MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Flavobacterium psychrophilum JIP02/86 complete genome

Total Repeats: 58791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009613	A	6	6	568	573	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
2	NC_009613	A	7	7	580	586	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
3	NC_009613	CAA	2	6	600	605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026517
4	NC_009613	ACT	2	6	667	672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026517
5	NC_009613	GAT	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
6	NC_009613	A	7	7	735	741	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
7	NC_009613	TAG	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
8	NC_009613	TTTG	2	8	839	846	0 %	75 %	25 %	0 %	150026517
9	NC_009613	TACC	2	8	873	880	25 %	25 %	0 %	50 %	150026517
10	NC_009613	ACA	2	6	930	935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026517
11	NC_009613	GAA	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
12	NC_009613	CAA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026517
13	NC_009613	TGT	2	6	1114	1119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026517
14	NC_009613	A	6	6	1145	1150	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
15	NC_009613	AACAC	2	10	1200	1209	60 %	0 %	0 %	40 %	150026517
16	NC_009613	GTAGAA	2	12	1259	1270	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	150026517
17	NC_009613	A	6	6	1281	1286	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
18	NC_009613	TGA	2	6	1381	1386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
19	NC_009613	A	6	6	1400	1405	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
20	NC_009613	AAG	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
21	NC_009613	TAG	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
22	NC_009613	GAA	2	6	1586	1591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
23	NC_009613	GAA	2	6	1656	1661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
24	NC_009613	GAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
25	NC_009613	AT	3	6	1705	1710	50 %	50 %	0 %	0 %	150026517
26	NC_009613	ACAAT	2	10	1725	1734	60 %	20 %	0 %	20 %	150026517
27	NC_009613	TA	3	6	1766	1771	50 %	50 %	0 %	0 %	150026517
28	NC_009613	GCT	2	6	1790	1795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026517
29	NC_009613	ATGA	2	8	1841	1848	50 %	25 %	25 %	0 %	150026517
30	NC_009613	ATC	2	6	1944	1949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026517
31	NC_009613	AGA	2	6	1954	1959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
32	NC_009613	TTGC	2	8	1967	1974	0 %	50 %	25 %	25 %	150026517
33	NC_009613	AT	3	6	1993	1998	50 %	50 %	0 %	0 %	150026517
34	NC_009613	TTTA	2	8	2018	2025	25 %	75 %	0 %	0 %	150026517
35	NC_009613	ACG	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026517
36	NC_009613	ATT	3	9	2259	2267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026517
37	NC_009613	TCG	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150026517
38	NC_009613	TTG	2	6	2318	2323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	150026517
39	NC_009613	TTTA	2	8	2328	2335	25 %	75 %	0 %	0 %	150026517
40	NC_009613	GAT	2	6	2576	2581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
41	NC_009613	TAG	2	6	2613	2618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026517
42	NC_009613	GTAAAA	2	12	2663	2674	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	150026517
43	NC_009613	A	6	6	2671	2676	100 %	0 %	0 %	0 %	150026517
44	NC_009613	GAA	2	6	2689	2694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026517
45	NC_009613	T	6	6	2710	2715	0 %	100 %	0 %	0 %	150026517
46	NC_009613	AAT	3	9	2724	2732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026517
47	NC_009613	A	6	6	2740	2745	100 %	0 %	0 %	0 %	150026518
48	NC_009613	TAG	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
49	NC_009613	TAATT	2	10	2775	2784	40 %	60 %	0 %	0 %	150026518
50	NC_009613	A	6	6	2799	2804	100 %	0 %	0 %	0 %	150026518
51	NC_009613	TTA	2	6	2816	2821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026518
52	NC_009613	AAAAT	2	10	2870	2879	80 %	20 %	0 %	0 %	150026518
53	NC_009613	AAT	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026518
54	NC_009613	T	6	6	2961	2966	0 %	100 %	0 %	0 %	150026518
55	NC_009613	GAT	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
56	NC_009613	TAG	2	6	2981	2986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
57	NC_009613	AAG	2	6	3089	3094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026518
58	NC_009613	ATC	2	6	3141	3146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026518
59	NC_009613	TAT	2	6	3156	3161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026518
60	NC_009613	AGG	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026518
61	NC_009613	AGG	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026518
62	NC_009613	AT	4	8	3281	3288	50 %	50 %	0 %	0 %	150026518
63	NC_009613	TAG	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026518
64	NC_009613	TGG	2	6	3321	3326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150026518
65	NC_009613	ATA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026518
66	NC_009613	AT	3	6	3525	3530	50 %	50 %	0 %	0 %	150026519
67	NC_009613	T	8	8	3584	3591	0 %	100 %	0 %	0 %	150026519
68	NC_009613	T	8	8	3668	3675	0 %	100 %	0 %	0 %	150026519
69	NC_009613	GAC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026519
70	NC_009613	ATT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
71	NC_009613	TAT	3	9	3753	3761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
72	NC_009613	T	6	6	3784	3789	0 %	100 %	0 %	0 %	150026519
73	NC_009613	CA	3	6	3803	3808	50 %	0 %	0 %	50 %	150026519
74	NC_009613	AGC	2	6	3810	3815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026519
75	NC_009613	GAG	2	6	3820	3825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026519
76	NC_009613	AGT	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026519
77	NC_009613	AATT	2	8	3836	3843	50 %	50 %	0 %	0 %	150026519
78	NC_009613	AAGA	2	8	3844	3851	75 %	0 %	25 %	0 %	150026519
79	NC_009613	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	150026519
80	NC_009613	TTA	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
81	NC_009613	T	6	6	3979	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	150026519
82	NC_009613	TACT	2	8	3995	4002	25 %	50 %	0 %	25 %	150026519
83	NC_009613	AT	3	6	4016	4021	50 %	50 %	0 %	0 %	150026519
84	NC_009613	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026519
85	NC_009613	A	7	7	4084	4090	100 %	0 %	0 %	0 %	150026519
86	NC_009613	AGT	2	6	4093	4098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026519
87	NC_009613	ATTA	2	8	4104	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	150026519
88	NC_009613	CT	3	6	4129	4134	0 %	50 %	0 %	50 %	150026519
89	NC_009613	GGTT	2	8	4138	4145	0 %	50 %	50 %	0 %	150026519
90	NC_009613	AGT	2	6	4196	4201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026519
91	NC_009613	TTC	2	6	4434	4439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026520
92	NC_009613	CAC	2	6	4466	4471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150026520
93	NC_009613	AGG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026520
94	NC_009613	ATTTA	2	10	4482	4491	40 %	60 %	0 %	0 %	150026520
95	NC_009613	AAT	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026520
96	NC_009613	TAA	2	6	4569	4574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026520
97	NC_009613	CGAA	2	8	4578	4585	50 %	0 %	25 %	25 %	150026520
98	NC_009613	TCT	2	6	4594	4599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026520
99	NC_009613	ATG	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026520
100	NC_009613	TCT	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026520
101	NC_009613	AAC	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026520
102	NC_009613	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	150026520
103	NC_009613	TAA	2	6	4769	4774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150026520
104	NC_009613	GAA	2	6	4894	4899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
105	NC_009613	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
106	NC_009613	CCA	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	150026521
107	NC_009613	TTAC	2	8	4998	5005	25 %	50 %	0 %	25 %	150026521
108	NC_009613	CGA	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150026521
109	NC_009613	AGA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
110	NC_009613	AGA	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
111	NC_009613	AGA	2	6	5166	5171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
112	NC_009613	ATT	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026521
113	NC_009613	TA	3	6	5242	5247	50 %	50 %	0 %	0 %	150026521
114	NC_009613	TCA	2	6	5260	5265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026521
115	NC_009613	GAA	2	6	5380	5385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
116	NC_009613	AC	3	6	5389	5394	50 %	0 %	0 %	50 %	150026521
117	NC_009613	TCT	2	6	5419	5424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150026521
118	NC_009613	CAT	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	150026521
119	NC_009613	TA	3	6	5542	5547	50 %	50 %	0 %	0 %	150026521
120	NC_009613	AT	3	6	5623	5628	50 %	50 %	0 %	0 %	150026521
121	NC_009613	ACA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026521
122	NC_009613	ACCAA	2	10	5646	5655	60 %	0 %	0 %	40 %	150026521
123	NC_009613	TGAATT	2	12	5672	5683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	150026521
124	NC_009613	GAT	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	150026521
125	NC_009613	CAA	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	150026521
126	NC_009613	GCC	2	6	5780	5785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	150026521
127	NC_009613	AGA	2	6	5970	5975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
128	NC_009613	AAG	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
129	NC_009613	TA	4	8	6047	6054	50 %	50 %	0 %	0 %	150026521
130	NC_009613	AGA	2	6	6060	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150026521
131	NC_009613	T	6	6	6091	6096	0 %	100 %	0 %	0 %	150026521
132	NC_009613	A	6	6	6126	6131	100 %	0 %	0 %	0 %	150026521
133	NC_009613	TAT	2	6	6138	6143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150026521
134	NC_009613	AAGCGG	2	12	6219	6230	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	150026521
135	NC_009613	GGA	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	150026521
136	NC_009613	A	6	6	6559	6564	100 %	0 %	0 %	0 %	150026521
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393	NC_009613	ATT	2	6	18181	18186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024118
394	NC_009613	TTC	2	6	18349	18354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	150024118
395	NC_009613	A	6	6	18370	18375	100 %	0 %	0 %	0 %	150024118
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398	NC_009613	TTA	2	6	18661	18666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	150024119
399	NC_009613	GCA	2	6	18667	18672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	150024119
400	NC_009613	AAT	2	6	18684	18689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024119
401	NC_009613	A	7	7	18700	18706	100 %	0 %	0 %	0 %	150024119
402	NC_009613	A	6	6	18746	18751	100 %	0 %	0 %	0 %	150024119
403	NC_009613	AGA	2	6	18855	18860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	150024119
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420	NC_009613	CTG	2	6	20293	20298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	150024120
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424	NC_009613	TGG	2	6	20429	20434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	150024120
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490	NC_009613	AAT	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	150024121
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