MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella noatunensis subsp. orientalis str. Toba 04 chromosome

Total Repeats: 1413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017909	AAATA	2	10	528	537	80 %	20 %	0 %	0 %	387885755
2	NC_017909	AAGAA	2	10	1199	1208	80 %	0 %	20 %	0 %	387885755
3	NC_017909	AAATG	2	10	3838	3847	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017909	AGCAA	2	10	3853	3862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017909	CATTT	2	10	6317	6326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017909	ATATC	2	10	8504	8513	40 %	40 %	0 %	20 %	387885762
7	NC_017909	AGATA	2	10	8743	8752	60 %	20 %	20 %	0 %	387885762
8	NC_017909	TATTT	2	10	8902	8911	20 %	80 %	0 %	0 %	387885762
9	NC_017909	ATTTG	2	10	9767	9776	20 %	60 %	20 %	0 %	387885763
10	NC_017909	CATTT	2	10	12142	12151	20 %	60 %	0 %	20 %	387885764
11	NC_017909	GTAGG	2	10	12491	12500	20 %	20 %	60 %	0 %	387885764
12	NC_017909	TCAAA	2	10	17823	17832	60 %	20 %	0 %	20 %	387885768
13	NC_017909	ATATA	2	10	20069	20078	60 %	40 %	0 %	0 %	387885771
14	NC_017909	TTGAT	2	10	21437	21446	20 %	60 %	20 %	0 %	387885772
15	NC_017909	TACAA	2	10	21847	21856	60 %	20 %	0 %	20 %	387885773
16	NC_017909	TTGAT	2	10	22057	22066	20 %	60 %	20 %	0 %	387885773
17	NC_017909	TTTCT	2	10	23190	23199	0 %	80 %	0 %	20 %	387885774
18	NC_017909	AGCAG	2	10	23660	23669	40 %	0 %	40 %	20 %	387885775
19	NC_017909	CTTGG	2	10	27619	27628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017909	TTAGT	2	10	28761	28770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017909	ATAGT	2	10	29269	29278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017909	AAATT	2	10	30470	30479	60 %	40 %	0 %	0 %	387885779
23	NC_017909	ATGGG	2	10	32772	32781	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017909	AATTT	2	10	33738	33747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017909	TAATT	2	10	33833	33842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017909	ATAAA	2	10	34084	34093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017909	CACTA	2	10	34666	34675	40 %	20 %	0 %	40 %	387885782
28	NC_017909	GATAA	2	10	34698	34707	60 %	20 %	20 %	0 %	387885782
29	NC_017909	ATGAC	2	10	35458	35467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017909	TGGAT	2	10	35648	35657	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017909	TAGTT	2	10	37357	37366	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017909	GTCAT	2	10	38451	38460	20 %	40 %	20 %	20 %	387885783
33	NC_017909	ATTTG	2	10	42028	42037	20 %	60 %	20 %	0 %	387885784
34	NC_017909	CAATA	2	10	42488	42497	60 %	20 %	0 %	20 %	387885784
35	NC_017909	GATTT	2	10	42969	42978	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017909	TCTAG	2	10	43464	43473	20 %	40 %	20 %	20 %	387885785
37	NC_017909	ATTTT	2	10	48256	48265	20 %	80 %	0 %	0 %	387885789
38	NC_017909	TTAAA	2	10	48571	48580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017909	TGAAA	2	10	49845	49854	60 %	20 %	20 %	0 %	387885791
40	NC_017909	TCATG	2	10	54927	54936	20 %	40 %	20 %	20 %	387885797
41	NC_017909	AGTTA	2	10	55532	55541	40 %	40 %	20 %	0 %	387885797
42	NC_017909	CTATA	2	10	56425	56434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017909	AAAAT	2	10	56451	56460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017909	TATTT	2	10	57041	57050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017909	ATATT	2	10	57063	57072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017909	TATAA	2	10	57341	57350	60 %	40 %	0 %	0 %	387885799
47	NC_017909	TCAAG	2	10	59024	59033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017909	ACAAT	2	10	59617	59626	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017909	GTAGA	2	10	59829	59838	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017909	TTAAA	2	10	61438	61447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017909	TAAAA	2	10	62319	62328	80 %	20 %	0 %	0 %	387885801
52	NC_017909	AATAG	2	10	63200	63209	60 %	20 %	20 %	0 %	387885802
53	NC_017909	GATAA	2	10	63329	63338	60 %	20 %	20 %	0 %	387885802
54	NC_017909	TAATG	2	10	63894	63903	40 %	40 %	20 %	0 %	387885803
55	NC_017909	TTATT	2	10	70566	70575	20 %	80 %	0 %	0 %	387885813
56	NC_017909	TTGTC	2	10	72213	72222	0 %	60 %	20 %	20 %	387885814
57	NC_017909	AGCAT	2	10	73083	73092	40 %	20 %	20 %	20 %	387885815
58	NC_017909	ATTCA	2	10	73403	73412	40 %	40 %	0 %	20 %	387885816
59	NC_017909	TGAAA	2	10	77787	77796	60 %	20 %	20 %	0 %	387885824
60	NC_017909	TTGAT	2	10	78767	78776	20 %	60 %	20 %	0 %	387885824
61	NC_017909	GCTGT	2	10	79544	79553	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017909	GCTGG	2	10	80745	80754	0 %	20 %	60 %	20 %	387885826
63	NC_017909	TTTTA	2	10	81906	81915	20 %	80 %	0 %	0 %	387885827
64	NC_017909	TTGTA	2	10	83565	83574	20 %	60 %	20 %	0 %	387885829
65	NC_017909	TATTT	2	10	85151	85160	20 %	80 %	0 %	0 %	387885831
66	NC_017909	GCCCT	2	10	85808	85817	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_017909	CTTAA	2	10	89001	89010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017909	CTAAA	2	10	90385	90394	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017909	CTTAG	2	10	91041	91050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017909	AGATA	2	10	91618	91627	60 %	20 %	20 %	0 %	387885839
71	NC_017909	AGCTA	2	10	95055	95064	40 %	20 %	20 %	20 %	387885843
72	NC_017909	AGTTT	2	10	95188	95197	20 %	60 %	20 %	0 %	387885843
73	NC_017909	TGAAT	2	10	95664	95673	40 %	40 %	20 %	0 %	387885844
74	NC_017909	TATGC	2	10	95764	95773	20 %	40 %	20 %	20 %	387885844
75	NC_017909	TTTGA	2	10	97687	97696	20 %	60 %	20 %	0 %	387885845
76	NC_017909	GAGGG	2	10	97864	97873	20 %	0 %	80 %	0 %	387885845
77	NC_017909	ATTGT	2	10	99978	99987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017909	TTTCA	2	10	100803	100812	20 %	60 %	0 %	20 %	387885847
79	NC_017909	AATTT	2	10	101830	101839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017909	GTGAT	2	10	103628	103637	20 %	40 %	40 %	0 %	387885848
81	NC_017909	TTTCT	2	10	104134	104143	0 %	80 %	0 %	20 %	387885849
82	NC_017909	AAATT	2	10	107014	107023	60 %	40 %	0 %	0 %	387885851
83	NC_017909	AAGAT	2	10	107338	107347	60 %	20 %	20 %	0 %	387885851
84	NC_017909	CAAAC	2	10	108629	108638	60 %	0 %	0 %	40 %	387885853
85	NC_017909	TTTAG	2	10	108719	108728	20 %	60 %	20 %	0 %	387885853
86	NC_017909	ATAAA	2	10	110253	110262	80 %	20 %	0 %	0 %	387885856
87	NC_017909	GTTTG	2	10	111974	111983	0 %	60 %	40 %	0 %	387885858
88	NC_017909	ACTTT	2	10	112655	112664	20 %	60 %	0 %	20 %	387885859
89	NC_017909	AGATG	2	10	113424	113433	40 %	20 %	40 %	0 %	387885859
90	NC_017909	TATGT	2	10	115562	115571	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017909	GTTTT	2	10	116308	116317	0 %	80 %	20 %	0 %	387885860
92	NC_017909	AGATT	2	10	118054	118063	40 %	40 %	20 %	0 %	387885861
93	NC_017909	TAATC	2	10	118846	118855	40 %	40 %	0 %	20 %	387885863
94	NC_017909	AGCAA	2	10	119811	119820	60 %	0 %	20 %	20 %	387885864
95	NC_017909	GATTT	2	10	121144	121153	20 %	60 %	20 %	0 %	387885865
96	NC_017909	TATTT	2	10	125133	125142	20 %	80 %	0 %	0 %	387885868
97	NC_017909	CTTCT	2	10	130631	130640	0 %	60 %	0 %	40 %	387885873
98	NC_017909	AACAA	2	10	131293	131302	80 %	0 %	0 %	20 %	387885873
99	NC_017909	ATGTA	2	10	132262	132271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017909	TTATC	2	10	132272	132281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017909	GTCTA	2	10	133805	133814	20 %	40 %	20 %	20 %	387885876
102	NC_017909	AAGAA	2	10	135312	135321	80 %	0 %	20 %	0 %	387885877
103	NC_017909	TAAGT	2	10	135723	135732	40 %	40 %	20 %	0 %	387885877
104	NC_017909	TGTCG	2	10	137039	137048	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017909	TTACG	2	10	137803	137812	20 %	40 %	20 %	20 %	387885879
106	NC_017909	TAGCT	2	10	138170	138179	20 %	40 %	20 %	20 %	387885880
107	NC_017909	TAATT	2	10	138818	138827	40 %	60 %	0 %	0 %	387885881
108	NC_017909	TGGTT	2	10	140719	140728	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017909	ATAAA	2	10	141006	141015	80 %	20 %	0 %	0 %	387885883
110	NC_017909	TCTCT	2	10	141026	141035	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017909	CAATA	2	10	143076	143085	60 %	20 %	0 %	20 %	387885885
112	NC_017909	GGTAG	2	10	143091	143100	20 %	20 %	60 %	0 %	387885885
113	NC_017909	GTATG	2	10	144275	144284	20 %	40 %	40 %	0 %	387885885
114	NC_017909	GCAGG	2	10	144294	144303	20 %	0 %	60 %	20 %	387885885
115	NC_017909	TAATA	2	10	145166	145175	60 %	40 %	0 %	0 %	387885887
116	NC_017909	TATTT	2	10	145331	145340	20 %	80 %	0 %	0 %	387885887
117	NC_017909	AAACT	2	10	145836	145845	60 %	20 %	0 %	20 %	387885888
118	NC_017909	GTTTT	2	10	148885	148894	0 %	80 %	20 %	0 %	387885890
119	NC_017909	ATACA	2	10	149047	149056	60 %	20 %	0 %	20 %	387885890
120	NC_017909	GATTT	2	10	149961	149970	20 %	60 %	20 %	0 %	387885892
121	NC_017909	TCATA	2	10	153321	153330	40 %	40 %	0 %	20 %	387885894
122	NC_017909	ATAAA	2	10	154362	154371	80 %	20 %	0 %	0 %	387885895
123	NC_017909	CTTTG	2	10	156971	156980	0 %	60 %	20 %	20 %	387885897
124	NC_017909	GTTAG	2	10	157454	157463	20 %	40 %	40 %	0 %	387885897
125	NC_017909	TGTAT	2	10	162147	162156	20 %	60 %	20 %	0 %	387885904
126	NC_017909	GTATT	2	10	162413	162422	20 %	60 %	20 %	0 %	387885904
127	NC_017909	CTTTA	2	10	163294	163303	20 %	60 %	0 %	20 %	387885905
128	NC_017909	TAAGT	2	10	163472	163481	40 %	40 %	20 %	0 %	387885905
129	NC_017909	TACAT	2	10	163997	164006	40 %	40 %	0 %	20 %	387885905
130	NC_017909	AATAA	2	10	165645	165654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017909	TAGGA	2	10	166117	166126	40 %	20 %	40 %	0 %	387885907
132	NC_017909	TTTTG	2	10	166996	167005	0 %	80 %	20 %	0 %	387885908
133	NC_017909	ATAGT	2	10	168942	168951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017909	ATCGT	2	10	174058	174067	20 %	40 %	20 %	20 %	387885913
135	NC_017909	TATGG	2	10	175670	175679	20 %	40 %	40 %	0 %	387885915
136	NC_017909	CTAAA	2	10	181779	181788	60 %	20 %	0 %	20 %	387885922
137	NC_017909	AGATA	2	10	182242	182251	60 %	20 %	20 %	0 %	387885922
138	NC_017909	GAAGA	2	10	184369	184378	60 %	0 %	40 %	0 %	387885924
139	NC_017909	TTGGA	2	10	184811	184820	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_017909	GATTG	2	10	345432	345441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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