MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata plasmid pFSYMDG01

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015664	GGA	2	6	389	394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176125
2	NC_015664	CGC	2	6	407	412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
3	NC_015664	GCG	2	6	508	513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
4	NC_015664	CGG	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
5	NC_015664	AGG	2	6	655	660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176125
6	NC_015664	CGG	2	6	863	868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
7	NC_015664	TGC	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
8	NC_015664	TCG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
9	NC_015664	AAC	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176125
10	NC_015664	CGC	2	6	1394	1399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
11	NC_015664	GTC	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
12	NC_015664	CGA	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
13	NC_015664	CGG	2	6	1553	1558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
14	NC_015664	TGC	2	6	1611	1616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176125
15	NC_015664	GGA	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176125
16	NC_015664	CTC	2	6	1677	1682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176125
17	NC_015664	TGG	2	6	2026	2031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176125
18	NC_015664	CGC	2	6	2152	2157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
19	NC_015664	CGG	2	6	2421	2426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
20	NC_015664	CGA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
21	NC_015664	GAC	3	9	2547	2555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
22	NC_015664	CAA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336176125
23	NC_015664	TGA	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176125
24	NC_015664	CGG	2	6	2600	2605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
25	NC_015664	CGG	2	6	2653	2658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
26	NC_015664	AGC	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
27	NC_015664	CCA	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176125
28	NC_015664	CCG	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176125
29	NC_015664	CGG	2	6	3092	3097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
30	NC_015664	CGG	2	6	3174	3179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
31	NC_015664	ACG	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
32	NC_015664	TCA	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176125
33	NC_015664	TAC	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176125
34	NC_015664	GGT	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176125
35	NC_015664	GGC	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
36	NC_015664	GCG	2	6	3828	3833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176125
37	NC_015664	GAC	2	6	3855	3860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
38	NC_015664	TGG	2	6	3874	3879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176125
39	NC_015664	GAC	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176125
40	NC_015664	TCG	2	6	4098	4103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176126
41	NC_015664	GGA	2	6	4124	4129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176126
42	NC_015664	CGG	2	6	4207	4212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176126
43	NC_015664	GCG	2	6	4255	4260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176126
44	NC_015664	TGC	2	6	4384	4389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176126
45	NC_015664	GCA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176126
46	NC_015664	GCC	2	6	5799	5804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176127
47	NC_015664	GCA	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176128
48	NC_015664	GCG	2	6	6145	6150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176128
49	NC_015664	GGT	2	6	6189	6194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176128
50	NC_015664	CGC	2	6	6805	6810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176129
51	NC_015664	TCG	2	6	6947	6952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
52	NC_015664	TCC	2	6	7091	7096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
53	NC_015664	CTT	2	6	7101	7106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176129
54	NC_015664	CGT	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
55	NC_015664	CTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
56	NC_015664	CTT	2	6	7363	7368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176129
57	NC_015664	TGG	2	6	7484	7489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
58	NC_015664	CAC	2	6	7498	7503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176129
59	NC_015664	CTT	2	6	7567	7572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336176129
60	NC_015664	CAC	2	6	7592	7597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176129
61	NC_015664	TCG	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
62	NC_015664	ATG	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176129
63	NC_015664	TCC	2	6	7658	7663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
64	NC_015664	CTG	2	6	7678	7683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
65	NC_015664	CGG	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176129
66	NC_015664	TCG	2	6	7746	7751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
67	NC_015664	GAT	2	6	7858	7863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176129
68	NC_015664	GTG	2	6	7913	7918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
69	NC_015664	GTC	2	6	8029	8034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
70	NC_015664	GGA	2	6	8035	8040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176129
71	NC_015664	GCT	2	6	8172	8177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
72	NC_015664	CTC	2	6	8182	8187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176129
73	NC_015664	CCG	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176129
74	NC_015664	TCA	2	6	8313	8318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336176129
75	NC_015664	GGT	2	6	8422	8427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
76	NC_015664	GCC	2	6	8479	8484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176129
77	NC_015664	GCG	2	6	8495	8500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176129
78	NC_015664	TGC	2	6	8519	8524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176129
79	NC_015664	GGT	2	6	8557	8562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176129
80	NC_015664	GCG	2	6	8607	8612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176129
81	NC_015664	CGA	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176129
82	NC_015664	GAT	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176130
83	NC_015664	GTG	3	9	8832	8840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176130
84	NC_015664	CCG	2	6	8851	8856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176130
85	NC_015664	CGC	2	6	8950	8955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176130
86	NC_015664	TCC	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176130
87	NC_015664	GAC	2	6	8973	8978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176130
88	NC_015664	CAC	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176130
89	NC_015664	CCG	2	6	9028	9033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176130
90	NC_015664	GCC	2	6	9049	9054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176130
91	NC_015664	CGA	3	9	9133	9141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176130
92	NC_015664	ACG	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176130
93	NC_015664	CCA	2	6	9353	9358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176131
94	NC_015664	ACC	2	6	9370	9375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176131
95	NC_015664	ACG	2	6	9433	9438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176131
96	NC_015664	CGG	2	6	9442	9447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176131
97	NC_015664	CGG	2	6	9564	9569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176131
98	NC_015664	CTG	2	6	9617	9622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176131
99	NC_015664	GAT	2	6	9686	9691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176132
100	NC_015664	CGG	2	6	9693	9698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176132
101	NC_015664	TCC	2	6	9846	9851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336176132
102	NC_015664	CGA	2	6	9967	9972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176132
103	NC_015664	CTG	2	6	10100	10105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176132
104	NC_015664	CGT	2	6	10120	10125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176132
105	NC_015664	CCA	2	6	10163	10168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176132
106	NC_015664	CGC	2	6	10178	10183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176132
107	NC_015664	CCG	2	6	10221	10226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176132
108	NC_015664	CGA	2	6	10468	10473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176132
109	NC_015664	CGC	2	6	10620	10625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176133
110	NC_015664	TGG	2	6	10745	10750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336176133
111	NC_015664	AGT	2	6	10782	10787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176133
112	NC_015664	CCG	2	6	10823	10828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176133
113	NC_015664	CAG	2	6	11005	11010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176134
114	NC_015664	CGA	2	6	11016	11021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176134
115	NC_015664	GAT	2	6	11089	11094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176134
116	NC_015664	GTA	2	6	11107	11112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176134
117	NC_015664	CCG	2	6	11495	11500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176135
118	NC_015664	CGG	2	6	11506	11511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176135
119	NC_015664	GAT	2	6	11604	11609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336176135
120	NC_015664	CCA	2	6	11636	11641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176135
121	NC_015664	GAG	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176135
122	NC_015664	GGA	2	6	11786	11791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336176135
123	NC_015664	CAC	2	6	11811	11816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336176135
124	NC_015664	GCG	2	6	11827	11832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176135
125	NC_015664	CGT	2	6	11867	11872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176135
126	NC_015664	CGG	2	6	11918	11923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336176135
127	NC_015664	AGC	2	6	12007	12012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336176135
128	NC_015664	CGT	2	6	12063	12068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336176135
129	NC_015664	CGC	2	6	12077	12082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336176135
130	NC_015664	TGT	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336176135

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.