MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis WY96-3418 chromosome

Total Repeats: 755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009257	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301170
2	NC_009257	GCTGGA	2	12	6597	6608	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	134301176
3	NC_009257	AATCAC	2	12	8321	8332	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134301177
4	NC_009257	GATATT	2	12	8557	8568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301177
5	NC_009257	CTATAT	2	12	12591	12602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134301181
6	NC_009257	ATTTGC	2	12	17903	17914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134301182
7	NC_009257	GTAACT	2	12	19197	19208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301183
8	NC_009257	CCAAAA	2	12	19455	19466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134301184
9	NC_009257	ATTCAT	2	12	22589	22600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134301188
10	NC_009257	TAAAGA	2	12	23704	23715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134301189
11	NC_009257	GTTTTA	2	12	27549	27560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301192
12	NC_009257	TACTGA	2	12	30695	30706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301193
13	NC_009257	TAGTTT	2	12	32903	32914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301193
14	NC_009257	TTTTGA	2	12	34258	34269	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301194
15	NC_009257	TTTATC	2	12	34730	34741	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134301195
16	NC_009257	TAGTAT	2	12	36609	36620	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301196
17	NC_009257	TCATTA	2	12	37152	37163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134301197
18	NC_009257	GATAAG	2	12	39000	39011	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301199
19	NC_009257	ATTAAA	2	12	39165	39176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301199
20	NC_009257	CATTTG	2	12	40834	40845	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134301199
21	NC_009257	CTATTT	2	12	41656	41667	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134301199
22	NC_009257	CTTTCA	2	12	43828	43839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	134301201
23	NC_009257	TCATTA	3	18	45070	45087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134301202
24	NC_009257	TTTATA	2	12	48730	48741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301205
25	NC_009257	TTTATA	2	12	54931	54942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301209
26	NC_009257	GTTTTA	2	12	62168	62179	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301210
27	NC_009257	TATGGT	2	12	65422	65433	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134301212
28	NC_009257	TCAGCA	2	12	67477	67488	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134301213
29	NC_009257	GTTTCT	2	12	75131	75142	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	134301218
30	NC_009257	AAAAGT	2	12	79396	79407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134301219
31	NC_009257	TTTTGC	2	12	79943	79954	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	134301220
32	NC_009257	TTCATT	2	12	80362	80373	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134301220
33	NC_009257	TTGCTG	2	12	85192	85203	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	134301224
34	NC_009257	TTTAAA	2	12	85548	85559	50 %	50 %	0 %	0 %	134301224
35	NC_009257	AAGGAT	2	12	87892	87903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301226
36	NC_009257	TACAGA	2	12	89114	89125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301227
37	NC_009257	TCAATG	2	12	90846	90857	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301227
38	NC_009257	GTTTTA	2	12	93260	93271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301228
39	NC_009257	TATATC	2	12	96933	96944	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134301230
40	NC_009257	CTGCTT	2	12	99792	99803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	134301233
41	NC_009257	TACTGA	2	12	99958	99969	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301233
42	NC_009257	AGATGG	2	12	102057	102068	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	134301235
43	NC_009257	TTATAT	2	12	102402	102413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301235
44	NC_009257	TCAAGA	2	12	102971	102982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301236
45	NC_009257	GAAGCA	2	12	103196	103207	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134301237
46	NC_009257	GAGTAT	2	12	105193	105204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301238
47	NC_009257	CCAGAT	2	12	105331	105342	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134301238
48	NC_009257	GTAAAG	2	12	105875	105886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301238
49	NC_009257	CAAATC	2	12	111489	111500	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134301242
50	NC_009257	AGCTAA	2	12	112979	112990	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301243
51	NC_009257	TACTCG	2	12	116770	116781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134301247
52	NC_009257	TGGTGC	2	12	119840	119851	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	134301251
53	NC_009257	TGCAAA	2	12	120900	120911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301252
54	NC_009257	ATATTG	2	12	122361	122372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301252
55	NC_009257	TAACAT	2	12	124995	125006	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134301255
56	NC_009257	TCAGTC	2	12	125133	125144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134301256
57	NC_009257	TGCAAA	2	12	127166	127177	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301257
58	NC_009257	TTGGTA	2	12	127949	127960	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134301258
59	NC_009257	TATTGG	2	12	128637	128648	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134301258
60	NC_009257	TTTTGA	2	12	134033	134044	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301262
61	NC_009257	TGAAGA	2	12	134299	134310	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301263
62	NC_009257	GGCAAA	2	12	144023	144034	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134301270
63	NC_009257	ATTATG	2	12	144682	144693	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301271
64	NC_009257	ATAAAT	2	12	146156	146167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301273
65	NC_009257	AGGCTA	2	12	146404	146415	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134301274
66	NC_009257	AGCAAG	2	12	151379	151390	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134301279
67	NC_009257	GTTAGA	2	12	161111	161122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301288
68	NC_009257	AAAGCT	2	12	162361	162372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301290
69	NC_009257	TAAAGC	2	12	162561	162572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301290
70	NC_009257	ATTATA	2	12	163730	163741	50 %	50 %	0 %	0 %	134301290
71	NC_009257	AAATGC	2	12	163808	163819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301290
72	NC_009257	AGATAC	2	12	166033	166044	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301291
73	NC_009257	GGAGCA	2	12	169159	169170	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	134301295
74	NC_009257	TGGTGT	2	12	174324	174335	0 %	50 %	50 %	0 %	134301302
75	NC_009257	ATCCGT	2	12	175849	175860	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134301302
76	NC_009257	TGATGT	2	12	176289	176300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134301302
77	NC_009257	GTTGAG	2	12	184833	184844	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134301307
78	NC_009257	AAAAAC	2	12	185050	185061	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	134301307
79	NC_009257	GCAAAT	2	12	194379	194390	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301316
80	NC_009257	CAAATA	2	12	194890	194901	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134301316
81	NC_009257	CAACAT	2	12	196003	196014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134301316
82	NC_009257	TAAATA	2	12	198801	198812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301318
83	NC_009257	TGCAGC	2	12	201014	201025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	134301320
84	NC_009257	TTATAG	2	12	202479	202490	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301321
85	NC_009257	AGATAA	2	12	202501	202512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	134301321
86	NC_009257	GAAAGT	2	12	204108	204119	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301322
87	NC_009257	CTGGTA	2	12	204296	204307	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134301322
88	NC_009257	GCAAAT	2	12	212537	212548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301329
89	NC_009257	TAGGTG	2	12	215450	215461	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134301331
90	NC_009257	TTAATA	2	12	226994	227005	50 %	50 %	0 %	0 %	134301339
91	NC_009257	ACTTTG	2	12	229293	229304	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134301341
92	NC_009257	ATTGTT	2	12	231874	231885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301343
93	NC_009257	AGCAAC	2	12	232867	232878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	134301345
94	NC_009257	TAGATC	2	12	233830	233841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301345
95	NC_009257	GCTGTT	2	12	238954	238965	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	134301352
96	NC_009257	AGAAAA	2	12	239971	239982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	134301353
97	NC_009257	TTGATT	2	12	240239	240250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301353
98	NC_009257	GGTAAA	2	12	240694	240705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301353
99	NC_009257	TATATG	2	12	243094	243105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301353
100	NC_009257	GTTGAG	2	12	243773	243784	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134301354
101	NC_009257	TGCCTA	2	12	253941	253952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	134301361
102	NC_009257	TGATTT	2	12	256975	256986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301366
103	NC_009257	ATTAAA	2	12	259951	259962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301367
104	NC_009257	TTTCAT	2	12	261655	261666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134301370
105	NC_009257	GTTTTA	2	12	270720	270731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301377
106	NC_009257	GTAAAG	2	12	279207	279218	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301385
107	NC_009257	TGAATC	2	12	283759	283770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301389
108	NC_009257	TCATCC	2	12	287211	287222	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134301392
109	NC_009257	GGTGAA	2	12	287939	287950	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	134301393
110	NC_009257	TAGGTT	2	12	292517	292528	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	134301396
111	NC_009257	AATATA	2	12	296154	296165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134301399
112	NC_009257	ATAACA	2	12	296758	296769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134301400
113	NC_009257	ATTTTG	2	12	296920	296931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301400
114	NC_009257	GTCAAG	2	12	298410	298421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	134301402
115	NC_009257	AGTTTA	2	12	311277	311288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301413
116	NC_009257	TTCCCA	2	12	314627	314638	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134301414
117	NC_009257	CAAAAG	2	12	317852	317863	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134301417
118	NC_009257	ACTCTA	2	12	319019	319030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134301418
119	NC_009257	TAAGAT	2	12	320101	320112	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134301418
120	NC_009257	TAGAAG	2	12	322630	322641	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	134301420
121	NC_009257	ATTATG	2	12	326281	326292	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301426
122	NC_009257	GGCTCT	2	12	327571	327582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134301428
123	NC_009257	TTGAGG	2	12	334135	334146	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	134301435
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125	NC_009257	TAATCT	2	12	335842	335853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134301438
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132	NC_009257	TCAAAG	2	12	366905	366916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301463
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140	NC_009257	CTTGAG	2	12	392592	392603	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134301486
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224	NC_009257	CTGTTG	2	12	598530	598541	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	134301664
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229	NC_009257	GTTTTA	2	12	610552	610563	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	134301677
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231	NC_009257	TGCAAT	2	12	614041	614052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301681
232	NC_009257	GAAGCA	2	12	615972	615983	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	134301683
233	NC_009257	TCAACA	2	12	616176	616187	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	134301683
234	NC_009257	TAAGAC	2	12	619343	619354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	134301686
235	NC_009257	TGATAC	2	12	619559	619570	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	134301686
236	NC_009257	TATATT	2	12	620767	620778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134301687
237	NC_009257	GAAGTT	2	12	622635	622646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134301689
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239	NC_009257	TGATGC	2	12	632133	632144	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134301698
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343	NC_009257	CATAAA	2	12	874112	874123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134301904
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345	NC_009257	ATCTAA	2	12	874646	874657	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134301905
346	NC_009257	TAAAGT	2	12	876617	876628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	134301905
347	NC_009257	AAGTTT	2	12	879791	879802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134301908
348	NC_009257	GATGGA	2	12	881042	881053	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	134301909
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367	NC_009257	CCTGAA	2	12	938696	938707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134301967
368	NC_009257	TGTAGC	2	12	939576	939587	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134301968
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443	NC_009257	TTTTTG	2	12	1141940	1141951	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	134302154
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447	NC_009257	TTTTCA	2	12	1147692	1147703	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134302158
448	NC_009257	CTTTAT	2	12	1148222	1148233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	134302159
449	NC_009257	TTCAAT	2	12	1150172	1150183	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134302161
450	NC_009257	TCAGGT	2	12	1156655	1156666	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	134302162
451	NC_009257	ACAGCT	2	12	1159548	1159559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134302163
452	NC_009257	CCCTAT	2	12	1162241	1162252	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	134302165
453	NC_009257	AATCTA	2	12	1162265	1162276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	134302165
454	NC_009257	TAAAAA	2	12	1162986	1162997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134302167
455	NC_009257	AAAGAC	2	12	1163368	1163379	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	134302167
456	NC_009257	CAAAAT	2	12	1166525	1166536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	134302170
457	NC_009257	TACTTG	2	12	1166909	1166920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	134302172
458	NC_009257	ATTCTA	2	12	1169312	1169323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	134302173
459	NC_009257	AATAAA	2	12	1169573	1169584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	134302173
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461	NC_009257	ATATTT	2	12	1179443	1179454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134302181
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