MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Finegoldia magna ATCC 29328 plasmid pFMC

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010371	TTTCTT	2	12	2257	2268	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823515
2	NC_010371	CATTTC	2	12	2733	2744	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169823516
3	NC_010371	GTATGG	2	12	3574	3585	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	169823516
4	NC_010371	TTTAAA	2	12	9613	9624	50 %	50 %	0 %	0 %	169823521
5	NC_010371	TACATT	2	12	14848	14859	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169823531
6	NC_010371	CTAGTC	2	12	16801	16812	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169823534
7	NC_010371	AGTTTT	2	12	20750	20761	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169823539
8	NC_010371	AACATC	2	12	27668	27679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169823547
9	NC_010371	AATCAA	2	12	29229	29240	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169823550
10	NC_010371	AAACAT	2	12	29701	29712	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169823551
11	NC_010371	AACATC	2	12	30368	30379	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169823551
12	NC_010371	AATCAA	2	12	32254	32265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169823554
13	NC_010371	TCTTTG	2	12	34357	34368	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169823557
14	NC_010371	AACATC	2	12	40312	40323	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	169823561
15	NC_010371	ATCTAA	2	12	42935	42946	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169823563
16	NC_010371	CTAGTC	2	12	44088	44099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	169823566
17	NC_010371	CTAATC	2	12	44166	44177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823566
18	NC_010371	TACATT	2	12	49351	49362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169823574
19	NC_010371	GCCTCT	2	12	52853	52864	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	169823578
20	NC_010371	ACAAAC	2	12	54853	54864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169823581
21	NC_010371	TAAATA	2	12	56631	56642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169823584
22	NC_010371	ATTCAT	2	12	58900	58911	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169823587
23	NC_010371	TAAAAT	2	12	60113	60124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169823589
24	NC_010371	TTTATC	2	12	60135	60146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823589
25	NC_010371	AGACCT	2	12	67983	67994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169823602
26	NC_010371	CATCTT	2	12	68357	68368	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169823603
27	NC_010371	ATTTAT	2	12	69820	69831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169823606
28	NC_010371	TTCATC	2	12	71132	71143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169823608
29	NC_010371	ATTTTT	2	12	71633	71644	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169823609
30	NC_010371	AGAACA	2	12	73396	73407	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169823612
31	NC_010371	TACAAA	2	12	74424	74435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169823613
32	NC_010371	GTATAT	2	12	76939	76950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169823616
33	NC_010371	ATAAAT	2	12	78844	78855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169823618
34	NC_010371	TCTTTC	2	12	78876	78887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169823618
35	NC_010371	TTAATT	2	12	80396	80407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169823619
36	NC_010371	CCTCAT	2	12	81020	81031	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	169823620
37	NC_010371	CAAAAG	2	12	81446	81457	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	169823620
38	NC_010371	TTCTTT	2	12	83443	83454	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823622
39	NC_010371	CATTTG	2	12	83641	83652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169823622
40	NC_010371	GTTTAA	2	12	87721	87732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169823623
41	NC_010371	TTTCCT	2	12	91985	91996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169823625
42	NC_010371	CTTTTG	2	12	93281	93292	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169823626
43	NC_010371	TCAACT	2	12	99081	99092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823633
44	NC_010371	TCAACT	2	12	99432	99443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823633
45	NC_010371	TCAACT	2	12	99783	99794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823633
46	NC_010371	TCAACT	2	12	100134	100145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823633
47	NC_010371	TAAAGA	2	12	101102	101113	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169823633
48	NC_010371	CCATAC	2	12	102707	102718	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	169823635
49	NC_010371	TTTAAA	2	12	103297	103308	50 %	50 %	0 %	0 %	169823636
50	NC_010371	CTTTTT	2	12	103897	103908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823636
51	NC_010371	ACATCT	2	12	104739	104750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823637
52	NC_010371	ATATTA	2	12	105723	105734	50 %	50 %	0 %	0 %	169823637
53	NC_010371	GCTATT	2	12	108640	108651	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	169823640
54	NC_010371	TACTTT	2	12	108789	108800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823640
55	NC_010371	TTCACC	2	12	110517	110528	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	169823640
56	NC_010371	TTACTT	2	12	113525	113536	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823640
57	NC_010371	TAAATC	2	12	115077	115088	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169823640
58	NC_010371	TAAATC	2	12	115143	115154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169823640
59	NC_010371	ATTTTA	2	12	116210	116221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169823640
60	NC_010371	GTCTCT	2	12	117615	117626	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	169823640
61	NC_010371	AAAGTA	2	12	118671	118682	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169823641
62	NC_010371	ATCTAT	2	12	121491	121502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169823645
63	NC_010371	ATAGCC	2	12	122436	122447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	169823646
64	NC_010371	TTAACC	2	12	128571	128582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823652
65	NC_010371	CATAAA	2	12	129218	129229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169823652
66	NC_010371	AAATTC	2	12	129822	129833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169823652
67	NC_010371	CTTAAT	2	12	132766	132777	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	169823655
68	NC_010371	TAGTAT	2	12	132938	132949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	169823656
69	NC_010371	TTTGTT	2	12	135068	135079	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	169823658
70	NC_010371	CCTATA	2	12	136338	136349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823659
71	NC_010371	CTTTTA	2	12	137959	137970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823659
72	NC_010371	TAAAAG	2	12	140374	140385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169823660
73	NC_010371	TGTTTT	2	12	141447	141458	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	169823660
74	NC_010371	AATTAA	2	12	145931	145942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169823662
75	NC_010371	CTTTTA	2	12	147678	147689	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823663
76	NC_010371	TATGTT	2	12	148700	148711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169823664
77	NC_010371	TTCTTT	2	12	149815	149826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823665
78	NC_010371	AAAACA	2	12	150840	150851	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	169823666
79	NC_010371	TTTTTC	2	12	153471	153482	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823669
80	NC_010371	CCAACC	2	12	156653	156664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	169823673
81	NC_010371	AAATCA	2	12	157134	157145	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	169823674
82	NC_010371	CTAATA	2	12	157231	157242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169823674
83	NC_010371	TTGTCT	2	12	157308	157319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169823674
84	NC_010371	TGCTTT	2	12	157376	157387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169823674
85	NC_010371	TTTTTC	2	12	160691	160702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823675
86	NC_010371	ATCTAC	2	12	162084	162095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823677
87	NC_010371	TTTTAT	2	12	162663	162674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169823677
88	NC_010371	CATTTT	2	12	163010	163021	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823677
89	NC_010371	TTTAAT	2	12	163609	163620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169823678
90	NC_010371	GATTTT	2	12	164180	164191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	169823679
91	NC_010371	TTTTTC	2	12	170026	170037	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	169823685
92	NC_010371	TAGAAA	2	12	171519	171530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	169823688
93	NC_010371	TCATAA	2	12	173357	173368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	169823689
94	NC_010371	TAACCT	2	12	175566	175577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169823691
95	NC_010371	TAGGTT	2	12	176232	176243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	169823691
96	NC_010371	CATCTT	2	12	176469	176480	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169823691
97	NC_010371	CCTTTA	2	12	182332	182343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169823692
98	NC_010371	TCTATT	2	12	183085	183096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	169823692
99	NC_010371	TGTTCT	2	12	184660	184671	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	169823692
100	NC_010371	TTTTTA	2	12	184798	184809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169823692
101	NC_010371	TTCCTA	2	12	185585	185596	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	169823694
102	NC_010371	ATTTTT	2	12	187062	187073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	169823695

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.