MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423049751
2	NC_019537	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423049753
3	NC_019537	TAAGAG	2	12	6969	6980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423049759
4	NC_019537	TGGTTT	2	12	7401	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	423049759
5	NC_019537	TAAAGG	2	12	8744	8755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423049761
6	NC_019537	GTTGAT	2	12	9833	9844	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423049763
7	NC_019537	ATTAAG	2	12	14494	14505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423049767
8	NC_019537	GTTTTA	2	12	21417	21428	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049773
9	NC_019537	TCTAGT	2	12	26844	26855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049778
10	NC_019537	CTAAAA	2	12	30404	30415	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423049779
11	NC_019537	TGGTGA	2	12	32390	32401	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423049781
12	NC_019537	ACCAAT	2	12	32426	32437	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	423049781
13	NC_019537	TAAATT	2	12	41552	41563	50 %	50 %	0 %	0 %	423049791
14	NC_019537	TACCAG	2	12	45306	45317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	423049796
15	NC_019537	TAAAAA	2	12	56134	56145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	423049807
16	NC_019537	TTATGT	2	12	57893	57904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049809
17	NC_019537	AAGGAT	2	12	58435	58446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423049809
18	NC_019537	TAAATA	2	12	61367	61378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049813
19	NC_019537	GTTATT	2	12	62929	62940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049814
20	NC_019537	ATCTTT	2	12	80392	80403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423049831
21	NC_019537	TATGAA	2	12	81507	81518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423049832
22	NC_019537	CAGTTA	2	12	84898	84909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423049837
23	NC_019537	TGCAAA	2	12	86190	86201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423049838
24	NC_019537	TCAAAA	2	12	87231	87242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423049839
25	NC_019537	CAGCTT	2	12	87844	87855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	423049839
26	NC_019537	GGACTA	2	12	88569	88580	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	423049839
27	NC_019537	CTTTCT	2	12	90350	90361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	423049840
28	NC_019537	ATATAG	2	12	91502	91513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423049840
29	NC_019537	AATATC	2	12	95464	95475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423049844
30	NC_019537	GTGATT	2	12	95700	95711	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423049844
31	NC_019537	TCCAGC	2	12	97424	97435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	423049845
32	NC_019537	GTTTTA	2	12	100356	100367	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049850
33	NC_019537	AGCTTT	2	12	101774	101785	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049852
34	NC_019537	TTTTGA	2	12	102799	102810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049853
35	NC_019537	TTTATC	2	12	103271	103282	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423049854
36	NC_019537	TAGTAT	2	12	105150	105161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423049855
37	NC_019537	TCATTA	2	12	105693	105704	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423049856
38	NC_019537	GATAAG	2	12	107541	107552	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423049858
39	NC_019537	ATTAAA	2	12	107706	107717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049858
40	NC_019537	CATTTG	2	12	109375	109386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049858
41	NC_019537	CTATTT	2	12	110197	110208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423049858
42	NC_019537	CTTTCA	2	12	112369	112380	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	423049860
43	NC_019537	TCATTA	3	18	113611	113628	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423049861
44	NC_019537	TTTATA	2	12	117269	117280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049863
45	NC_019537	TTTATA	2	12	123470	123481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423049867
46	NC_019537	GTTTTA	2	12	130680	130691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049868
47	NC_019537	ATCAAT	2	12	134338	134349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423049873
48	NC_019537	AATACC	2	12	139163	139174	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	423049874
49	NC_019537	CTGATA	2	12	139429	139440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423049874
50	NC_019537	TTGAGA	2	12	144010	144021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049879
51	NC_019537	TTAGGC	2	12	144867	144878	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	423049879
52	NC_019537	TATTTT	2	12	148105	148116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423049883
53	NC_019537	TAAGTA	2	12	149049	149060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423049885
54	NC_019537	GATCTA	2	12	153017	153028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423049889
55	NC_019537	AAATAT	2	12	155893	155904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423049890
56	NC_019537	ACAGGT	2	12	158070	158081	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	423049893
57	NC_019537	ACTTTT	2	12	158413	158424	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423049894
58	NC_019537	GTTTTA	2	12	159038	159049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049895
59	NC_019537	ACCTTA	2	12	159864	159875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423049898
60	NC_019537	GCCATT	2	12	160529	160540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	423049900
61	NC_019537	ACTGTT	2	12	161932	161943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049901
62	NC_019537	TAATTA	2	12	163555	163566	50 %	50 %	0 %	0 %	423049902
63	NC_019537	ATCAAT	2	12	165191	165202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423049904
64	NC_019537	AAACTT	2	12	165596	165607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423049905
65	NC_019537	TATCAA	2	12	172299	172310	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423049913
66	NC_019537	AATTAT	2	12	172563	172574	50 %	50 %	0 %	0 %	423049913
67	NC_019537	GCTTTG	2	12	176803	176814	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	423049919
68	NC_019537	TAAAAA	2	12	178644	178655	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	423049923
69	NC_019537	TAGCTT	2	12	179318	179329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049924
70	NC_019537	CCAGCT	2	12	180150	180161	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	423049924
71	NC_019537	GACAAA	2	12	180681	180692	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	423049925
72	NC_019537	GTTTTA	2	12	184350	184361	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049931
73	NC_019537	CAAATT	2	12	189732	189743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423049937
74	NC_019537	TTTTAT	2	12	190417	190428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423049938
75	NC_019537	TTAAGT	2	12	191158	191169	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423049938
76	NC_019537	ATTATA	2	12	196429	196440	50 %	50 %	0 %	0 %	423049943
77	NC_019537	CACCAA	2	12	198195	198206	50 %	0 %	0 %	50 %	423049944
78	NC_019537	ACTAGT	2	12	205538	205549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423049953
79	NC_019537	AAGATG	2	12	210072	210083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423049957
80	NC_019537	TACTGC	2	12	210688	210699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	423049957
81	NC_019537	TTTAGC	2	12	210886	210897	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049957
82	NC_019537	ATTAGT	2	12	211489	211500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	423049957
83	NC_019537	TAGCTT	2	12	215494	215505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423049960
84	NC_019537	CATCAC	2	12	218753	218764	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	423049963
85	NC_019537	TTTTGA	2	12	218766	218777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423049963
86	NC_019537	TTATGG	2	12	221813	221824	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423049965
87	NC_019537	ATTTTT	2	12	224104	224115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	423049967
88	NC_019537	TGAAGC	2	12	225066	225077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	423049968
89	NC_019537	AAAGAA	2	12	226171	226182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423049969
90	NC_019537	AAAAGA	2	12	227654	227665	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	423049971
91	NC_019537	TGGTGT	2	12	228683	228694	0 %	50 %	50 %	0 %	423049973
92	NC_019537	GTTTTT	2	12	229383	229394	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	423049973
93	NC_019537	TGAAGT	2	12	231174	231185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423049977
94	NC_019537	GCAAGA	2	12	231650	231661	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	423049978
95	NC_019537	CTGTTG	2	12	232732	232743	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	423049978
96	NC_019537	AGGTTG	2	12	233341	233352	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423049978
97	NC_019537	GTAAAG	2	12	238055	238066	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	423049987
98	NC_019537	TGGGTG	2	12	239605	239616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	423049992
99	NC_019537	TTGGTG	2	12	240734	240745	0 %	50 %	50 %	0 %	423049994
100	NC_019537	GGTATG	2	12	249285	249296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423050007
101	NC_019537	TGATAA	2	12	256219	256230	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423050014
102	NC_019537	AAATGC	2	12	256916	256927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423050015
103	NC_019537	CATTAG	2	12	257353	257364	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423050017
104	NC_019537	CTAAAG	2	12	258182	258193	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423050018
105	NC_019537	ATAACA	2	12	258754	258765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423050019
106	NC_019537	TTTATG	2	12	260514	260525	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050020
107	NC_019537	TGGTGA	2	12	262671	262682	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423050023
108	NC_019537	GCTTTA	2	12	264726	264737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423050025
109	NC_019537	AAAGCC	2	12	267526	267537	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	423050027
110	NC_019537	TTGCCT	2	12	270957	270968	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	423050032
111	NC_019537	TACTAT	2	12	272671	272682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423050033
112	NC_019537	ATTTTA	2	12	272889	272900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	423050034
113	NC_019537	TCTTGT	2	12	276396	276407	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	423050037
114	NC_019537	ATCTAA	2	12	281124	281135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	423050041
115	NC_019537	GCTAAA	2	12	281680	281691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	423050041
116	NC_019537	TGGTAA	2	12	290176	290187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423050051
117	NC_019537	GATTTT	2	12	290999	291010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050051
118	NC_019537	ATGGTA	2	12	292156	292167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423050052
119	NC_019537	TGCTGG	2	12	292196	292207	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	423050052
120	NC_019537	GTTGAG	2	12	294266	294277	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423050053
121	NC_019537	AGTGGT	2	12	294887	294898	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423050053
122	NC_019537	CATTAT	2	12	295530	295541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423050053
123	NC_019537	TGAGAC	2	12	296726	296737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	423050054
124	NC_019537	ACATCC	2	12	296966	296977	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	423050054
125	NC_019537	GTTTTA	2	12	297745	297756	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050056
126	NC_019537	TTGGTT	2	12	306729	306740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	423050070
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128	NC_019537	CTCTAA	2	12	308829	308840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	423050072
129	NC_019537	AAGCAA	2	12	312983	312994	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	423050078
130	NC_019537	GTTTTA	2	12	317182	317193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050083
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141	NC_019537	TGATCG	2	12	343913	343924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	423050114
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149	NC_019537	TAGTGA	2	12	374721	374732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	423050146
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218	NC_019537	TACAGC	2	12	563478	563489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	423050313
219	NC_019537	GTGTTA	2	12	569806	569817	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423050317
220	NC_019537	AGATAA	2	12	572182	572193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	423050318
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223	NC_019537	TTAAAT	2	12	584163	584174	50 %	50 %	0 %	0 %	423050326
224	NC_019537	CTTGAA	2	12	588749	588760	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423050329
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227	NC_019537	CCTATT	2	12	593239	593250	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	423050333
228	NC_019537	GTTTTA	2	12	594047	594058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050334
229	NC_019537	TATGTT	2	12	595454	595465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050336
230	NC_019537	TTGAGG	2	12	611505	611516	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	423050350
231	NC_019537	TTTGCA	2	12	612346	612357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423050351
232	NC_019537	TTGCTA	2	12	613728	613739	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	423050353
233	NC_019537	AGCTAT	2	12	614615	614626	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	423050354
234	NC_019537	ATACTT	3	18	620892	620909	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	423050365
235	NC_019537	GATTTG	2	12	623765	623776	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423050369
236	NC_019537	AAAACT	2	12	624088	624099	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423050369
237	NC_019537	TTTATC	2	12	625203	625214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	423050372
238	NC_019537	TTAATA	2	12	627820	627831	50 %	50 %	0 %	0 %	423050375
239	NC_019537	ATCAGC	2	12	629444	629455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	423050378
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337	NC_019537	CTTTTG	2	12	908494	908505	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	423050639
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340	NC_019537	GTGATT	2	12	919162	919173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	423050649
341	NC_019537	ACCAAT	2	12	922320	922331	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	423050652
342	NC_019537	GATTTT	2	12	923329	923340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	423050653
343	NC_019537	TAACAA	2	12	927531	927542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	423050657
344	NC_019537	TAAATG	2	12	944969	944980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423050674
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346	NC_019537	TTGAAA	2	12	956931	956942	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	423050684
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449	NC_019537	TTTGGT	2	12	1204608	1204619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	423050942
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459	NC_019537	AAATTA	2	12	1225280	1225291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	423050961
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