MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 4131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	89255450
2	NC_007880	TGAT	2	8	1044	1051	25 %	50 %	25 %	0 %	89255450
3	NC_007880	GTAC	2	8	1331	1338	25 %	25 %	25 %	25 %	89255450
4	NC_007880	GCTT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	89255450
5	NC_007880	ATGC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	25 %	25 %	89255450
6	NC_007880	TAAA	2	8	1748	1755	75 %	25 %	0 %	0 %	89255450
7	NC_007880	AGTT	2	8	1960	1967	25 %	50 %	25 %	0 %	89255451
8	NC_007880	TGAT	2	8	2043	2050	25 %	50 %	25 %	0 %	89255451
9	NC_007880	AGCA	2	8	2157	2164	50 %	0 %	25 %	25 %	89255451
10	NC_007880	TCTA	2	8	2801	2808	25 %	50 %	0 %	25 %	89255451
11	NC_007880	GTTT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	89255451
12	NC_007880	GAAT	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	89255452
13	NC_007880	TCAA	2	8	4008	4015	50 %	25 %	0 %	25 %	89255453
14	NC_007880	CAAC	2	8	4047	4054	50 %	0 %	0 %	50 %	89255453
15	NC_007880	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	89255453
16	NC_007880	TGTT	2	8	4598	4605	0 %	75 %	25 %	0 %	89255454
17	NC_007880	GGTA	2	8	4608	4615	25 %	25 %	50 %	0 %	89255454
18	NC_007880	ATTT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	89255455
19	NC_007880	TTGA	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	89255455
20	NC_007880	TTTC	2	8	5535	5542	0 %	75 %	0 %	25 %	89255455
21	NC_007880	TTTA	2	8	5698	5705	25 %	75 %	0 %	0 %	89255455
22	NC_007880	ATTA	2	8	5764	5771	50 %	50 %	0 %	0 %	89255455
23	NC_007880	GTTT	2	8	7263	7270	0 %	75 %	25 %	0 %	89255457
24	NC_007880	AAAT	2	8	7470	7477	75 %	25 %	0 %	0 %	89255457
25	NC_007880	TATG	2	8	7558	7565	25 %	50 %	25 %	0 %	89255457
26	NC_007880	TGTA	2	8	7567	7574	25 %	50 %	25 %	0 %	89255457
27	NC_007880	AGCA	2	8	9325	9332	50 %	0 %	25 %	25 %	89255460
28	NC_007880	TCTT	2	8	9371	9378	0 %	75 %	0 %	25 %	89255460
29	NC_007880	AGCA	2	8	9753	9760	50 %	0 %	25 %	25 %	89255460
30	NC_007880	CAAG	2	8	10281	10288	50 %	0 %	25 %	25 %	89255461
31	NC_007880	TTAT	2	8	10567	10574	25 %	75 %	0 %	0 %	89255461
32	NC_007880	AAAT	2	8	10769	10776	75 %	25 %	0 %	0 %	89255461
33	NC_007880	AAAT	2	8	10998	11005	75 %	25 %	0 %	0 %	89255462
34	NC_007880	AGTT	2	8	11302	11309	25 %	50 %	25 %	0 %	89255462
35	NC_007880	GCAG	2	8	12610	12617	25 %	0 %	50 %	25 %	89255464
36	NC_007880	CATA	2	8	12789	12796	50 %	25 %	0 %	25 %	89255464
37	NC_007880	TTGG	2	8	12807	12814	0 %	50 %	50 %	0 %	89255464
38	NC_007880	ATTT	2	8	12986	12993	25 %	75 %	0 %	0 %	89255464
39	NC_007880	TATT	2	8	13239	13246	25 %	75 %	0 %	0 %	89255465
40	NC_007880	GGTT	2	8	13324	13331	0 %	50 %	50 %	0 %	89255465
41	NC_007880	CTAT	2	8	13341	13348	25 %	50 %	0 %	25 %	89255465
42	NC_007880	TAGA	2	8	14286	14293	50 %	25 %	25 %	0 %	89255465
43	NC_007880	AATG	2	8	14521	14528	50 %	25 %	25 %	0 %	89255465
44	NC_007880	TCAA	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	89255466
45	NC_007880	CAAC	2	8	16945	16952	50 %	0 %	0 %	50 %	89255466
46	NC_007880	ATTA	2	8	17073	17080	50 %	50 %	0 %	0 %	89255466
47	NC_007880	AACT	2	8	18007	18014	50 %	25 %	0 %	25 %	89255468
48	NC_007880	ATCT	2	8	18680	18687	25 %	50 %	0 %	25 %	89255468
49	NC_007880	TAAT	2	8	18961	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	89255468
50	NC_007880	CAAA	2	8	19567	19574	75 %	0 %	0 %	25 %	89255469
51	NC_007880	ATAG	2	8	19811	19818	50 %	25 %	25 %	0 %	89255469
52	NC_007880	GCTG	2	8	20330	20337	0 %	25 %	50 %	25 %	89255469
53	NC_007880	TAAT	2	8	21412	21419	50 %	50 %	0 %	0 %	89255470
54	NC_007880	GTTG	2	8	21540	21547	0 %	50 %	50 %	0 %	89255470
55	NC_007880	ATTG	2	8	21578	21585	25 %	50 %	25 %	0 %	89255470
56	NC_007880	TTTG	2	8	23759	23766	0 %	75 %	25 %	0 %	89255471
57	NC_007880	TTTA	2	8	24902	24909	25 %	75 %	0 %	0 %	89255472
58	NC_007880	TAAA	2	8	26225	26232	75 %	25 %	0 %	0 %	89255474
59	NC_007880	TCTA	2	8	26537	26544	25 %	50 %	0 %	25 %	89255475
60	NC_007880	AGTG	2	8	26778	26785	25 %	25 %	50 %	0 %	89255475
61	NC_007880	TTAC	2	8	27822	27829	25 %	50 %	0 %	25 %	89255476
62	NC_007880	CATT	2	8	28189	28196	25 %	50 %	0 %	25 %	89255476
63	NC_007880	TAGA	2	8	28264	28271	50 %	25 %	25 %	0 %	89255476
64	NC_007880	ATCA	2	8	28415	28422	50 %	25 %	0 %	25 %	89255476
65	NC_007880	CTTT	2	8	29002	29009	0 %	75 %	0 %	25 %	89255476
66	NC_007880	TCTT	2	8	29279	29286	0 %	75 %	0 %	25 %	89255476
67	NC_007880	ATCT	2	8	29327	29334	25 %	50 %	0 %	25 %	89255476
68	NC_007880	TGGT	2	8	30981	30988	0 %	50 %	50 %	0 %	89255477
69	NC_007880	CAGA	2	8	31059	31066	50 %	0 %	25 %	25 %	89255477
70	NC_007880	ATTT	2	8	31415	31422	25 %	75 %	0 %	0 %	89255477
71	NC_007880	TACG	2	8	31514	31521	25 %	25 %	25 %	25 %	89255477
72	NC_007880	AGAT	2	8	32689	32696	50 %	25 %	25 %	0 %	89255478
73	NC_007880	ATCT	2	8	34120	34127	25 %	50 %	0 %	25 %	89255479
74	NC_007880	TGAT	2	8	34466	34473	25 %	50 %	25 %	0 %	89255480
75	NC_007880	ACTT	2	8	35263	35270	25 %	50 %	0 %	25 %	89255480
76	NC_007880	TAAT	2	8	35664	35671	50 %	50 %	0 %	0 %	89255481
77	NC_007880	AGTA	2	8	36047	36054	50 %	25 %	25 %	0 %	89255481
78	NC_007880	ATTG	2	8	36460	36467	25 %	50 %	25 %	0 %	89255481
79	NC_007880	CTTA	2	8	36475	36482	25 %	50 %	0 %	25 %	89255481
80	NC_007880	GAAT	2	8	37973	37980	50 %	25 %	25 %	0 %	89255483
81	NC_007880	TGAT	2	8	38195	38202	25 %	50 %	25 %	0 %	89255483
82	NC_007880	GATA	2	8	38415	38422	50 %	25 %	25 %	0 %	89255483
83	NC_007880	TAAA	2	8	38671	38678	75 %	25 %	0 %	0 %	89255484
84	NC_007880	AAAC	2	8	38745	38752	75 %	0 %	0 %	25 %	89255484
85	NC_007880	TTTA	2	8	38954	38961	25 %	75 %	0 %	0 %	89255484
86	NC_007880	CCTT	2	8	39291	39298	0 %	50 %	0 %	50 %	89255484
87	NC_007880	TTTC	2	8	39727	39734	0 %	75 %	0 %	25 %	89255485
88	NC_007880	CTTT	2	8	39880	39887	0 %	75 %	0 %	25 %	89255485
89	NC_007880	GTAA	2	8	40891	40898	50 %	25 %	25 %	0 %	89255486
90	NC_007880	ATTG	2	8	40915	40922	25 %	50 %	25 %	0 %	89255486
91	NC_007880	TTAG	2	8	41919	41926	25 %	50 %	25 %	0 %	89255487
92	NC_007880	TCTT	2	8	42898	42905	0 %	75 %	0 %	25 %	89255489
93	NC_007880	CTTG	2	8	44210	44217	0 %	50 %	25 %	25 %	89255490
94	NC_007880	CTTC	2	8	45406	45413	0 %	50 %	0 %	50 %	89255491
95	NC_007880	AAAT	2	8	46023	46030	75 %	25 %	0 %	0 %	89255491
96	NC_007880	AAAT	2	8	46125	46132	75 %	25 %	0 %	0 %	89255491
97	NC_007880	ATTT	2	8	46598	46605	25 %	75 %	0 %	0 %	89255491
98	NC_007880	CAAG	2	8	46900	46907	50 %	0 %	25 %	25 %	89255491
99	NC_007880	CCAG	2	8	46959	46966	25 %	0 %	25 %	50 %	89255491
100	NC_007880	TTCT	2	8	47468	47475	0 %	75 %	0 %	25 %	89255491
101	NC_007880	GTAG	2	8	48530	48537	25 %	25 %	50 %	0 %	89255492
102	NC_007880	ATTT	2	8	48973	48980	25 %	75 %	0 %	0 %	89255493
103	NC_007880	AGTT	2	8	49297	49304	25 %	50 %	25 %	0 %	89255493
104	NC_007880	CTTT	2	8	49707	49714	0 %	75 %	0 %	25 %	89255494
105	NC_007880	CCAT	2	8	49764	49771	25 %	25 %	0 %	50 %	89255494
106	NC_007880	GTTT	2	8	49802	49809	0 %	75 %	25 %	0 %	89255494
107	NC_007880	CCTA	2	8	49933	49940	25 %	25 %	0 %	50 %	89255495
108	NC_007880	CTAG	2	8	50120	50127	25 %	25 %	25 %	25 %	89255495
109	NC_007880	TTTA	2	8	51166	51173	25 %	75 %	0 %	0 %	89255496
110	NC_007880	CTTG	2	8	51575	51582	0 %	50 %	25 %	25 %	89255497
111	NC_007880	AAAT	2	8	51608	51615	75 %	25 %	0 %	0 %	89255497
112	NC_007880	TAAC	2	8	52318	52325	50 %	25 %	0 %	25 %	89255498
113	NC_007880	ACCA	2	8	52391	52398	50 %	0 %	0 %	50 %	89255498
114	NC_007880	AATT	2	8	52440	52447	50 %	50 %	0 %	0 %	89255498
115	NC_007880	TCTT	2	8	53185	53192	0 %	75 %	0 %	25 %	89255499
116	NC_007880	TAAA	2	8	53465	53472	75 %	25 %	0 %	0 %	89255500
117	NC_007880	TCAT	2	8	54030	54037	25 %	50 %	0 %	25 %	89255500
118	NC_007880	AAGT	2	8	54161	54168	50 %	25 %	25 %	0 %	89255500
119	NC_007880	TCAA	2	8	55080	55087	50 %	25 %	0 %	25 %	89255501
120	NC_007880	CAAC	2	8	55119	55126	50 %	0 %	0 %	50 %	89255501
121	NC_007880	ATTA	2	8	55247	55254	50 %	50 %	0 %	0 %	89255501
122	NC_007880	TATT	2	8	55695	55702	25 %	75 %	0 %	0 %	89255502
123	NC_007880	ATAA	2	8	55742	55749	75 %	25 %	0 %	0 %	89255502
124	NC_007880	ATGG	2	8	55807	55814	25 %	25 %	50 %	0 %	89255502
125	NC_007880	AATA	2	8	57954	57961	75 %	25 %	0 %	0 %	89255505
126	NC_007880	CTAA	2	8	57988	57995	50 %	25 %	0 %	25 %	89255505
127	NC_007880	TGAT	2	8	58309	58316	25 %	50 %	25 %	0 %	89255505
128	NC_007880	TGAG	2	8	58778	58785	25 %	25 %	50 %	0 %	89255505
129	NC_007880	ACAA	2	8	58968	58975	75 %	0 %	0 %	25 %	89255505
130	NC_007880	ATTT	2	8	59362	59369	25 %	75 %	0 %	0 %	89255506
131	NC_007880	TGAT	2	8	59811	59818	25 %	50 %	25 %	0 %	89255506
132	NC_007880	GTAG	2	8	60443	60450	25 %	25 %	50 %	0 %	89255507
133	NC_007880	CCAA	2	8	61348	61355	50 %	0 %	0 %	50 %	89255508
134	NC_007880	TAGA	2	8	61558	61565	50 %	25 %	25 %	0 %	89255509
135	NC_007880	ATTT	2	8	61619	61626	25 %	75 %	0 %	0 %	89255509
136	NC_007880	ATTA	2	8	62549	62556	50 %	50 %	0 %	0 %	89255510
137	NC_007880	TGGT	2	8	62682	62689	0 %	50 %	50 %	0 %	89255510
138	NC_007880	GCTA	2	8	62966	62973	25 %	25 %	25 %	25 %	89255510
139	NC_007880	TGTA	2	8	63470	63477	25 %	50 %	25 %	0 %	89255510
140	NC_007880	TTAA	2	8	67244	67251	50 %	50 %	0 %	0 %	89255513
141	NC_007880	TTTC	2	8	67471	67478	0 %	75 %	0 %	25 %	89255513
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