MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis TIGB03 chromosome

Total Repeats: 773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016933	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716391
2	NC_016933	TATATC	2	12	12059	12070	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379716395
3	NC_016933	CTGCTT	2	12	14915	14926	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379716398
4	NC_016933	TACTGA	2	12	15081	15092	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716398
5	NC_016933	AGATGG	2	12	17180	17191	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	379716400
6	NC_016933	TTATAT	2	12	17525	17536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379716400
7	NC_016933	TCAAGA	2	12	18094	18105	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716401
8	NC_016933	GAAGCA	2	12	18321	18332	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379716402
9	NC_016933	GAGTAT	2	12	20318	20329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379716403
10	NC_016933	CCAGAT	2	12	20456	20467	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379716403
11	NC_016933	GTAAAG	2	12	21000	21011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379716403
12	NC_016933	CAAATC	2	12	26615	26626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379716408
13	NC_016933	AGCTAA	2	12	28105	28116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716409
14	NC_016933	TACTCG	2	12	31894	31905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379716413
15	NC_016933	TGGTGC	2	12	34964	34975	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379716417
16	NC_016933	TGCAAA	2	12	36024	36035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716418
17	NC_016933	ATATTG	2	12	37485	37496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716418
18	NC_016933	TAACAT	2	12	40119	40130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379716421
19	NC_016933	TCAGTC	2	12	40257	40268	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379716422
20	NC_016933	TGCAAA	2	12	42290	42301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716423
21	NC_016933	TTGGTA	2	12	43073	43084	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379716424
22	NC_016933	TATTGG	2	12	43761	43772	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379716424
23	NC_016933	TTTTGA	2	12	49141	49152	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379716428
24	NC_016933	TGAAGA	2	12	49407	49418	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379716429
25	NC_016933	GGCAAA	2	12	59140	59151	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379716436
26	NC_016933	ATTATG	2	12	59799	59810	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716437
27	NC_016933	ATAAAT	2	12	61273	61284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379716439
28	NC_016933	AGGCTA	2	12	61521	61532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379716440
29	NC_016933	AGCAAG	2	12	66496	66507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379716445
30	NC_016933	GTTAGA	2	12	76228	76239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379716454
31	NC_016933	AAAGCT	2	12	77478	77489	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716456
32	NC_016933	TAAAGC	2	12	77678	77689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716456
33	NC_016933	ATTATA	2	12	78847	78858	50 %	50 %	0 %	0 %	379716456
34	NC_016933	AAATGC	2	12	78925	78936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716456
35	NC_016933	AGATAC	2	12	81150	81161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716457
36	NC_016933	GGAGCA	2	12	84276	84287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	379716461
37	NC_016933	TGGTGT	2	12	89444	89455	0 %	50 %	50 %	0 %	379716466
38	NC_016933	ATCCGT	2	12	90969	90980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379716466
39	NC_016933	TGATGT	2	12	91409	91420	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379716466
40	NC_016933	AGCTTG	2	12	94366	94377	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379716469
41	NC_016933	GTTGAG	2	12	99953	99964	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379716472
42	NC_016933	AAAAAC	2	12	100170	100181	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379716472
43	NC_016933	GCAAAT	2	12	109760	109771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716478
44	NC_016933	CAAATA	2	12	110271	110282	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379716478
45	NC_016933	CAACAT	2	12	111384	111395	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379716478
46	NC_016933	CAATAG	2	12	113495	113506	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716479
47	NC_016933	TAAATA	2	12	114182	114193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379716480
48	NC_016933	TGCAGC	2	12	116395	116406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379716482
49	NC_016933	TTATAG	2	12	117860	117871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716483
50	NC_016933	AGATAA	2	12	117882	117893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379716483
51	NC_016933	GAAAGT	2	12	119489	119500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379716484
52	NC_016933	CTGGTA	2	12	119677	119688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379716484
53	NC_016933	GCAAAT	2	12	127918	127929	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716491
54	NC_016933	TAGGTG	2	12	130831	130842	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379716493
55	NC_016933	TTAATA	2	12	142561	142572	50 %	50 %	0 %	0 %	379716501
56	NC_016933	ACTTTG	2	12	144860	144871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379716502
57	NC_016933	ATTGTT	2	12	147441	147452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379716504
58	NC_016933	AGCAAC	2	12	148434	148445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379716506
59	NC_016933	TAGATC	2	12	149397	149408	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716506
60	NC_016933	GCTGTT	2	12	154521	154532	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379716513
61	NC_016933	AGAAAA	2	12	155538	155549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379716514
62	NC_016933	TTGATT	2	12	155806	155817	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379716514
63	NC_016933	GGTAAA	2	12	156261	156272	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379716514
64	NC_016933	TATATG	2	12	158661	158672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716514
65	NC_016933	GTTGAG	2	12	159340	159351	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379716515
66	NC_016933	TGCCTA	2	12	169508	169519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379716522
67	NC_016933	TGATTT	2	12	172542	172553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379716527
68	NC_016933	ATTAAA	2	12	175517	175528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379716528
69	NC_016933	TTTCAT	2	12	177231	177242	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379716531
70	NC_016933	TCCTTG	2	12	191952	191963	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379716543
71	NC_016933	AGCTAT	2	12	192879	192890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716544
72	NC_016933	TAAAAG	2	12	196661	196672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379716545
73	NC_016933	AAATAA	2	12	197248	197259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379716546
74	NC_016933	TTATGA	2	12	201387	201398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716550
75	NC_016933	ATCAAA	2	12	203912	203923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379716553
76	NC_016933	GTACAG	2	12	204085	204096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379716553
77	NC_016933	TATTGA	2	12	208287	208298	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716556
78	NC_016933	CAAAGT	2	12	208417	208428	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716556
79	NC_016933	AAATGC	2	12	211770	211781	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716559
80	NC_016933	ATAGCT	2	12	212916	212927	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716560
81	NC_016933	CAGATA	2	12	222470	222481	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379716564
82	NC_016933	ATCGTA	2	12	222692	222703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716565
83	NC_016933	AAGGTA	2	12	222723	222734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379716565
84	NC_016933	TTGTGT	2	12	226437	226448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379716568
85	NC_016933	GTTGCT	2	12	230102	230113	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379716571
86	NC_016933	TAGTAT	2	12	230182	230193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716571
87	NC_016933	TCATTA	2	12	230929	230940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379716572
88	NC_016933	GACAAG	2	12	233892	233903	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379716573
89	NC_016933	GCCATT	2	12	236080	236091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379716574
90	NC_016933	ACTGTT	2	12	237483	237494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379716575
91	NC_016933	AATTAT	2	12	239106	239117	50 %	50 %	0 %	0 %	379716576
92	NC_016933	ATCAAT	2	12	240744	240755	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379716578
93	NC_016933	TTTGTC	2	12	246885	246896	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379716585
94	NC_016933	AGCTGG	2	12	247416	247427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379716586
95	NC_016933	AGCCAA	2	12	250760	250771	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379716590
96	NC_016933	ATAATT	2	12	255003	255014	50 %	50 %	0 %	0 %	379716595
97	NC_016933	ATTGAT	2	12	255266	255277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716595
98	NC_016933	TATCAG	2	12	261190	261201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716599
99	NC_016933	GGTATT	2	12	261456	261467	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379716599
100	NC_016933	TTGAGA	2	12	273279	273290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379716606
101	NC_016933	TTAGGC	2	12	274136	274147	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379716606
102	NC_016933	TATTTT	2	12	277375	277386	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379716610
103	NC_016933	TAAGTA	2	12	278299	278310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379716612
104	NC_016933	AAATAT	2	12	284761	284772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379716617
105	NC_016933	ACAGGT	2	12	286929	286940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379716620
106	NC_016933	ACTTTT	2	12	287272	287283	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379716621
107	NC_016933	CAAATT	2	12	293277	293288	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379716624
108	NC_016933	TTTTAT	2	12	293962	293973	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379716625
109	NC_016933	TTAAGT	2	12	294703	294714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716625
110	NC_016933	ATTATA	2	12	299975	299986	50 %	50 %	0 %	0 %	379716630
111	NC_016933	GCTTTA	2	12	300122	300133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379716630
112	NC_016933	CACCAA	2	12	301742	301753	50 %	0 %	0 %	50 %	379716632
113	NC_016933	ACTAGT	2	12	309103	309114	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379716639
114	NC_016933	AAGATG	2	12	313640	313651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379716643
115	NC_016933	TACTGC	2	12	314256	314267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379716643
116	NC_016933	TTTAGC	2	12	314454	314465	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379716643
117	NC_016933	ATTAGT	2	12	315057	315068	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379716643
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119	NC_016933	TAGCTT	2	12	319061	319072	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379716648
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234	NC_016933	TCGAGC	2	12	581552	581563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	379716888
235	NC_016933	TGATTT	2	12	586303	586314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379716892
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459	NC_016933	AGCTGT	2	12	1122088	1122099	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379717362
460	NC_016933	ATACCA	2	12	1122483	1122494	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379717363
461	NC_016933	GTATAA	2	12	1124354	1124365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379717364
462	NC_016933	TATGCC	2	12	1127066	1127077	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379717367
463	NC_016933	TTATAG	2	12	1136382	1136393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379717377
464	NC_016933	GTTTGT	2	12	1136864	1136875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379717377
465	NC_016933	AAAACC	2	12	1140540	1140551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379717379
466	NC_016933	ACCCAT	2	12	1143500	1143511	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379717383
467	NC_016933	CTGATA	2	12	1147607	1147618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379717388
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471	NC_016933	CCTCAT	2	12	1172802	1172813	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379717408
472	NC_016933	ACCTGC	2	12	1173691	1173702	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379717408
473	NC_016933	AAATCA	2	12	1173910	1173921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379717409
474	NC_016933	TTTAAA	2	12	1182318	1182329	50 %	50 %	0 %	0 %	379717417
475	NC_016933	ACTGAT	2	12	1184365	1184376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379717418
476	NC_016933	TATGAC	2	12	1191465	1191476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379717422
477	NC_016933	CATCAG	2	12	1192074	1192085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379717422
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480	NC_016933	GCTCTT	2	12	1198964	1198975	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	379717427
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482	NC_016933	ATTAAG	2	12	1201030	1201041	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379717430
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487	NC_016933	TCTAAC	2	12	1218258	1218269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379717444
488	NC_016933	CTTTTA	2	12	1220710	1220721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379717446
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