MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 1412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016510	AGAATC	2	12	2861	2872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365959087
2	NC_016510	CTTTTG	2	12	6695	6706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	365959092
3	NC_016510	AAATTA	2	12	7579	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959092
4	NC_016510	TTTAGG	2	12	8549	8560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959093
5	NC_016510	ACCGTA	2	12	14786	14797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959101
6	NC_016510	TCGTGG	2	12	16091	16102	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365959103
7	NC_016510	GATTTA	2	12	16407	16418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959103
8	NC_016510	ATTGGT	2	12	16626	16637	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959103
9	NC_016510	ATTGTG	2	12	19447	19458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959105
10	NC_016510	TTTAGG	2	12	22034	22045	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959110
11	NC_016510	AGGTTC	2	12	22109	22120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365959110
12	NC_016510	GATGCT	2	12	26814	26825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365959114
13	NC_016510	AAGTTA	2	12	30880	30891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959115
14	NC_016510	ATTAAT	2	12	30895	30906	50 %	50 %	0 %	0 %	365959115
15	NC_016510	TTAATT	2	12	34657	34668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959119
16	NC_016510	GATAAT	2	12	35066	35077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386262269
17	NC_016510	CACGAT	2	12	36188	36199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959121
18	NC_016510	TAGTTG	2	12	40413	40424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262270
19	NC_016510	TGCACC	2	12	41482	41493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	365959124
20	NC_016510	ATTTAT	2	12	42657	42668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959124
21	NC_016510	AATAGA	2	12	43727	43738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365959125
22	NC_016510	TTTGTA	2	12	43795	43806	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959125
23	NC_016510	ATTGCA	2	12	45618	45629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959127
24	NC_016510	TACATT	2	12	46782	46793	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959127
25	NC_016510	GACTAT	2	12	49483	49494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959128
26	NC_016510	CAGTAA	2	12	49665	49676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365959128
27	NC_016510	TTTTCT	2	12	50611	50622	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	365959129
28	NC_016510	CAAAAT	2	12	51176	51187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959129
29	NC_016510	ACAGAA	2	12	59577	59588	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959135
30	NC_016510	TATTGG	2	12	61379	61390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959137
31	NC_016510	TAAAAC	2	12	63953	63964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959138
32	NC_016510	GATTTT	2	12	64630	64641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959139
33	NC_016510	TGAAGA	2	12	67612	67623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959142
34	NC_016510	AAAAAC	2	12	68166	68177	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365959142
35	NC_016510	CAATTG	2	12	71100	71111	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959144
36	NC_016510	AGAACA	2	12	73359	73370	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959146
37	NC_016510	ATTAGA	2	12	74118	74129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959146
38	NC_016510	AGAAGC	2	12	75000	75011	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365959146
39	NC_016510	GTAGAG	2	12	76657	76668	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	365959148
40	NC_016510	ATCGTC	2	12	77900	77911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365959150
41	NC_016510	TTCCTT	2	12	78419	78430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959151
42	NC_016510	AGGAAC	2	12	79652	79663	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365959152
43	NC_016510	ACAATA	2	12	80306	80317	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959152
44	NC_016510	AGGAGA	2	12	82296	82307	50 %	0 %	50 %	0 %	365959154
45	NC_016510	ACACAA	2	12	83208	83219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365959155
46	NC_016510	ACCCAA	2	12	83690	83701	50 %	0 %	0 %	50 %	365959155
47	NC_016510	AAATAG	3	18	89691	89708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365959159
48	NC_016510	TAAAAT	2	12	89736	89747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959159
49	NC_016510	CTTTAG	2	12	93647	93658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365959161
50	NC_016510	CCTGAA	2	12	105033	105044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959171
51	NC_016510	ATTTTT	2	12	106959	106970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386262272
52	NC_016510	AAAAAC	2	12	108090	108101	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365959173
53	NC_016510	AAAAGA	2	12	112755	112766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959178
54	NC_016510	AAGAAA	2	12	112775	112786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959178
55	NC_016510	TGAAGA	2	12	115067	115078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959181
56	NC_016510	TTTCAA	2	12	117127	117138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959182
57	NC_016510	GCTTGT	2	12	120423	120434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365959186
58	NC_016510	AATTGT	2	12	121421	121432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959186
59	NC_016510	GAAACA	2	12	125352	125363	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959187
60	NC_016510	ATTTTA	2	12	127114	127125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959189
61	NC_016510	AAAAGA	2	12	127478	127489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959189
62	NC_016510	CAAGTC	2	12	128481	128492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959190
63	NC_016510	CAATGC	2	12	128549	128560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959190
64	NC_016510	GATTTC	2	12	133604	133615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365959194
65	NC_016510	AAATTC	2	12	133783	133794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365959194
66	NC_016510	TACTTA	2	12	135789	135800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959196
67	NC_016510	GTATAT	2	12	140569	140580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959201
68	NC_016510	AGAATG	2	12	141584	141595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959202
69	NC_016510	AACGAA	2	12	141596	141607	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959202
70	NC_016510	TAACCA	2	12	142781	142792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959203
71	NC_016510	GCTCCT	2	12	143134	143145	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365959203
72	NC_016510	TCACCA	2	12	146560	146571	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	365959205
73	NC_016510	TTAAAT	2	12	147518	147529	50 %	50 %	0 %	0 %	365959206
74	NC_016510	TTTCCT	2	12	157060	157071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959215
75	NC_016510	TCTAAT	2	12	172723	172734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959216
76	NC_016510	ATTTCT	2	12	173176	173187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365959216
77	NC_016510	TTGTTT	2	12	173568	173579	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	365959217
78	NC_016510	ATTAAA	2	12	173768	173779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959217
79	NC_016510	GATGTT	2	12	176670	176681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959220
80	NC_016510	GTATAG	2	12	177082	177093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959220
81	NC_016510	GATTTT	2	12	180256	180267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959222
82	NC_016510	TATTTT	2	12	181158	181169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	365959223
83	NC_016510	CTAATG	2	12	184318	184329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959226
84	NC_016510	ACAACT	2	12	185386	185397	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959227
85	NC_016510	ATGTAT	2	12	185675	185686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959227
86	NC_016510	AAAATA	2	12	190277	190288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365959232
87	NC_016510	AGGAGA	2	12	192606	192617	50 %	0 %	50 %	0 %	365959234
88	NC_016510	AATTCA	2	12	193810	193821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365959235
89	NC_016510	TGTAAT	2	12	195133	195144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959237
90	NC_016510	AATTAG	2	12	196850	196861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959238
91	NC_016510	GCTGAG	2	12	197512	197523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365959238
92	NC_016510	TTTCTA	2	12	198115	198126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365959239
93	NC_016510	AACAAA	2	12	201673	201684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365959243
94	NC_016510	GCAGAA	2	12	203949	203960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386262276
95	NC_016510	TCAAAA	2	12	203969	203980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262276
96	NC_016510	TGAGTA	2	12	204037	204048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262276
97	NC_016510	AAAAGC	2	12	206981	206992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959247
98	NC_016510	TATAAA	2	12	207297	207308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959247
99	NC_016510	CCTAAA	2	12	210877	210888	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959250
100	NC_016510	TAATTG	2	12	213856	213867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959252
101	NC_016510	TTGTAA	2	12	219673	219684	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959256
102	NC_016510	ATCCAA	2	12	220006	220017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959256
103	NC_016510	GCATCC	2	12	221992	222003	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	365959257
104	NC_016510	AAATTT	2	12	223594	223605	50 %	50 %	0 %	0 %	365959259
105	NC_016510	TAAAAC	2	12	224689	224700	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959260
106	NC_016510	AAAGAA	2	12	234551	234562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959267
107	NC_016510	ATTTAG	2	12	237010	237021	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959269
108	NC_016510	TTTTGG	2	12	239290	239301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365959270
109	NC_016510	TTAATA	2	12	240027	240038	50 %	50 %	0 %	0 %	365959271
110	NC_016510	GTAAGT	2	12	240727	240738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959272
111	NC_016510	AAGAAA	2	12	241529	241540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959272
112	NC_016510	TTTCAT	2	12	247213	247224	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365959277
113	NC_016510	CCAGGA	2	12	255285	255296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365959284
114	NC_016510	AATTCA	2	12	255333	255344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365959284
115	NC_016510	TTTGAA	2	12	262054	262065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959291
116	NC_016510	CTGTTT	2	12	263390	263401	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	365959292
117	NC_016510	TAGAAT	2	12	264383	264394	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959292
118	NC_016510	CTTTTG	2	12	265598	265609	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	365959293
119	NC_016510	TGAAAG	2	12	268254	268265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959295
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