	GTT	2	6	182804	182809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833537
3621	NC_020054	ATC	2	6	182819	182824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436833537
3622	NC_020054	ACG	2	6	182871	182876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833537
3623	NC_020054	CATCGG	2	12	182893	182904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	436833537
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3626	NC_020054	GTTGG	2	10	182936	182945	0 %	40 %	60 %	0 %	436833537
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3720	NC_020054	GTC	2	6	187383	187388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833539
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3724	NC_020054	TTG	3	9	187777	187785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833539
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3730	NC_020054	CTG	2	6	188286	188291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833539
3731	NC_020054	TGGT	2	8	188350	188357	0 %	50 %	50 %	0 %	436833539
3732	NC_020054	TCG	2	6	188375	188380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833539
3733	NC_020054	CCG	2	6	188413	188418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833539
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3737	NC_020054	GCAT	2	8	188683	188690	25 %	25 %	25 %	25 %	436833539
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3739	NC_020054	GCTG	2	8	188723	188730	0 %	25 %	50 %	25 %	436833539
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3981	NC_020054	CAC	2	6	203595	203600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833548
3982	NC_020054	AGC	2	6	203614	203619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833548
3983	NC_020054	TGA	2	6	203642	203647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436833548
3984	NC_020054	GAC	2	6	203748	203753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833548
3985	NC_020054	A	6	6	203757	203762	100 %	0 %	0 %	0 %	436833548
3986	NC_020054	CAG	3	9	203772	203780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833548
3987	NC_020054	CCG	3	9	203870	203878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436833548
3988	NC_020054	CTT	2	6	203886	203891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436833548
3989	NC_020054	GCA	3	9	203966	203974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833548
3990	NC_020054	GTT	2	6	204015	204020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436833548
3991	NC_020054	GC	3	6	204055	204060	0 %	0 %	50 %	50 %	436833548
3992	NC_020054	ACA	2	6	204200	204205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436833548
3993	NC_020054	CAG	2	6	204249	204254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436833548
3994	NC_020054	A	6	6	204273	204278	100 %	0 %	0 %	0 %	436833548
3995	NC_020054	CCA	2	6	204338	204343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833548
3996	NC_020054	CCGAGC	2	12	204344	204355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	436833548
3997	NC_020054	CCA	2	6	204356	204361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436833548
3998	NC_020054	CGT	2	6	204455	204460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436833548
3999	NC_020054	AGCTC	2	10	204515	204524	20 %	20 %	20 %	40 %	436833548
4000	NC_020054	GCAG	2	8	204548	204555	25 %	0 %	50 %	25 %	436833548

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