MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ferroglobus placidus DSM 10642 chromosome

Total Repeats: 28033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013849	AGC	2	6	360	365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930408
2	NC_013849	ACT	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930408
3	NC_013849	CTT	2	6	453	458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930408
4	NC_013849	GAA	2	6	474	479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930408
5	NC_013849	GAG	3	9	731	739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930408
6	NC_013849	CCG	2	6	749	754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288930408
7	NC_013849	AGC	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930408
8	NC_013849	GAC	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930408
9	NC_013849	GCT	2	6	857	862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930408
10	NC_013849	GAA	2	6	961	966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930408
11	NC_013849	GTT	2	6	995	1000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288930408
12	NC_013849	AAT	2	6	1048	1053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930408
13	NC_013849	GAC	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930408
14	NC_013849	AAG	2	6	1124	1129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930408
15	NC_013849	AAT	2	6	1195	1200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930408
16	NC_013849	GAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930408
17	NC_013849	AAG	2	6	1278	1283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930408
18	NC_013849	CGA	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930408
19	NC_013849	CAG	2	6	1426	1431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930409
20	NC_013849	GCT	2	6	1470	1475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930409
21	NC_013849	ACT	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930409
22	NC_013849	ACG	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930409
23	NC_013849	AAC	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288930409
24	NC_013849	CAG	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930409
25	NC_013849	AGG	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930409
26	NC_013849	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930409
27	NC_013849	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930409
28	NC_013849	GAA	2	6	1829	1834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930409
29	NC_013849	CAC	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288930409
30	NC_013849	AGG	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930409
31	NC_013849	GAA	2	6	2005	2010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930409
32	NC_013849	ATT	2	6	2084	2089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288930409
33	NC_013849	TCC	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288930409
34	NC_013849	GGA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930409
35	NC_013849	GAG	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930409
36	NC_013849	GTG	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288930409
37	NC_013849	GAG	2	6	2354	2359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930409
38	NC_013849	CGT	2	6	2463	2468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930410
39	NC_013849	CGA	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930410
40	NC_013849	AGA	2	6	2567	2572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930410
41	NC_013849	GAA	2	6	2578	2583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930410
42	NC_013849	AGG	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930410
43	NC_013849	GCT	2	6	2815	2820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930410
44	NC_013849	GAC	2	6	2830	2835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930410
45	NC_013849	AAG	2	6	2841	2846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930410
46	NC_013849	AAT	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930410
47	NC_013849	GGA	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930410
48	NC_013849	TTA	2	6	2891	2896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288930410
49	NC_013849	CGA	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930410
50	NC_013849	AGG	2	6	3002	3007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930410
51	NC_013849	AAC	2	6	3055	3060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288930410
52	NC_013849	TCC	2	6	3085	3090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288930410
53	NC_013849	TGA	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930410
54	NC_013849	AAT	2	6	3126	3131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930410
55	NC_013849	GGA	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930410
56	NC_013849	TTC	2	6	3284	3289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930410
57	NC_013849	AAT	2	6	3360	3365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930410
58	NC_013849	GTC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930411
59	NC_013849	GAG	2	6	3524	3529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930411
60	NC_013849	CCT	2	6	3537	3542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288930411
61	NC_013849	CCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288930411
62	NC_013849	AGG	2	6	3872	3877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930411
63	NC_013849	GGA	2	6	3941	3946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930411
64	NC_013849	AAG	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930411
65	NC_013849	ACT	2	6	3998	4003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930411
66	NC_013849	TAC	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930411
67	NC_013849	AAT	2	6	4231	4236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930411
68	NC_013849	GGA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930411
69	NC_013849	TAA	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930411
70	NC_013849	GAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930411
71	NC_013849	CGA	2	6	4339	4344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930411
72	NC_013849	TAC	2	6	4391	4396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930411
73	NC_013849	CGA	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930411
74	NC_013849	ACT	2	6	4509	4514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930411
75	NC_013849	GAA	2	6	4577	4582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930411
76	NC_013849	GAT	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930411
77	NC_013849	ACC	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288930411
78	NC_013849	TCT	2	6	4842	4847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930411
79	NC_013849	ATT	2	6	5013	5018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288930412
80	NC_013849	GAG	3	9	5126	5134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930412
81	NC_013849	AGT	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930412
82	NC_013849	TGT	2	6	5156	5161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288930412
83	NC_013849	AGC	2	6	5369	5374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930412
84	NC_013849	AGC	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930412
85	NC_013849	TAG	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930413
86	NC_013849	GAG	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930413
87	NC_013849	CAA	2	6	6174	6179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288930413
88	NC_013849	TCT	2	6	6233	6238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930413
89	NC_013849	TCT	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930413
90	NC_013849	ACG	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930413
91	NC_013849	ATT	2	6	6554	6559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288930413
92	NC_013849	CTG	4	12	6561	6572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930413
93	NC_013849	TCA	2	6	6618	6623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930413
94	NC_013849	CAG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930413
95	NC_013849	ATC	2	6	6849	6854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930414
96	NC_013849	TCG	2	6	6900	6905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930414
97	NC_013849	CGC	2	6	6970	6975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288930414
98	NC_013849	TCG	2	6	7002	7007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930414
99	NC_013849	GCT	3	9	7057	7065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930414
100	NC_013849	TCC	2	6	7067	7072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288930414
101	NC_013849	CAG	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930414
102	NC_013849	CTT	2	6	7140	7145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930414
103	NC_013849	CTG	2	6	7229	7234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930414
104	NC_013849	TCT	2	6	7256	7261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930414
105	NC_013849	TCC	2	6	7297	7302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288930414
106	NC_013849	GTA	2	6	7454	7459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930414
107	NC_013849	TCT	2	6	7507	7512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930414
108	NC_013849	CAA	2	6	7554	7559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288930415
109	NC_013849	CTT	2	6	7589	7594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930415
110	NC_013849	TGT	2	6	7684	7689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288930415
111	NC_013849	TTC	2	6	7691	7696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930415
112	NC_013849	GTA	2	6	8434	8439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930415
113	NC_013849	GTT	2	6	8441	8446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288930415
114	NC_013849	TAA	2	6	8559	8564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930415
115	NC_013849	CGA	2	6	8574	8579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930415
116	NC_013849	CTT	2	6	8694	8699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930415
117	NC_013849	AAT	2	6	8728	8733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930415
118	NC_013849	TTC	2	6	8765	8770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930415
119	NC_013849	TCT	2	6	8852	8857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930416
120	NC_013849	GAG	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930416
121	NC_013849	TAC	2	6	9088	9093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288930416
122	NC_013849	GAG	3	9	9187	9195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930416
123	NC_013849	TCT	2	6	9808	9813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930417
124	NC_013849	AAG	2	6	9856	9861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930417
125	NC_013849	GAA	2	6	9889	9894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930417
126	NC_013849	AGA	2	6	10028	10033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930417
127	NC_013849	CTT	2	6	10098	10103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930418
128	NC_013849	CTT	2	6	10125	10130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930418
129	NC_013849	TTA	2	6	10284	10289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	288930418
130	NC_013849	TTC	2	6	10441	10446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930418
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254	NC_013849	AGG	2	6	20349	20354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930432
255	NC_013849	AGG	2	6	20358	20363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930432
256	NC_013849	CTT	2	6	20411	20416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930432
257	NC_013849	ACG	2	6	20428	20433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930432
258	NC_013849	AAG	2	6	20472	20477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288930432
259	NC_013849	ATA	2	6	20505	20510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930432
260	NC_013849	TAA	2	6	20527	20532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	288930432
261	NC_013849	GTT	2	6	20547	20552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288930432
262	NC_013849	GTT	2	6	20688	20693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288930432
263	NC_013849	TCT	2	6	20729	20734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930432
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270	NC_013849	CTG	2	6	21452	21457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288930433
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280	NC_013849	CGA	2	6	21833	21838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288930433
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287	NC_013849	CTT	2	6	22166	22171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930434
288	NC_013849	CTT	3	9	22244	22252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	288930434
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374	NC_013849	GGA	2	6	30338	30343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288930446
375	NC_013849	CAC	2	6	30367	30372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288930446
376	NC_013849	GAT	2	6	30383	30388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288930446
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