MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis NE061598 chromosome

Total Repeats: 778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017453	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793752
2	NC_017453	TATTTC	2	12	2865	2876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385793754
3	NC_017453	GTTTTA	2	12	8759	8770	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793761
4	NC_017453	TATATC	2	12	12139	12150	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385793766
5	NC_017453	CTGCTT	2	12	14995	15006	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385793769
6	NC_017453	TACTGA	2	12	15161	15172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793769
7	NC_017453	AGATGG	2	12	17260	17271	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385793771
8	NC_017453	TTATAT	2	12	17605	17616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385793771
9	NC_017453	TCAAGA	2	12	18174	18185	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793772
10	NC_017453	GAAGCA	2	12	18399	18410	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793773
11	NC_017453	GAGTAT	2	12	20396	20407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385793774
12	NC_017453	CCAGAT	2	12	20534	20545	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385793774
13	NC_017453	GTAAAG	2	12	21078	21089	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793774
14	NC_017453	CAAATC	2	12	26693	26704	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385793780
15	NC_017453	AGCTAA	2	12	28183	28194	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793781
16	NC_017453	TACTCG	2	12	31972	31983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793785
17	NC_017453	TGGTGC	2	12	35042	35053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385793789
18	NC_017453	TGCAAA	2	12	36102	36113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793790
19	NC_017453	ATATTG	2	12	37563	37574	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793790
20	NC_017453	TAACAT	2	12	40197	40208	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385793793
21	NC_017453	TCAGTC	2	12	40335	40346	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793794
22	NC_017453	TGCAAA	2	12	42368	42379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793795
23	NC_017453	TTGGTA	2	12	43151	43162	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385793796
24	NC_017453	TATTGG	2	12	43839	43850	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385793796
25	NC_017453	TTTTGA	2	12	49219	49230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793800
26	NC_017453	TGAAGA	2	12	49485	49496	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793801
27	NC_017453	GGCAAA	2	12	59218	59229	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793808
28	NC_017453	ATTATG	2	12	59877	59888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793809
29	NC_017453	ATAAAT	2	12	61351	61362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385793812
30	NC_017453	AGGCTA	2	12	61599	61610	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385793813
31	NC_017453	AGCAAG	2	12	66574	66585	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793818
32	NC_017453	GTTAGA	2	12	76306	76317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385793827
33	NC_017453	AAAGCT	2	12	77556	77567	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793829
34	NC_017453	TAAAGC	2	12	77756	77767	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793829
35	NC_017453	ATTATA	2	12	78925	78936	50 %	50 %	0 %	0 %	385793829
36	NC_017453	AAATGC	2	12	79003	79014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793829
37	NC_017453	AGATAC	2	12	81228	81239	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793830
38	NC_017453	GGAGCA	2	12	84354	84365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385793834
39	NC_017453	TTTATA	2	12	85342	85353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385793835
40	NC_017453	TGGTGT	2	12	89522	89533	0 %	50 %	50 %	0 %	385793841
41	NC_017453	ATCCGT	2	12	91047	91058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793841
42	NC_017453	TGATGT	2	12	91487	91498	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385793841
43	NC_017453	AGCTTG	2	12	94444	94455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385793844
44	NC_017453	GTTGAG	2	12	100031	100042	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385793849
45	NC_017453	AAAAAC	2	12	100248	100259	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385793849
46	NC_017453	GCAAAT	2	12	109838	109849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793862
47	NC_017453	CAAATA	2	12	110349	110360	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385793862
48	NC_017453	CAACAT	2	12	111462	111473	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385793862
49	NC_017453	CAATAG	2	12	113573	113584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793863
50	NC_017453	TAAATA	2	12	114260	114271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385793865
51	NC_017453	TGCAGC	2	12	116473	116484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385793867
52	NC_017453	TTATAG	2	12	117938	117949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793868
53	NC_017453	AGATAA	2	12	117960	117971	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385793868
54	NC_017453	GAAAGT	2	12	119567	119578	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793869
55	NC_017453	CTGGTA	2	12	119755	119766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385793869
56	NC_017453	GCAAAT	2	12	127996	128007	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793876
57	NC_017453	TAGGTG	2	12	130909	130920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385793878
58	NC_017453	TAGTGC	2	12	135596	135607	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385793882
59	NC_017453	TTAATA	2	12	142639	142650	50 %	50 %	0 %	0 %	385793889
60	NC_017453	ACTTTG	2	12	144938	144949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385793892
61	NC_017453	ATTGTT	2	12	147519	147530	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793894
62	NC_017453	AGCAAC	2	12	148512	148523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385793896
63	NC_017453	TAGATC	2	12	149475	149486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793896
64	NC_017453	GCTGTT	2	12	154599	154610	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385793903
65	NC_017453	AGAAAA	2	12	155616	155627	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385793905
66	NC_017453	TTGATT	2	12	155884	155895	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793905
67	NC_017453	GGTAAA	2	12	156339	156350	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793905
68	NC_017453	TATATG	2	12	158739	158750	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793905
69	NC_017453	GTTGAG	2	12	159418	159429	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385793906
70	NC_017453	TGCCTA	2	12	169586	169597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793913
71	NC_017453	TGATTT	2	12	172620	172631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793918
72	NC_017453	ATTAAA	2	12	175595	175606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385793920
73	NC_017453	TTTCAT	2	12	177309	177320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385793923
74	NC_017453	GTTTTA	2	12	186400	186411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793931
75	NC_017453	TCCTTG	2	12	192030	192041	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385793938
76	NC_017453	AGCTAT	2	12	192957	192968	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793939
77	NC_017453	TAAAAG	2	12	196739	196750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385793942
78	NC_017453	AAATAA	2	12	197326	197337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385793943
79	NC_017453	TTATGA	2	12	201465	201476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793947
80	NC_017453	ATCAAA	2	12	203990	204001	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385793950
81	NC_017453	GTACAG	2	12	204163	204174	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385793950
82	NC_017453	TATTGA	2	12	208365	208376	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385793953
83	NC_017453	CAAAGT	2	12	208495	208506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793953
84	NC_017453	AAATGC	2	12	211848	211859	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793956
85	NC_017453	ATAGCT	2	12	212994	213005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793957
86	NC_017453	CAGATA	2	12	222548	222559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385793964
87	NC_017453	ATCGTA	2	12	222770	222781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385793965
88	NC_017453	AAGGTA	2	12	222801	222812	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385793965
89	NC_017453	TTGTGT	2	12	226515	226526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385793968
90	NC_017453	GTTGCT	2	12	230180	230191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385793971
91	NC_017453	TCATTA	2	12	231007	231018	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385793972
92	NC_017453	GACAAG	2	12	233970	233981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385793974
93	NC_017453	GTTTTA	2	12	234666	234677	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385793975
94	NC_017453	ACCTTA	2	12	235492	235503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385793978
95	NC_017453	GCCATT	2	12	236158	236169	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385793979
96	NC_017453	ACTGTT	2	12	237561	237572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385793980
97	NC_017453	AATTAT	2	12	239184	239195	50 %	50 %	0 %	0 %	385793981
98	NC_017453	ATCAAT	2	12	240822	240833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385793983
99	NC_017453	TTTGTC	2	12	246963	246974	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385793993
100	NC_017453	AGCTGG	2	12	247494	247505	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385793994
101	NC_017453	AGCCAA	2	12	250838	250849	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385793999
102	NC_017453	ATAATT	2	12	255081	255092	50 %	50 %	0 %	0 %	385794005
103	NC_017453	ATTGAT	2	12	255344	255355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385794005
104	NC_017453	GTTTTA	2	12	259977	259988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385794009
105	NC_017453	TATCAG	2	12	261268	261279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385794012
106	NC_017453	GGTATT	2	12	261534	261545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385794012
107	NC_017453	TTGAGA	2	12	273357	273368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385794021
108	NC_017453	TTAGGC	2	12	274214	274225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385794021
109	NC_017453	TATTTT	2	12	277453	277464	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385794025
110	NC_017453	TAAGTA	2	12	278377	278388	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385794026
111	NC_017453	AAATAT	2	12	284839	284850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385794031
112	NC_017453	ACAGGT	2	12	287007	287018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385794034
113	NC_017453	GTTTTA	2	12	287975	287986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385794036
114	NC_017453	CAAATT	2	12	293355	293366	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385794040
115	NC_017453	TTTTAT	2	12	294040	294051	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385794041
116	NC_017453	TTAAGT	2	12	294781	294792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385794041
117	NC_017453	ATTATA	2	12	300053	300064	50 %	50 %	0 %	0 %	385794046
118	NC_017453	GCTTTA	2	12	300200	300211	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385794046
119	NC_017453	CACCAA	2	12	301820	301831	50 %	0 %	0 %	50 %	385794048
120	NC_017453	ACTAGT	2	12	309262	309273	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385794057
121	NC_017453	AAGATG	2	12	313799	313810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385794061
122	NC_017453	TACTGC	2	12	314415	314426	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385794061
123	NC_017453	TTTAGC	2	12	314613	314624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385794061
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221	NC_017453	TATTAA	2	12	530258	530269	50 %	50 %	0 %	0 %	385794271
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224	NC_017453	TGGTGT	2	12	530828	530839	0 %	50 %	50 %	0 %	385794273
225	NC_017453	AAGATG	2	12	532117	532128	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385794273
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230	NC_017453	TAGATA	2	12	547580	547591	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385794287
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449	NC_017453	TATGCC	2	12	1051224	1051235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385794792
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459	NC_017453	ACCTGC	2	12	1097847	1097858	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385794848
460	NC_017453	AAATCA	2	12	1098066	1098077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385794849
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