MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome

Total Repeats: 117021

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009441	AT	3	6	113	118	50 %	50 %	0 %	0 %	146297767
2	NC_009441	AAC	2	6	155	160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297767
3	NC_009441	TGG	2	6	175	180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146297767
4	NC_009441	TAT	2	6	206	211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
5	NC_009441	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
6	NC_009441	TTA	2	6	288	293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
7	NC_009441	A	7	7	293	299	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
8	NC_009441	CCT	2	6	348	353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146297767
9	NC_009441	TGATT	2	10	359	368	20 %	60 %	20 %	0 %	146297767
10	NC_009441	CAAA	2	8	373	380	75 %	0 %	0 %	25 %	146297767
11	NC_009441	A	6	6	441	446	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
12	NC_009441	TGT	2	6	467	472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297767
13	NC_009441	AGA	2	6	485	490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297767
14	NC_009441	CAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297767
15	NC_009441	T	7	7	515	521	0 %	100 %	0 %	0 %	146297767
16	NC_009441	CCA	2	6	527	532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146297767
17	NC_009441	A	6	6	534	539	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
18	NC_009441	TAT	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
19	NC_009441	GAAA	2	8	612	619	75 %	0 %	25 %	0 %	146297767
20	NC_009441	CAAT	2	8	635	642	50 %	25 %	0 %	25 %	146297767
21	NC_009441	GAA	2	6	675	680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297767
22	NC_009441	GTT	2	6	708	713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297767
23	NC_009441	GAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297767
24	NC_009441	AAT	2	6	753	758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146297767
25	NC_009441	AAC	2	6	783	788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297767
26	NC_009441	GTTTT	2	10	805	814	0 %	80 %	20 %	0 %	146297767
27	NC_009441	TGA	2	6	815	820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297767
28	NC_009441	A	6	6	886	891	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
29	NC_009441	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297767
30	NC_009441	AGG	2	6	968	973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146297767
31	NC_009441	CAGA	2	8	974	981	50 %	0 %	25 %	25 %	146297767
32	NC_009441	A	6	6	1037	1042	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
33	NC_009441	A	6	6	1050	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	146297767
34	NC_009441	ACG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297767
35	NC_009441	AT	3	6	1122	1127	50 %	50 %	0 %	0 %	146297767
36	NC_009441	TGAT	2	8	1139	1146	25 %	50 %	25 %	0 %	146297767
37	NC_009441	AAAC	2	8	1185	1192	75 %	0 %	0 %	25 %	146297768
38	NC_009441	GAATG	2	10	1231	1240	40 %	20 %	40 %	0 %	146297768
39	NC_009441	TAT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297768
40	NC_009441	ATG	2	6	1289	1294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297768
41	NC_009441	AAC	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297768
42	NC_009441	AGA	2	6	1338	1343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297768
43	NC_009441	CTT	2	6	1382	1387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297768
44	NC_009441	TAGAT	2	10	1389	1398	40 %	40 %	20 %	0 %	146297768
45	NC_009441	A	7	7	1416	1422	100 %	0 %	0 %	0 %	146297768
46	NC_009441	GTTT	2	8	1427	1434	0 %	75 %	25 %	0 %	146297768
47	NC_009441	TTA	2	6	1435	1440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297768
48	NC_009441	A	6	6	1475	1480	100 %	0 %	0 %	0 %	146297768
49	NC_009441	TGA	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297768
50	NC_009441	TGA	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297768
51	NC_009441	A	6	6	1636	1641	100 %	0 %	0 %	0 %	146297768
52	NC_009441	GCA	2	6	1660	1665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146297768
53	NC_009441	AAG	2	6	1700	1705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297768
54	NC_009441	TGT	2	6	1707	1712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297768
55	NC_009441	ATTT	2	8	1715	1722	25 %	75 %	0 %	0 %	146297768
56	NC_009441	ATT	2	6	1731	1736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297768
57	NC_009441	GAA	2	6	1960	1965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297769
58	NC_009441	GAA	3	9	2023	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297769
59	NC_009441	TAT	2	6	2040	2045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297769
60	NC_009441	ATT	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297769
61	NC_009441	ATG	3	9	2135	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297769
62	NC_009441	AACG	2	8	2202	2209	50 %	0 %	25 %	25 %	146297769
63	NC_009441	CGG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146297769
64	NC_009441	AAC	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297769
65	NC_009441	TTG	2	6	2315	2320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297769
66	NC_009441	A	6	6	2321	2326	100 %	0 %	0 %	0 %	146297769
67	NC_009441	T	6	6	2340	2345	0 %	100 %	0 %	0 %	146297769
68	NC_009441	A	8	8	2396	2403	100 %	0 %	0 %	0 %	146297769
69	NC_009441	GGAAAT	2	12	2421	2432	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	146297769
70	NC_009441	ATC	2	6	2464	2469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297769
71	NC_009441	A	9	9	2481	2489	100 %	0 %	0 %	0 %	146297769
72	NC_009441	TA	3	6	2544	2549	50 %	50 %	0 %	0 %	146297769
73	NC_009441	ATT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297770
74	NC_009441	GGC	2	6	2632	2637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146297770
75	NC_009441	AAAT	2	8	2650	2657	75 %	25 %	0 %	0 %	146297770
76	NC_009441	GTT	2	6	2676	2681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297770
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82	NC_009441	ATT	2	6	2985	2990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297770
83	NC_009441	AATCA	2	10	3266	3275	60 %	20 %	0 %	20 %	146297771
84	NC_009441	TA	3	6	3298	3303	50 %	50 %	0 %	0 %	146297771
85	NC_009441	ATT	2	6	3356	3361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
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90	NC_009441	TTG	2	6	3699	3704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297771
91	NC_009441	GGA	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146297771
92	NC_009441	AC	3	6	3732	3737	50 %	0 %	0 %	50 %	146297771
93	NC_009441	A	6	6	3781	3786	100 %	0 %	0 %	0 %	146297771
94	NC_009441	TA	4	8	3793	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	146297771
95	NC_009441	CA	3	6	3815	3820	50 %	0 %	0 %	50 %	146297771
96	NC_009441	AT	3	6	3824	3829	50 %	50 %	0 %	0 %	146297771
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98	NC_009441	TTCA	2	8	3861	3868	25 %	50 %	0 %	25 %	146297771
99	NC_009441	ATT	2	6	3894	3899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
100	NC_009441	GAT	2	6	3900	3905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297771
101	NC_009441	TAT	2	6	4042	4047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
102	NC_009441	CTG	2	6	4069	4074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146297771
103	NC_009441	TCA	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297771
104	NC_009441	A	6	6	4115	4120	100 %	0 %	0 %	0 %	146297771
105	NC_009441	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
106	NC_009441	CT	3	6	4220	4225	0 %	50 %	0 %	50 %	146297771
107	NC_009441	TCT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297771
108	NC_009441	A	6	6	4248	4253	100 %	0 %	0 %	0 %	146297771
109	NC_009441	AG	3	6	4309	4314	50 %	0 %	50 %	0 %	146297771
110	NC_009441	A	6	6	4336	4341	100 %	0 %	0 %	0 %	146297771
111	NC_009441	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297771
112	NC_009441	AAGA	2	8	4391	4398	75 %	0 %	25 %	0 %	146297771
113	NC_009441	TGT	2	6	4403	4408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297771
114	NC_009441	T	6	6	4431	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	146297771
115	NC_009441	CTT	2	6	4456	4461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146297771
116	NC_009441	ACAA	2	8	4549	4556	75 %	0 %	0 %	25 %	146297771
117	NC_009441	A	6	6	4560	4565	100 %	0 %	0 %	0 %	146297771
118	NC_009441	CAA	2	6	4580	4585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146297771
119	NC_009441	A	6	6	4584	4589	100 %	0 %	0 %	0 %	146297771
120	NC_009441	GTTT	2	8	4631	4638	0 %	75 %	25 %	0 %	146297772
121	NC_009441	ATC	2	6	4825	4830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146297772
122	NC_009441	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297772
123	NC_009441	AAAGT	2	10	4917	4926	60 %	20 %	20 %	0 %	146297772
124	NC_009441	ATT	2	6	4945	4950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297772
125	NC_009441	TTA	2	6	4981	4986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297772
126	NC_009441	A	7	7	5062	5068	100 %	0 %	0 %	0 %	146297772
127	NC_009441	GATG	2	8	5189	5196	25 %	25 %	50 %	0 %	146297773
128	NC_009441	AAG	2	6	5213	5218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146297773
129	NC_009441	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297773
130	NC_009441	A	8	8	5296	5303	100 %	0 %	0 %	0 %	146297773
131	NC_009441	AAAC	2	8	5330	5337	75 %	0 %	0 %	25 %	146297773
132	NC_009441	TTA	2	6	5376	5381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146297773
133	NC_009441	GTT	2	6	5481	5486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146297773
134	NC_009441	GAT	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146297773
135	NC_009441	GAAT	2	8	5533	5540	50 %	25 %	25 %	0 %	146297773
136	NC_009441	A	8	8	5587	5594	100 %	0 %	0 %	0 %	146297773
137	NC_009441	GA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	146297773
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