MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica FSC200 chromosome

Total Repeats: 5269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019551	ATTA	2	8	129	136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019551	ACTT	2	8	153	160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019551	TTAT	2	8	173	180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019551	GCAA	2	8	892	899	50 %	0 %	25 %	25 %	422937996
5	NC_019551	TGAT	2	8	1044	1051	25 %	50 %	25 %	0 %	422937996
6	NC_019551	GTAC	2	8	1331	1338	25 %	25 %	25 %	25 %	422937996
7	NC_019551	GCTT	2	8	1427	1434	0 %	50 %	25 %	25 %	422937996
8	NC_019551	ATGC	2	8	1658	1665	25 %	25 %	25 %	25 %	422937996
9	NC_019551	TAAA	2	8	1748	1755	75 %	25 %	0 %	0 %	422937996
10	NC_019551	AGTT	2	8	1960	1967	25 %	50 %	25 %	0 %	422937997
11	NC_019551	TGAT	2	8	2043	2050	25 %	50 %	25 %	0 %	422937997
12	NC_019551	AGCA	2	8	2157	2164	50 %	0 %	25 %	25 %	422937997
13	NC_019551	TCTA	2	8	2801	2808	25 %	50 %	0 %	25 %	422937997
14	NC_019551	GTTT	2	8	2859	2866	0 %	75 %	25 %	0 %	422937997
15	NC_019551	GAAT	2	8	2935	2942	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019551	TCAA	2	8	4008	4015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_019551	CAAC	2	8	4047	4054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019551	ATTA	2	8	4175	4182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019551	TGTT	2	8	4598	4605	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019551	GGTA	2	8	4608	4615	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019551	ATTT	2	8	5248	5255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019551	TTGA	2	8	5398	5405	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019551	TTTC	2	8	5535	5542	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019551	TTTA	2	8	5698	5705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019551	ATTA	2	8	5764	5771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019551	TAGC	2	8	6443	6450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_019551	ATTA	2	8	6693	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019551	ATGA	2	8	6844	6851	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019551	GTTT	2	8	7263	7270	0 %	75 %	25 %	0 %	422937998
30	NC_019551	AAAT	2	8	7470	7477	75 %	25 %	0 %	0 %	422937998
31	NC_019551	TATG	2	8	7558	7565	25 %	50 %	25 %	0 %	422937998
32	NC_019551	TGTA	2	8	7567	7574	25 %	50 %	25 %	0 %	422937998
33	NC_019551	ATTA	2	8	8846	8853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019551	AGCA	2	8	9325	9332	50 %	0 %	25 %	25 %	422938001
35	NC_019551	TCTT	2	8	9371	9378	0 %	75 %	0 %	25 %	422938001
36	NC_019551	AGCA	2	8	9753	9760	50 %	0 %	25 %	25 %	422938001
37	NC_019551	CAAG	2	8	10281	10288	50 %	0 %	25 %	25 %	422938002
38	NC_019551	TTAT	2	8	10567	10574	25 %	75 %	0 %	0 %	422938002
39	NC_019551	AAAT	2	8	10769	10776	75 %	25 %	0 %	0 %	422938002
40	NC_019551	AAAT	2	8	10998	11005	75 %	25 %	0 %	0 %	422938003
41	NC_019551	AGTT	2	8	11302	11309	25 %	50 %	25 %	0 %	422938003
42	NC_019551	ATTT	2	8	11401	11408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019551	GCAG	2	8	12610	12617	25 %	0 %	50 %	25 %	422938005
44	NC_019551	CATA	2	8	12789	12796	50 %	25 %	0 %	25 %	422938005
45	NC_019551	TTGG	2	8	12807	12814	0 %	50 %	50 %	0 %	422938005
46	NC_019551	ATTT	2	8	12986	12993	25 %	75 %	0 %	0 %	422938005
47	NC_019551	TATT	2	8	13239	13246	25 %	75 %	0 %	0 %	422938006
48	NC_019551	GGTT	2	8	13324	13331	0 %	50 %	50 %	0 %	422938006
49	NC_019551	CTAT	2	8	13341	13348	25 %	50 %	0 %	25 %	422938006
50	NC_019551	TAGA	2	8	14286	14293	50 %	25 %	25 %	0 %	422938006
51	NC_019551	AATG	2	8	14521	14528	50 %	25 %	25 %	0 %	422938006
52	NC_019551	TCAA	2	8	16906	16913	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_019551	CAAC	2	8	16945	16952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019551	ATTA	2	8	17073	17080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019551	AACT	2	8	18007	18014	50 %	25 %	0 %	25 %	422938007
56	NC_019551	ATCT	2	8	18680	18687	25 %	50 %	0 %	25 %	422938007
57	NC_019551	TAAT	2	8	18961	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	422938007
58	NC_019551	CAAA	2	8	19492	19499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019551	CAAA	2	8	19567	19574	75 %	0 %	0 %	25 %	422938008
60	NC_019551	ATAG	2	8	19811	19818	50 %	25 %	25 %	0 %	422938008
61	NC_019551	GCTG	2	8	20330	20337	0 %	25 %	50 %	25 %	422938008
62	NC_019551	TAAA	2	8	20747	20754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019551	TAAC	2	8	20769	20776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019551	ACCA	2	8	20907	20914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019551	TTAA	2	8	21230	21237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019551	TAAT	2	8	21412	21419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019551	GTTG	2	8	21540	21547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019551	ATTG	2	8	21578	21585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019551	AGTT	2	8	22467	22474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019551	TTTA	2	8	22526	22533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019551	AAGA	2	8	22934	22941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019551	TTTG	2	8	23759	23766	0 %	75 %	25 %	0 %	422938009
73	NC_019551	TAAA	2	8	24439	24446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019551	TAAT	2	8	24501	24508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019551	TTAA	2	8	24563	24570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019551	TTTA	2	8	24902	24909	25 %	75 %	0 %	0 %	422938010
77	NC_019551	TTTA	2	8	25065	25072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019551	ATTA	2	8	25173	25180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019551	TCAG	2	8	25300	25307	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019551	TAAA	2	8	26225	26232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019551	TCTA	2	8	26537	26544	25 %	50 %	0 %	25 %	422938011
82	NC_019551	AGTG	2	8	26778	26785	25 %	25 %	50 %	0 %	422938011
83	NC_019551	TATT	2	8	27313	27320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019551	TTAC	2	8	27822	27829	25 %	50 %	0 %	25 %	422938012
85	NC_019551	CATT	2	8	28189	28196	25 %	50 %	0 %	25 %	422938012
86	NC_019551	TAGA	2	8	28264	28271	50 %	25 %	25 %	0 %	422938012
87	NC_019551	ATCA	2	8	28415	28422	50 %	25 %	0 %	25 %	422938012
88	NC_019551	CTTT	2	8	29002	29009	0 %	75 %	0 %	25 %	422938012
89	NC_019551	TCTT	2	8	29279	29286	0 %	75 %	0 %	25 %	422938012
90	NC_019551	ATCT	2	8	29327	29334	25 %	50 %	0 %	25 %	422938012
91	NC_019551	TGGT	2	8	30981	30988	0 %	50 %	50 %	0 %	422938013
92	NC_019551	CAGA	2	8	31059	31066	50 %	0 %	25 %	25 %	422938013
93	NC_019551	ATTT	2	8	31415	31422	25 %	75 %	0 %	0 %	422938013
94	NC_019551	TACG	2	8	31514	31521	25 %	25 %	25 %	25 %	422938013
95	NC_019551	ATTA	2	8	32276	32283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019551	AGAT	2	8	32689	32696	50 %	25 %	25 %	0 %	422938014
97	NC_019551	ATCT	2	8	34120	34127	25 %	50 %	0 %	25 %	422938015
98	NC_019551	TTGT	2	8	34167	34174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019551	ACTA	2	8	34190	34197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_019551	TGAT	2	8	34466	34473	25 %	50 %	25 %	0 %	422938016
101	NC_019551	ACTT	2	8	35263	35270	25 %	50 %	0 %	25 %	422938016
102	NC_019551	TAAT	2	8	35664	35671	50 %	50 %	0 %	0 %	422938017
103	NC_019551	AGTA	2	8	36047	36054	50 %	25 %	25 %	0 %	422938017
104	NC_019551	ATTG	2	8	36460	36467	25 %	50 %	25 %	0 %	422938017
105	NC_019551	CTTA	2	8	36475	36482	25 %	50 %	0 %	25 %	422938017
106	NC_019551	ATTT	2	8	36808	36815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019551	TATT	2	8	37206	37213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019551	GAAT	2	8	37973	37980	50 %	25 %	25 %	0 %	422938018
109	NC_019551	TGAT	2	8	38195	38202	25 %	50 %	25 %	0 %	422938018
110	NC_019551	GATA	2	8	38415	38422	50 %	25 %	25 %	0 %	422938018
111	NC_019551	TAAA	2	8	38671	38678	75 %	25 %	0 %	0 %	422938019
112	NC_019551	AAAC	2	8	38745	38752	75 %	0 %	0 %	25 %	422938019
113	NC_019551	TTTA	2	8	38954	38961	25 %	75 %	0 %	0 %	422938019
114	NC_019551	CCTT	2	8	39291	39298	0 %	50 %	0 %	50 %	422938019
115	NC_019551	TTTC	2	8	39727	39734	0 %	75 %	0 %	25 %	422938020
116	NC_019551	CTTT	2	8	39880	39887	0 %	75 %	0 %	25 %	422938020
117	NC_019551	TTAT	2	8	40604	40611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019551	GTAA	2	8	40891	40898	50 %	25 %	25 %	0 %	422938021
119	NC_019551	ATTG	2	8	40915	40922	25 %	50 %	25 %	0 %	422938021
120	NC_019551	TTAG	2	8	41919	41926	25 %	50 %	25 %	0 %	422938022
121	NC_019551	TCTT	2	8	42898	42905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_019551	AATA	2	8	43408	43415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019551	GTAT	2	8	43439	43446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019551	CTTG	2	8	44210	44217	0 %	50 %	25 %	25 %	422938023
125	NC_019551	CTTC	2	8	45406	45413	0 %	50 %	0 %	50 %	422938024
126	NC_019551	AAAT	2	8	46023	46030	75 %	25 %	0 %	0 %	422938024
127	NC_019551	AAAT	2	8	46125	46132	75 %	25 %	0 %	0 %	422938024
128	NC_019551	ATTT	2	8	46598	46605	25 %	75 %	0 %	0 %	422938024
129	NC_019551	CAAG	2	8	46900	46907	50 %	0 %	25 %	25 %	422938024
130	NC_019551	CCAG	2	8	46959	46966	25 %	0 %	25 %	50 %	422938024
131	NC_019551	TTCT	2	8	47468	47475	0 %	75 %	0 %	25 %	422938024
132	NC_019551	ACCT	2	8	47687	47694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_019551	AGTT	2	8	47778	47785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019551	GTAG	2	8	48530	48537	25 %	25 %	50 %	0 %	422938025
135	NC_019551	ATTT	2	8	48973	48980	25 %	75 %	0 %	0 %	422938026
136	NC_019551	AGTT	2	8	49297	49304	25 %	50 %	25 %	0 %	422938026
137	NC_019551	CTTT	2	8	49707	49714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_019551	CCAT	2	8	49764	49771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019551	GTTT	2	8	49802	49809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019551	CCTA	2	8	49933	49940	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_019551	CTAG	2	8	50120	50127	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019551	ATTT	2	8	50758	50765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019551	ATCT	2	8	50784	50791	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019551	TTTA	2	8	51166	51173	25 %	75 %	0 %	0 %	422938027
145	NC_019551	TAAT	2	8	51450	51457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019551	CTTG	2	8	51575	51582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_019551	AAAT	2	8	51608	51615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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