MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Frankia sp. EAN1pec chromosome

Total Repeats: 160003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009921	CGG	2	6	147	152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311868
2	NC_009921	CAG	2	6	200	205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311868
3	NC_009921	GCT	2	6	256	261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311868
4	NC_009921	CGC	2	6	262	267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
5	NC_009921	CGG	3	9	433	441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311868
6	NC_009921	GAG	2	6	485	490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
7	NC_009921	CCG	2	6	505	510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
8	NC_009921	CGC	3	9	685	693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
9	NC_009921	CTG	2	6	773	778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311868
10	NC_009921	GGA	2	6	841	846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
11	NC_009921	CGA	2	6	877	882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311868
12	NC_009921	TGG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311868
13	NC_009921	AGG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
14	NC_009921	TTC	2	6	980	985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311868
15	NC_009921	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311868
16	NC_009921	AGC	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311868
17	NC_009921	CGC	2	6	1116	1121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
18	NC_009921	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311868
19	NC_009921	GCC	2	6	1160	1165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
20	NC_009921	TGC	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311868
21	NC_009921	CCG	2	6	1359	1364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311868
22	NC_009921	CAT	2	6	1369	1374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311868
23	NC_009921	GGA	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311868
24	NC_009921	CGG	2	6	1522	1527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311868
25	NC_009921	ATC	2	6	3016	3021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311869
26	NC_009921	CTA	4	12	3105	3116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311869
27	NC_009921	TCT	2	6	3126	3131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158311869
28	NC_009921	GCC	2	6	3250	3255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311869
29	NC_009921	CCG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311869
30	NC_009921	GTC	2	6	3299	3304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311869
31	NC_009921	ACG	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311869
32	NC_009921	GGT	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311869
33	NC_009921	GCG	3	9	3586	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311869
34	NC_009921	GGT	2	6	3596	3601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311869
35	NC_009921	GTC	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311869
36	NC_009921	ACC	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311869
37	NC_009921	CGC	2	6	3772	3777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311869
38	NC_009921	CGA	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311869
39	NC_009921	GAC	2	6	3936	3941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311869
40	NC_009921	GGA	2	6	3943	3948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311869
41	NC_009921	TGC	2	6	4059	4064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
42	NC_009921	CGC	2	6	4093	4098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
43	NC_009921	CGC	2	6	4114	4119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
44	NC_009921	TCG	3	9	4245	4253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
45	NC_009921	TGC	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
46	NC_009921	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311870
47	NC_009921	GCC	2	6	4312	4317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
48	NC_009921	GAC	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311870
49	NC_009921	CGC	2	6	4459	4464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
50	NC_009921	ACC	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311870
51	NC_009921	TGC	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
52	NC_009921	TCG	2	6	4788	4793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
53	NC_009921	ACC	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311870
54	NC_009921	CGG	2	6	4858	4863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311870
55	NC_009921	CGC	2	6	5005	5010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311870
56	NC_009921	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311870
57	NC_009921	CTG	2	6	5087	5092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311870
58	NC_009921	ACG	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
59	NC_009921	TCG	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
60	NC_009921	TGT	2	6	5321	5326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158311871
61	NC_009921	GGA	2	6	5474	5479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311871
62	NC_009921	GCG	3	9	5510	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
63	NC_009921	CGA	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
64	NC_009921	CTG	2	6	5532	5537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
65	NC_009921	GGC	2	6	5558	5563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
66	NC_009921	AGC	2	6	5593	5598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
67	NC_009921	CGG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
68	NC_009921	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311871
69	NC_009921	GCT	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
70	NC_009921	GAG	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158311871
71	NC_009921	CGC	2	6	5765	5770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311871
72	NC_009921	CGG	2	6	5957	5962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
73	NC_009921	CGG	2	6	6074	6079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
74	NC_009921	GCG	2	6	6093	6098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
75	NC_009921	CGG	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
76	NC_009921	CTG	2	6	6189	6194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
77	NC_009921	GAC	2	6	6297	6302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
78	NC_009921	TGC	3	9	6313	6321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311871
79	NC_009921	CGA	2	6	6323	6328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311871
80	NC_009921	CGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311871
81	NC_009921	CGG	2	6	6409	6414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
82	NC_009921	CGG	2	6	6430	6435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311871
83	NC_009921	GGT	2	6	6458	6463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311871
84	NC_009921	GAC	2	6	6750	6755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311872
85	NC_009921	GCG	2	6	6785	6790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311872
86	NC_009921	CGT	2	6	6811	6816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311872
87	NC_009921	CGC	2	6	6867	6872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311872
88	NC_009921	TCG	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311872
89	NC_009921	TGG	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311872
90	NC_009921	CGT	2	6	7143	7148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311872
91	NC_009921	CGG	2	6	7194	7199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311872
92	NC_009921	GGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311872
93	NC_009921	ACG	2	6	7562	7567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
94	NC_009921	CAC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
95	NC_009921	CTG	2	6	7732	7737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
96	NC_009921	CGG	2	6	7743	7748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
97	NC_009921	AAG	2	6	7801	7806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
98	NC_009921	CAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
99	NC_009921	CGG	2	6	7845	7850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
100	NC_009921	GGT	2	6	7882	7887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158311873
101	NC_009921	CGT	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
102	NC_009921	GAA	2	6	8025	8030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
103	NC_009921	ACC	2	6	8077	8082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
104	NC_009921	GGC	2	6	8193	8198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
105	NC_009921	TCG	2	6	8246	8251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
106	NC_009921	GCC	2	6	8431	8436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311873
107	NC_009921	CCT	2	6	8475	8480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158311873
108	NC_009921	GAA	2	6	8502	8507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
109	NC_009921	CGA	2	6	8511	8516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
110	NC_009921	CGA	2	6	8529	8534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
111	NC_009921	ATC	2	6	8557	8562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158311873
112	NC_009921	AAG	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
113	NC_009921	CGC	2	6	8742	8747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311873
114	NC_009921	CGG	2	6	8787	8792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158311873
115	NC_009921	TCG	2	6	8858	8863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
116	NC_009921	GAA	2	6	8979	8984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158311873
117	NC_009921	ACG	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
118	NC_009921	CTG	2	6	9115	9120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
119	NC_009921	CTG	2	6	9127	9132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
120	NC_009921	TCG	2	6	9152	9157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311873
121	NC_009921	ACC	2	6	9355	9360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311873
122	NC_009921	CGA	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
123	NC_009921	CGC	2	6	9405	9410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311873
124	NC_009921	CGA	2	6	9417	9422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311873
125	NC_009921	TCG	2	6	9811	9816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
126	NC_009921	ACG	2	6	9883	9888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158311874
127	NC_009921	CGT	2	6	9929	9934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
128	NC_009921	ACC	2	6	9955	9960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311874
129	NC_009921	TGC	2	6	10126	10131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158311874
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133	NC_009921	ACC	2	6	10321	10326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158311874
134	NC_009921	CCG	2	6	10336	10341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158311874
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