MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 1599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	AAGAA	2	10	1181	1190	80 %	0 %	20 %	0 %	423049751
2	NC_019537	CATCT	2	10	3512	3521	20 %	40 %	0 %	40 %	423049754
3	NC_019537	TTCTT	2	10	3584	3593	0 %	80 %	0 %	20 %	423049755
4	NC_019537	CCTTG	2	10	3782	3791	0 %	40 %	20 %	40 %	423049755
5	NC_019537	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	423049758
6	NC_019537	CAACA	2	10	6924	6933	60 %	0 %	0 %	40 %	423049759
7	NC_019537	TGTTT	2	10	8632	8641	0 %	80 %	20 %	0 %	423049761
8	NC_019537	CAAGA	2	10	11612	11621	60 %	0 %	20 %	20 %	423049765
9	NC_019537	TTGAT	2	10	13940	13949	20 %	60 %	20 %	0 %	423049767
10	NC_019537	CATCT	2	10	16410	16419	20 %	40 %	0 %	40 %	423049768
11	NC_019537	TTCTT	2	10	16482	16491	0 %	80 %	0 %	20 %	423049769
12	NC_019537	CCTTG	2	10	16680	16689	0 %	40 %	20 %	40 %	423049769
13	NC_019537	AGCTA	2	10	19244	19253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019537	ACGCA	2	10	19774	19783	40 %	0 %	20 %	40 %	423049772
15	NC_019537	TTGAA	2	10	19863	19872	40 %	40 %	20 %	0 %	423049772
16	NC_019537	GCAAA	2	10	20378	20387	60 %	0 %	20 %	20 %	423049772
17	NC_019537	TTAAT	2	10	20485	20494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019537	TGATT	2	10	20672	20681	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019537	CAAGG	2	10	21255	21264	40 %	0 %	40 %	20 %	423049773
20	NC_019537	AAAGA	2	10	21452	21461	80 %	0 %	20 %	0 %	423049773
21	NC_019537	ATTTT	2	10	23023	23032	20 %	80 %	0 %	0 %	423049776
22	NC_019537	ATATC	2	10	23095	23104	40 %	40 %	0 %	20 %	423049776
23	NC_019537	ATTTT	2	10	23190	23199	20 %	80 %	0 %	0 %	423049776
24	NC_019537	AGATA	2	10	23334	23343	60 %	20 %	20 %	0 %	423049776
25	NC_019537	CAAAG	2	10	25307	25316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019537	ATATT	2	10	25683	25692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019537	ATTTT	2	10	26087	26096	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019537	ATTTG	2	10	26147	26156	20 %	60 %	20 %	0 %	423049778
29	NC_019537	AAAGA	2	10	26865	26874	80 %	0 %	20 %	0 %	423049778
30	NC_019537	CATTT	2	10	28509	28518	20 %	60 %	0 %	20 %	423049779
31	NC_019537	ATAGT	2	10	30839	30848	40 %	40 %	20 %	0 %	423049780
32	NC_019537	AAAAT	2	10	33080	33089	80 %	20 %	0 %	0 %	423049781
33	NC_019537	GTTTA	2	10	33771	33780	20 %	60 %	20 %	0 %	423049782
34	NC_019537	TCAAA	2	10	34025	34034	60 %	20 %	0 %	20 %	423049783
35	NC_019537	GAAAA	2	10	35856	35865	80 %	0 %	20 %	0 %	423049784
36	NC_019537	CTTGT	2	10	35929	35938	0 %	60 %	20 %	20 %	423049784
37	NC_019537	AAACA	2	10	36034	36043	80 %	0 %	0 %	20 %	423049784
38	NC_019537	AAATA	2	10	36142	36151	80 %	20 %	0 %	0 %	423049784
39	NC_019537	CTGTA	2	10	36464	36473	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_019537	TTATC	2	10	36751	36760	20 %	60 %	0 %	20 %	423049785
41	NC_019537	TTGAT	2	10	38118	38127	20 %	60 %	20 %	0 %	423049787
42	NC_019537	TACAA	2	10	38958	38967	60 %	20 %	0 %	20 %	423049788
43	NC_019537	CTAAC	2	10	39432	39441	40 %	20 %	0 %	40 %	423049789
44	NC_019537	TTTTA	2	10	40006	40015	20 %	80 %	0 %	0 %	423049789
45	NC_019537	TAATA	2	10	40687	40696	60 %	40 %	0 %	0 %	423049790
46	NC_019537	AGAAA	2	10	42599	42608	80 %	0 %	20 %	0 %	423049794
47	NC_019537	AGTTT	2	10	45948	45957	20 %	60 %	20 %	0 %	423049796
48	NC_019537	CTTGT	2	10	49874	49883	0 %	60 %	20 %	20 %	423049800
49	NC_019537	AGTTT	2	10	51776	51785	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019537	GATAA	2	10	52893	52902	60 %	20 %	20 %	0 %	423049802
51	NC_019537	TAAAC	2	10	53747	53756	60 %	20 %	0 %	20 %	423049802
52	NC_019537	CATCT	2	10	54592	54601	20 %	40 %	0 %	40 %	423049803
53	NC_019537	TTCTT	2	10	54664	54673	0 %	80 %	0 %	20 %	423049804
54	NC_019537	CCTTG	2	10	54862	54871	0 %	40 %	20 %	40 %	423049804
55	NC_019537	TATTT	2	10	55673	55682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019537	ATTAT	2	10	55703	55712	40 %	60 %	0 %	0 %	423049806
57	NC_019537	TAATA	2	10	56282	56291	60 %	40 %	0 %	0 %	423049807
58	NC_019537	AATTT	2	10	56707	56716	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019537	TTATT	2	10	56961	56970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019537	TACTT	2	10	57246	57255	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_019537	TTCAA	2	10	59798	59807	40 %	40 %	0 %	20 %	423049811
62	NC_019537	GATAA	2	10	61256	61265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019537	AATTT	2	10	62824	62833	40 %	60 %	0 %	0 %	423049814
64	NC_019537	TTTGT	2	10	63103	63112	0 %	80 %	20 %	0 %	423049814
65	NC_019537	ATTTT	2	10	64169	64178	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019537	CTAAA	2	10	65817	65826	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_019537	GTTTA	2	10	66594	66603	20 %	60 %	20 %	0 %	423049816
68	NC_019537	TGAAA	2	10	67623	67632	60 %	20 %	20 %	0 %	423049818
69	NC_019537	AAAGT	2	10	71458	71467	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019537	TTTTA	2	10	74689	74698	20 %	80 %	0 %	0 %	423049825
71	NC_019537	TATTT	2	10	74920	74929	20 %	80 %	0 %	0 %	423049825
72	NC_019537	GCCCT	2	10	75587	75596	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_019537	AGAAA	2	10	75798	75807	80 %	0 %	20 %	0 %	423049826
74	NC_019537	CATCT	2	10	76906	76915	20 %	40 %	0 %	40 %	423049827
75	NC_019537	TTCTT	2	10	76978	76987	0 %	80 %	0 %	20 %	423049828
76	NC_019537	CCTTG	2	10	77176	77185	0 %	40 %	20 %	40 %	423049828
77	NC_019537	TTTGG	2	10	77457	77466	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019537	ACTTT	2	10	77498	77507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_019537	TTTGT	2	10	81708	81717	0 %	80 %	20 %	0 %	423049832
80	NC_019537	ATTTT	2	10	84692	84701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019537	AGTTA	2	10	84816	84825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019537	AACTC	2	10	85792	85801	40 %	20 %	0 %	40 %	423049838
83	NC_019537	ATTAC	2	10	90829	90838	40 %	40 %	0 %	20 %	423049840
84	NC_019537	ATGTA	2	10	91371	91380	40 %	40 %	20 %	0 %	423049840
85	NC_019537	TAAAA	2	10	92559	92568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019537	AAACT	2	10	92830	92839	60 %	20 %	0 %	20 %	423049841
87	NC_019537	TTTCT	2	10	93766	93775	0 %	80 %	0 %	20 %	423049842
88	NC_019537	CTTTT	2	10	93824	93833	0 %	80 %	0 %	20 %	423049843
89	NC_019537	TAGTA	2	10	95740	95749	40 %	40 %	20 %	0 %	423049844
90	NC_019537	CAAGG	2	10	100194	100203	40 %	0 %	40 %	20 %	423049850
91	NC_019537	AAAGA	2	10	100391	100400	80 %	0 %	20 %	0 %	423049850
92	NC_019537	TGAAA	2	10	102931	102940	60 %	20 %	20 %	0 %	423049853
93	NC_019537	GTCGA	2	10	104418	104427	20 %	20 %	40 %	20 %	423049854
94	NC_019537	TAAGT	2	10	105605	105614	40 %	40 %	20 %	0 %	423049856
95	NC_019537	TAAAT	2	10	106097	106106	60 %	40 %	0 %	0 %	423049856
96	NC_019537	TTATA	2	10	106542	106551	40 %	60 %	0 %	0 %	423049857
97	NC_019537	TTTTC	2	10	106556	106565	0 %	80 %	0 %	20 %	423049857
98	NC_019537	TAATA	2	10	107932	107941	60 %	40 %	0 %	0 %	423049858
99	NC_019537	TTTTA	2	10	108269	108278	20 %	80 %	0 %	0 %	423049858
100	NC_019537	GCTTG	2	10	109445	109454	0 %	40 %	40 %	20 %	423049858
101	NC_019537	ATTTT	2	10	110526	110535	20 %	80 %	0 %	0 %	423049858
102	NC_019537	TATAA	2	10	111332	111341	60 %	40 %	0 %	0 %	423049859
103	NC_019537	TATTT	2	10	111936	111945	20 %	80 %	0 %	0 %	423049860
104	NC_019537	ATTAA	2	10	114404	114413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019537	TCTTT	2	10	115118	115127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_019537	TTCTA	2	10	117031	117040	20 %	60 %	0 %	20 %	423049863
107	NC_019537	TATAA	2	10	117342	117351	60 %	40 %	0 %	0 %	423049863
108	NC_019537	TATTC	2	10	120387	120396	20 %	60 %	0 %	20 %	423049866
109	NC_019537	TTGTT	2	10	123564	123573	0 %	80 %	20 %	0 %	423049867
110	NC_019537	GAATA	2	10	126012	126021	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019537	CAAGG	2	10	130524	130533	40 %	0 %	40 %	20 %	423049868
112	NC_019537	AAAGA	2	10	130715	130724	80 %	0 %	20 %	0 %	423049868
113	NC_019537	CGTAT	2	10	133392	133401	20 %	40 %	20 %	20 %	423049872
114	NC_019537	GATTT	2	10	133633	133642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019537	CTAGC	2	10	134136	134145	20 %	20 %	20 %	40 %	423049873
116	NC_019537	TTTTC	2	10	135105	135114	0 %	80 %	0 %	20 %	423049873
117	NC_019537	TTTTA	2	10	136651	136660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019537	TATAG	2	10	139637	139646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019537	CATCT	2	10	140597	140606	20 %	40 %	0 %	40 %	423049876
120	NC_019537	TTCTT	2	10	140669	140678	0 %	80 %	0 %	20 %	423049877
121	NC_019537	CCTTG	2	10	140867	140876	0 %	40 %	20 %	40 %	423049877
122	NC_019537	AAAAT	2	10	141129	141138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019537	ATAAA	2	10	141707	141716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019537	AATAA	2	10	141857	141866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019537	GGGAT	2	10	145377	145386	20 %	20 %	60 %	0 %	423049879
126	NC_019537	TTGAT	2	10	145429	145438	20 %	60 %	20 %	0 %	423049879
127	NC_019537	AAATT	2	10	147434	147443	60 %	40 %	0 %	0 %	423049881
128	NC_019537	TTATT	2	10	149178	149187	20 %	80 %	0 %	0 %	423049885
129	NC_019537	TATTT	2	10	150928	150937	20 %	80 %	0 %	0 %	423049887
130	NC_019537	AGATG	2	10	152194	152203	40 %	20 %	40 %	0 %	423049888
131	NC_019537	ATTTT	2	10	158365	158374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019537	CAAGG	2	10	158876	158885	40 %	0 %	40 %	20 %	423049895
133	NC_019537	AAAGA	2	10	159073	159082	80 %	0 %	20 %	0 %	423049895
134	NC_019537	ATTGT	2	10	164099	164108	20 %	60 %	20 %	0 %	423049903
135	NC_019537	AAAGC	2	10	166244	166253	60 %	0 %	20 %	20 %	423049906
136	NC_019537	TAAAC	2	10	166625	166634	60 %	20 %	0 %	20 %	423049906
137	NC_019537	CATCT	2	10	167561	167570	20 %	40 %	0 %	40 %	423049908
138	NC_019537	TTCTT	2	10	167633	167642	0 %	80 %	0 %	20 %	423049909
139	NC_019537	CCTTG	2	10	167831	167840	0 %	40 %	20 %	40 %	423049909
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203	NC_019537	CTTTT	2	10	249483	249492	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_019537	TATTT	2	10	304990	304999	20 %	80 %	0 %	0 %	423050067
253	NC_019537	AGGTA	2	10	309096	309105	40 %	20 %	40 %	0 %	423050072
254	NC_019537	ATTTA	2	10	310579	310588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_019537	GGTAA	2	10	313442	313451	40 %	20 %	40 %	0 %	423050078
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259	NC_019537	ACTAC	2	10	315758	315767	40 %	20 %	0 %	40 %	423050081
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263	NC_019537	ATATA	2	10	318168	318177	60 %	40 %	0 %	0 %	423050086
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268	NC_019537	GATTT	2	10	322689	322698	20 %	60 %	20 %	0 %	423050091
269	NC_019537	ATTTT	2	10	322918	322927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_019537	GCTTG	2	10	324788	324797	0 %	40 %	40 %	20 %	423050092
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388	NC_019537	AGATA	2	10	476676	476685	60 %	20 %	20 %	0 %	423050226
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393	NC_019537	TGATT	2	10	483626	483635	20 %	60 %	20 %	0 %	423050234
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400	NC_019537	CATCT	2	10	492441	492450	20 %	40 %	0 %	40 %	423050246
401	NC_019537	TTCTT	2	10	492513	492522	0 %	80 %	0 %	20 %	423050247
402	NC_019537	CCTTG	2	10	492711	492720	0 %	40 %	20 %	40 %	423050247
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