MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 32636

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019551	TTAA	2	8	207204	207211	50 %	50 %	0 %	0 %	422938140
3502	NC_019551	AGTT	2	8	207247	207254	25 %	50 %	25 %	0 %	422938140
3503	NC_019551	A	7	7	207282	207288	100 %	0 %	0 %	0 %	422938141
3504	NC_019551	TAT	2	6	207292	207297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938141
3505	NC_019551	TGT	2	6	207320	207325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422938141
3506	NC_019551	TGG	2	6	207371	207376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422938141
3507	NC_019551	A	6	6	207447	207452	100 %	0 %	0 %	0 %	422938141
3508	NC_019551	ATT	2	6	207525	207530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938141
3509	NC_019551	AGC	2	6	207554	207559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938141
3510	NC_019551	TATC	2	8	207562	207569	25 %	50 %	0 %	25 %	422938141
3511	NC_019551	TGA	2	6	207590	207595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938141
3512	NC_019551	TA	3	6	207729	207734	50 %	50 %	0 %	0 %	422938141
3513	NC_019551	ATC	2	6	207775	207780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938141
3514	NC_019551	TAA	2	6	207809	207814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938141
3515	NC_019551	GTG	2	6	207855	207860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422938141
3516	NC_019551	ATT	2	6	207974	207979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938142
3517	NC_019551	TTTAT	2	10	207994	208003	20 %	80 %	0 %	0 %	422938142
3518	NC_019551	AT	3	6	208014	208019	50 %	50 %	0 %	0 %	422938142
3519	NC_019551	T	6	6	208041	208046	0 %	100 %	0 %	0 %	422938142
3520	NC_019551	GCT	2	6	208072	208077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938142
3521	NC_019551	TTA	2	6	208091	208096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938142
3522	NC_019551	AAT	2	6	208143	208148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938142
3523	NC_019551	AGC	2	6	208161	208166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938142
3524	NC_019551	A	6	6	208170	208175	100 %	0 %	0 %	0 %	422938142
3525	NC_019551	T	6	6	208246	208251	0 %	100 %	0 %	0 %	422938142
3526	NC_019551	ATT	2	6	208272	208277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938142
3527	NC_019551	GAT	2	6	208284	208289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938142
3528	NC_019551	ATG	2	6	208330	208335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938142
3529	NC_019551	ATT	2	6	208357	208362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938142
3530	NC_019551	TTA	2	6	208397	208402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938142
3531	NC_019551	TTTA	2	8	208416	208423	25 %	75 %	0 %	0 %	422938142
3532	NC_019551	TGA	2	6	208469	208474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938143
3533	NC_019551	CAG	2	6	208586	208591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938143
3534	NC_019551	GAT	2	6	208609	208614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938143
3535	NC_019551	CAT	2	6	208651	208656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938143
3536	NC_019551	AG	3	6	208672	208677	50 %	0 %	50 %	0 %	422938143
3537	NC_019551	ATA	3	9	208688	208696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938143
3538	NC_019551	TATT	2	8	208721	208728	25 %	75 %	0 %	0 %	422938143
3539	NC_019551	ATG	2	6	208739	208744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938143
3540	NC_019551	TAA	2	6	208748	208753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938143
3541	NC_019551	CAA	2	6	208819	208824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938143
3542	NC_019551	AAG	2	6	208849	208854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938143
3543	NC_019551	TAC	2	6	208861	208866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938143
3544	NC_019551	A	6	6	208867	208872	100 %	0 %	0 %	0 %	422938143
3545	NC_019551	AAAT	2	8	209050	209057	75 %	25 %	0 %	0 %	422938144
3546	NC_019551	ACC	2	6	209168	209173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422938144
3547	NC_019551	AG	3	6	209321	209326	50 %	0 %	50 %	0 %	422938144
3548	NC_019551	GA	3	6	209368	209373	50 %	0 %	50 %	0 %	422938144
3549	NC_019551	ATCAC	2	10	209421	209430	40 %	20 %	0 %	40 %	422938144
3550	NC_019551	GA	3	6	209469	209474	50 %	0 %	50 %	0 %	422938144
3551	NC_019551	AAG	2	6	209508	209513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938144
3552	NC_019551	TTA	2	6	209518	209523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938144
3553	NC_019551	GA	3	6	209556	209561	50 %	0 %	50 %	0 %	422938144
3554	NC_019551	TA	3	6	209648	209653	50 %	50 %	0 %	0 %	422938144
3555	NC_019551	TGA	2	6	209669	209674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3556	NC_019551	CAA	2	6	209689	209694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938144
3557	NC_019551	AGA	2	6	209741	209746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938144
3558	NC_019551	GAT	2	6	209774	209779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3559	NC_019551	TGA	2	6	209819	209824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3560	NC_019551	TGA	2	6	209936	209941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3561	NC_019551	TAGA	2	8	209983	209990	50 %	25 %	25 %	0 %	422938144
3562	NC_019551	AGATA	2	10	210041	210050	60 %	20 %	20 %	0 %	422938144
3563	NC_019551	CTAA	2	8	210111	210118	50 %	25 %	0 %	25 %	422938144
3564	NC_019551	GA	3	6	210230	210235	50 %	0 %	50 %	0 %	422938144
3565	NC_019551	GT	3	6	210248	210253	0 %	50 %	50 %	0 %	422938144
3566	NC_019551	TGG	2	6	210267	210272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	422938144
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3568	NC_019551	TGA	2	6	210362	210367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3569	NC_019551	AAGATG	2	12	210382	210393	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	422938144
3570	NC_019551	CAA	2	6	210481	210486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938144
3571	NC_019551	TCT	3	9	210514	210522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422938144
3572	NC_019551	ATG	3	9	210534	210542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3573	NC_019551	ATGA	2	8	210558	210565	50 %	25 %	25 %	0 %	422938144
3574	NC_019551	ACT	2	6	210705	210710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938144
3575	NC_019551	CTA	2	6	210751	210756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938144
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3577	NC_019551	TGC	2	6	210815	210820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938144
3578	NC_019551	ATG	2	6	210918	210923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3579	NC_019551	TGA	2	6	210929	210934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3580	NC_019551	TACTGC	2	12	210998	211009	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	422938144
3581	NC_019551	AACA	2	8	211052	211059	75 %	0 %	0 %	25 %	422938144
3582	NC_019551	AAT	2	6	211080	211085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938144
3583	NC_019551	GAT	2	6	211128	211133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3584	NC_019551	CAA	2	6	211146	211151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938144
3585	NC_019551	A	7	7	211150	211156	100 %	0 %	0 %	0 %	422938144
3586	NC_019551	TTTAGC	2	12	211196	211207	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	422938144
3587	NC_019551	AG	3	6	211232	211237	50 %	0 %	50 %	0 %	422938144
3588	NC_019551	CAG	2	6	211245	211250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938144
3589	NC_019551	ATG	2	6	211267	211272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938144
3590	NC_019551	TGT	2	6	211364	211369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422938144
3591	NC_019551	AATA	2	8	211505	211512	75 %	25 %	0 %	0 %	422938144
3592	NC_019551	AGA	2	6	211669	211674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938144
3593	NC_019551	TGC	2	6	211721	211726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938144
3594	NC_019551	GAA	2	6	211778	211783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938144
3595	NC_019551	ATTAGT	2	12	211799	211810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	422938144
3596	NC_019551	TGT	2	6	211844	211849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422938145
3597	NC_019551	TTA	2	6	211880	211885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938145
3598	NC_019551	ATA	2	6	211913	211918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938145
3599	NC_019551	CAA	2	6	211949	211954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422938145
3600	NC_019551	TAG	2	6	211964	211969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938145
3601	NC_019551	ATT	2	6	211971	211976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938145
3602	NC_019551	TCT	2	6	212007	212012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422938145
3603	NC_019551	TA	3	6	212026	212031	50 %	50 %	0 %	0 %	422938145
3604	NC_019551	AG	3	6	212127	212132	50 %	0 %	50 %	0 %	422938145
3605	NC_019551	TAT	2	6	212160	212165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938145
3606	NC_019551	AG	4	8	212166	212173	50 %	0 %	50 %	0 %	422938145
3607	NC_019551	GAAGA	2	10	212197	212206	60 %	0 %	40 %	0 %	422938145
3608	NC_019551	AT	3	6	212210	212215	50 %	50 %	0 %	0 %	422938145
3609	NC_019551	ACT	2	6	212216	212221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938145
3610	NC_019551	AAT	2	6	212242	212247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938145
3611	NC_019551	AAT	2	6	212257	212262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422938145
3612	NC_019551	ATG	3	9	212279	212287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938145
3613	NC_019551	AAG	2	6	212289	212294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938145
3614	NC_019551	TCTA	2	8	212307	212314	25 %	50 %	0 %	25 %	422938145
3615	NC_019551	ATAA	2	8	212326	212333	75 %	25 %	0 %	0 %	422938145
3616	NC_019551	GAT	2	6	212335	212340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938145
3617	NC_019551	AGT	2	6	212343	212348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938145
3618	NC_019551	AGC	2	6	212378	212383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422938145
3619	NC_019551	ATT	2	6	212396	212401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422938145
3620	NC_019551	AAG	2	6	212412	212417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938145
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3622	NC_019551	TA	3	6	212454	212459	50 %	50 %	0 %	0 %	422938145
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3988	NC_019551	ATC	2	6	231623	231628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938163
3989	NC_019551	TGC	2	6	231631	231636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938163
3990	NC_019551	GCT	2	6	231674	231679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938163
3991	NC_019551	TGC	2	6	231709	231714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938163
3992	NC_019551	AAG	2	6	231719	231724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938163
3993	NC_019551	AG	3	6	231723	231728	50 %	0 %	50 %	0 %	422938163
3994	NC_019551	AGA	2	6	231794	231799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422938164
3995	NC_019551	ACT	3	9	231868	231876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422938164
3996	NC_019551	ATG	2	6	231929	231934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422938164
3997	NC_019551	TGC	2	6	231936	231941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938164
3998	NC_019551	TGGA	2	8	231952	231959	25 %	25 %	50 %	0 %	422938164
3999	NC_019551	GCAAGA	2	12	231960	231971	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	422938164
4000	NC_019551	CTG	2	6	231992	231997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422938164

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