MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	CAAGAT	2	12	766	777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707188
2	NC_006570	TATATC	2	12	12043	12054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56707193
3	NC_006570	CTGCTT	2	12	14899	14910	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56707196
4	NC_006570	TACTGA	2	12	15065	15076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707196
5	NC_006570	AGATGG	2	12	17164	17175	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	56707198
6	NC_006570	TTATAT	2	12	17509	17520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707198
7	NC_006570	TCAAGA	2	12	18078	18089	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707199
8	NC_006570	GAAGCA	2	12	18303	18314	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707200
9	NC_006570	GAGTAT	2	12	20300	20311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707201
10	NC_006570	CCAGAT	2	12	20438	20449	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56707201
11	NC_006570	GTAAAG	2	12	20982	20993	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707201
12	NC_006570	CAAATC	2	12	26597	26608	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56707207
13	NC_006570	AGCTAA	2	12	28087	28098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707208
14	NC_006570	TACTCG	2	12	31876	31887	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707212
15	NC_006570	TGGTGC	2	12	34946	34957	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56707216
16	NC_006570	TGCAAA	2	12	36006	36017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707217
17	NC_006570	ATATTG	2	12	37467	37478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707217
18	NC_006570	TAACAT	2	12	40101	40112	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707220
19	NC_006570	TCAGTC	2	12	40239	40250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707221
20	NC_006570	TGCAAA	2	12	42272	42283	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707222
21	NC_006570	TTGGTA	2	12	43055	43066	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707223
22	NC_006570	TATTGG	2	12	43743	43754	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707223
23	NC_006570	TTTTGA	2	12	49123	49134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707227
24	NC_006570	TGAAGA	2	12	49389	49400	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707228
25	NC_006570	GGCAAA	2	12	59122	59133	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707235
26	NC_006570	ATTATG	2	12	59781	59792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707236
27	NC_006570	ATAAAT	2	12	61255	61266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707238
28	NC_006570	AGGCTA	2	12	61503	61514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56707239
29	NC_006570	AGCAAG	2	12	66478	66489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707244
30	NC_006570	GTTAGA	2	12	76210	76221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707253
31	NC_006570	AAAGCT	2	12	77460	77471	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707255
32	NC_006570	TAAAGC	2	12	77660	77671	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707255
33	NC_006570	ATTATA	2	12	78829	78840	50 %	50 %	0 %	0 %	56707255
34	NC_006570	AAATGC	2	12	78907	78918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707255
35	NC_006570	AGATAC	2	12	81132	81143	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707256
36	NC_006570	GGAGCA	2	12	84258	84269	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	56707260
37	NC_006570	TGGTGT	2	12	89426	89437	0 %	50 %	50 %	0 %	56707265
38	NC_006570	ATCCGT	2	12	90951	90962	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707265
39	NC_006570	TGATGT	2	12	91391	91402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707265
40	NC_006570	AGCTTG	2	12	94348	94359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707268
41	NC_006570	GTTGAG	2	12	99935	99946	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707271
42	NC_006570	AAAAAC	2	12	100152	100163	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	56707271
43	NC_006570	GCAAAT	2	12	109742	109753	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707279
44	NC_006570	CAAATA	2	12	110253	110264	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707279
45	NC_006570	CAACAT	2	12	111366	111377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56707279
46	NC_006570	CAATAG	2	12	113477	113488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707280
47	NC_006570	TAAATA	2	12	114164	114175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707281
48	NC_006570	TGCAGC	2	12	116377	116388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	56707283
49	NC_006570	TTATAG	2	12	117842	117853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707284
50	NC_006570	AGATAA	2	12	117864	117875	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56707284
51	NC_006570	GAAAGT	2	12	119471	119482	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707285
52	NC_006570	CTGGTA	2	12	119659	119670	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707285
53	NC_006570	GCAAAT	2	12	127900	127911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707292
54	NC_006570	TAGGTG	2	12	130813	130824	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707294
55	NC_006570	TTAATA	2	12	142543	142554	50 %	50 %	0 %	0 %	56707301
56	NC_006570	ACTTTG	2	12	144842	144853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707303
57	NC_006570	ATTGTT	2	12	147423	147434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707305
58	NC_006570	AGCAAC	2	12	148416	148427	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56707306
59	NC_006570	TAGATC	2	12	149379	149390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707306
60	NC_006570	GCTGTT	2	12	154503	154514	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56707313
61	NC_006570	AGAAAA	2	12	155520	155531	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	56707314
62	NC_006570	TTGATT	2	12	155788	155799	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707314
63	NC_006570	GGTAAA	2	12	156243	156254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707314
64	NC_006570	TATATG	2	12	158643	158654	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707314
65	NC_006570	GTTGAG	2	12	159322	159333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	56707315
66	NC_006570	TGCCTA	2	12	169490	169501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707322
67	NC_006570	TGATTT	2	12	172524	172535	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707327
68	NC_006570	ATAAAC	2	12	173953	173964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707328
69	NC_006570	ATTAAA	2	12	175499	175510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707330
70	NC_006570	TTTCAT	2	12	177213	177224	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56707333
71	NC_006570	GTTTTA	2	12	186304	186315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707340
72	NC_006570	TCCTTG	2	12	191934	191945	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56707343
73	NC_006570	AGCTAT	2	12	192861	192872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707344
74	NC_006570	TAAAAG	2	12	196643	196654	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	56707345
75	NC_006570	AAATAA	2	12	197230	197241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	56707346
76	NC_006570	TTATGA	2	12	201369	201380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707350
77	NC_006570	ATCAAA	2	12	203894	203905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707353
78	NC_006570	GTACAG	2	12	204067	204078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56707353
79	NC_006570	TATTGA	2	12	208269	208280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707356
80	NC_006570	CAAAGT	2	12	208399	208410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707356
81	NC_006570	AAATGC	2	12	211752	211763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707359
82	NC_006570	ATAGCT	2	12	212898	212909	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707360
83	NC_006570	CAGATA	2	12	222452	222463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	56707367
84	NC_006570	ATCGTA	2	12	222674	222685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707368
85	NC_006570	AAGGTA	2	12	222705	222716	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707368
86	NC_006570	TTGTGT	2	12	226419	226430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707371
87	NC_006570	GTTGCT	2	12	230084	230095	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	56707374
88	NC_006570	TAGTAT	2	12	230164	230175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707374
89	NC_006570	TCATTA	2	12	230911	230922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56707375
90	NC_006570	GACAAG	2	12	233874	233885	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56707376
91	NC_006570	GTTTTA	2	12	234570	234581	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707377
92	NC_006570	GCCATT	2	12	236062	236073	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707378
93	NC_006570	ACTGTT	2	12	237465	237476	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707379
94	NC_006570	AATTAT	2	12	239088	239099	50 %	50 %	0 %	0 %	56707380
95	NC_006570	ATCAAT	2	12	240726	240737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707382
96	NC_006570	TTTGTC	2	12	246867	246878	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	56707389
97	NC_006570	AGCTGG	2	12	247398	247409	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56707390
98	NC_006570	AGCCAA	2	12	250742	250753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56707395
99	NC_006570	ATAATT	2	12	254985	254996	50 %	50 %	0 %	0 %	56707400
100	NC_006570	ATTGAT	2	12	255248	255259	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707400
101	NC_006570	GTTTTA	2	12	259881	259892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707403
102	NC_006570	TATCAG	2	12	261172	261183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707405
103	NC_006570	GGTATT	2	12	261438	261449	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	56707405
104	NC_006570	TTGAGA	2	12	273261	273272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707413
105	NC_006570	TTAGGC	2	12	274118	274129	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707413
106	NC_006570	TATTTT	2	12	277357	277368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	56707417
107	NC_006570	AAATAT	2	12	284743	284754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707424
108	NC_006570	ACAGGT	2	12	286911	286922	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56707427
109	NC_006570	ACTTTT	2	12	287254	287265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56707428
110	NC_006570	GTTTTA	2	12	287879	287890	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	56707429
111	NC_006570	CAAATT	2	12	293259	293270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56707433
112	NC_006570	TTTTAT	2	12	293944	293955	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	56707434
113	NC_006570	TTAAGT	2	12	294685	294696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707434
114	NC_006570	ATTATA	2	12	299957	299968	50 %	50 %	0 %	0 %	56707439
115	NC_006570	GCTTTA	2	12	300104	300115	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707439
116	NC_006570	CACCAA	2	12	301724	301735	50 %	0 %	0 %	50 %	56707441
117	NC_006570	ACTAGT	2	12	309193	309204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707448
118	NC_006570	AAGATG	2	12	313730	313741	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	56707452
119	NC_006570	TACTGC	2	12	314346	314357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56707452
120	NC_006570	TTTAGC	2	12	314544	314555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707452
121	NC_006570	ATTAGT	2	12	315147	315158	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56707452
122	NC_006570	ATAAGT	2	12	316233	316244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	56707454
123	NC_006570	TAGCTT	2	12	319151	319162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56707457
124	NC_006570	AATTTC	2	12	322009	322020	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	56707460
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133	NC_006570	GTTTTT	2	12	333045	333056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	56707471
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232	NC_006570	CTAAAA	2	12	564936	564947	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707675
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236	NC_006570	AGCTAC	2	12	574590	574601	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56707686
237	NC_006570	TTCAGG	2	12	575471	575482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56707687
238	NC_006570	TACGAT	2	12	576456	576467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56707689
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240	NC_006570	CAACGT	2	12	579977	579988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56707692
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351	NC_006570	ACTAAA	2	12	867881	867892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56707960
352	NC_006570	TAAAAT	2	12	868033	868044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707960
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453	NC_006570	ACTGAT	2	12	1108457	1108468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56708180
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456	NC_006570	CATCAG	2	12	1116166	1116177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56708184
457	NC_006570	CACAAA	2	12	1119320	1119331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56708186
458	NC_006570	GCCAAA	2	12	1120834	1120845	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	56708187
459	NC_006570	GCTCTT	2	12	1123056	1123067	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56708190
460	NC_006570	ATTATA	2	12	1123722	1123733	50 %	50 %	0 %	0 %	56708191
461	NC_006570	ATTAAG	2	12	1125122	1125133	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	56708193
462	NC_006570	ATCTTT	2	12	1125451	1125462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56708193
463	NC_006570	ATCAAC	2	12	1126048	1126059	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56708193
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465	NC_006570	TATATT	2	12	1138283	1138294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56708204
466	NC_006570	TCTAAC	2	12	1142350	1142361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708207
467	NC_006570	CTTTTA	2	12	1144802	1144813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	56708208
468	NC_006570	ATAAAA	2	12	1147031	1147042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	56708210
469	NC_006570	CATTCA	2	12	1155117	1155128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56708216
470	NC_006570	CTACCA	2	12	1158318	1158329	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	56708218
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472	NC_006570	AATACC	2	12	1164851	1164862	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	56708221
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489	NC_006570	TCAGGT	2	12	1195716	1195727	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56708247
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499	NC_006570	ATATTT	2	12	1219692	1219703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56708264
500	NC_006570	TGCTTC	2	12	1220165	1220176	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56708264

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