MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 459

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017461	AAAATT	2	12	1864	1875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
2	NC_017461	ATTCGG	2	12	2193	2204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805052
3	NC_017461	AGCTTC	2	12	2438	2449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385805052
4	NC_017461	TCCTTT	2	12	6599	6610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
5	NC_017461	TCCGCC	2	12	6649	6660	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385805057
6	NC_017461	GACAGC	2	12	11123	11134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805064
7	NC_017461	CCTTAT	2	12	12854	12865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385805066
8	NC_017461	TTCCCC	2	12	16226	16237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805073
9	NC_017461	AGATAG	2	12	18171	18182	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805075
10	NC_017461	CAGATC	2	12	19064	19075	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385805076
11	NC_017461	TCCTCT	2	12	20271	20282	0 %	50 %	0 %	50 %	385805078
12	NC_017461	GAAGAG	2	12	25450	25461	50 %	0 %	50 %	0 %	385805084
13	NC_017461	GGAGAG	2	12	27402	27413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805086
14	NC_017461	GTCATA	2	12	39514	39525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385805099
15	NC_017461	CTGAAG	2	12	39887	39898	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385805099
16	NC_017461	GATCGA	2	12	40212	40223	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385805099
17	NC_017461	TCCCGA	2	12	42112	42123	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385805101
18	NC_017461	GATAGA	2	12	42980	42991	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805101
19	NC_017461	TCAAGA	2	12	44050	44061	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385805102
20	NC_017461	TGGAAT	2	12	51194	51205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805108
21	NC_017461	CATATT	2	12	52263	52274	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385805109
22	NC_017461	CTTTCT	2	12	54044	54055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805111
23	NC_017461	CTTTTC	2	12	54446	54457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805111
24	NC_017461	ATGTAT	2	12	54654	54665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805111
25	NC_017461	TCTCCT	2	12	60526	60537	0 %	50 %	0 %	50 %	385805120
26	NC_017461	GAACTC	2	12	60806	60817	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385805120
27	NC_017461	TCCGGT	2	12	65885	65896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805125
28	NC_017461	CCCTAG	2	12	66264	66275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385805125
29	NC_017461	ATCTTT	2	12	66304	66315	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805125
30	NC_017461	ACCTTG	2	12	67600	67611	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385805127
31	NC_017461	CCTCAG	2	12	69614	69625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385805128
32	NC_017461	CTTAGG	2	12	72704	72715	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805129
33	NC_017461	GGAGAA	2	12	75002	75013	50 %	0 %	50 %	0 %	385805131
34	NC_017461	ATGACC	2	12	77933	77944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385805133
35	NC_017461	CCTCTC	2	12	78487	78498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805133
36	NC_017461	ACCTGG	2	12	79094	79105	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385805134
37	NC_017461	CACGAA	2	12	81829	81840	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385805140
38	NC_017461	TGGTCA	2	12	81999	82010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805140
39	NC_017461	AAGGGA	2	12	83577	83588	50 %	0 %	50 %	0 %	385805141
40	NC_017461	GAAGGC	2	12	88537	88548	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385805146
41	NC_017461	GCTTAT	2	12	100569	100580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385805155
42	NC_017461	TGGATG	2	12	100930	100941	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385805155
43	NC_017461	ATGTGA	2	12	103949	103960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805159
44	NC_017461	ATCTCT	2	12	107665	107676	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385805163
45	NC_017461	GAACAA	2	12	114884	114895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385805173
46	NC_017461	CTCAAG	2	12	126227	126238	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385805185
47	NC_017461	GCCCAA	2	12	128486	128497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385805188
48	NC_017461	ATAATT	2	12	134065	134076	50 %	50 %	0 %	0 %	385805191
49	NC_017461	AAGGAA	2	12	134987	134998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805193
50	NC_017461	AAAGAT	2	12	135068	135079	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385805193
51	NC_017461	AGGAAT	2	12	138332	138343	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805196
52	NC_017461	AATTGT	2	12	140208	140219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805198
53	NC_017461	CTTTGA	2	12	140754	140765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385805198
54	NC_017461	TCTGGA	2	12	143453	143464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805200
55	NC_017461	AATTAG	2	12	146062	146073	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385805203
56	NC_017461	ATTAGA	2	12	147865	147876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385805205
57	NC_017461	TTATCT	2	12	150418	150429	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805209
58	NC_017461	GAATTT	2	12	159960	159971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805220
59	NC_017461	AGGGAG	2	12	163318	163329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805222
60	NC_017461	TTACTT	2	12	164120	164131	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805223
61	NC_017461	TCTGTT	2	12	164815	164826	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385805223
62	NC_017461	CATCTG	2	12	165089	165100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385805223
63	NC_017461	AACATA	2	12	165633	165644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385805223
64	NC_017461	CTTTTT	2	12	170387	170398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385805229
65	NC_017461	TTGGAG	2	12	172938	172949	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385805232
66	NC_017461	TCAAAG	2	12	176791	176802	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385805234
67	NC_017461	GGAATT	2	12	187549	187560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805241
68	NC_017461	ATAGAT	2	12	193050	193061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385805246
69	NC_017461	TCATTT	2	12	195461	195472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805250
70	NC_017461	GAGAAA	2	12	197787	197798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805253
71	NC_017461	TAAATC	2	12	200301	200312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385805257
72	NC_017461	TTCATT	2	12	202292	202303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805259
73	NC_017461	AGGATA	2	12	202612	202623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805259
74	NC_017461	GCCTCC	2	12	205448	205459	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	385805262
75	NC_017461	AAATGA	2	12	206793	206804	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385805264
76	NC_017461	ACCACT	2	12	207102	207113	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385805264
77	NC_017461	TTGCTA	2	12	207779	207790	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385805264
78	NC_017461	AGGCTT	2	12	214022	214033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805268
79	NC_017461	TTCTCT	2	12	219509	219520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805273
80	NC_017461	GTGTTG	2	12	220043	220054	0 %	50 %	50 %	0 %	385805273
81	NC_017461	AATGAA	2	12	221656	221667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385805273
82	NC_017461	TGAAGA	2	12	222127	222138	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805273
83	NC_017461	TGTTAT	2	12	222160	222171	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385805273
84	NC_017461	CTTTTG	2	12	222801	222812	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385805274
85	NC_017461	TAAAGA	2	12	227146	227157	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385805279
86	NC_017461	CTATTG	2	12	236862	236873	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385805291
87	NC_017461	TGAATT	2	12	238425	238436	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805293
88	NC_017461	AATCCT	2	12	244812	244823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805301
89	NC_017461	AAAAAG	2	12	248436	248447	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385805303
90	NC_017461	TAAAAA	2	12	256187	256198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385805311
91	NC_017461	AATAGC	2	12	259420	259431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385805317
92	NC_017461	TAAATA	2	12	266514	266525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805324
93	NC_017461	TTTTCC	2	12	266694	266705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805324
94	NC_017461	TTCAAA	2	12	266938	266949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385805324
95	NC_017461	AGAAAA	2	12	275207	275218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385805336
96	NC_017461	TTTAGA	2	12	276203	276214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805336
97	NC_017461	ATTTTT	2	12	279424	279435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385805339
98	NC_017461	GGAAGG	2	12	288443	288454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805348
99	NC_017461	CAGATG	2	12	289462	289473	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385805348
100	NC_017461	TCATAA	2	12	293851	293862	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385805352
101	NC_017461	ATGTTG	2	12	297962	297973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385805357
102	NC_017461	ATATTG	2	12	302164	302175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805359
103	NC_017461	ATTGCT	2	12	304220	304231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385805361
104	NC_017461	TAAATC	2	12	311732	311743	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385805370
105	NC_017461	AGTTGT	2	12	311883	311894	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385805370
106	NC_017461	ATTTTC	2	12	316599	316610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805375
107	NC_017461	TTCTTT	2	12	316971	316982	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385805376
108	NC_017461	CAATAA	2	12	317030	317041	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385805376
109	NC_017461	CAGTTA	2	12	318764	318775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385805376
110	NC_017461	ATAATT	2	12	318840	318851	50 %	50 %	0 %	0 %	385805376
111	NC_017461	TAGGAA	2	12	322534	322545	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805381
112	NC_017461	ATATTG	2	12	323353	323364	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805382
113	NC_017461	GTTTTT	2	12	324116	324127	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385805383
114	NC_017461	TATCTT	2	12	325742	325753	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805384
115	NC_017461	TTCATT	2	12	333087	333098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385805391
116	NC_017461	TTCTCT	2	12	333974	333985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805393
117	NC_017461	TATAAA	2	12	334345	334356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805393
118	NC_017461	AATAAA	2	12	340059	340070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385805401
119	NC_017461	GTTATA	2	12	345071	345082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385805405
120	NC_017461	TAAAAA	2	12	345498	345509	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385805406
121	NC_017461	CTATAT	2	12	350047	350058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385805411
122	NC_017461	GAATAT	2	12	350468	350479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385805411
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217	NC_017461	TCCAGC	2	12	620633	620644	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385805706
218	NC_017461	CGACAT	2	12	624513	624524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385805708
219	NC_017461	AGAGCC	2	12	625956	625967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805708
220	NC_017461	GGGTTC	2	12	631461	631472	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385805715
221	NC_017461	AACTTC	2	12	634386	634397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805721
222	NC_017461	GCATCA	2	12	642251	642262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385805729
223	NC_017461	ATAGAT	2	12	644010	644021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385805732
224	NC_017461	TTGAGC	2	12	647284	647295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805736
225	NC_017461	CTCCTT	2	12	650560	650571	0 %	50 %	0 %	50 %	385805739
226	NC_017461	AAAGGC	2	12	657242	657253	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385805743
227	NC_017461	TTCTCC	2	12	661585	661596	0 %	50 %	0 %	50 %	385805748
228	NC_017461	ATGCTC	2	12	663609	663620	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385805750
229	NC_017461	TGAGCT	2	12	664523	664534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805751
230	NC_017461	ATATCA	2	12	665112	665123	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385805751
231	NC_017461	CACTTC	2	12	665355	665366	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385805752
232	NC_017461	TAATTC	2	12	669055	669066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385805756
233	NC_017461	GAAGTA	2	12	670457	670468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385805758
234	NC_017461	AAACAG	2	12	671198	671209	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385805759
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236	NC_017461	CTTCCT	2	12	682418	682429	0 %	50 %	0 %	50 %	385805765
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345	NC_017461	ATAGGT	2	12	993578	993589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806080
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347	NC_017461	TGGAGA	2	12	1003974	1003985	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385806090
348	NC_017461	ATGCAA	2	12	1007844	1007855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385806092
349	NC_017461	ATTGTT	2	12	1009455	1009466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385806094
350	NC_017461	GAATAT	2	12	1013071	1013082	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385806098
351	NC_017461	GATTAG	2	12	1017249	1017260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806102
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450	NC_017461	GTCGAT	2	12	1287571	1287582	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385806399
451	NC_017461	GTATCA	2	12	1291115	1291126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385806401
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453	NC_017461	GAGTTG	2	12	1301920	1301931	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385806411
454	NC_017461	TGTACT	2	12	1304936	1304947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385806412
455	NC_017461	ACATGC	2	12	1307900	1307911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385806417
456	NC_017461	CTCTCG	2	12	1312403	1312414	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385806424
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458	NC_017461	TTGAGG	2	12	1314473	1314484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385806426
459	NC_017461	AGAGGA	2	12	1316739	1316750	50 %	0 %	50 %	0 %	385806432