MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Fusobacterium nucleatum subsp. polymorphum ATCC 10953 plasmid pFN3

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009506	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
2	NC_009506	A	6	6	1321	1326	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
3	NC_009506	GAT	3	9	1327	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
4	NC_009506	TTA	2	6	1358	1363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
5	NC_009506	TAC	2	6	1397	1402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148557804
6	NC_009506	A	7	7	1437	1443	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
7	NC_009506	ATA	2	6	1445	1450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
8	NC_009506	TAA	2	6	1454	1459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
9	NC_009506	AGA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
10	NC_009506	A	7	7	1512	1518	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
11	NC_009506	T	6	6	1542	1547	0 %	100 %	0 %	0 %	148557804
12	NC_009506	TAAAA	2	10	1554	1563	80 %	20 %	0 %	0 %	148557804
13	NC_009506	ACA	2	6	1613	1618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557804
14	NC_009506	AT	3	6	1692	1697	50 %	50 %	0 %	0 %	148557804
15	NC_009506	TTC	2	6	1751	1756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
16	NC_009506	AATG	2	8	1764	1771	50 %	25 %	25 %	0 %	148557804
17	NC_009506	TAAA	2	8	1796	1803	75 %	25 %	0 %	0 %	148557804
18	NC_009506	AGA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
19	NC_009506	AGT	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
20	NC_009506	A	6	6	1932	1937	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
21	NC_009506	TAA	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
22	NC_009506	A	6	6	1996	2001	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
23	NC_009506	AGA	3	9	2013	2021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
24	NC_009506	ATA	2	6	2044	2049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557804
25	NC_009506	GAA	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
26	NC_009506	A	7	7	2106	2112	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
27	NC_009506	A	7	7	2156	2162	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
28	NC_009506	GAA	2	6	2197	2202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
29	NC_009506	GAT	3	9	2242	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
30	NC_009506	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
31	NC_009506	AGA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
32	NC_009506	AACTT	2	10	2303	2312	40 %	40 %	0 %	20 %	148557804
33	NC_009506	AGA	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
34	NC_009506	AG	3	6	2330	2335	50 %	0 %	50 %	0 %	148557804
35	NC_009506	A	7	7	2336	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
36	NC_009506	A	6	6	2368	2373	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
37	NC_009506	TTC	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
38	NC_009506	GAA	3	9	2434	2442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
39	NC_009506	A	8	8	2441	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
40	NC_009506	AGT	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557804
41	NC_009506	GAAAA	2	10	2461	2470	80 %	0 %	20 %	0 %	148557804
42	NC_009506	AGAA	2	8	2499	2506	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
43	NC_009506	A	8	8	2520	2527	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
44	NC_009506	A	6	6	2534	2539	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
45	NC_009506	A	6	6	2554	2559	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
46	NC_009506	AAGA	2	8	2574	2581	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
47	NC_009506	T	7	7	2586	2592	0 %	100 %	0 %	0 %	148557804
48	NC_009506	A	7	7	2661	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
49	NC_009506	AAG	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
50	NC_009506	AGAA	2	8	2706	2713	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
51	NC_009506	TATT	2	8	2714	2721	25 %	75 %	0 %	0 %	148557804
52	NC_009506	AAAAGA	2	12	2727	2738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	148557804
53	NC_009506	AGA	3	9	2736	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
54	NC_009506	AGTTGC	2	12	2763	2774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	148557804
55	NC_009506	GTT	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557804
56	NC_009506	A	7	7	2786	2792	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
57	NC_009506	GAA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
58	NC_009506	AAAG	2	8	2820	2827	75 %	0 %	25 %	0 %	148557804
59	NC_009506	CTT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557804
60	NC_009506	AC	3	6	2873	2878	50 %	0 %	0 %	50 %	148557804
61	NC_009506	AGA	2	6	2886	2891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
62	NC_009506	AAGAA	2	10	2892	2901	80 %	0 %	20 %	0 %	148557804
63	NC_009506	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557804
64	NC_009506	AGA	2	6	2952	2957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557804
65	NC_009506	CGA	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148557804
66	NC_009506	A	6	6	2992	2997	100 %	0 %	0 %	0 %	148557804
67	NC_009506	T	8	8	3073	3080	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
68	NC_009506	TAT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
69	NC_009506	TGT	2	6	3107	3112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148557805
70	NC_009506	T	8	8	3119	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
71	NC_009506	T	8	8	3131	3138	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
72	NC_009506	T	6	6	3174	3179	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
73	NC_009506	TTC	2	6	3187	3192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
74	NC_009506	ATTTT	2	10	3204	3213	20 %	80 %	0 %	0 %	148557805
75	NC_009506	T	7	7	3210	3216	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
76	NC_009506	T	7	7	3266	3272	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
77	NC_009506	TAT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
78	NC_009506	T	7	7	3298	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
79	NC_009506	TATAT	2	10	3319	3328	40 %	60 %	0 %	0 %	148557805
80	NC_009506	ATT	2	6	3344	3349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
81	NC_009506	ATT	2	6	3358	3363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557805
82	NC_009506	T	8	8	3362	3369	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
83	NC_009506	CTT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557805
84	NC_009506	T	7	7	3387	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	148557805
85	NC_009506	TAA	2	6	3785	3790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557806
86	NC_009506	TCAAT	2	10	3797	3806	40 %	40 %	0 %	20 %	148557806
87	NC_009506	CTTTT	2	10	3813	3822	0 %	80 %	0 %	20 %	148557806
88	NC_009506	T	6	6	3819	3824	0 %	100 %	0 %	0 %	148557806
89	NC_009506	TAAT	2	8	3839	3846	50 %	50 %	0 %	0 %	148557806
90	NC_009506	ATG	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557807
91	NC_009506	TAAAC	2	10	4991	5000	60 %	20 %	0 %	20 %	148557807
92	NC_009506	GAATT	2	10	5014	5023	40 %	40 %	20 %	0 %	148557807
93	NC_009506	A	6	6	5037	5042	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
94	NC_009506	CTT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148557807
95	NC_009506	TA	3	6	5058	5063	50 %	50 %	0 %	0 %	148557807
96	NC_009506	AAAG	2	8	5079	5086	75 %	0 %	25 %	0 %	148557807
97	NC_009506	A	6	6	5229	5234	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
98	NC_009506	GACA	2	8	5273	5280	50 %	0 %	25 %	25 %	148557807
99	NC_009506	AAT	2	6	5309	5314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
100	NC_009506	T	6	6	5343	5348	0 %	100 %	0 %	0 %	148557807
101	NC_009506	AAT	2	6	5349	5354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
102	NC_009506	A	8	8	5364	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
103	NC_009506	GAA	2	6	5496	5501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
104	NC_009506	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
105	NC_009506	GAA	2	6	5571	5576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
106	NC_009506	ATT	2	6	5583	5588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
107	NC_009506	AGA	2	6	5617	5622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
108	NC_009506	AAGA	2	8	5636	5643	75 %	0 %	25 %	0 %	148557807
109	NC_009506	AC	3	6	5646	5651	50 %	0 %	0 %	50 %	148557807
110	NC_009506	TAA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
111	NC_009506	ATG	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148557807
112	NC_009506	A	6	6	5691	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
113	NC_009506	GAA	2	6	5697	5702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
114	NC_009506	AGA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
115	NC_009506	A	6	6	5745	5750	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
116	NC_009506	ATA	2	6	5776	5781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
117	NC_009506	ATGAAA	2	12	5791	5802	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	148557807
118	NC_009506	A	6	6	5800	5805	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
119	NC_009506	AGA	3	9	5822	5830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
120	NC_009506	GAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
121	NC_009506	A	7	7	5852	5858	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
122	NC_009506	A	7	7	5902	5908	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
123	NC_009506	GAA	2	6	5943	5948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
124	NC_009506	TAA	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148557807
125	NC_009506	AACTT	2	10	6049	6058	40 %	40 %	0 %	20 %	148557807
126	NC_009506	AGA	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
127	NC_009506	A	7	7	6082	6088	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
128	NC_009506	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
129	NC_009506	CAA	2	6	6149	6154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148557807
130	NC_009506	A	7	7	6161	6167	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
131	NC_009506	AGA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
132	NC_009506	AT	3	6	6215	6220	50 %	50 %	0 %	0 %	148557807
133	NC_009506	A	6	6	6228	6233	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
134	NC_009506	AGA	2	6	6248	6253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
135	NC_009506	TAAA	2	8	6265	6272	75 %	25 %	0 %	0 %	148557807
136	NC_009506	A	7	7	6335	6341	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
137	NC_009506	TAT	2	6	6344	6349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148557807
138	NC_009506	A	6	6	6372	6377	100 %	0 %	0 %	0 %	148557807
139	NC_009506	AGA	2	6	6383	6388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148557807
140	NC_009506	AAAG	2	8	6393	6400	75 %	0 %	25 %	0 %	148557807
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.