MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Francisella philomiragia subsp. philomiragia ATCC 25017 chromosome

Total Repeats: 44260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010336	TTC	2	6	552	557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626226
2	NC_010336	T	6	6	589	594	0 %	100 %	0 %	0 %	167626226
3	NC_010336	TA	3	6	638	643	50 %	50 %	0 %	0 %	167626226
4	NC_010336	CT	4	8	648	655	0 %	50 %	0 %	50 %	167626226
5	NC_010336	T	6	6	681	686	0 %	100 %	0 %	0 %	167626226
6	NC_010336	ATC	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626226
7	NC_010336	TC	3	6	729	734	0 %	50 %	0 %	50 %	167626226
8	NC_010336	GTT	2	6	737	742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626226
9	NC_010336	AAC	2	6	765	770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626226
10	NC_010336	CAC	3	9	818	826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626226
11	NC_010336	TC	4	8	877	884	0 %	50 %	0 %	50 %	167626226
12	NC_010336	CTT	2	6	899	904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626226
13	NC_010336	T	7	7	946	952	0 %	100 %	0 %	0 %	167626226
14	NC_010336	ATC	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626226
15	NC_010336	TAG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626226
16	NC_010336	T	6	6	1054	1059	0 %	100 %	0 %	0 %	167626226
17	NC_010336	AAT	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626227
18	NC_010336	TTA	2	6	1323	1328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626227
19	NC_010336	TAC	2	6	1367	1372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
20	NC_010336	TAG	2	6	1399	1404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626227
21	NC_010336	AAT	2	6	1421	1426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626227
22	NC_010336	T	6	6	1479	1484	0 %	100 %	0 %	0 %	167626227
23	NC_010336	GAG	2	6	1528	1533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626227
24	NC_010336	TGC	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626227
25	NC_010336	TTG	2	6	1595	1600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626227
26	NC_010336	TAA	2	6	1624	1629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626227
27	NC_010336	ATT	2	6	1640	1645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626227
28	NC_010336	CAA	2	6	1648	1653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626227
29	NC_010336	CAA	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626227
30	NC_010336	GATG	2	8	1824	1831	25 %	25 %	50 %	0 %	167626227
31	NC_010336	T	6	6	1957	1962	0 %	100 %	0 %	0 %	167626227
32	NC_010336	TAC	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
33	NC_010336	CCA	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167626227
34	NC_010336	TTTTG	2	10	2040	2049	0 %	80 %	20 %	0 %	167626227
35	NC_010336	TAA	2	6	2059	2064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626227
36	NC_010336	GCT	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626227
37	NC_010336	GTA	2	6	2085	2090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626227
38	NC_010336	GTT	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626227
39	NC_010336	TTTG	2	8	2145	2152	0 %	75 %	25 %	0 %	167626227
40	NC_010336	GTT	2	6	2161	2166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626227
41	NC_010336	TGC	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626227
42	NC_010336	GCT	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626227
43	NC_010336	TAC	2	6	2206	2211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
44	NC_010336	T	7	7	2215	2221	0 %	100 %	0 %	0 %	167626227
45	NC_010336	TCA	2	6	2254	2259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
46	NC_010336	ACT	3	9	2309	2317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
47	NC_010336	AAC	2	6	2318	2323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626227
48	NC_010336	GAA	2	6	2356	2361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626227
49	NC_010336	CTGT	2	8	2362	2369	0 %	50 %	25 %	25 %	167626227
50	NC_010336	TCTA	2	8	2492	2499	25 %	50 %	0 %	25 %	167626227
51	NC_010336	CTA	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
52	NC_010336	TTAC	2	8	2586	2593	25 %	50 %	0 %	25 %	167626227
53	NC_010336	ATC	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626227
54	NC_010336	TTC	2	6	2690	2695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626227
55	NC_010336	TGG	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167626227
56	NC_010336	TCC	2	6	2894	2899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167626227
57	NC_010336	TAA	2	6	2918	2923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626227
58	NC_010336	TAT	2	6	2926	2931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626227
59	NC_010336	A	6	6	2936	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	167626227
60	NC_010336	T	6	6	2974	2979	0 %	100 %	0 %	0 %	167626228
61	NC_010336	CT	3	6	2986	2991	0 %	50 %	0 %	50 %	167626228
62	NC_010336	T	8	8	3000	3007	0 %	100 %	0 %	0 %	167626228
63	NC_010336	CTT	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626228
64	NC_010336	CTT	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626228
65	NC_010336	TA	4	8	3086	3093	50 %	50 %	0 %	0 %	167626228
66	NC_010336	ATT	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626228
67	NC_010336	TGT	2	6	3186	3191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626228
68	NC_010336	TTA	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626228
69	NC_010336	CTT	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626228
70	NC_010336	AAC	2	6	3257	3262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626228
71	NC_010336	TGTT	2	8	3269	3276	0 %	75 %	25 %	0 %	167626228
72	NC_010336	T	6	6	3298	3303	0 %	100 %	0 %	0 %	167626228
73	NC_010336	GCA	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626228
74	NC_010336	CTT	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626228
75	NC_010336	AAG	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626228
76	NC_010336	AAT	2	6	3501	3506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626228
77	NC_010336	T	6	6	3619	3624	0 %	100 %	0 %	0 %	167626229
78	NC_010336	ATTT	2	8	3747	3754	25 %	75 %	0 %	0 %	167626229
79	NC_010336	T	7	7	3752	3758	0 %	100 %	0 %	0 %	167626229
80	NC_010336	CTG	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167626229
81	NC_010336	AAT	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626229
82	NC_010336	TCTT	2	8	3929	3936	0 %	75 %	0 %	25 %	167626229
83	NC_010336	AAAT	2	8	4029	4036	75 %	25 %	0 %	0 %	167626229
84	NC_010336	AAT	2	6	4040	4045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626229
85	NC_010336	ATT	2	6	4055	4060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626229
86	NC_010336	TCT	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626229
87	NC_010336	CT	3	6	4156	4161	0 %	50 %	0 %	50 %	167626230
88	NC_010336	T	6	6	4251	4256	0 %	100 %	0 %	0 %	167626230
89	NC_010336	TC	3	6	4309	4314	0 %	50 %	0 %	50 %	167626230
90	NC_010336	AT	3	6	4369	4374	50 %	50 %	0 %	0 %	167626230
91	NC_010336	T	6	6	4400	4405	0 %	100 %	0 %	0 %	167626230
92	NC_010336	AGT	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626230
93	NC_010336	GTTTA	2	10	4518	4527	20 %	60 %	20 %	0 %	167626230
94	NC_010336	AT	3	6	4543	4548	50 %	50 %	0 %	0 %	167626230
95	NC_010336	CT	3	6	4549	4554	0 %	50 %	0 %	50 %	167626230
96	NC_010336	TCA	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626230
97	NC_010336	AG	3	6	4593	4598	50 %	0 %	50 %	0 %	167626230
98	NC_010336	TA	3	6	4650	4655	50 %	50 %	0 %	0 %	167626230
99	NC_010336	GTT	2	6	4661	4666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626230
100	NC_010336	CCT	2	6	4718	4723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167626231
101	NC_010336	ATT	2	6	4893	4898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626231
102	NC_010336	TCA	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626231
103	NC_010336	CAA	2	6	4971	4976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626231
104	NC_010336	ATC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626231
105	NC_010336	GAG	2	6	5060	5065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167626231
106	NC_010336	A	7	7	5104	5110	100 %	0 %	0 %	0 %	167626231
107	NC_010336	ACT	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167626231
108	NC_010336	TACA	2	8	5189	5196	50 %	25 %	0 %	25 %	167626231
109	NC_010336	TA	3	6	5228	5233	50 %	50 %	0 %	0 %	167626231
110	NC_010336	T	6	6	5243	5248	0 %	100 %	0 %	0 %	167626231
111	NC_010336	TA	3	6	5266	5271	50 %	50 %	0 %	0 %	167626231
112	NC_010336	TTC	2	6	5344	5349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626231
113	NC_010336	TA	3	6	5364	5369	50 %	50 %	0 %	0 %	167626231
114	NC_010336	T	6	6	5385	5390	0 %	100 %	0 %	0 %	167626231
115	NC_010336	TCT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167626231
116	NC_010336	CAA	2	6	5510	5515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626231
117	NC_010336	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	167626231
118	NC_010336	GCTA	2	8	5628	5635	25 %	25 %	25 %	25 %	167626231
119	NC_010336	T	6	6	5679	5684	0 %	100 %	0 %	0 %	167626231
120	NC_010336	T	6	6	5690	5695	0 %	100 %	0 %	0 %	167626231
121	NC_010336	AGT	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626231
122	NC_010336	ATA	2	6	5911	5916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626232
123	NC_010336	A	7	7	5987	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	167626232
124	NC_010336	TAT	2	6	6029	6034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626232
125	NC_010336	GAT	2	6	6063	6068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626232
126	NC_010336	AAT	2	6	6107	6112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626232
127	NC_010336	TTG	2	6	6157	6162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167626232
128	NC_010336	AGA	2	6	6207	6212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626232
129	NC_010336	TAA	2	6	6298	6303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626232
130	NC_010336	TACAAA	2	12	6401	6412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	167626232
131	NC_010336	TC	3	6	6460	6465	0 %	50 %	0 %	50 %	167626232
132	NC_010336	TAAA	2	8	6485	6492	75 %	25 %	0 %	0 %	167626232
133	NC_010336	CT	3	6	6493	6498	0 %	50 %	0 %	50 %	167626233
134	NC_010336	TAA	3	9	6512	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626233
135	NC_010336	AT	3	6	6532	6537	50 %	50 %	0 %	0 %	167626233
136	NC_010336	CAG	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167626233
137	NC_010336	T	6	6	6728	6733	0 %	100 %	0 %	0 %	167626233
138	NC_010336	TAT	2	6	6751	6756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626233
139	NC_010336	CAAT	2	8	6780	6787	50 %	25 %	0 %	25 %	167626233
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141	NC_010336	TAT	2	6	6907	6912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167626233
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397	NC_010336	A	6	6	18771	18776	100 %	0 %	0 %	0 %	167626244
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400	NC_010336	ATA	2	6	18839	18844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626244
401	NC_010336	TAA	2	6	18846	18851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626244
402	NC_010336	A	6	6	18926	18931	100 %	0 %	0 %	0 %	167626244
403	NC_010336	TTGGTG	2	12	18945	18956	0 %	50 %	50 %	0 %	167626244
404	NC_010336	AAG	2	6	18972	18977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167626244
405	NC_010336	GAT	2	6	19051	19056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626244
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407	NC_010336	GTA	2	6	19205	19210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626244
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430	NC_010336	TAA	2	6	20326	20331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626245
431	NC_010336	A	8	8	20337	20344	100 %	0 %	0 %	0 %	167626245
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433	NC_010336	A	6	6	20375	20380	100 %	0 %	0 %	0 %	167626245
434	NC_010336	ATA	2	6	20418	20423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167626245
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436	NC_010336	AT	3	6	20476	20481	50 %	50 %	0 %	0 %	167626245
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440	NC_010336	TATG	2	8	20623	20630	25 %	50 %	25 %	0 %	167626245
441	NC_010336	TTTG	2	8	20635	20642	0 %	75 %	25 %	0 %	167626245
442	NC_010336	AT	3	6	20710	20715	50 %	50 %	0 %	0 %	167626245
443	NC_010336	TGA	2	6	20752	20757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167626245
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452	NC_010336	CAA	2	6	21202	21207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626246
453	NC_010336	TTTGAA	2	12	21219	21230	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	167626246
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499	NC_010336	ACA	2	6	22888	22893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167626248
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