MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica LVS chromosome

Total Repeats: 23590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007880	CAA	2	6	450	455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255450
2	NC_007880	ATT	2	6	482	487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255450
3	NC_007880	TAA	2	6	496	501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255450
4	NC_007880	CAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255450
5	NC_007880	AGA	2	6	595	600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
6	NC_007880	AGT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255450
7	NC_007880	AAG	2	6	632	637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
8	NC_007880	TCA	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255450
9	NC_007880	AGA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
10	NC_007880	TGT	2	6	769	774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255450
11	NC_007880	AGC	2	6	799	804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255450
12	NC_007880	TGG	2	6	859	864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255450
13	NC_007880	ATT	2	6	938	943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255450
14	NC_007880	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255450
15	NC_007880	GAA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
16	NC_007880	CAG	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255450
17	NC_007880	TAC	2	6	1378	1383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255450
18	NC_007880	CTA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255450
19	NC_007880	ATA	2	6	1476	1481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255450
20	NC_007880	GTT	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255450
21	NC_007880	AAG	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255450
22	NC_007880	TGG	2	6	1633	1638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255450
23	NC_007880	GAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255450
24	NC_007880	TAT	2	6	1872	1877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
25	NC_007880	ATA	3	9	1899	1907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
26	NC_007880	TAA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
27	NC_007880	CAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255451
28	NC_007880	TCA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255451
29	NC_007880	TAT	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
30	NC_007880	ATG	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255451
31	NC_007880	CTA	2	6	2282	2287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255451
32	NC_007880	AGA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255451
33	NC_007880	ATA	2	6	2544	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
34	NC_007880	ATT	2	6	2590	2595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
35	NC_007880	TAA	2	6	2674	2679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
36	NC_007880	GAA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255451
37	NC_007880	ATA	2	6	2853	2858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255451
38	NC_007880	ATT	2	6	2867	2872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255451
39	NC_007880	TAA	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255452
40	NC_007880	AGT	3	9	3007	3015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255452
41	NC_007880	TAA	2	6	3019	3024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255452
42	NC_007880	CAC	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255452
43	NC_007880	TGA	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255452
44	NC_007880	ATA	2	6	3209	3214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255452
45	NC_007880	ACC	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255452
46	NC_007880	GAA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255452
47	NC_007880	TAT	2	6	3395	3400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255453
48	NC_007880	ATA	2	6	3479	3484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255453
49	NC_007880	TAG	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
50	NC_007880	ATG	2	6	3575	3580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
51	NC_007880	CAA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255453
52	NC_007880	CTT	3	9	3691	3699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
53	NC_007880	CAC	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255453
54	NC_007880	CTT	2	6	3933	3938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
55	NC_007880	CTT	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
56	NC_007880	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
57	NC_007880	AAC	2	6	4106	4111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255453
58	NC_007880	CTT	2	6	4162	4167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255453
59	NC_007880	ATG	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255453
60	NC_007880	GGT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255454
61	NC_007880	TAC	2	6	4346	4351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255454
62	NC_007880	TGA	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
63	NC_007880	GAT	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
64	NC_007880	TTA	2	6	4484	4489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255454
65	NC_007880	CAA	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255454
66	NC_007880	TGA	2	6	4575	4580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
67	NC_007880	ATT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255454
68	NC_007880	AAT	2	6	4662	4667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255454
69	NC_007880	GGT	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255454
70	NC_007880	TAG	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255454
71	NC_007880	ATT	2	6	4978	4983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255455
72	NC_007880	GAA	2	6	4984	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255455
73	NC_007880	TTC	2	6	5083	5088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255455
74	NC_007880	ATC	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255455
75	NC_007880	CAT	2	6	5220	5225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255455
76	NC_007880	ATA	2	6	5240	5245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255455
77	NC_007880	TGG	2	6	5294	5299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255455
78	NC_007880	GCA	2	6	5360	5365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255455
79	NC_007880	ACA	2	6	5468	5473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255455
80	NC_007880	TAG	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255455
81	NC_007880	TAA	2	6	5611	5616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255455
82	NC_007880	AGT	2	6	5624	5629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255455
83	NC_007880	ATT	2	6	5713	5718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255455
84	NC_007880	CAG	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255455
85	NC_007880	ATA	2	6	5814	5819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255455
86	NC_007880	ATA	2	6	5882	5887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255455
87	NC_007880	CAA	2	6	5970	5975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255455
88	NC_007880	ATC	2	6	6064	6069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255455
89	NC_007880	ATG	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255455
90	NC_007880	TCT	2	6	6279	6284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255455
91	NC_007880	ACA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255455
92	NC_007880	AGT	2	6	6910	6915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255456
93	NC_007880	TTG	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255456
94	NC_007880	TAA	2	6	7278	7283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255457
95	NC_007880	TAA	2	6	7359	7364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255457
96	NC_007880	TGA	2	6	7384	7389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255457
97	NC_007880	TGA	2	6	7426	7431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255457
98	NC_007880	TTG	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255457
99	NC_007880	AGG	2	6	7483	7488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255457
100	NC_007880	TGA	2	6	7504	7509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255457
101	NC_007880	TTA	2	6	7597	7602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255457
102	NC_007880	GCT	2	6	7607	7612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255457
103	NC_007880	TCA	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255457
104	NC_007880	ACA	2	6	7886	7891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255457
105	NC_007880	TAA	2	6	7984	7989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255457
106	NC_007880	TTG	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255457
107	NC_007880	CAG	2	6	8031	8036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255457
108	NC_007880	TAT	2	6	8063	8068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255457
109	NC_007880	TGG	2	6	8226	8231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255458
110	NC_007880	TGG	2	6	8262	8267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255458
111	NC_007880	TGA	2	6	8334	8339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255458
112	NC_007880	GAT	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255458
113	NC_007880	GAT	2	6	8440	8445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255458
114	NC_007880	CAG	2	6	8474	8479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255458
115	NC_007880	CAA	2	6	8503	8508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255458
116	NC_007880	CTG	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255458
117	NC_007880	AAT	2	6	8729	8734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255458
118	NC_007880	CTA	2	6	8929	8934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255459
119	NC_007880	ATT	2	6	9076	9081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255459
120	NC_007880	ATG	2	6	9101	9106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255459
121	NC_007880	AAC	2	6	9111	9116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255459
122	NC_007880	CAA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255459
123	NC_007880	AAG	2	6	9203	9208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255459
124	NC_007880	AGC	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255459
125	NC_007880	CTA	2	6	9454	9459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255460
126	NC_007880	AGA	2	6	9467	9472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255460
127	NC_007880	ATG	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255460
128	NC_007880	AAG	2	6	9583	9588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255460
129	NC_007880	GTG	2	6	9673	9678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255460
130	NC_007880	CAG	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255460
131	NC_007880	AAG	2	6	9874	9879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255461
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133	NC_007880	AGG	2	6	9941	9946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255461
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