MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4 chromosome

Total Repeats: 22407

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006570	TTA	2	6	26	31	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
2	NC_006570	CAA	2	6	221	226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707188
3	NC_006570	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
4	NC_006570	TAA	2	6	267	272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707188
5	NC_006570	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707188
6	NC_006570	AGA	2	6	366	371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
7	NC_006570	AGT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707188
8	NC_006570	AAG	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
9	NC_006570	TCA	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707188
10	NC_006570	AGA	2	6	480	485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
11	NC_006570	TGT	2	6	540	545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707188
12	NC_006570	AGC	3	9	570	578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707188
13	NC_006570	TGG	2	6	630	635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707188
14	NC_006570	ATT	2	6	709	714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
15	NC_006570	TTA	2	6	734	739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707188
16	NC_006570	GAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
17	NC_006570	CAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707188
18	NC_006570	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707188
19	NC_006570	CTA	2	6	1178	1183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707188
20	NC_006570	ATA	2	6	1247	1252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707188
21	NC_006570	GTT	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707188
22	NC_006570	AAG	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707188
23	NC_006570	TGG	2	6	1404	1409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707188
24	NC_006570	GAT	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707188
25	NC_006570	TAT	2	6	1643	1648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
26	NC_006570	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
27	NC_006570	TAA	2	6	1857	1862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
28	NC_006570	CAA	2	6	1951	1956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707189
29	NC_006570	TCA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707189
30	NC_006570	TAT	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
31	NC_006570	ATG	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707189
32	NC_006570	CTA	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707189
33	NC_006570	AGA	2	6	2193	2198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707189
34	NC_006570	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
35	NC_006570	ATT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
36	NC_006570	TAA	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
37	NC_006570	GAA	2	6	2560	2565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707189
38	NC_006570	ATA	2	6	2624	2629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707189
39	NC_006570	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707189
40	NC_006570	ATA	2	6	3251	3256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707190
41	NC_006570	TAG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
42	NC_006570	ATG	2	6	3347	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
43	NC_006570	CAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707190
44	NC_006570	CTT	3	9	3463	3471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
45	NC_006570	CTT	2	6	3705	3710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
46	NC_006570	CTT	2	6	3730	3735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
47	NC_006570	GAT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
48	NC_006570	AAC	2	6	3878	3883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707190
49	NC_006570	CTT	2	6	3934	3939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707190
50	NC_006570	ATG	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707190
51	NC_006570	AGT	3	9	4949	4957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707191
52	NC_006570	AGC	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707191
53	NC_006570	TGC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707191
54	NC_006570	TTA	2	6	5045	5050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707191
55	NC_006570	AGC	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707191
56	NC_006570	AGA	2	6	5072	5077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707191
57	NC_006570	GAT	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707191
58	NC_006570	TCT	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707191
59	NC_006570	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707191
60	NC_006570	TTG	2	6	5298	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707191
61	NC_006570	CTA	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707191
62	NC_006570	CTG	3	9	5355	5363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707191
63	NC_006570	TGG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707191
64	NC_006570	ATT	2	6	5516	5521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707191
65	NC_006570	ATT	2	6	5590	5595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707191
66	NC_006570	CTG	2	6	5604	5609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707191
67	NC_006570	TTG	2	6	5673	5678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707191
68	NC_006570	GTT	2	6	5857	5862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707191
69	NC_006570	TCG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707192
70	NC_006570	GGT	2	6	6140	6145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707192
71	NC_006570	GTT	2	6	6266	6271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707192
72	NC_006570	TTA	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
73	NC_006570	GAT	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
74	NC_006570	CGT	2	6	6440	6445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707192
75	NC_006570	ATA	2	6	6510	6515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707192
76	NC_006570	TGA	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
77	NC_006570	TGA	2	6	6769	6774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
78	NC_006570	AGA	2	6	6943	6948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707192
79	NC_006570	GAT	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
80	NC_006570	TTG	2	6	7077	7082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707192
81	NC_006570	GAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707192
82	NC_006570	TAT	2	6	7230	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
83	NC_006570	TAA	2	6	7318	7323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707192
84	NC_006570	GTT	2	6	7343	7348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707192
85	NC_006570	GAT	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
86	NC_006570	AGA	2	6	7453	7458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707192
87	NC_006570	TTA	2	6	7485	7490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
88	NC_006570	GGT	2	6	7505	7510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707192
89	NC_006570	TGA	3	9	7573	7581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707192
90	NC_006570	TGG	2	6	7639	7644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707192
91	NC_006570	TTA	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707192
92	NC_006570	TGC	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707192
93	NC_006570	AGC	2	6	7776	7781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707192
94	NC_006570	GCA	2	6	11573	11578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707193
95	NC_006570	ATA	2	6	11585	11590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707193
96	NC_006570	TCA	2	6	11687	11692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707193
97	NC_006570	GTT	3	9	11726	11734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707193
98	NC_006570	ATT	2	6	11770	11775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707193
99	NC_006570	ATA	2	6	11947	11952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707193
100	NC_006570	AGC	2	6	12165	12170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707193
101	NC_006570	ATA	2	6	12174	12179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707193
102	NC_006570	TAT	2	6	12181	12186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707193
103	NC_006570	TTA	2	6	12499	12504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707194
104	NC_006570	TAG	2	6	12525	12530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707194
105	NC_006570	TGT	3	9	12535	12543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707194
106	NC_006570	AAC	2	6	12582	12587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707194
107	NC_006570	ATT	2	6	12672	12677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707194
108	NC_006570	TAG	2	6	12689	12694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707194
109	NC_006570	ATC	2	6	12717	12722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707194
110	NC_006570	TGA	2	6	13355	13360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707195
111	NC_006570	CAT	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707195
112	NC_006570	ATT	2	6	13470	13475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707195
113	NC_006570	AGA	2	6	13565	13570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707195
114	NC_006570	AGA	2	6	13757	13762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707195
115	NC_006570	GAA	2	6	13800	13805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707195
116	NC_006570	TCA	2	6	13965	13970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707195
117	NC_006570	CAG	2	6	14101	14106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707195
118	NC_006570	TAT	2	6	14135	14140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707195
119	NC_006570	TCG	2	6	14182	14187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707195
120	NC_006570	GAA	2	6	14348	14353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707195
121	NC_006570	ATA	2	6	14380	14385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707195
122	NC_006570	TGT	2	6	14522	14527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707196
123	NC_006570	AGT	2	6	14559	14564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707196
124	NC_006570	AGA	2	6	14567	14572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707196
125	NC_006570	CAA	2	6	14575	14580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707196
126	NC_006570	GAA	2	6	14664	14669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707196
127	NC_006570	ATT	2	6	14686	14691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707196
128	NC_006570	TAT	2	6	14724	14729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707196
129	NC_006570	TGT	2	6	14825	14830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707196
130	NC_006570	AGG	2	6	14965	14970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56707196
131	NC_006570	GGA	2	6	15036	15041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56707196
132	NC_006570	TAT	2	6	15252	15257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707197
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262	NC_006570	CAT	3	9	25062	25070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707206
263	NC_006570	ATC	2	6	25105	25110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707206
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280	NC_006570	TAT	3	9	25837	25845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707207
281	NC_006570	TGA	2	6	25879	25884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707207
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498	NC_006570	TTG	2	6	40477	40482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707221
499	NC_006570	ATA	2	6	40557	40562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707222
500	NC_006570	AGC	2	6	40574	40579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707222

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