MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. mediasiatica FSC147 chromosome

Total Repeats: 675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010677	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930914
2	NC_010677	AGATAT	2	12	7831	7842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	187930918
3	NC_010677	TCTAGT	2	12	8751	8762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187930919
4	NC_010677	CTAAAA	2	12	12311	12322	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187930920
5	NC_010677	TGGTGA	2	12	14296	14307	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187930922
6	NC_010677	ACCAAT	2	12	14332	14343	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187930922
7	NC_010677	TAAATT	2	12	23460	23471	50 %	50 %	0 %	0 %	187930931
8	NC_010677	TAAAAA	2	12	35858	35869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187930938
9	NC_010677	TTATGT	2	12	37620	37631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187930940
10	NC_010677	AAGGAT	2	12	38162	38173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187930940
11	NC_010677	TAAATA	2	12	41094	41105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187930944
12	NC_010677	GTTATT	2	12	42657	42668	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187930945
13	NC_010677	GCTGGA	2	12	59426	59437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187930959
14	NC_010677	CTATAT	2	12	65414	65425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187930962
15	NC_010677	GAAGCT	2	12	69071	69082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187930963
16	NC_010677	TTTTGA	2	12	69685	69696	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187930963
17	NC_010677	ATTTGC	2	12	70725	70736	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187930964
18	NC_010677	CCAAAA	2	12	72230	72241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187930965
19	NC_010677	ATTCAT	2	12	75369	75380	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	187930969
20	NC_010677	TAAAGA	2	12	76484	76495	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187930970
21	NC_010677	CTGCTT	2	12	86732	86743	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187930975
22	NC_010677	TACTGA	2	12	86898	86909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187930975
23	NC_010677	AGATGG	2	12	88997	89008	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187930977
24	NC_010677	TTATAT	2	12	89342	89353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187930977
25	NC_010677	TCAAGA	2	12	89911	89922	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930978
26	NC_010677	GAAGCA	2	12	90136	90147	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187930979
27	NC_010677	GAGTAT	2	12	92133	92144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187930980
28	NC_010677	CCAGAT	2	12	92271	92282	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187930980
29	NC_010677	GTAAAG	2	12	92815	92826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187930980
30	NC_010677	CAAATC	2	12	98431	98442	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187930984
31	NC_010677	AGCTAA	2	12	99921	99932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930985
32	NC_010677	TACTCG	2	12	103709	103720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187930989
33	NC_010677	TGGTGC	2	12	106779	106790	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	187930993
34	NC_010677	TGCAAA	2	12	107839	107850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930994
35	NC_010677	ATATTG	2	12	109300	109311	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187930994
36	NC_010677	TAACAT	2	12	111934	111945	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187930997
37	NC_010677	TCAGTC	2	12	112072	112083	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187930998
38	NC_010677	TGCAAA	2	12	114105	114116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187930999
39	NC_010677	TTGGTA	2	12	114888	114899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931000
40	NC_010677	TATTGG	2	12	115576	115587	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931000
41	NC_010677	TTTTGA	2	12	120972	120983	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931004
42	NC_010677	TGAAGA	2	12	121238	121249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931005
43	NC_010677	GGCAAA	2	12	130971	130982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187931012
44	NC_010677	ATTATG	2	12	131630	131641	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931013
45	NC_010677	ATAAAT	2	12	133104	133115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187931015
46	NC_010677	AGGCTA	2	12	133352	133363	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	187931016
47	NC_010677	GTTAGA	2	12	148060	148071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187931030
48	NC_010677	AAAGCT	2	12	149310	149321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931032
49	NC_010677	TAAAGC	2	12	149510	149521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931032
50	NC_010677	ATTATA	2	12	150679	150690	50 %	50 %	0 %	0 %	187931032
51	NC_010677	AAATGC	2	12	150757	150768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931032
52	NC_010677	AGATAC	2	12	152982	152993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931033
53	NC_010677	GGAGCA	2	12	156108	156119	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187931037
54	NC_010677	TGGTGT	2	12	161269	161280	0 %	50 %	50 %	0 %	187931041
55	NC_010677	ATCCGT	2	12	162794	162805	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187931041
56	NC_010677	TGATGT	2	12	163234	163245	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931041
57	NC_010677	GCAAAT	2	12	182319	182330	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931049
58	NC_010677	CAAATA	2	12	182830	182841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187931049
59	NC_010677	CAACAT	2	12	183943	183954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187931049
60	NC_010677	TAAATA	2	12	186741	186752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187931051
61	NC_010677	TGCAGC	2	12	188954	188965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187931053
62	NC_010677	TTATAG	2	12	190419	190430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931054
63	NC_010677	AGATAA	2	12	190441	190452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187931054
64	NC_010677	GAAAGT	2	12	192048	192059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931055
65	NC_010677	CTGGTA	2	12	192236	192247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187931055
66	NC_010677	GCAAAT	2	12	200477	200488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187931062
67	NC_010677	TAGGTG	2	12	203393	203404	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187931064
68	NC_010677	TTAATA	2	12	215289	215300	50 %	50 %	0 %	0 %	187931071
69	NC_010677	ACTTTG	2	12	217458	217469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187931072
70	NC_010677	ATTGTT	2	12	220039	220050	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931074
71	NC_010677	CTGTTG	2	12	227123	227134	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187931082
72	NC_010677	AGAAAA	2	12	228139	228150	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187931083
73	NC_010677	TTGATT	2	12	228407	228418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931083
74	NC_010677	GGTAAA	2	12	228862	228873	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931083
75	NC_010677	TATATG	2	12	231262	231273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931083
76	NC_010677	GTTGAG	2	12	231941	231952	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187931084
77	NC_010677	TGCCTA	2	12	242109	242120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	187931091
78	NC_010677	ATTAAA	2	12	248119	248130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187931095
79	NC_010677	TTTCAT	2	12	249823	249834	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	187931098
80	NC_010677	GTAAAG	2	12	267212	267223	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931110
81	NC_010677	TGAATC	2	12	271743	271754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187931114
82	NC_010677	TCATCC	2	12	275195	275206	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187931117
83	NC_010677	GGTGAA	2	12	275923	275934	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	187931118
84	NC_010677	TAGGTT	2	12	280500	280511	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931120
85	NC_010677	ATAACA	2	12	284739	284750	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	187931122
86	NC_010677	ATTTTG	2	12	284901	284912	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931122
87	NC_010677	CAAAAA	2	12	289761	289772	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	187931124
88	NC_010677	AGTTTA	2	12	299131	299142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187931131
89	NC_010677	ACAGCA	2	12	311787	311798	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	187931133
90	NC_010677	AATTCA	2	12	312909	312920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187931135
91	NC_010677	CTTGAT	2	12	314170	314181	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187931135
92	NC_010677	TGGTAC	2	12	317560	317571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187931139
93	NC_010677	GTAACT	2	12	318096	318107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187931140
94	NC_010677	CTTGCT	2	12	323564	323575	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187931145
95	NC_010677	CAACAT	2	12	327001	327012	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187931148
96	NC_010677	GGTATG	2	12	336325	336336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187931151
97	NC_010677	CCTCAA	2	12	338080	338091	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	187931152
98	NC_010677	AGAGCC	2	12	344643	344654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187931159
99	NC_010677	ATCATA	2	12	345931	345942	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187931161
100	NC_010677	ATTTTA	2	12	353405	353416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187931167
101	NC_010677	GAAAAT	2	12	355249	355260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187931168
102	NC_010677	ATAAAA	2	12	355610	355621	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187931168
103	NC_010677	ATGAAG	2	12	359929	359940	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187931170
104	NC_010677	TTTAGT	2	12	363259	363270	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931172
105	NC_010677	TTAGTT	2	12	369515	369526	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931178
106	NC_010677	ATTTTG	2	12	374334	374345	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	187931182
107	NC_010677	CTAAAT	2	12	397096	397107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	187931198
108	NC_010677	AAAAAT	2	12	397518	397529	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	187931198
109	NC_010677	CTCAAA	2	12	398204	398215	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	187931199
110	NC_010677	ATCAGC	2	12	404486	404497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187931202
111	NC_010677	ATCTTG	2	12	405633	405644	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187931203
112	NC_010677	TCATAC	2	12	405770	405781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187931203
113	NC_010677	CTTGAG	2	12	406622	406633	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187931204
114	NC_010677	TCTTGC	2	12	406930	406941	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	187931204
115	NC_010677	TACAGC	2	12	409491	409502	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	187931205
116	NC_010677	GTGTTA	2	12	415819	415830	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	187931209
117	NC_010677	AGATAA	2	12	418199	418210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	187931210
118	NC_010677	CATTAG	2	12	426295	426306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187931212
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229	NC_010677	GCACCA	2	12	712167	712178	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	187931429
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