MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017909	CAAGAT	2	12	739	750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885755
2	NC_017909	ATAATG	2	12	2466	2477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885756
3	NC_017909	TTTGAT	2	12	3940	3951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017909	TTATAT	2	12	5631	5642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885759
5	NC_017909	CCACAG	2	12	6098	6109	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387885760
6	NC_017909	AATATT	2	12	9039	9050	50 %	50 %	0 %	0 %	387885762
7	NC_017909	GTTCTA	2	12	10001	10012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885763
8	NC_017909	ATCAGA	2	12	16208	16219	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885767
9	NC_017909	TATTTA	2	12	17563	17574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017909	TATAGA	2	12	19507	19518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885770
11	NC_017909	TGGATA	2	12	20954	20965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885772
12	NC_017909	TAAAGT	2	12	21465	21476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885772
13	NC_017909	TTTTAT	2	12	23246	23257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387885774
14	NC_017909	AAAGTT	2	12	25733	25744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017909	GATAAA	2	12	26212	26223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885778
16	NC_017909	GCAAAT	2	12	30842	30853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885780
17	NC_017909	TAAAAG	2	12	32200	32211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885781
18	NC_017909	TATGGT	2	12	33971	33982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017909	ATTATA	2	12	34160	34171	50 %	50 %	0 %	0 %	387885782
20	NC_017909	AGCTTC	2	12	37432	37443	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017909	CTTGAG	2	12	40123	40134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017909	TTCAGC	2	12	46478	46489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885786
23	NC_017909	TTATAT	2	12	46492	46503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387885786
24	NC_017909	TGCTGT	2	12	47308	47319	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387885788
25	NC_017909	TTTTTA	2	12	51198	51209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017909	TTCTTT	2	12	51850	51861	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387885793
27	NC_017909	AAAGCA	2	12	53014	53025	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387885795
28	NC_017909	TTGATC	2	12	53931	53942	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885796
29	NC_017909	TGTACC	2	12	55085	55096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885797
30	NC_017909	AAAGCT	2	12	59009	59020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017909	ATTTTA	2	12	59678	59689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017909	TATGTA	2	12	63008	63019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885802
33	NC_017909	GATTAT	2	12	65938	65949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885806
34	NC_017909	AACTGT	2	12	66392	66403	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885807
35	NC_017909	AAACTG	2	12	69001	69012	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885810
36	NC_017909	GTTATA	2	12	69465	69476	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017909	TAAATA	2	12	69772	69783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387885811
38	NC_017909	ATTTAT	2	12	70190	70201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017909	AATTGC	2	12	71280	71291	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885814
40	NC_017909	ACACCA	2	12	72187	72198	50 %	0 %	0 %	50 %	387885814
41	NC_017909	GGTTTT	2	12	78688	78699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387885824
42	NC_017909	TAATAG	2	12	81587	81598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387885826
43	NC_017909	TTTCAA	2	12	81869	81880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387885827
44	NC_017909	TGATTT	2	12	84846	84857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885831
45	NC_017909	AAAAAT	2	12	86393	86404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	387885833
46	NC_017909	TCTAAC	2	12	87430	87441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017909	TTTAAA	2	12	87947	87958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017909	AATGCA	2	12	88758	88769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017909	ACTCTT	2	12	92228	92239	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387885840
50	NC_017909	GATATG	2	12	95479	95490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885844
51	NC_017909	GAGATA	2	12	96620	96631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885844
52	NC_017909	AGCTAA	2	12	103176	103187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387885848
53	NC_017909	TAGAAA	2	12	104772	104783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885850
54	NC_017909	TGATTT	2	12	104848	104859	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885850
55	NC_017909	GAGTTA	2	12	104888	104899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885850
56	NC_017909	TACAGG	24	144	109885	110028	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387885856
57	NC_017909	GTCTGG	24	144	110029	110172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387885856
58	NC_017909	AGATAA	2	12	110413	110424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017909	CTATTC	2	12	111075	111086	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387885858
60	NC_017909	TTACTG	2	12	111102	111113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885858
61	NC_017909	TTTGAT	2	12	114673	114684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017909	TGCTGG	2	12	115017	115028	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017909	GATAAA	2	12	117441	117452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	387885860
64	NC_017909	TTGATA	2	12	118908	118919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885863
65	NC_017909	AGAAAA	2	12	123363	123374	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017909	ACTATA	2	12	125244	125255	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387885868
67	NC_017909	TAGATT	2	12	130473	130484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017909	AACTTC	2	12	131185	131196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885873
69	NC_017909	ATTTCC	2	12	132181	132192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017909	GTTCAA	2	12	139060	139071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885882
71	NC_017909	TGTGGC	12	72	139260	139331	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387885882
72	NC_017909	TCAATC	2	12	140223	140234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387885882
73	NC_017909	TCAGGT	2	12	141845	141856	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387885884
74	NC_017909	ATAGCT	2	12	145941	145952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885888
75	NC_017909	ATCAGT	2	12	152125	152136	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885893
76	NC_017909	TTAAAA	2	12	152851	152862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017909	CATTAG	2	12	155307	155318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885896
78	NC_017909	TAGTAT	2	12	160857	160868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885902
79	NC_017909	TGGTCT	2	12	162184	162195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387885904
80	NC_017909	ATCTTT	2	12	166066	166077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387885907
81	NC_017909	ACTGAT	2	12	168122	168133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885908
82	NC_017909	AGTTTT	2	12	171178	171189	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	387885910
83	NC_017909	TTTTTG	2	12	171231	171242	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387885910
84	NC_017909	TTCATC	2	12	171406	171417	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	387885910
85	NC_017909	ATTTTC	2	12	175709	175720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387885916
86	NC_017909	ATTTTT	2	12	175884	175895	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387885916
87	NC_017909	TGTTTT	2	12	176736	176747	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387885917
88	NC_017909	TATATT	2	12	178973	178984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017909	TCTAAA	2	12	182828	182839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387885922
90	NC_017909	ACTGCT	2	12	183200	183211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387885922
91	NC_017909	ATTAGT	2	12	184000	184011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387885922
92	NC_017909	ATAGCT	2	12	189945	189956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387885933
93	NC_017909	TTTGAC	2	12	196175	196186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387885938
94	NC_017909	TGAGAA	2	12	198424	198435	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017909	AGAAGC	2	12	199473	199484	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885941
96	NC_017909	CTGAGA	2	12	201986	201997	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387885944
97	NC_017909	GTTTTT	2	12	203041	203052	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	387885946
98	NC_017909	TGAAGT	2	12	205580	205591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387885950
99	NC_017909	CTGTTG	2	12	207137	207148	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	387885951
100	NC_017909	AGGTTG	2	12	207749	207760	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387885951
101	NC_017909	TAAAGG	2	12	208795	208806	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885953
102	NC_017909	AGAGCA	2	12	209329	209340	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885954
103	NC_017909	TTGGTG	2	12	215140	215151	0 %	50 %	50 %	0 %	387885967
104	NC_017909	TAAAGG	2	12	215670	215681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387885968
105	NC_017909	TGGTAT	2	12	222937	222948	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387885981
106	NC_017909	GGTATG	2	12	224393	224404	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387885981
107	NC_017909	TTTATC	2	12	227381	227392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	387885984
108	NC_017909	TCTGTT	2	12	232941	232952	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387885989
109	NC_017909	CCTGAG	2	12	234601	234612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387885991
110	NC_017909	GATGCT	2	12	237044	237055	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387885992
111	NC_017909	AGCAGA	2	12	237850	237861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885993
112	NC_017909	AGAAGC	2	12	238006	238017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387885993
113	NC_017909	GTTGAT	2	12	241084	241095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387885997
114	NC_017909	TATTTT	2	12	242012	242023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	387885998
115	NC_017909	TACCAG	2	12	245876	245887	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886001
116	NC_017909	TGATTA	2	12	246605	246616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387886002
117	NC_017909	TAAACT	2	12	246689	246700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886002
118	NC_017909	CAAAAG	2	12	247857	247868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387886004
119	NC_017909	ATCAAA	2	12	247886	247897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886004
120	NC_017909	CTAAAA	2	12	248778	248789	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886005
121	NC_017909	TGTTGA	2	12	248935	248946	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	387886005
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238	NC_017909	ATTTAC	2	12	451661	451672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	387886197
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241	NC_017909	ATAAAT	2	12	459082	459093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_017909	ATTTCA	2	12	460272	460283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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248	NC_017909	TACTGA	2	12	474235	474246	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886208
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468	NC_017909	TATATT	2	12	967900	967911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017909	ATGCTG	2	12	969731	969742	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387886612
470	NC_017909	TTGAGT	2	12	970261	970272	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017909	ATTCTG	2	12	972106	972117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387886615
472	NC_017909	ATAGCA	2	12	974739	974750	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387886618
473	NC_017909	TGATTA	2	12	976708	976719	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017909	CTAATA	2	12	983688	983699	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886627
475	NC_017909	TTTCTT	2	12	989294	989305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	387886633
476	NC_017909	ATATTG	2	12	992174	992185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387886635
477	NC_017909	GATCTG	2	12	992503	992514	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387886635
478	NC_017909	TTTAAG	2	12	993169	993180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387886635
479	NC_017909	CAAATA	2	12	994368	994379	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
480	NC_017909	CTACAG	2	12	997471	997482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886641
481	NC_017909	TTACTA	2	12	997844	997855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_017909	CATCAG	2	12	999524	999535	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387886642
483	NC_017909	AAACAT	2	12	1001207	1001218	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	387886643
484	NC_017909	CACAAA	2	12	1001768	1001779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387886644
485	NC_017909	ATCATG	2	12	1002348	1002359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886645
486	NC_017909	AGCTCT	2	12	1004678	1004689	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
487	NC_017909	TTGCTA	2	12	1006090	1006101	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387886648
488	NC_017909	TACACC	2	12	1009104	1009115	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
489	NC_017909	CTGTTG	2	12	1012141	1012152	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
490	NC_017909	CTAAAA	2	12	1013950	1013961	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
491	NC_017909	ATCATA	2	12	1020453	1020464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	387886657
492	NC_017909	CCCATA	2	12	1020748	1020759	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	387886657
493	NC_017909	ACAGTA	2	12	1024693	1024704	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	387886661
494	NC_017909	CATTAT	2	12	1025405	1025416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
495	NC_017909	TTAAAT	2	12	1026365	1026376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_017909	ATGCTA	3	18	1029063	1029080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387886664
497	NC_017909	ATTTTG	2	12	1032857	1032868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017909	AGTTAT	2	12	1032870	1032881	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
499	NC_017909	AATATG	2	12	1035057	1035068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387886671
500	NC_017909	AAGCAG	2	12	1035651	1035662	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387886671

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