MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 32636

< Previous12...54555657585960616263646566Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
32501	NC_019551	AT	3	6	1888421	1888426	50 %	50 %	0 %	0 %	422939428
32502	NC_019551	CATT	2	8	1888437	1888444	25 %	50 %	0 %	25 %	422939428
32503	NC_019551	TATATT	2	12	1888458	1888469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939428
32504	NC_019551	TATT	2	8	1888545	1888552	25 %	75 %	0 %	0 %	422939429
32505	NC_019551	TTG	2	6	1888568	1888573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422939429
32506	NC_019551	ATT	2	6	1888602	1888607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939429
32507	NC_019551	CTT	2	6	1888615	1888620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939429
32508	NC_019551	GTTTT	2	10	1888625	1888634	0 %	80 %	20 %	0 %	422939429
32509	NC_019551	ATC	2	6	1888637	1888642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939429
32510	NC_019551	CAG	2	6	1888684	1888689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422939429
32511	NC_019551	CTT	2	6	1888699	1888704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939429
32512	NC_019551	TC	3	6	1888735	1888740	0 %	50 %	0 %	50 %	422939429
32513	NC_019551	TA	4	8	1888786	1888793	50 %	50 %	0 %	0 %	422939429
32514	NC_019551	ATT	2	6	1888832	1888837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939429
32515	NC_019551	ATC	2	6	1888859	1888864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939429
32516	NC_019551	TAC	3	9	1888898	1888906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939429
32517	NC_019551	TTA	2	6	1889005	1889010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939429
32518	NC_019551	TA	3	6	1889116	1889121	50 %	50 %	0 %	0 %	422939429
32519	NC_019551	TTGTT	2	10	1889132	1889141	0 %	80 %	20 %	0 %	422939429
32520	NC_019551	ACC	2	6	1889219	1889224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422939429
32521	NC_019551	CAG	2	6	1889245	1889250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422939429
32522	NC_019551	AGC	2	6	1889252	1889257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422939429
32523	NC_019551	AGC	2	6	1889264	1889269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422939429
32524	NC_019551	TGT	2	6	1889270	1889275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422939429
32525	NC_019551	CCA	2	6	1889304	1889309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422939429
32526	NC_019551	TAT	2	6	1889359	1889364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939429
32527	NC_019551	GCT	2	6	1889385	1889390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422939429
32528	NC_019551	T	7	7	1889408	1889414	0 %	100 %	0 %	0 %	422939429
32529	NC_019551	TAA	2	6	1889467	1889472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939429
32530	NC_019551	AAT	2	6	1889473	1889478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939429
32531	NC_019551	TCT	2	6	1889511	1889516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939429
32532	NC_019551	CAA	2	6	1889533	1889538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422939429
32533	NC_019551	TTG	2	6	1889557	1889562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422939429
32534	NC_019551	TAT	2	6	1889577	1889582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939430
32535	NC_019551	ATT	2	6	1889609	1889614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939430
32536	NC_019551	ATC	2	6	1889653	1889658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939430
32537	NC_019551	TAC	2	6	1889659	1889664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939430
32538	NC_019551	CTA	2	6	1889724	1889729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939430
32539	NC_019551	AT	3	6	1889775	1889780	50 %	50 %	0 %	0 %	422939430
32540	NC_019551	ATT	2	6	1889819	1889824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939430
32541	NC_019551	ACC	2	6	1889845	1889850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422939430
32542	NC_019551	ACCTGG	2	12	1889956	1889967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	422939430
32543	NC_019551	TTTAT	2	10	1889999	1890008	20 %	80 %	0 %	0 %	422939430
32544	NC_019551	TAA	2	6	1890010	1890015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939430
32545	NC_019551	TA	3	6	1890039	1890044	50 %	50 %	0 %	0 %	422939430
32546	NC_019551	TCA	2	6	1890074	1890079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939430
32547	NC_019551	AGAA	2	8	1890093	1890100	75 %	0 %	25 %	0 %	422939430
32548	NC_019551	ATA	2	6	1890119	1890124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939430
32549	NC_019551	TCA	2	6	1890194	1890199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32550	NC_019551	ATC	2	6	1890457	1890462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32551	NC_019551	TATC	2	8	1890509	1890516	25 %	50 %	0 %	25 %	422939431
32552	NC_019551	AGA	2	6	1890524	1890529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422939431
32553	NC_019551	CAT	2	6	1890570	1890575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32554	NC_019551	CTA	2	6	1890588	1890593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32555	NC_019551	CAT	2	6	1890595	1890600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32556	NC_019551	ATCTA	2	10	1890622	1890631	40 %	40 %	0 %	20 %	422939431
32557	NC_019551	CTA	2	6	1890647	1890652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32558	NC_019551	AT	3	6	1890715	1890720	50 %	50 %	0 %	0 %	422939431
32559	NC_019551	CT	3	6	1890758	1890763	0 %	50 %	0 %	50 %	422939431
32560	NC_019551	TA	3	6	1890843	1890848	50 %	50 %	0 %	0 %	422939431
32561	NC_019551	CTT	2	6	1890881	1890886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939431
32562	NC_019551	ACT	2	6	1890893	1890898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939431
32563	NC_019551	AT	3	6	1890903	1890908	50 %	50 %	0 %	0 %	422939431
32564	NC_019551	ACA	2	6	1890941	1890946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422939431
32565	NC_019551	ATT	2	6	1891021	1891026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939431
32566	NC_019551	GCA	2	6	1891043	1891048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422939431
32567	NC_019551	TGA	2	6	1891076	1891081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422939431
32568	NC_019551	ATTT	2	8	1891170	1891177	25 %	75 %	0 %	0 %	422939431
32569	NC_019551	AAC	3	9	1891210	1891218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422939431
32570	NC_019551	AAT	2	6	1891229	1891234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939431
32571	NC_019551	TA	3	6	1891260	1891265	50 %	50 %	0 %	0 %	422939431
32572	NC_019551	T	7	7	1891312	1891318	0 %	100 %	0 %	0 %	422939431
32573	NC_019551	TGA	2	6	1891350	1891355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422939431
32574	NC_019551	TTA	2	6	1891379	1891384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939431
32575	NC_019551	T	7	7	1891405	1891411	0 %	100 %	0 %	0 %	422939431
32576	NC_019551	CTG	2	6	1891551	1891556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422939431
32577	NC_019551	TAA	2	6	1891561	1891566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939431
32578	NC_019551	T	8	8	1891574	1891581	0 %	100 %	0 %	0 %	422939431
32579	NC_019551	ATTT	2	8	1891605	1891612	25 %	75 %	0 %	0 %	422939431
32580	NC_019551	TCT	2	6	1891616	1891621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939431
32581	NC_019551	TAT	2	6	1891632	1891637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939431
32582	NC_019551	T	6	6	1891692	1891697	0 %	100 %	0 %	0 %	422939432
32583	NC_019551	T	6	6	1891818	1891823	0 %	100 %	0 %	0 %	422939432
32584	NC_019551	TTCT	2	8	1891863	1891870	0 %	75 %	0 %	25 %	422939432
32585	NC_019551	CTT	2	6	1891871	1891876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939432
32586	NC_019551	TAA	2	6	1891881	1891886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939432
32587	NC_019551	A	6	6	1891885	1891890	100 %	0 %	0 %	0 %	422939432
32588	NC_019551	TTATAT	2	12	1891898	1891909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939432
32589	NC_019551	ATTA	2	8	1891938	1891945	50 %	50 %	0 %	0 %	422939432
32590	NC_019551	TTG	2	6	1891947	1891952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	422939432
32591	NC_019551	ATT	2	6	1891959	1891964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939432
32592	NC_019551	ATA	2	6	1891975	1891980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939432
32593	NC_019551	T	7	7	1892445	1892451	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32594	NC_019551	TA	4	8	1892479	1892486	50 %	50 %	0 %	0 %	422939433
32595	NC_019551	T	7	7	1892514	1892520	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32596	NC_019551	TCTAAT	2	12	1892526	1892537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	422939433
32597	NC_019551	TTC	2	6	1892555	1892560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939433
32598	NC_019551	TA	3	6	1892567	1892572	50 %	50 %	0 %	0 %	422939433
32599	NC_019551	ATT	2	6	1892577	1892582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939433
32600	NC_019551	T	6	6	1892581	1892586	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32601	NC_019551	AGA	2	6	1892588	1892593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422939433
32602	NC_019551	TAA	2	6	1892597	1892602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	422939433
32603	NC_019551	T	6	6	1892625	1892630	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32604	NC_019551	TTCT	2	8	1892825	1892832	0 %	75 %	0 %	25 %	422939433
32605	NC_019551	CAT	2	6	1892870	1892875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939433
32606	NC_019551	TATAAT	2	12	1892888	1892899	50 %	50 %	0 %	0 %	422939433
32607	NC_019551	ACC	2	6	1892900	1892905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422939433
32608	NC_019551	TAG	2	6	1892941	1892946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422939433
32609	NC_019551	TCT	2	6	1892973	1892978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939433
32610	NC_019551	T	6	6	1892982	1892987	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32611	NC_019551	ACC	2	6	1892999	1893004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422939433
32612	NC_019551	ACC	2	6	1893056	1893061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	422939433
32613	NC_019551	TTTA	2	8	1893092	1893099	25 %	75 %	0 %	0 %	422939433
32614	NC_019551	TC	3	6	1893157	1893162	0 %	50 %	0 %	50 %	422939433
32615	NC_019551	AT	3	6	1893174	1893179	50 %	50 %	0 %	0 %	422939433
32616	NC_019551	AT	3	6	1893256	1893261	50 %	50 %	0 %	0 %	422939433
32617	NC_019551	ATT	2	6	1893273	1893278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939433
32618	NC_019551	ACA	2	6	1893297	1893302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	422939433
32619	NC_019551	TGA	2	6	1893310	1893315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	422939433
32620	NC_019551	TTC	2	6	1893380	1893385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939433
32621	NC_019551	CAG	2	6	1893400	1893405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	422939433
32622	NC_019551	AT	3	6	1893417	1893422	50 %	50 %	0 %	0 %	422939433
32623	NC_019551	T	8	8	1893448	1893455	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32624	NC_019551	A	7	7	1893531	1893537	100 %	0 %	0 %	0 %	422939433
32625	NC_019551	A	6	6	1893540	1893545	100 %	0 %	0 %	0 %	422939433
32626	NC_019551	TTA	2	6	1893585	1893590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939433
32627	NC_019551	CT	3	6	1893597	1893602	0 %	50 %	0 %	50 %	422939433
32628	NC_019551	ACT	2	6	1893606	1893611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939433
32629	NC_019551	CTT	2	6	1893622	1893627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	422939433
32630	NC_019551	T	6	6	1893668	1893673	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433
32631	NC_019551	TCA	2	6	1893687	1893692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939433
32632	NC_019551	ATC	3	9	1893695	1893703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	422939433
32633	NC_019551	GCT	2	6	1893774	1893779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	422939433
32634	NC_019551	GAA	2	6	1893790	1893795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	422939433
32635	NC_019551	ATT	2	6	1893801	1893806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	422939433
32636	NC_019551	T	6	6	1893835	1893840	0 %	100 %	0 %	0 %	422939433

< Previous12...54555657585960616263646566Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.