MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 1748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021592	TTTCA	2	10	145	154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021592	TTAAT	2	10	928	937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021592	ATTTA	2	10	1359	1368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021592	TCTAA	2	10	3877	3886	40 %	40 %	0 %	20 %	518651365
5	NC_021592	TGTAT	2	10	3904	3913	20 %	60 %	20 %	0 %	518651365
6	NC_021592	ATTTT	2	10	4518	4527	20 %	80 %	0 %	0 %	518651366
7	NC_021592	ATTAC	2	10	5280	5289	40 %	40 %	0 %	20 %	518651366
8	NC_021592	TAAAT	2	10	6627	6636	60 %	40 %	0 %	0 %	518651367
9	NC_021592	CTTTC	2	10	7472	7481	0 %	60 %	0 %	40 %	518651368
10	NC_021592	GAACT	2	10	7835	7844	40 %	20 %	20 %	20 %	518651368
11	NC_021592	TTTAT	2	10	9015	9024	20 %	80 %	0 %	0 %	518651369
12	NC_021592	ATTTT	2	10	10396	10405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021592	AATAA	2	10	10822	10831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021592	AGTAC	2	10	11597	11606	40 %	20 %	20 %	20 %	518651371
15	NC_021592	CAATA	2	10	11792	11801	60 %	20 %	0 %	20 %	518651371
16	NC_021592	AAATA	2	10	11918	11927	80 %	20 %	0 %	0 %	518651371
17	NC_021592	TTCAA	2	10	12861	12870	40 %	40 %	0 %	20 %	518651371
18	NC_021592	TACAT	2	10	12997	13006	40 %	40 %	0 %	20 %	518651371
19	NC_021592	AAGAA	2	10	13464	13473	80 %	0 %	20 %	0 %	518651371
20	NC_021592	GGGAT	2	10	16232	16241	20 %	20 %	60 %	0 %	518651374
21	NC_021592	AAATA	2	10	17262	17271	80 %	20 %	0 %	0 %	518651374
22	NC_021592	TAAAA	2	10	18395	18404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021592	CTTCG	2	10	19979	19988	0 %	40 %	20 %	40 %	518651378
24	NC_021592	AGTGC	2	10	23063	23072	20 %	20 %	40 %	20 %	518651380
25	NC_021592	TAAAA	2	10	24649	24658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021592	CTTTT	2	10	24974	24983	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021592	TGATT	2	10	27419	27428	20 %	60 %	20 %	0 %	518651381
28	NC_021592	TTGAT	2	10	29885	29894	20 %	60 %	20 %	0 %	518651382
29	NC_021592	TGGAA	2	10	32047	32056	40 %	20 %	40 %	0 %	518651383
30	NC_021592	TGAAA	2	10	35593	35602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021592	AGAAA	2	10	36196	36205	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021592	ACAAT	2	10	36667	36676	60 %	20 %	0 %	20 %	518651386
33	NC_021592	TATAA	2	10	37097	37106	60 %	40 %	0 %	0 %	518651386
34	NC_021592	TTAAT	2	10	37929	37938	40 %	60 %	0 %	0 %	518651386
35	NC_021592	TAATC	2	10	38173	38182	40 %	40 %	0 %	20 %	518651386
36	NC_021592	ATATT	2	10	41957	41966	40 %	60 %	0 %	0 %	518651389
37	NC_021592	TACTG	2	10	44302	44311	20 %	40 %	20 %	20 %	518651390
38	NC_021592	TAAAA	2	10	44365	44374	80 %	20 %	0 %	0 %	518651390
39	NC_021592	AATGG	2	10	45683	45692	40 %	20 %	40 %	0 %	518651390
40	NC_021592	TATTT	2	10	46382	46391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021592	ATGGG	2	10	48588	48597	20 %	20 %	60 %	0 %	518651392
42	NC_021592	ATCTC	2	10	52037	52046	20 %	40 %	0 %	40 %	518651395
43	NC_021592	TCCTG	2	10	52261	52270	0 %	40 %	20 %	40 %	518651395
44	NC_021592	TAATA	2	10	52314	52323	60 %	40 %	0 %	0 %	518651395
45	NC_021592	ATTAT	2	10	53655	53664	40 %	60 %	0 %	0 %	518651397
46	NC_021592	ATATA	2	10	54302	54311	60 %	40 %	0 %	0 %	518651397
47	NC_021592	GTATA	2	10	54748	54757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021592	AAAAT	2	10	55634	55643	80 %	20 %	0 %	0 %	518651399
49	NC_021592	GAAAA	2	10	56312	56321	80 %	0 %	20 %	0 %	518651400
50	NC_021592	AAGCA	2	10	56421	56430	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021592	TTATG	2	10	56923	56932	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021592	TAAAA	2	10	58836	58845	80 %	20 %	0 %	0 %	518651402
53	NC_021592	CAATT	2	10	59103	59112	40 %	40 %	0 %	20 %	518651402
54	NC_021592	AGCAG	2	10	59618	59627	40 %	0 %	40 %	20 %	518651402
55	NC_021592	ATTAT	2	10	61433	61442	40 %	60 %	0 %	0 %	518651403
56	NC_021592	ATTAA	2	10	61682	61691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021592	TCAAT	2	10	61918	61927	40 %	40 %	0 %	20 %	518651404
58	NC_021592	CATAT	2	10	61954	61963	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021592	TGAAA	2	10	65006	65015	60 %	20 %	20 %	0 %	518651408
60	NC_021592	AATTG	2	10	65492	65501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021592	AGGAT	2	10	66510	66519	40 %	20 %	40 %	0 %	518651409
62	NC_021592	ATTTC	2	10	66673	66682	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_021592	TTAAT	2	10	67001	67010	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021592	AGTTA	2	10	68926	68935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021592	ATTTT	2	10	70082	70091	20 %	80 %	0 %	0 %	518651413
66	NC_021592	TTATA	2	10	70663	70672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021592	ATTGA	2	10	71813	71822	40 %	40 %	20 %	0 %	518651416
68	NC_021592	TTTAT	2	10	72048	72057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021592	CAAAA	2	10	74753	74762	80 %	0 %	0 %	20 %	518651419
70	NC_021592	AATTA	2	10	75159	75168	60 %	40 %	0 %	0 %	518651419
71	NC_021592	GTATA	2	10	77033	77042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021592	TTTAT	2	10	78182	78191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021592	AAGGC	2	10	78758	78767	40 %	0 %	40 %	20 %	518651424
74	NC_021592	ATACA	2	10	80073	80082	60 %	20 %	0 %	20 %	518651425
75	NC_021592	ATTAG	2	10	80299	80308	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021592	ATACA	2	10	81621	81630	60 %	20 %	0 %	20 %	518651426
77	NC_021592	ATTGT	2	10	81772	81781	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021592	TTGTA	2	10	84511	84520	20 %	60 %	20 %	0 %	518651428
79	NC_021592	TATAT	2	10	86300	86309	40 %	60 %	0 %	0 %	518651430
80	NC_021592	TATAT	2	10	86462	86471	40 %	60 %	0 %	0 %	518651430
81	NC_021592	TCTTT	2	10	86688	86697	0 %	80 %	0 %	20 %	518651430
82	NC_021592	CTTTT	2	10	87200	87209	0 %	80 %	0 %	20 %	518651430
83	NC_021592	AATAT	2	10	88289	88298	60 %	40 %	0 %	0 %	518651431
84	NC_021592	TTAAT	2	10	90684	90693	40 %	60 %	0 %	0 %	518651434
85	NC_021592	ATGGC	2	10	91067	91076	20 %	20 %	40 %	20 %	518651434
86	NC_021592	AAATT	2	10	93359	93368	60 %	40 %	0 %	0 %	518651436
87	NC_021592	GCAGG	2	10	93425	93434	20 %	0 %	60 %	20 %	518651436
88	NC_021592	TCAAT	2	10	95852	95861	40 %	40 %	0 %	20 %	518651438
89	NC_021592	AAATT	2	10	96022	96031	60 %	40 %	0 %	0 %	518651438
90	NC_021592	TTTCT	2	10	99284	99293	0 %	80 %	0 %	20 %	518651441
91	NC_021592	TAAAT	2	10	100541	100550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021592	ATTAA	2	10	100963	100972	60 %	40 %	0 %	0 %	518651444
93	NC_021592	AATAA	2	10	105038	105047	80 %	20 %	0 %	0 %	518651447
94	NC_021592	AATAG	2	10	105075	105084	60 %	20 %	20 %	0 %	518651447
95	NC_021592	ATATA	2	10	105240	105249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021592	CATTT	2	10	105760	105769	20 %	60 %	0 %	20 %	518651448
97	NC_021592	CAATC	2	10	105858	105867	40 %	20 %	0 %	40 %	518651448
98	NC_021592	GAAGA	2	10	105906	105915	60 %	0 %	40 %	0 %	518651448
99	NC_021592	TAAAA	2	10	106718	106727	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021592	TAAAT	2	10	107521	107530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021592	CCTGA	2	10	108890	108899	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_021592	ATTCA	2	10	109930	109939	40 %	40 %	0 %	20 %	518651451
103	NC_021592	GGGAT	2	10	110001	110010	20 %	20 %	60 %	0 %	518651451
104	NC_021592	ATCTT	2	10	111258	111267	20 %	60 %	0 %	20 %	518651452
105	NC_021592	CATTT	2	10	114040	114049	20 %	60 %	0 %	20 %	518651456
106	NC_021592	AATGG	2	10	115044	115053	40 %	20 %	40 %	0 %	518651457
107	NC_021592	AAGAG	2	10	115216	115225	60 %	0 %	40 %	0 %	518651457
108	NC_021592	AATTA	2	10	118059	118068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021592	CCAGG	2	10	118110	118119	20 %	0 %	40 %	40 %	518651461
110	NC_021592	CAACA	2	10	123069	123078	60 %	0 %	0 %	40 %	518651464
111	NC_021592	AATTA	2	10	124747	124756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021592	TTATG	2	10	126514	126523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021592	CTATC	2	10	126531	126540	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_021592	TAAAA	2	10	126743	126752	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021592	TTATT	2	10	126768	126777	20 %	80 %	0 %	0 %	518651466
116	NC_021592	TCAGG	2	10	126801	126810	20 %	20 %	40 %	20 %	518651466
117	NC_021592	AGTAT	2	10	127160	127169	40 %	40 %	20 %	0 %	518651466
118	NC_021592	AAGTA	2	10	129445	129454	60 %	20 %	20 %	0 %	518651468
119	NC_021592	ATGGC	2	10	130278	130287	20 %	20 %	40 %	20 %	518651469
120	NC_021592	AAATA	2	10	131648	131657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021592	GAAAA	2	10	131699	131708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021592	TTTTA	2	10	133003	133012	20 %	80 %	0 %	0 %	518651470
123	NC_021592	TGCTA	2	10	133501	133510	20 %	40 %	20 %	20 %	518651471
124	NC_021592	TTTAT	2	10	136529	136538	20 %	80 %	0 %	0 %	518651474
125	NC_021592	AAATA	2	10	136841	136850	80 %	20 %	0 %	0 %	518651474
126	NC_021592	TAATT	2	10	137126	137135	40 %	60 %	0 %	0 %	518651474
127	NC_021592	TTTAT	2	10	137137	137146	20 %	80 %	0 %	0 %	518651474
128	NC_021592	TAAAA	2	10	138044	138053	80 %	20 %	0 %	0 %	518651475
129	NC_021592	TACGG	2	10	140177	140186	20 %	20 %	40 %	20 %	518651476
130	NC_021592	TATAC	2	10	143513	143522	40 %	40 %	0 %	20 %	518651478
131	NC_021592	ATTCA	2	10	143572	143581	40 %	40 %	0 %	20 %	518651478
132	NC_021592	ATGCA	2	10	144090	144099	40 %	20 %	20 %	20 %	518651478
133	NC_021592	GAATG	2	10	144551	144560	40 %	20 %	40 %	0 %	518651478
134	NC_021592	TTAAT	2	10	145287	145296	40 %	60 %	0 %	0 %	518651479
135	NC_021592	AGTAT	2	10	145354	145363	40 %	40 %	20 %	0 %	518651479
136	NC_021592	AAATA	2	10	146328	146337	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021592	ATATA	2	10	146571	146580	60 %	40 %	0 %	0 %	518651480
138	NC_021592	CCCAG	2	10	147041	147050	20 %	0 %	20 %	60 %	518651480
139	NC_021592	ATAGG	2	10	147332	147341	40 %	20 %	40 %	0 %	518651480
140	NC_021592	TAAAA	2	10	147912	147921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021592	GCATG	2	10	147978	147987	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_021592	CTATA	2	10	149891	149900	40 %	40 %	0 %	20 %	518651481
143	NC_021592	TTTCA	2	10	150006	150015	20 %	60 %	0 %	20 %	518651481
144	NC_021592	GACCA	2	10	150562	150571	40 %	0 %	20 %	40 %	518651482
145	NC_021592	CAATG	2	10	155832	155841	40 %	20 %	20 %	20 %	518651486
146	NC_021592	CAATG	2	10	157303	157312	40 %	20 %	20 %	20 %	518651487
147	NC_021592	TGGCA	2	10	157415	157424	20 %	20 %	40 %	20 %	518651487
148	NC_021592	CTGGC	2	10	157828	157837	0 %	20 %	40 %	40 %	518651487
149	NC_021592	ATAGA	2	10	158278	158287	60 %	20 %	20 %	0 %	518651488
150	NC_021592	TAAAA	2	10	160137	160146	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021592	TAATT	2	10	160721	160730	40 %	60 %	0 %	0 %	518651490
152	NC_021592	AAATA	2	10	161238	161247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021592	ATATA	2	10	161281	161290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021592	ATGCT	2	10	161646	161655	20 %	40 %	20 %	20 %	518651491
155	NC_021592	ATCAT	2	10	162260	162269	40 %	40 %	0 %	20 %	518651491
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157	NC_021592	ATATA	2	10	163766	163775	60 %	40 %	0 %	0 %	518651492
158	NC_021592	TACTT	2	10	165173	165182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_021592	AAATA	2	10	166870	166879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021592	TAATA	2	10	167982	167991	60 %	40 %	0 %	0 %	518651496
163	NC_021592	AGTAT	2	10	168349	168358	40 %	40 %	20 %	0 %	518651496
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167	NC_021592	TTCTG	2	10	175047	175056	0 %	60 %	20 %	20 %	518651503
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170	NC_021592	ATTAT	2	10	176856	176865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021592	GCTTT	2	10	180187	180196	0 %	60 %	20 %	20 %	518651507
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174	NC_021592	AATGG	2	10	183933	183942	40 %	20 %	40 %	0 %	518651510
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177	NC_021592	GAATA	2	10	187574	187583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021592	ATAAA	2	10	187607	187616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_021592	TTATT	2	10	187719	187728	20 %	80 %	0 %	0 %	518651513
180	NC_021592	TTTTC	2	10	187746	187755	0 %	80 %	0 %	20 %	518651513
181	NC_021592	TTTTA	2	10	188168	188177	20 %	80 %	0 %	0 %	518651513
182	NC_021592	ATCAC	2	10	188360	188369	40 %	20 %	0 %	40 %	518651513
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185	NC_021592	TCCTG	2	10	190257	190266	0 %	40 %	20 %	40 %	518651514
186	NC_021592	CATTA	2	10	190667	190676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
187	NC_021592	AGTAA	2	10	190867	190876	60 %	20 %	20 %	0 %	518651515
188	NC_021592	TGATA	2	10	191541	191550	40 %	40 %	20 %	0 %	518651515
189	NC_021592	TGGAG	2	10	191664	191673	20 %	20 %	60 %	0 %	518651515
190	NC_021592	ATTGG	2	10	191949	191958	20 %	40 %	40 %	0 %	518651515
191	NC_021592	TATAT	2	10	192314	192323	40 %	60 %	0 %	0 %	518651515
192	NC_021592	CATAT	2	10	192361	192370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_021592	TATCT	2	10	195021	195030	20 %	60 %	0 %	20 %	518651518
194	NC_021592	TATTG	2	10	195623	195632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021592	AGAAA	2	10	195860	195869	80 %	0 %	20 %	0 %	518651519
196	NC_021592	ATGGC	2	10	196420	196429	20 %	20 %	40 %	20 %	518651519
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202	NC_021592	TTAAT	2	10	200535	200544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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206	NC_021592	TATAA	2	10	204866	204875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_021592	TATAA	2	10	209476	209485	60 %	40 %	0 %	0 %	518651529
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212	NC_021592	CCAGA	2	10	212256	212265	40 %	0 %	20 %	40 %	518651533
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214	NC_021592	GCAGT	2	10	215593	215602	20 %	20 %	40 %	20 %	518651535
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222	NC_021592	TGTCC	2	10	225296	225305	0 %	40 %	20 %	40 %	518651543
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232	NC_021592	TGGAT	2	10	235097	235106	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
233	NC_021592	ATAGA	2	10	235146	235155	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_021592	TGGAT	2	10	250816	250825	20 %	40 %	40 %	0 %	518651569
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251	NC_021592	TATTT	2	10	260186	260195	20 %	80 %	0 %	0 %	518651579
252	NC_021592	ATATT	2	10	260206	260215	40 %	60 %	0 %	0 %	518651579
253	NC_021592	TAGTT	2	10	260231	260240	20 %	60 %	20 %	0 %	518651579
254	NC_021592	TTTAT	2	10	260658	260667	20 %	80 %	0 %	0 %	518651579
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256	NC_021592	ATAAA	2	10	261664	261673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021592	ATTTT	2	10	262243	262252	20 %	80 %	0 %	0 %	518651580
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263	NC_021592	AGGGA	2	10	267716	267725	40 %	0 %	60 %	0 %	518651586
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266	NC_021592	ATTGC	2	10	272004	272013	20 %	40 %	20 %	20 %	518651591
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268	NC_021592	TTCTC	2	10	274440	274449	0 %	60 %	0 %	40 %	518651593
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270	NC_021592	GAATA	2	10	275308	275317	60 %	20 %	20 %	0 %	518651594
271	NC_021592	CTTTT	2	10	276469	276478	0 %	80 %	0 %	20 %	518651596
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273	NC_021592	ATTAT	2	10	277598	277607	40 %	60 %	0 %	0 %	518651599
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403	NC_021592	AAAAG	2	10	427142	427151	80 %	0 %	20 %	0 %	518651760
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