MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica F92 chromosome

Total Repeats: 5222

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019537	GCAA	2	8	618	625	50 %	0 %	25 %	25 %	423049751
2	NC_019537	TGAT	2	8	770	777	25 %	50 %	25 %	0 %	423049751
3	NC_019537	GTAC	2	8	1057	1064	25 %	25 %	25 %	25 %	423049751
4	NC_019537	GCTT	2	8	1153	1160	0 %	50 %	25 %	25 %	423049751
5	NC_019537	ATGC	2	8	1384	1391	25 %	25 %	25 %	25 %	423049751
6	NC_019537	TAAA	2	8	1474	1481	75 %	25 %	0 %	0 %	423049751
7	NC_019537	AGTT	2	8	1686	1693	25 %	50 %	25 %	0 %	423049752
8	NC_019537	TGAT	2	8	1769	1776	25 %	50 %	25 %	0 %	423049752
9	NC_019537	AGCA	2	8	1883	1890	50 %	0 %	25 %	25 %	423049752
10	NC_019537	TCTA	2	8	2527	2534	25 %	50 %	0 %	25 %	423049752
11	NC_019537	GTTT	2	8	2585	2592	0 %	75 %	25 %	0 %	423049752
12	NC_019537	GAAT	2	8	2661	2668	50 %	25 %	25 %	0 %	423049753
13	NC_019537	TCAA	2	8	3734	3741	50 %	25 %	0 %	25 %	423049755
14	NC_019537	CAAC	2	8	3773	3780	50 %	0 %	0 %	50 %	423049755
15	NC_019537	ATTA	2	8	3901	3908	50 %	50 %	0 %	0 %	423049755
16	NC_019537	TGTT	2	8	4324	4331	0 %	75 %	25 %	0 %	423049756
17	NC_019537	GGTA	2	8	4334	4341	25 %	25 %	50 %	0 %	423049756
18	NC_019537	ATTT	2	8	4974	4981	25 %	75 %	0 %	0 %	423049757
19	NC_019537	TTGA	2	8	5124	5131	25 %	50 %	25 %	0 %	423049757
20	NC_019537	TTTC	2	8	5261	5268	0 %	75 %	0 %	25 %	423049757
21	NC_019537	TTTA	2	8	5424	5431	25 %	75 %	0 %	0 %	423049757
22	NC_019537	ATTA	2	8	5490	5497	50 %	50 %	0 %	0 %	423049757
23	NC_019537	TAGC	2	8	6169	6176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019537	ATTA	2	8	6419	6426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019537	ATGA	2	8	6570	6577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019537	GTTT	2	8	6989	6996	0 %	75 %	25 %	0 %	423049759
27	NC_019537	AAAT	2	8	7196	7203	75 %	25 %	0 %	0 %	423049759
28	NC_019537	TATG	2	8	7284	7291	25 %	50 %	25 %	0 %	423049759
29	NC_019537	TGTA	2	8	7293	7300	25 %	50 %	25 %	0 %	423049759
30	NC_019537	ATTA	2	8	8572	8579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019537	AGCA	2	8	9051	9058	50 %	0 %	25 %	25 %	423049762
32	NC_019537	TCTT	2	8	9097	9104	0 %	75 %	0 %	25 %	423049762
33	NC_019537	AGCA	2	8	9479	9486	50 %	0 %	25 %	25 %	423049762
34	NC_019537	CAAG	2	8	10007	10014	50 %	0 %	25 %	25 %	423049763
35	NC_019537	TTAT	2	8	10293	10300	25 %	75 %	0 %	0 %	423049763
36	NC_019537	AAAT	2	8	10495	10502	75 %	25 %	0 %	0 %	423049763
37	NC_019537	AAAT	2	8	10724	10731	75 %	25 %	0 %	0 %	423049764
38	NC_019537	AGTT	2	8	11028	11035	25 %	50 %	25 %	0 %	423049764
39	NC_019537	ATTT	2	8	11127	11134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019537	GCAG	2	8	12336	12343	25 %	0 %	50 %	25 %	423049766
41	NC_019537	CATA	2	8	12515	12522	50 %	25 %	0 %	25 %	423049766
42	NC_019537	TTGG	2	8	12533	12540	0 %	50 %	50 %	0 %	423049766
43	NC_019537	ATTT	2	8	12712	12719	25 %	75 %	0 %	0 %	423049766
44	NC_019537	TATT	2	8	12965	12972	25 %	75 %	0 %	0 %	423049767
45	NC_019537	GGTT	2	8	13050	13057	0 %	50 %	50 %	0 %	423049767
46	NC_019537	CTAT	2	8	13067	13074	25 %	50 %	0 %	25 %	423049767
47	NC_019537	TAGA	2	8	14012	14019	50 %	25 %	25 %	0 %	423049767
48	NC_019537	AATG	2	8	14247	14254	50 %	25 %	25 %	0 %	423049767
49	NC_019537	TCAA	2	8	16632	16639	50 %	25 %	0 %	25 %	423049769
50	NC_019537	CAAC	2	8	16671	16678	50 %	0 %	0 %	50 %	423049769
51	NC_019537	ATTA	2	8	16799	16806	50 %	50 %	0 %	0 %	423049769
52	NC_019537	AACT	2	8	17733	17740	50 %	25 %	0 %	25 %	423049771
53	NC_019537	ATCT	2	8	18406	18413	25 %	50 %	0 %	25 %	423049771
54	NC_019537	TAAT	2	8	18687	18694	50 %	50 %	0 %	0 %	423049771
55	NC_019537	CAAA	2	8	19218	19225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019537	CAAA	2	8	19293	19300	75 %	0 %	0 %	25 %	423049772
57	NC_019537	ATAG	2	8	19537	19544	50 %	25 %	25 %	0 %	423049772
58	NC_019537	GCTG	2	8	20056	20063	0 %	25 %	50 %	25 %	423049772
59	NC_019537	TAAA	2	8	20473	20480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019537	TAAC	2	8	20495	20502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019537	ACCA	2	8	20633	20640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019537	TTAA	2	8	20956	20963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019537	TAAT	2	8	21138	21145	50 %	50 %	0 %	0 %	423049773
64	NC_019537	GTTG	2	8	21266	21273	0 %	50 %	50 %	0 %	423049773
65	NC_019537	ATTG	2	8	21304	21311	25 %	50 %	25 %	0 %	423049773
66	NC_019537	AGTT	2	8	22193	22200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019537	TTTA	2	8	22252	22259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019537	AAGA	2	8	22660	22667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019537	TTTG	2	8	23485	23492	0 %	75 %	25 %	0 %	423049776
70	NC_019537	TAAA	2	8	24165	24172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019537	TAAT	2	8	24227	24234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019537	TTAA	2	8	24289	24296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019537	TTTA	2	8	24628	24635	25 %	75 %	0 %	0 %	423049777
74	NC_019537	TTTA	2	8	24791	24798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019537	ATTA	2	8	24899	24906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019537	TCAG	2	8	25026	25033	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019537	TCTA	2	8	26262	26269	25 %	50 %	0 %	25 %	423049778
78	NC_019537	AGTG	2	8	26503	26510	25 %	25 %	50 %	0 %	423049778
79	NC_019537	TATT	2	8	27038	27045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019537	TTAC	2	8	27547	27554	25 %	50 %	0 %	25 %	423049779
81	NC_019537	CATT	2	8	27914	27921	25 %	50 %	0 %	25 %	423049779
82	NC_019537	TAGA	2	8	27989	27996	50 %	25 %	25 %	0 %	423049779
83	NC_019537	ATCA	2	8	28140	28147	50 %	25 %	0 %	25 %	423049779
84	NC_019537	CTTT	2	8	28727	28734	0 %	75 %	0 %	25 %	423049779
85	NC_019537	TCTT	2	8	29004	29011	0 %	75 %	0 %	25 %	423049779
86	NC_019537	ATCT	2	8	29052	29059	25 %	50 %	0 %	25 %	423049779
87	NC_019537	TGGT	2	8	30706	30713	0 %	50 %	50 %	0 %	423049780
88	NC_019537	CAGA	2	8	30784	30791	50 %	0 %	25 %	25 %	423049780
89	NC_019537	ATTT	2	8	31140	31147	25 %	75 %	0 %	0 %	423049780
90	NC_019537	TACG	2	8	31239	31246	25 %	25 %	25 %	25 %	423049780
91	NC_019537	ATTA	2	8	32001	32008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019537	AGAT	2	8	32414	32421	50 %	25 %	25 %	0 %	423049781
93	NC_019537	ATCT	2	8	33845	33852	25 %	50 %	0 %	25 %	423049782
94	NC_019537	TTGT	2	8	33892	33899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019537	ACTA	2	8	33915	33922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019537	TGAT	2	8	34191	34198	25 %	50 %	25 %	0 %	423049783
97	NC_019537	ACTT	2	8	34988	34995	25 %	50 %	0 %	25 %	423049783
98	NC_019537	TAAT	2	8	35389	35396	50 %	50 %	0 %	0 %	423049784
99	NC_019537	AGTA	2	8	35772	35779	50 %	25 %	25 %	0 %	423049784
100	NC_019537	ATTG	2	8	36185	36192	25 %	50 %	25 %	0 %	423049784
101	NC_019537	CTTA	2	8	36200	36207	25 %	50 %	0 %	25 %	423049784
102	NC_019537	ATTT	2	8	36533	36540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019537	TATT	2	8	36931	36938	25 %	75 %	0 %	0 %	423049785
104	NC_019537	GAAT	2	8	37698	37705	50 %	25 %	25 %	0 %	423049787
105	NC_019537	TGAT	2	8	37920	37927	25 %	50 %	25 %	0 %	423049787
106	NC_019537	GATA	2	8	38140	38147	50 %	25 %	25 %	0 %	423049787
107	NC_019537	TAAA	2	8	38396	38403	75 %	25 %	0 %	0 %	423049788
108	NC_019537	AAAC	2	8	38470	38477	75 %	0 %	0 %	25 %	423049788
109	NC_019537	TTTA	2	8	38679	38686	25 %	75 %	0 %	0 %	423049788
110	NC_019537	CCTT	2	8	39016	39023	0 %	50 %	0 %	50 %	423049788
111	NC_019537	TTTC	2	8	39452	39459	0 %	75 %	0 %	25 %	423049789
112	NC_019537	CTTT	2	8	39605	39612	0 %	75 %	0 %	25 %	423049789
113	NC_019537	TTAT	2	8	40329	40336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019537	GTAA	2	8	40616	40623	50 %	25 %	25 %	0 %	423049790
115	NC_019537	ATTG	2	8	40640	40647	25 %	50 %	25 %	0 %	423049790
116	NC_019537	TTAG	2	8	41644	41651	25 %	50 %	25 %	0 %	423049791
117	NC_019537	TCTT	2	8	42623	42630	0 %	75 %	0 %	25 %	423049794
118	NC_019537	AATA	2	8	43133	43140	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019537	GTAT	2	8	43164	43171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019537	CTTG	2	8	43935	43942	0 %	50 %	25 %	25 %	423049795
121	NC_019537	CTTC	2	8	45131	45138	0 %	50 %	0 %	50 %	423049796
122	NC_019537	AAAT	2	8	45748	45755	75 %	25 %	0 %	0 %	423049796
123	NC_019537	AAAT	2	8	45850	45857	75 %	25 %	0 %	0 %	423049796
124	NC_019537	ATTT	2	8	46323	46330	25 %	75 %	0 %	0 %	423049796
125	NC_019537	CAAG	2	8	46625	46632	50 %	0 %	25 %	25 %	423049796
126	NC_019537	CCAG	2	8	46684	46691	25 %	0 %	25 %	50 %	423049796
127	NC_019537	TTCT	2	8	47193	47200	0 %	75 %	0 %	25 %	423049796
128	NC_019537	ACCT	2	8	47412	47419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_019537	AGTT	2	8	47503	47510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019537	GTAG	2	8	48255	48262	25 %	25 %	50 %	0 %	423049797
131	NC_019537	AGTT	2	8	49022	49029	25 %	50 %	25 %	0 %	423049798
132	NC_019537	CTTT	2	8	49432	49439	0 %	75 %	0 %	25 %	423049799
133	NC_019537	CCAT	2	8	49489	49496	25 %	25 %	0 %	50 %	423049799
134	NC_019537	GTTT	2	8	49527	49534	0 %	75 %	25 %	0 %	423049799
135	NC_019537	CCTA	2	8	49658	49665	25 %	25 %	0 %	50 %	423049800
136	NC_019537	CTAG	2	8	49845	49852	25 %	25 %	25 %	25 %	423049800
137	NC_019537	ATTT	2	8	50483	50490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019537	ATCT	2	8	50509	50516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_019537	TTTA	2	8	50891	50898	25 %	75 %	0 %	0 %	423049801
140	NC_019537	TAAT	2	8	51175	51182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019537	CTTG	2	8	51300	51307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019537	AAAT	2	8	51333	51340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019537	AATA	2	8	51898	51905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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