MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 23764

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	CCGG	2	8	771	778	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
2	NC_008278	CCGG	2	8	854	861	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
3	NC_008278	CGGG	2	8	862	869	0 %	0 %	75 %	25 %	111219506
4	NC_008278	GACC	2	8	1860	1867	25 %	0 %	25 %	50 %	111219506
5	NC_008278	CGGG	2	8	2095	2102	0 %	0 %	75 %	25 %	111219507
6	NC_008278	ACCG	2	8	2104	2111	25 %	0 %	25 %	50 %	111219507
7	NC_008278	GTGG	2	8	2295	2302	0 %	25 %	75 %	0 %	111219507
8	NC_008278	CGGC	2	8	2312	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	111219507
9	NC_008278	CCGC	2	8	2968	2975	0 %	0 %	25 %	75 %	111219508
10	NC_008278	GCCG	2	8	2986	2993	0 %	0 %	50 %	50 %	111219508
11	NC_008278	GCCG	2	8	3167	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	111219508
12	NC_008278	CGAC	2	8	3427	3434	25 %	0 %	25 %	50 %	111219508
13	NC_008278	CACC	2	8	4107	4114	25 %	0 %	0 %	75 %	111219509
14	NC_008278	GGTC	2	8	4182	4189	0 %	25 %	50 %	25 %	111219509
15	NC_008278	GCCA	2	8	4246	4253	25 %	0 %	25 %	50 %	111219509
16	NC_008278	CGTG	2	8	4320	4327	0 %	25 %	50 %	25 %	111219509
17	NC_008278	GGGC	2	8	4366	4373	0 %	0 %	75 %	25 %	111219509
18	NC_008278	CCGC	2	8	4694	4701	0 %	0 %	25 %	75 %	111219509
19	NC_008278	GCCC	2	8	4876	4883	0 %	0 %	25 %	75 %	111219509
20	NC_008278	TCGC	2	8	4993	5000	0 %	25 %	25 %	50 %	111219509
21	NC_008278	GCCG	2	8	5172	5179	0 %	0 %	50 %	50 %	111219509
22	NC_008278	CGGG	2	8	6165	6172	0 %	0 %	75 %	25 %	111219511
23	NC_008278	GCAT	2	8	6621	6628	25 %	25 %	25 %	25 %	111219512
24	NC_008278	CGGG	2	8	6678	6685	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
25	NC_008278	CCCG	2	8	6822	6829	0 %	0 %	25 %	75 %	111219512
26	NC_008278	GGCG	2	8	7303	7310	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
27	NC_008278	GGGC	2	8	7702	7709	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
28	NC_008278	GGCC	2	8	7969	7976	0 %	0 %	50 %	50 %	111219512
29	NC_008278	CCCG	2	8	8850	8857	0 %	0 %	25 %	75 %	111219513
30	NC_008278	CGAC	2	8	9113	9120	25 %	0 %	25 %	50 %	111219513
31	NC_008278	GACC	2	8	10071	10078	25 %	0 %	25 %	50 %	111219513
32	NC_008278	GCCC	2	8	11163	11170	0 %	0 %	25 %	75 %	111219514
33	NC_008278	GCCG	2	8	11268	11275	0 %	0 %	50 %	50 %	111219514
34	NC_008278	CGGG	2	8	11390	11397	0 %	0 %	75 %	25 %	111219514
35	NC_008278	CCGG	2	8	11459	11466	0 %	0 %	50 %	50 %	111219514
36	NC_008278	CGGC	2	8	12301	12308	0 %	0 %	50 %	50 %	111219515
37	NC_008278	CGCC	2	8	12311	12318	0 %	0 %	25 %	75 %	111219515
38	NC_008278	CCGC	3	12	12521	12532	0 %	0 %	25 %	75 %	111219515
39	NC_008278	GCCG	2	8	12538	12545	0 %	0 %	50 %	50 %	111219515
40	NC_008278	GCTG	2	8	12743	12750	0 %	25 %	50 %	25 %	111219515
41	NC_008278	GGCC	2	8	13823	13830	0 %	0 %	50 %	50 %	111219517
42	NC_008278	GGCC	2	8	13865	13872	0 %	0 %	50 %	50 %	111219517
43	NC_008278	CGGG	2	8	14493	14500	0 %	0 %	75 %	25 %	111219518
44	NC_008278	CGGG	2	8	14628	14635	0 %	0 %	75 %	25 %	111219518
45	NC_008278	CCGC	2	8	14828	14835	0 %	0 %	25 %	75 %	111219518
46	NC_008278	GCCG	2	8	15138	15145	0 %	0 %	50 %	50 %	111219518
47	NC_008278	CGGC	2	8	15744	15751	0 %	0 %	50 %	50 %	111219519
48	NC_008278	GGGC	2	8	16332	16339	0 %	0 %	75 %	25 %	111219520
49	NC_008278	CCCG	2	8	17321	17328	0 %	0 %	25 %	75 %	111219523
50	NC_008278	CTGC	2	8	17747	17754	0 %	25 %	25 %	50 %	111219523
51	NC_008278	CGCC	2	8	17861	17868	0 %	0 %	25 %	75 %	111219523
52	NC_008278	CGGG	2	8	18384	18391	0 %	0 %	75 %	25 %	111219524
53	NC_008278	CGGC	2	8	19177	19184	0 %	0 %	50 %	50 %	111219526
54	NC_008278	GACT	2	8	19695	19702	25 %	25 %	25 %	25 %	111219526
55	NC_008278	CGGT	2	8	19911	19918	0 %	25 %	50 %	25 %	111219527
56	NC_008278	CGGC	2	8	19925	19932	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
57	NC_008278	AGCG	2	8	20240	20247	25 %	0 %	50 %	25 %	111219527
58	NC_008278	CGGC	2	8	20260	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
59	NC_008278	ACCG	2	8	20929	20936	25 %	0 %	25 %	50 %	111219527
60	NC_008278	AGGG	2	8	22144	22151	25 %	0 %	75 %	0 %	111219529
61	NC_008278	GCCC	2	8	22265	22272	0 %	0 %	25 %	75 %	111219529
62	NC_008278	CCGC	2	8	22779	22786	0 %	0 %	25 %	75 %	111219529
63	NC_008278	GGCC	2	8	24193	24200	0 %	0 %	50 %	50 %	111219531
64	NC_008278	GTCG	2	8	24401	24408	0 %	25 %	50 %	25 %	111219531
65	NC_008278	CGCC	2	8	24542	24549	0 %	0 %	25 %	75 %	111219531
66	NC_008278	CTGA	2	8	24644	24651	25 %	25 %	25 %	25 %	111219531
67	NC_008278	GCGG	2	8	27507	27514	0 %	0 %	75 %	25 %	111219534
68	NC_008278	CCGG	2	8	27695	27702	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
69	NC_008278	GCCC	2	8	28121	28128	0 %	0 %	25 %	75 %	111219534
70	NC_008278	CGGC	2	8	28156	28163	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
71	NC_008278	GGGA	2	8	28174	28181	25 %	0 %	75 %	0 %	111219534
72	NC_008278	GCGG	2	8	28191	28198	0 %	0 %	75 %	25 %	111219534
73	NC_008278	CCGC	2	8	28208	28215	0 %	0 %	25 %	75 %	111219534
74	NC_008278	CCGG	2	8	28522	28529	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
75	NC_008278	CGGC	2	8	28587	28594	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
76	NC_008278	GCCG	2	8	28706	28713	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
77	NC_008278	TTCT	2	8	29469	29476	0 %	75 %	0 %	25 %	111219535
78	NC_008278	GGCC	2	8	29615	29622	0 %	0 %	50 %	50 %	111219535
79	NC_008278	GTTC	2	8	29729	29736	0 %	50 %	25 %	25 %	111219535
80	NC_008278	AGAT	2	8	29869	29876	50 %	25 %	25 %	0 %	111219535
81	NC_008278	GCCG	2	8	30050	30057	0 %	0 %	50 %	50 %	111219535
82	NC_008278	GCCG	2	8	30095	30102	0 %	0 %	50 %	50 %	111219535
83	NC_008278	CGTC	2	8	30779	30786	0 %	25 %	25 %	50 %	111219536
84	NC_008278	GCGG	2	8	31390	31397	0 %	0 %	75 %	25 %	111219537
85	NC_008278	CGGG	2	8	31418	31425	0 %	0 %	75 %	25 %	111219537
86	NC_008278	AGAC	2	8	31914	31921	50 %	0 %	25 %	25 %	111219538
87	NC_008278	CGGC	2	8	31942	31949	0 %	0 %	50 %	50 %	111219538
88	NC_008278	CGCC	2	8	31958	31965	0 %	0 %	25 %	75 %	111219538
89	NC_008278	CGCC	2	8	32207	32214	0 %	0 %	25 %	75 %	111219538
90	NC_008278	GCCG	2	8	32295	32302	0 %	0 %	50 %	50 %	111219538
91	NC_008278	GGCA	2	8	32392	32399	25 %	0 %	50 %	25 %	111219538
92	NC_008278	GAAC	2	8	32540	32547	50 %	0 %	25 %	25 %	111219538
93	NC_008278	GCGG	2	8	32741	32748	0 %	0 %	75 %	25 %	111219538
94	NC_008278	GAGC	2	8	32808	32815	25 %	0 %	50 %	25 %	111219538
95	NC_008278	GGCG	2	8	33358	33365	0 %	0 %	75 %	25 %	111219539
96	NC_008278	TCCA	2	8	33477	33484	25 %	25 %	0 %	50 %	111219539
97	NC_008278	ACCG	2	8	34121	34128	25 %	0 %	25 %	50 %	111219539
98	NC_008278	CCGA	2	8	34220	34227	25 %	0 %	25 %	50 %	111219539
99	NC_008278	CCGC	2	8	34438	34445	0 %	0 %	25 %	75 %	111219539
100	NC_008278	GACC	2	8	34750	34757	25 %	0 %	25 %	50 %	111219539
101	NC_008278	GGCC	2	8	34819	34826	0 %	0 %	50 %	50 %	111219539
102	NC_008278	CCGG	2	8	35287	35294	0 %	0 %	50 %	50 %	111219540
103	NC_008278	TCGA	2	8	35552	35559	25 %	25 %	25 %	25 %	111219540
104	NC_008278	CAGC	2	8	35608	35615	25 %	0 %	25 %	50 %	111219540
105	NC_008278	CCGC	2	8	36076	36083	0 %	0 %	25 %	75 %	111219540
106	NC_008278	GCGA	2	8	36893	36900	25 %	0 %	50 %	25 %	111219541
107	NC_008278	GCCG	3	12	37045	37056	0 %	0 %	50 %	50 %	111219541
108	NC_008278	CGAA	2	8	37605	37612	50 %	0 %	25 %	25 %	111219541
109	NC_008278	GTCC	2	8	38047	38054	0 %	25 %	25 %	50 %	111219542
110	NC_008278	CACT	2	8	38373	38380	25 %	25 %	0 %	50 %	111219542
111	NC_008278	CTGG	2	8	38452	38459	0 %	25 %	50 %	25 %	111219542
112	NC_008278	CGGG	2	8	39212	39219	0 %	0 %	75 %	25 %	111219544
113	NC_008278	CGGC	2	8	39626	39633	0 %	0 %	50 %	50 %	111219544
114	NC_008278	TGGC	2	8	39970	39977	0 %	25 %	50 %	25 %	111219544
115	NC_008278	CCGG	2	8	40003	40010	0 %	0 %	50 %	50 %	111219544
116	NC_008278	GGGA	2	8	40522	40529	25 %	0 %	75 %	0 %	111219544
117	NC_008278	GCGG	2	8	40598	40605	0 %	0 %	75 %	25 %	111219544
118	NC_008278	TCGG	2	8	40893	40900	0 %	25 %	50 %	25 %	111219544
119	NC_008278	CGGG	2	8	41168	41175	0 %	0 %	75 %	25 %	111219544
120	NC_008278	CGGC	4	16	41518	41533	0 %	0 %	50 %	50 %	111219544
121	NC_008278	GCTG	2	8	41596	41603	0 %	25 %	50 %	25 %	111219544
122	NC_008278	GCCG	2	8	42356	42363	0 %	0 %	50 %	50 %	111219546
123	NC_008278	GCCG	2	8	42461	42468	0 %	0 %	50 %	50 %	111219546
124	NC_008278	CGGC	2	8	42625	42632	0 %	0 %	50 %	50 %	111219547
125	NC_008278	CTGG	2	8	42800	42807	0 %	25 %	50 %	25 %	111219547
126	NC_008278	GCCA	2	8	43127	43134	25 %	0 %	25 %	50 %	111219548
127	NC_008278	CGGC	2	8	43269	43276	0 %	0 %	50 %	50 %	111219548
128	NC_008278	CGGG	2	8	43363	43370	0 %	0 %	75 %	25 %	111219548
129	NC_008278	TCGA	2	8	43790	43797	25 %	25 %	25 %	25 %	111219549
130	NC_008278	GCCA	2	8	43982	43989	25 %	0 %	25 %	50 %	111219549
131	NC_008278	GTCG	2	8	44062	44069	0 %	25 %	50 %	25 %	111219549
132	NC_008278	CAGC	2	8	44857	44864	25 %	0 %	25 %	50 %	111219551
133	NC_008278	CGGA	2	8	44874	44881	25 %	0 %	50 %	25 %	111219551
134	NC_008278	CAGC	2	8	45404	45411	25 %	0 %	25 %	50 %	111219552
135	NC_008278	CGGC	2	8	45430	45437	0 %	0 %	50 %	50 %	111219552
136	NC_008278	CCCG	2	8	45557	45564	0 %	0 %	25 %	75 %	111219552
137	NC_008278	GGCC	2	8	45805	45812	0 %	0 %	50 %	50 %	111219552
138	NC_008278	GGCC	2	8	45844	45851	0 %	0 %	50 %	50 %	111219552
139	NC_008278	GGTG	2	8	46069	46076	0 %	25 %	75 %	0 %	111219552
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141	NC_008278	GCCC	2	8	46358	46365	0 %	0 %	25 %	75 %	111219552
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