MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Flavobacterium branchiophilum FL-15

Total Repeats: 1598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016001	CTCAAA	2	12	600	611	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347534972
2	NC_016001	GTTAAA	2	12	2601	2612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347534972
3	NC_016001	ACTATT	2	12	3276	3287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347534973
4	NC_016001	TTGTTT	2	12	3854	3865	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347534974
5	NC_016001	TTTGAA	2	12	5805	5816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347534976
6	NC_016001	TTTCAA	2	12	6586	6597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347534976
7	NC_016001	TTTTCA	2	12	7962	7973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347534977
8	NC_016001	TTTTTG	2	12	8030	8041	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347534977
9	NC_016001	TTTCCA	2	12	8313	8324	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347534977
10	NC_016001	AATACT	2	12	8571	8582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347534977
11	NC_016001	TAAAAA	2	12	9649	9660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347534978
12	NC_016001	TCAAAA	2	12	10477	10488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347534978
13	NC_016001	CCAAAC	2	12	11418	11429	50 %	0 %	0 %	50 %	347534978
14	NC_016001	GAACAA	2	12	11495	11506	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347534978
15	NC_016001	CAAAAA	2	12	15326	15337	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347534981
16	NC_016001	AGCAAA	2	12	15445	15456	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347534981
17	NC_016001	ATATTT	2	12	15891	15902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534981
18	NC_016001	AAATAC	2	12	20102	20113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347534984
19	NC_016001	ATTTTT	2	12	20557	20568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347534984
20	NC_016001	TCAGGT	2	12	25042	25053	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347534988
21	NC_016001	ATTCAA	2	12	26807	26818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347534990
22	NC_016001	AAATTA	2	12	28689	28700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534990
23	NC_016001	ATTGAA	2	12	29201	29212	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347534991
24	NC_016001	TATAGA	2	12	29311	29322	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347534991
25	NC_016001	TTTTCT	2	12	31830	31841	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347534993
26	NC_016001	AACGGA	2	12	32868	32879	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347534994
27	NC_016001	GAAAAT	2	12	35585	35596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347534996
28	NC_016001	TTTTGA	2	12	38048	38059	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347534999
29	NC_016001	TTACAG	2	12	39548	39559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347535001
30	NC_016001	TCCAAA	2	12	41614	41625	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347535002
31	NC_016001	GTTTGA	2	12	45328	45339	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347535005
32	NC_016001	AGATTT	2	12	46556	46567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347535006
33	NC_016001	TTTTTG	2	12	49591	49602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535010
34	NC_016001	TTGGTA	2	12	51934	51945	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347535012
35	NC_016001	TATGAT	2	12	53781	53792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347535015
36	NC_016001	AGGCAG	2	12	54634	54645	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347535015
37	NC_016001	TTTTAA	2	12	55287	55298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347535016
38	NC_016001	GGTAAT	2	12	55827	55838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347535016
39	NC_016001	CAATAG	2	12	57657	57668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347535018
40	NC_016001	TAGGTT	2	12	59196	59207	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347535019
41	NC_016001	TTTGAA	2	12	61063	61074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347535021
42	NC_016001	CAGGAT	2	12	61314	61325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347535022
43	NC_016001	GGAATG	2	12	61727	61738	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347535022
44	NC_016001	GAAAAT	2	12	63309	63320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347535024
45	NC_016001	TTAAAC	2	12	64441	64452	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347535025
46	NC_016001	GCCACC	2	12	66713	66724	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	347535029
47	NC_016001	ATTTTC	2	12	66765	66776	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347535030
48	NC_016001	CTTTTT	2	12	67247	67258	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347535031
49	NC_016001	CGATAC	2	12	68241	68252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347535033
50	NC_016001	GATGAA	2	12	72453	72464	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347535036
51	NC_016001	TTCGTC	2	12	73259	73270	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	347535037
52	NC_016001	TTTCCC	2	12	79759	79770	0 %	50 %	0 %	50 %	347535040
53	NC_016001	TTTAAA	2	12	80930	80941	50 %	50 %	0 %	0 %	347535041
54	NC_016001	GAAAAA	2	12	81218	81229	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347535041
55	NC_016001	TCGAAA	2	12	82262	82273	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347535042
56	NC_016001	AGGCGG	2	12	86965	86976	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347535048
57	NC_016001	GAAATT	2	12	89585	89596	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347535050
58	NC_016001	TAGAAT	2	12	90271	90282	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347535050
59	NC_016001	CAAAAC	2	12	94623	94634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347535055
60	NC_016001	TCGAAA	2	12	95029	95040	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347535055
61	NC_016001	ATGCTT	2	12	97724	97735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347535057
62	NC_016001	AAAGGA	2	12	99169	99180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347535057
63	NC_016001	TAGTGT	2	12	102134	102145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347535061
64	NC_016001	ACCAGC	2	12	106940	106951	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347535064
65	NC_016001	TTGTTT	2	12	110768	110779	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535067
66	NC_016001	CGAAAA	2	12	111174	111185	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347535067
67	NC_016001	CTCGCC	2	12	111579	111590	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	347535068
68	NC_016001	TAAGTA	2	12	112547	112558	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347535068
69	NC_016001	AGCCGA	2	12	121234	121245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347535071
70	NC_016001	CTTTTA	2	12	132025	132036	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347535082
71	NC_016001	TGTTTT	2	12	132291	132302	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535082
72	NC_016001	ATCTAA	2	12	137274	137285	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347535085
73	NC_016001	TCAAAA	2	12	138013	138024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347535085
74	NC_016001	TCTGTT	2	12	140894	140905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347535086
75	NC_016001	ATTTCA	2	12	141219	141230	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347535086
76	NC_016001	TGTTCT	2	12	141668	141679	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347535086
77	NC_016001	AATCCT	2	12	142614	142625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347535086
78	NC_016001	AAAACC	2	12	145247	145258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347535088
79	NC_016001	CAAAGG	2	12	146188	146199	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347535088
80	NC_016001	CAAGGT	2	12	152855	152866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347535093
81	NC_016001	TGCAAT	2	12	159835	159846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347535100
82	NC_016001	AGTGGC	2	12	162122	162133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347535101
83	NC_016001	CATCAA	2	12	163547	163558	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347535102
84	NC_016001	AAAAGA	2	12	163645	163656	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347535102
85	NC_016001	TTACAG	2	12	164407	164418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347535103
86	NC_016001	GCTCCT	2	12	164487	164498	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	347535103
87	NC_016001	CTCTAT	2	12	165753	165764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347535104
88	NC_016001	ACCTAA	2	12	170820	170831	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347535109
89	NC_016001	CAATGT	2	12	174496	174507	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347535114
90	NC_016001	TAAAAA	2	12	174518	174529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347535114
91	NC_016001	ACAAAC	2	12	175901	175912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347535114
92	NC_016001	TGAAAA	2	12	176560	176571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347535115
93	NC_016001	CATTTC	2	12	180931	180942	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347535119
94	NC_016001	AATTTG	2	12	181980	181991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347535119
95	NC_016001	ATTCGT	2	12	182616	182627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347535120
96	NC_016001	TGTTTT	2	12	182752	182763	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535121
97	NC_016001	TTGTTT	2	12	182772	182783	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535121
98	NC_016001	CTTTCA	2	12	183712	183723	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347535121
99	NC_016001	GGCTTT	2	12	185486	185497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347535123
100	NC_016001	AATATT	2	12	186648	186659	50 %	50 %	0 %	0 %	347535125
101	NC_016001	TAAACA	2	12	187051	187062	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347535125
102	NC_016001	TCAATT	2	12	188143	188154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347535125
103	NC_016001	TTTTCT	2	12	188519	188530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347535125
104	NC_016001	ATTTTC	2	12	191977	191988	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347535127
105	NC_016001	TATAAA	2	12	193193	193204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347535128
106	NC_016001	ATTTTG	2	12	197586	197597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347535131
107	NC_016001	TTACTA	2	12	201077	201088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347535135
108	NC_016001	AATAGC	2	12	201286	201297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347535135
109	NC_016001	AGGCAA	2	12	201597	201608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347535136
110	NC_016001	GAAATG	2	12	203154	203165	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347535137
111	NC_016001	GATTTT	2	12	204163	204174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347535138
112	NC_016001	AATATG	2	12	205662	205673	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347535139
113	NC_016001	GCAGAA	2	12	207705	207716	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347535139
114	NC_016001	ATAAAA	2	12	208964	208975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347535140
115	NC_016001	CAAAAC	2	12	209012	209023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347535140
116	NC_016001	GCTAGA	2	12	209034	209045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347535140
117	NC_016001	AAAAGT	2	12	209864	209875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347535142
118	NC_016001	GGTTTT	2	12	211916	211927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347535144
119	NC_016001	GCAATC	2	12	217746	217757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347535149
120	NC_016001	ATTGCC	2	12	225866	225877	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347535156
121	NC_016001	TTTTTG	2	12	226517	226528	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535157
122	NC_016001	GCATTA	2	12	226612	226623	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347535157
123	NC_016001	TTTTGT	2	12	228772	228783	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347535158
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139	NC_016001	CCTTGC	2	12	284092	284103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	347535198
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