MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 42146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021592	A	6	6	42141	42146	100 %	0 %	0 %	0 %	518651389
1003	NC_021592	GAT	2	6	42148	42153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651389
1004	NC_021592	ATT	2	6	42188	42193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651389
1005	NC_021592	TAT	2	6	42251	42256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651389
1006	NC_021592	AT	3	6	42255	42260	50 %	50 %	0 %	0 %	518651389
1007	NC_021592	TGA	3	9	42300	42308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651389
1008	NC_021592	AT	3	6	42338	42343	50 %	50 %	0 %	0 %	518651389
1009	NC_021592	TTG	3	9	42410	42418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651389
1010	NC_021592	CAA	2	6	42455	42460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651389
1011	NC_021592	GCT	2	6	42471	42476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651389
1012	NC_021592	AAT	2	6	42550	42555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
1013	NC_021592	AT	3	6	42558	42563	50 %	50 %	0 %	0 %	518651389
1014	NC_021592	TTA	3	9	42579	42587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651389
1015	NC_021592	TAC	2	6	42648	42653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651389
1016	NC_021592	CAA	2	6	42654	42659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651389
1017	NC_021592	TAGA	2	8	42674	42681	50 %	25 %	25 %	0 %	518651389
1018	NC_021592	TGA	2	6	42747	42752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651389
1019	NC_021592	TATT	2	8	42753	42760	25 %	75 %	0 %	0 %	518651389
1020	NC_021592	ACA	2	6	42769	42774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651389
1021	NC_021592	CGG	2	6	42795	42800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	518651389
1022	NC_021592	TAA	2	6	42806	42811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
1023	NC_021592	AAT	2	6	42862	42867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
1024	NC_021592	AGG	2	6	42877	42882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651389
1025	NC_021592	CA	3	6	42935	42940	50 %	0 %	0 %	50 %	518651389
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1028	NC_021592	A	7	7	43069	43075	100 %	0 %	0 %	0 %	518651389
1029	NC_021592	ATT	2	6	43185	43190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651389
1030	NC_021592	AATT	2	8	43193	43200	50 %	50 %	0 %	0 %	518651389
1031	NC_021592	ACT	2	6	43205	43210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651389
1032	NC_021592	A	6	6	43352	43357	100 %	0 %	0 %	0 %	518651389
1033	NC_021592	TGA	2	6	43362	43367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651389
1034	NC_021592	GCA	2	6	43376	43381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651389
1035	NC_021592	AATTAT	2	12	43438	43449	50 %	50 %	0 %	0 %	518651389
1036	NC_021592	ATT	2	6	43504	43509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651389
1037	NC_021592	ATA	2	6	43529	43534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
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1039	NC_021592	A	6	6	43627	43632	100 %	0 %	0 %	0 %	518651389
1040	NC_021592	TAA	2	6	43647	43652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
1041	NC_021592	ATA	2	6	43673	43678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
1042	NC_021592	ACAT	2	8	43694	43701	50 %	25 %	0 %	25 %	518651389
1043	NC_021592	ATA	3	9	43717	43725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651389
1044	NC_021592	TGG	2	6	43758	43763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651389
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1046	NC_021592	TAT	2	6	43842	43847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651389
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1048	NC_021592	TA	3	6	43937	43942	50 %	50 %	0 %	0 %	518651389
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1051	NC_021592	CAT	2	6	44222	44227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651390
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1054	NC_021592	TACTG	2	10	44302	44311	20 %	40 %	20 %	20 %	518651390
1055	NC_021592	ATG	2	6	44337	44342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651390
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1057	NC_021592	TAAAA	2	10	44365	44374	80 %	20 %	0 %	0 %	518651390
1058	NC_021592	GTA	2	6	44402	44407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651390
1059	NC_021592	TAA	3	9	44431	44439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651390
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1065	NC_021592	TTG	2	6	44808	44813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651390
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1067	NC_021592	TAT	2	6	44908	44913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651390
1068	NC_021592	TGA	2	6	44935	44940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651390
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1082	NC_021592	GAAA	2	8	45548	45555	75 %	0 %	25 %	0 %	518651390
1083	NC_021592	GGA	2	6	45556	45561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651390
1084	NC_021592	CAGG	2	8	45631	45638	25 %	0 %	50 %	25 %	518651390
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1086	NC_021592	AATGG	2	10	45683	45692	40 %	20 %	40 %	0 %	518651390
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1089	NC_021592	AAT	2	6	45823	45828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651390
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1092	NC_021592	A	6	6	46022	46027	100 %	0 %	0 %	0 %	518651390
1093	NC_021592	TCG	2	6	46116	46121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651390
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1095	NC_021592	AGA	2	6	46201	46206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651390
1096	NC_021592	TGA	2	6	46210	46215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651390
1097	NC_021592	CG	3	6	46222	46227	0 %	0 %	50 %	50 %	518651390
1098	NC_021592	TA	4	8	46357	46364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021592	TATTT	2	10	46382	46391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021592	CT	3	6	46429	46434	0 %	50 %	0 %	50 %	518651391
1101	NC_021592	TATT	2	8	46511	46518	25 %	75 %	0 %	0 %	518651391
1102	NC_021592	TAT	2	6	46527	46532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651391
1103	NC_021592	CTGATT	2	12	46588	46599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	518651391
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1108	NC_021592	ATT	2	6	46870	46875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651391
1109	NC_021592	GCA	2	6	46916	46921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651391
1110	NC_021592	TTA	3	9	46958	46966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651391
1111	NC_021592	TAA	2	6	46998	47003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651391
1112	NC_021592	GTA	2	6	47152	47157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021592	TA	4	8	47156	47163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021592	AT	3	6	47165	47170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021592	TA	3	6	47325	47330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021592	TCAA	2	8	47371	47378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_021592	GATG	2	8	47385	47392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_021592	CCT	2	6	47393	47398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_021592	TCA	2	6	47470	47475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_021592	TTC	2	6	47508	47513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_021592	AATA	2	8	47554	47561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021592	ATG	2	6	47611	47616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651392
1123	NC_021592	GCT	2	6	47625	47630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651392
1124	NC_021592	AGC	2	6	47714	47719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651392
1125	NC_021592	AC	3	6	47728	47733	50 %	0 %	0 %	50 %	518651392
1126	NC_021592	TCAT	2	8	47781	47788	25 %	50 %	0 %	25 %	518651392
1127	NC_021592	TGG	2	6	47809	47814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651392
1128	NC_021592	AAT	2	6	47849	47854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651392
1129	NC_021592	AGG	2	6	47943	47948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651392
1130	NC_021592	GA	3	6	48076	48081	50 %	0 %	50 %	0 %	518651392
1131	NC_021592	GCAG	2	8	48086	48093	25 %	0 %	50 %	25 %	518651392
1132	NC_021592	GCT	2	6	48161	48166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651392
1133	NC_021592	GAA	2	6	48201	48206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651392
1134	NC_021592	GGA	2	6	48270	48275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651392
1135	NC_021592	CTC	2	6	48292	48297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	518651392
1136	NC_021592	AGA	2	6	48322	48327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651392
1137	NC_021592	TAA	2	6	48337	48342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651392
1138	NC_021592	GAA	2	6	48518	48523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651392
1139	NC_021592	ATGGG	2	10	48588	48597	20 %	20 %	60 %	0 %	518651392
1140	NC_021592	ATA	2	6	48612	48617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651392
1141	NC_021592	GAG	2	6	48648	48653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651392
1142	NC_021592	GCTG	2	8	48683	48690	0 %	25 %	50 %	25 %	518651392
1143	NC_021592	AGA	2	6	48692	48697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651392
1144	NC_021592	CAT	2	6	48711	48716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651392
1145	NC_021592	T	7	7	48766	48772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1146	NC_021592	TACA	2	8	48780	48787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1147	NC_021592	TTA	2	6	48829	48834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1148	NC_021592	ATC	2	6	48836	48841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1149	NC_021592	TTAA	2	8	48874	48881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_021592	TCCC	2	8	48950	48957	0 %	25 %	0 %	75 %	518651393
1151	NC_021592	AAT	2	6	48968	48973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651393
1152	NC_021592	AT	3	6	49013	49018	50 %	50 %	0 %	0 %	518651393
1153	NC_021592	AAGG	2	8	49152	49159	50 %	0 %	50 %	0 %	518651393
1154	NC_021592	TGC	2	6	49178	49183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651393
1155	NC_021592	GCA	2	6	49202	49207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651393
1156	NC_021592	CAA	2	6	49227	49232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651393
1157	NC_021592	AAT	2	6	49264	49269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651393
1158	NC_021592	GGGT	2	8	49322	49329	0 %	25 %	75 %	0 %	518651393
1159	NC_021592	GA	3	6	49390	49395	50 %	0 %	50 %	0 %	518651393
1160	NC_021592	AAG	2	6	49421	49426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651393
1161	NC_021592	CAC	2	6	49435	49440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651393
1162	NC_021592	CAA	2	6	49443	49448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651393
1163	NC_021592	ATCC	2	8	49451	49458	25 %	25 %	0 %	50 %	518651393
1164	NC_021592	GAA	2	6	49520	49525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651393
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1167	NC_021592	TTC	2	6	49642	49647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651393
1168	NC_021592	ACA	2	6	49658	49663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651393
1169	NC_021592	GAT	2	6	49711	49716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651393
1170	NC_021592	GAA	2	6	49766	49771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651393
1171	NC_021592	ATT	2	6	49784	49789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651393
1172	NC_021592	GGC	2	6	49795	49800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	518651393
1173	NC_021592	ATGT	2	8	49994	50001	25 %	50 %	25 %	0 %	518651393
1174	NC_021592	GAA	2	6	50014	50019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651393
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1178	NC_021592	TTG	2	6	50354	50359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1179	NC_021592	AAT	2	6	50536	50541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1180	NC_021592	TA	4	8	50562	50569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1181	NC_021592	ATA	2	6	50631	50636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1182	NC_021592	T	6	6	50715	50720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1183	NC_021592	CTG	2	6	50761	50766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1184	NC_021592	TG	3	6	50765	50770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1185	NC_021592	CTT	2	6	50824	50829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1186	NC_021592	ATC	2	6	50889	50894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1187	NC_021592	ATT	2	6	50900	50905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1188	NC_021592	AAG	2	6	50953	50958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1189	NC_021592	AAT	2	6	50990	50995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1190	NC_021592	CTGC	2	8	50999	51006	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1191	NC_021592	GGA	2	6	51066	51071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1192	NC_021592	ATT	2	6	51078	51083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1193	NC_021592	ATTT	2	8	51109	51116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1194	NC_021592	TTA	2	6	51146	51151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1195	NC_021592	AATT	2	8	51165	51172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1196	NC_021592	TA	4	8	51182	51189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1197	NC_021592	A	7	7	51189	51195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1198	NC_021592	ATTA	2	8	51204	51211	50 %	50 %	0 %	0 %	518651394
1199	NC_021592	A	6	6	51216	51221	100 %	0 %	0 %	0 %	518651394
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1201	NC_021592	A	7	7	51303	51309	100 %	0 %	0 %	0 %	518651394
1202	NC_021592	AGA	2	6	51330	51335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651394
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1205	NC_021592	GAATAA	2	12	51420	51431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	518651394
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1207	NC_021592	GAAA	2	8	51488	51495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1208	NC_021592	A	6	6	51515	51520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1209	NC_021592	AT	3	6	51596	51601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1210	NC_021592	TA	3	6	51615	51620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1211	NC_021592	ATT	2	6	51634	51639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1212	NC_021592	ATTA	2	8	51667	51674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1213	NC_021592	AAT	2	6	51702	51707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1214	NC_021592	ATTT	2	8	51818	51825	25 %	75 %	0 %	0 %	518651395
1215	NC_021592	T	7	7	51869	51875	0 %	100 %	0 %	0 %	518651395
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1217	NC_021592	ATTT	2	8	51945	51952	25 %	75 %	0 %	0 %	518651395
1218	NC_021592	ACTT	2	8	51997	52004	25 %	50 %	0 %	25 %	518651395
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1222	NC_021592	CAA	2	6	52062	52067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651395
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1228	NC_021592	TAATA	2	10	52314	52323	60 %	40 %	0 %	0 %	518651395
1229	NC_021592	TA	3	6	52399	52404	50 %	50 %	0 %	0 %	518651395
1230	NC_021592	CCT	2	6	52466	52471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	518651395
1231	NC_021592	TATT	2	8	52563	52570	25 %	75 %	0 %	0 %	518651395
1232	NC_021592	TCA	2	6	52589	52594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651395
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1234	NC_021592	TA	3	6	52696	52701	50 %	50 %	0 %	0 %	518651395
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1239	NC_021592	TAA	2	6	52834	52839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651395
1240	NC_021592	AT	3	6	52846	52851	50 %	50 %	0 %	0 %	518651395
1241	NC_021592	TAT	2	6	52915	52920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651395
1242	NC_021592	TTC	2	6	52925	52930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651395
1243	NC_021592	ATT	2	6	52957	52962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651395
1244	NC_021592	GAAT	2	8	52978	52985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_021592	TTA	2	6	53006	53011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1246	NC_021592	ATC	2	6	53017	53022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1247	NC_021592	A	6	6	53027	53032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_021592	AT	3	6	53095	53100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1249	NC_021592	TTA	2	6	53124	53129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_021592	AT	3	6	53158	53163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_021592	A	6	6	53221	53226	100 %	0 %	0 %	0 %	518651396
1252	NC_021592	TTC	2	6	53253	53258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651396
1253	NC_021592	T	6	6	53323	53328	0 %	100 %	0 %	0 %	518651396
1254	NC_021592	ATA	2	6	53425	53430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651396
1255	NC_021592	GTATAC	2	12	53433	53444	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1256	NC_021592	TA	3	6	53445	53450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1257	NC_021592	T	6	6	53455	53460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1258	NC_021592	AGC	2	6	53511	53516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1259	NC_021592	CTAT	2	8	53616	53623	25 %	50 %	0 %	25 %	518651397
1260	NC_021592	ATTAT	2	10	53655	53664	40 %	60 %	0 %	0 %	518651397
1261	NC_021592	AAT	2	6	53712	53717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651397
1262	NC_021592	ATT	2	6	53741	53746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651397
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1281	NC_021592	TC	3	6	54538	54543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1287	NC_021592	TA	3	6	54797	54802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1393	NC_021592	TAAAA	2	10	58836	58845	80 %	20 %	0 %	0 %	518651402
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1463	NC_021592	TAT	2	6	61494	61499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_021592	TAT	2	6	61503	61508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1467	NC_021592	ATC	2	6	61639	61644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1469	NC_021592	ATTAA	2	10	61682	61691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_021592	A	7	7	61693	61699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_021592	CTT	2	6	62231	62236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651405
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1488	NC_021592	ATA	2	6	62601	62606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1491	NC_021592	TAAA	2	8	62771	62778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1492	NC_021592	TTA	2	6	62784	62789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1493	NC_021592	TAT	2	6	62806	62811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1494	NC_021592	AT	3	6	62820	62825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1495	NC_021592	AAT	2	6	62826	62831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1496	NC_021592	ATA	3	9	62841	62849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651406
1497	NC_021592	CAT	2	6	62874	62879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651406
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