MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Frankia sp. CcI3 chromosome

Total Repeats: 129109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007777	TCACT	2	10	147293	147302	20 %	40 %	0 %	40 %	86738842
3502	NC_007777	GGT	2	6	147312	147317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738842
3503	NC_007777	GAG	2	6	147658	147663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738842
3504	NC_007777	GGC	2	6	147678	147683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738842
3505	NC_007777	GCG	2	6	147735	147740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738842
3506	NC_007777	CCG	2	6	147758	147763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738842
3507	NC_007777	TGA	2	6	147810	147815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86738842
3508	NC_007777	ACG	2	6	147841	147846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738842
3509	NC_007777	CAG	2	6	147952	147957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738842
3510	NC_007777	ATT	2	6	147967	147972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86738842
3511	NC_007777	TGCT	2	8	148049	148056	0 %	50 %	25 %	25 %	86738842
3512	NC_007777	GTC	2	6	148307	148312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738843
3513	NC_007777	GCT	2	6	148348	148353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738843
3514	NC_007777	AGC	2	6	148452	148457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738843
3515	NC_007777	CGC	2	6	148549	148554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738843
3516	NC_007777	CGT	2	6	148606	148611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738843
3517	NC_007777	CG	3	6	148628	148633	0 %	0 %	50 %	50 %	86738843
3518	NC_007777	CAA	2	6	148636	148641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86738843
3519	NC_007777	TAC	2	6	148646	148651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86738843
3520	NC_007777	CGGC	2	8	148705	148712	0 %	0 %	50 %	50 %	86738843
3521	NC_007777	CTCTAC	2	12	148805	148816	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	86738843
3522	NC_007777	CGG	2	6	148834	148839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738843
3523	NC_007777	CCT	2	6	148852	148857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86738843
3524	NC_007777	AAC	2	6	148880	148885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86738843
3525	NC_007777	AGG	2	6	148905	148910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86738843
3526	NC_007777	CCA	2	6	148926	148931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86738843
3527	NC_007777	GGT	2	6	149098	149103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738844
3528	NC_007777	TGG	2	6	149147	149152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86738844
3529	NC_007777	TGC	2	6	149235	149240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3530	NC_007777	CGT	2	6	149271	149276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
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3532	NC_007777	CGG	2	6	149317	149322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738844
3533	NC_007777	GCG	2	6	149323	149328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86738844
3534	NC_007777	TCG	2	6	149346	149351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3535	NC_007777	CG	3	6	149401	149406	0 %	0 %	50 %	50 %	86738844
3536	NC_007777	TCG	3	9	149451	149459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3537	NC_007777	GGCCG	2	10	149473	149482	0 %	0 %	60 %	40 %	86738844
3538	NC_007777	CGT	3	9	149488	149496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3539	NC_007777	CGGG	2	8	149516	149523	0 %	0 %	75 %	25 %	86738844
3540	NC_007777	GAA	2	6	149524	149529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86738844
3541	NC_007777	ACG	2	6	149553	149558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738844
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3543	NC_007777	TCG	2	6	149607	149612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
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3545	NC_007777	GCT	2	6	149632	149637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
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3547	NC_007777	CTGC	2	8	149650	149657	0 %	25 %	25 %	50 %	86738844
3548	NC_007777	CTGG	2	8	149707	149714	0 %	25 %	50 %	25 %	86738844
3549	NC_007777	CCGC	2	8	149715	149722	0 %	0 %	25 %	75 %	86738844
3550	NC_007777	CGCC	2	8	149752	149759	0 %	0 %	25 %	75 %	86738844
3551	NC_007777	CGT	2	6	149767	149772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3552	NC_007777	GCC	2	6	149780	149785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738844
3553	NC_007777	CGA	2	6	149794	149799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3554	NC_007777	GAC	2	6	149830	149835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738844
3555	NC_007777	CCG	2	6	149842	149847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738844
3556	NC_007777	CGC	2	6	149851	149856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738844
3557	NC_007777	CGCCCC	2	12	149863	149874	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	86738844
3558	NC_007777	GGCC	2	8	149894	149901	0 %	0 %	50 %	50 %	86738844
3559	NC_007777	CCCT	2	8	149924	149931	0 %	25 %	0 %	75 %	86738844
3560	NC_007777	CGC	2	6	149941	149946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738844
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3562	NC_007777	CGT	2	6	150058	150063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738844
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3564	NC_007777	CGAC	2	8	150114	150121	25 %	0 %	25 %	50 %	86738844
3565	NC_007777	CCG	2	6	150135	150140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738844
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3569	NC_007777	GGCCT	2	10	150266	150275	0 %	20 %	40 %	40 %	86738844
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3580	NC_007777	CGCCT	2	10	150482	150491	0 %	20 %	20 %	60 %	86738844
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3591	NC_007777	GGCG	2	8	151750	151757	0 %	0 %	75 %	25 %	86738845
3592	NC_007777	GTGG	2	8	151829	151836	0 %	25 %	75 %	0 %	86738845
3593	NC_007777	CG	3	6	151880	151885	0 %	0 %	50 %	50 %	86738845
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3596	NC_007777	GCCG	2	8	152080	152087	0 %	0 %	50 %	50 %	86738845
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3601	NC_007777	CGC	2	6	152195	152200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738845
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3608	NC_007777	CTCG	2	8	152309	152316	0 %	25 %	25 %	50 %	86738845
3609	NC_007777	GCAGCC	2	12	152347	152358	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	86738845
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3741	NC_007777	TCG	2	6	160517	160522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86738853
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3994	NC_007777	TCACCG	2	12	173428	173439	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86738867
3995	NC_007777	CCG	2	6	173443	173448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86738867
3996	NC_007777	ACCT	2	8	173472	173479	25 %	25 %	0 %	50 %	86738867
3997	NC_007777	CACC	2	8	173521	173528	25 %	0 %	0 %	75 %	86738867
3998	NC_007777	GGAC	2	8	173530	173537	25 %	0 %	50 %	25 %	86738867
3999	NC_007777	CGA	2	6	173570	173575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86738867
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