MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 plasmid pFAES01

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019012	ATCGT	2	10	166	175	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_019012	CGCCC	2	10	1804	1813	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3	NC_019012	CGTCG	2	10	2173	2182	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_019012	AGTTG	2	10	4100	4109	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019012	CTAAC	2	10	6141	6150	40 %	20 %	0 %	40 %	410503523
6	NC_019012	TACGC	2	10	8663	8672	20 %	20 %	20 %	40 %	410503527
7	NC_019012	ACTGA	2	10	9560	9569	40 %	20 %	20 %	20 %	410503528
8	NC_019012	TACGG	2	10	10048	10057	20 %	20 %	40 %	20 %	410503529
9	NC_019012	TTTAT	2	10	10078	10087	20 %	80 %	0 %	0 %	410503529
10	NC_019012	GCGGG	2	10	10379	10388	0 %	0 %	80 %	20 %	410503529
11	NC_019012	CAGCC	2	10	10452	10461	20 %	0 %	20 %	60 %	410503529
12	NC_019012	CTGAA	2	10	10642	10651	40 %	20 %	20 %	20 %	410503529
13	NC_019012	CGGTA	2	10	12162	12171	20 %	20 %	40 %	20 %	410503529
14	NC_019012	CGGCT	2	10	14159	14168	0 %	20 %	40 %	40 %	410503531
15	NC_019012	TACCG	2	10	16040	16049	20 %	20 %	20 %	40 %	410503532
16	NC_019012	TGGGC	2	10	18505	18514	0 %	20 %	60 %	20 %	410503536
17	NC_019012	CCGAC	2	10	19211	19220	20 %	0 %	20 %	60 %	410503536
18	NC_019012	GCCTG	2	10	19424	19433	0 %	20 %	40 %	40 %	410503536
19	NC_019012	ACGGT	2	10	19966	19975	20 %	20 %	40 %	20 %	410503537
20	NC_019012	ACGCA	2	10	24495	24504	40 %	0 %	20 %	40 %	410503541
21	NC_019012	GTACC	2	10	25333	25342	20 %	20 %	20 %	40 %	410503542
22	NC_019012	CTGGT	2	10	26431	26440	0 %	40 %	40 %	20 %	410503543
23	NC_019012	AAGCA	2	10	26957	26966	60 %	0 %	20 %	20 %	410503543
24	NC_019012	GCCGA	2	10	27178	27187	20 %	0 %	40 %	40 %	410503544
25	NC_019012	GGCTC	2	10	27272	27281	0 %	20 %	40 %	40 %	410503544
26	NC_019012	GTTTC	2	10	28172	28181	0 %	60 %	20 %	20 %	410503545
27	NC_019012	CAGCG	2	10	29108	29117	20 %	0 %	40 %	40 %	410503546
28	NC_019012	CTTTT	2	10	30477	30486	0 %	80 %	0 %	20 %	410503548
29	NC_019012	GTTTT	2	10	31109	31118	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019012	GATTC	2	10	32442	32451	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_019012	CGACG	2	10	36616	36625	20 %	0 %	40 %	40 %	410503554
32	NC_019012	GTGGG	2	10	36978	36987	0 %	20 %	80 %	0 %	410503554
33	NC_019012	TCGGG	2	10	37113	37122	0 %	20 %	60 %	20 %	410503554
34	NC_019012	ATCGT	2	10	37729	37738	20 %	40 %	20 %	20 %	410503555
35	NC_019012	CAGCC	2	10	38672	38681	20 %	0 %	20 %	60 %	410503557
36	NC_019012	CGGTA	2	10	39437	39446	20 %	20 %	40 %	20 %	410503557
37	NC_019012	CCCCT	2	10	40846	40855	0 %	20 %	0 %	80 %	410503558
38	NC_019012	CCGAC	2	10	42257	42266	20 %	0 %	20 %	60 %	410503559
39	NC_019012	GGTTT	2	10	44274	44283	0 %	60 %	40 %	0 %	410503562
40	NC_019012	CGGCC	2	10	46168	46177	0 %	0 %	40 %	60 %	410503562
41	NC_019012	CCCTG	2	10	49012	49021	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_019012	TTGAG	2	10	49721	49730	20 %	40 %	40 %	0 %	410503563
43	NC_019012	GTTGC	2	10	50986	50995	0 %	40 %	40 %	20 %	410503564
44	NC_019012	CAGAT	2	10	51878	51887	40 %	20 %	20 %	20 %	410503566
45	NC_019012	AGGGC	2	10	52386	52395	20 %	0 %	60 %	20 %	410503566
46	NC_019012	AAAAT	2	10	52747	52756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019012	ACAAA	2	10	54141	54150	80 %	0 %	0 %	20 %	410503568
48	NC_019012	TCTGT	2	10	56304	56313	0 %	60 %	20 %	20 %	410503573
49	NC_019012	GCCAC	2	10	60122	60131	20 %	0 %	20 %	60 %	410503578
50	NC_019012	GACGC	2	10	65813	65822	20 %	0 %	40 %	40 %	410503583
51	NC_019012	CGAAT	2	10	65834	65843	40 %	20 %	20 %	20 %	410503583
52	NC_019012	GCCGG	2	10	65860	65869	0 %	0 %	60 %	40 %	410503583
53	NC_019012	ACGGC	2	10	67197	67206	20 %	0 %	40 %	40 %	410503584
54	NC_019012	TGTAT	2	10	68626	68635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019012	TTTTC	2	10	70848	70857	0 %	80 %	0 %	20 %	410503589
56	NC_019012	GCCCG	2	10	74588	74597	0 %	0 %	40 %	60 %	410503591
57	NC_019012	CCAAT	2	10	76126	76135	40 %	20 %	0 %	40 %	410503591
58	NC_019012	ACCAA	2	10	76233	76242	60 %	0 %	0 %	40 %	410503592
59	NC_019012	ATCAA	2	10	76712	76721	60 %	20 %	0 %	20 %	410503592
60	NC_019012	GCAAG	2	10	79581	79590	40 %	0 %	40 %	20 %	410503595
61	NC_019012	GGAGC	2	10	79845	79854	20 %	0 %	60 %	20 %	410503595
62	NC_019012	AAGGT	2	10	80057	80066	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019012	TGAAG	2	10	80465	80474	40 %	20 %	40 %	0 %	410503596
64	NC_019012	GATCC	2	10	80930	80939	20 %	20 %	20 %	40 %	410503596
65	NC_019012	TCGAA	2	10	81415	81424	40 %	20 %	20 %	20 %	410503596
66	NC_019012	ATCCG	2	10	83492	83501	20 %	20 %	20 %	40 %	410503599
67	NC_019012	TTCTG	2	10	84765	84774	0 %	60 %	20 %	20 %	410503601
68	NC_019012	ACTGA	2	10	88417	88426	40 %	20 %	20 %	20 %	410503603
69	NC_019012	TGTGG	2	10	88704	88713	0 %	40 %	60 %	0 %	410503603
70	NC_019012	ACCTG	2	10	88918	88927	20 %	20 %	20 %	40 %	410503604
71	NC_019012	CAACA	2	10	91460	91469	60 %	0 %	0 %	40 %	410503606
72	NC_019012	CTGAT	2	10	92677	92686	20 %	40 %	20 %	20 %	410503606
73	NC_019012	AGCCC	2	10	92919	92928	20 %	0 %	20 %	60 %	410503607
74	NC_019012	GCAAT	2	10	93506	93515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_019012	AGAAT	2	10	96394	96403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019012	CTTGG	2	10	97929	97938	0 %	40 %	40 %	20 %	410503614
77	NC_019012	GGGAG	2	10	98012	98021	20 %	0 %	80 %	0 %	410503614
78	NC_019012	GATGA	2	10	100930	100939	40 %	20 %	40 %	0 %	410503618
79	NC_019012	TGTCG	2	10	101967	101976	0 %	40 %	40 %	20 %	410503618
80	NC_019012	CCTGG	2	10	102507	102516	0 %	20 %	40 %	40 %	410503619
81	NC_019012	GGCGG	2	10	102900	102909	0 %	0 %	80 %	20 %	410503619
82	NC_019012	TGGAG	2	10	103643	103652	20 %	20 %	60 %	0 %	410503619
83	NC_019012	GGGCG	2	10	104630	104639	0 %	0 %	80 %	20 %	410503620
84	NC_019012	TCGGG	2	10	106655	106664	0 %	20 %	60 %	20 %	410503621
85	NC_019012	GCTCG	2	10	107294	107303	0 %	20 %	40 %	40 %	410503622
86	NC_019012	GGTGC	2	10	107675	107684	0 %	20 %	60 %	20 %	410503622
87	NC_019012	TGGCC	2	10	107953	107962	0 %	20 %	40 %	40 %	410503622
88	NC_019012	CCGGC	2	10	108423	108432	0 %	0 %	40 %	60 %	410503622
89	NC_019012	TTGTA	2	10	109065	109074	20 %	60 %	20 %	0 %	410503623
90	NC_019012	CTACA	2	10	109664	109673	40 %	20 %	0 %	40 %	410503623
91	NC_019012	CAACG	2	10	111065	111074	40 %	0 %	20 %	40 %	410503624
92	NC_019012	TCAAG	2	10	113074	113083	40 %	20 %	20 %	20 %	410503625
93	NC_019012	AAGGT	2	10	115458	115467	40 %	20 %	40 %	0 %	410503626
94	NC_019012	ATGAC	2	10	119630	119639	40 %	20 %	20 %	20 %	410503630
95	NC_019012	CGGCC	2	10	119677	119686	0 %	0 %	40 %	60 %	410503630
96	NC_019012	ATTGA	2	10	120109	120118	40 %	40 %	20 %	0 %	410503630
97	NC_019012	GCTCG	2	10	122841	122850	0 %	20 %	40 %	40 %	410503633
98	NC_019012	GACCT	2	10	123355	123364	20 %	20 %	20 %	40 %	410503633
99	NC_019012	TGCCC	2	10	124199	124208	0 %	20 %	20 %	60 %	410503634
100	NC_019012	CCTGA	2	10	124317	124326	20 %	20 %	20 %	40 %	410503634
101	NC_019012	GGTAC	2	10	126216	126225	20 %	20 %	40 %	20 %	410503634
102	NC_019012	GGCTC	2	10	129385	129394	0 %	20 %	40 %	40 %	410503635
103	NC_019012	GGCTG	2	10	132033	132042	0 %	20 %	60 %	20 %	410503640
104	NC_019012	GCTGG	2	10	132058	132067	0 %	20 %	60 %	20 %	410503640
105	NC_019012	GGCTG	2	10	132113	132122	0 %	20 %	60 %	20 %	410503640
106	NC_019012	CAGCG	2	10	132135	132144	20 %	0 %	40 %	40 %	410503640
107	NC_019012	GGACT	2	10	132380	132389	20 %	20 %	40 %	20 %	410503640
108	NC_019012	GGCAG	2	10	133075	133084	20 %	0 %	60 %	20 %	410503641
109	NC_019012	CGGGC	2	10	134091	134100	0 %	0 %	60 %	40 %	410503642
110	NC_019012	CGATG	2	10	134748	134757	20 %	20 %	40 %	20 %	410503643
111	NC_019012	GATGG	2	10	135151	135160	20 %	20 %	60 %	0 %	410503644
112	NC_019012	CAACT	2	10	139280	139289	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_019012	GTTTG	2	10	140454	140463	0 %	60 %	40 %	0 %	410503650
114	NC_019012	ACCAA	2	10	141203	141212	60 %	0 %	0 %	40 %	410503650
115	NC_019012	TCAGG	2	10	145564	145573	20 %	20 %	40 %	20 %	410503653
116	NC_019012	TGCGC	2	10	145813	145822	0 %	20 %	40 %	40 %	410503653
117	NC_019012	GCCGG	2	10	147150	147159	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_019012	TCAAC	2	10	148373	148382	40 %	20 %	0 %	40 %	410503655
119	NC_019012	CCTTA	2	10	149769	149778	20 %	40 %	0 %	40 %	410503656
120	NC_019012	TTTAG	2	10	158680	158689	20 %	60 %	20 %	0 %	410503665
121	NC_019012	GGGCA	2	10	158892	158901	20 %	0 %	60 %	20 %	410503665
122	NC_019012	GTTAG	2	10	159274	159283	20 %	40 %	40 %	0 %	410503665
123	NC_019012	GCCCG	2	10	160287	160296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.