MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 31089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017461	A	6	6	5	10	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017461	TCA	2	6	11	16	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017461	CAA	2	6	17	22	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017461	TC	3	6	40	45	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017461	TC	3	6	101	106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017461	AGA	2	6	155	160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017461	TC	3	6	162	167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017461	CTG	2	6	208	213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017461	TC	3	6	222	227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017461	TAG	2	6	271	276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017461	TC	3	6	282	287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017461	TC	3	6	344	349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017461	TC	3	6	405	410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017461	TC	3	6	466	471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017461	TC	3	6	528	533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017461	CTG	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017461	TC	3	6	590	595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017461	TC	3	6	622	627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017461	TC	3	6	651	656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017461	CAA	3	9	694	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017461	TC	3	6	713	718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017461	TC	3	6	774	779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017461	CTT	2	6	835	840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
24	NC_017461	CTT	2	6	885	890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
25	NC_017461	GAA	2	6	895	900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805052
26	NC_017461	GCT	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
27	NC_017461	AGT	2	6	960	965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
28	NC_017461	TCA	2	6	966	971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
29	NC_017461	AATTG	2	10	989	998	40 %	40 %	20 %	0 %	385805052
30	NC_017461	ATC	2	6	1085	1090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
31	NC_017461	TCT	3	9	1107	1115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
32	NC_017461	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
33	NC_017461	CTT	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805052
34	NC_017461	AGAA	2	8	1386	1393	75 %	0 %	25 %	0 %	385805052
35	NC_017461	CT	3	6	1446	1451	0 %	50 %	0 %	50 %	385805052
36	NC_017461	CCA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385805052
37	NC_017461	CCG	2	6	1580	1585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385805052
38	NC_017461	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
39	NC_017461	TTA	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805052
40	NC_017461	CTG	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
41	NC_017461	GGT	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805052
42	NC_017461	AAAT	2	8	1796	1803	75 %	25 %	0 %	0 %	385805052
43	NC_017461	AAT	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
44	NC_017461	AAAATT	2	12	1864	1875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
45	NC_017461	CCTTT	2	10	1891	1900	0 %	60 %	0 %	40 %	385805052
46	NC_017461	GAGT	2	8	1903	1910	25 %	25 %	50 %	0 %	385805052
47	NC_017461	TCC	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805052
48	NC_017461	CAT	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805052
49	NC_017461	AAT	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805052
50	NC_017461	ATTCGG	2	12	2193	2204	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385805052
51	NC_017461	TC	3	6	2255	2260	0 %	50 %	0 %	50 %	385805052
52	NC_017461	AGCTTC	2	12	2438	2449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385805052
53	NC_017461	GCT	2	6	2468	2473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805052
54	NC_017461	GTA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805052
55	NC_017461	CA	3	6	2600	2605	50 %	0 %	0 %	50 %	385805052
56	NC_017461	TGG	2	6	2871	2876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385805053
57	NC_017461	TTC	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805053
58	NC_017461	T	6	6	2935	2940	0 %	100 %	0 %	0 %	385805053
59	NC_017461	T	6	6	2943	2948	0 %	100 %	0 %	0 %	385805053
60	NC_017461	CTT	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805053
61	NC_017461	TTTTC	2	10	2974	2983	0 %	80 %	0 %	20 %	385805053
62	NC_017461	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805053
63	NC_017461	ATG	2	6	3043	3048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017461	ATG	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017461	CTG	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017461	TCAT	2	8	3156	3163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017461	T	6	6	3179	3184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017461	A	6	6	3199	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017461	GAC	2	6	3339	3344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017461	TG	3	6	3359	3364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017461	G	9	9	3381	3389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017461	GTT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017461	GATC	2	8	3532	3539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017461	AAG	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017461	CAG	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017461	ATG	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017461	TAA	2	6	3755	3760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017461	CGAC	2	8	3851	3858	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017461	TTG	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017461	GA	3	6	3950	3955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017461	GCTT	2	8	4002	4009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017461	TCT	2	6	4081	4086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017461	AAT	2	6	4091	4096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017461	TCG	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017461	CTG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017461	AAT	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017461	CCT	2	6	4330	4335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805054
88	NC_017461	TGA	2	6	4503	4508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
89	NC_017461	CTC	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805055
90	NC_017461	CTA	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805055
91	NC_017461	ACTTC	2	10	4689	4698	20 %	40 %	0 %	40 %	385805055
92	NC_017461	GGC	2	6	4700	4705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385805055
93	NC_017461	TGA	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
94	NC_017461	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805055
95	NC_017461	ATT	2	6	4778	4783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805055
96	NC_017461	AAGA	2	8	4789	4796	75 %	0 %	25 %	0 %	385805055
97	NC_017461	AGA	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805055
98	NC_017461	TAG	2	6	4832	4837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805055
99	NC_017461	CAT	2	6	4914	4919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017461	TAA	2	6	4954	4959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017461	AAG	2	6	5000	5005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017461	CCG	2	6	5008	5013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017461	CCT	2	6	5142	5147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017461	ACA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017461	CTT	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017461	CTGCC	2	10	5285	5294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017461	CGG	2	6	5350	5355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017461	TCT	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017461	CAT	2	6	5437	5442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017461	TC	3	6	5457	5462	0 %	50 %	0 %	50 %	385805056
111	NC_017461	GA	3	6	5501	5506	50 %	0 %	50 %	0 %	385805056
112	NC_017461	ATA	2	6	5537	5542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805056
113	NC_017461	TTA	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385805056
114	NC_017461	CTT	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805056
115	NC_017461	TCC	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805057
116	NC_017461	CCTT	2	8	5756	5763	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
117	NC_017461	GTTA	2	8	5773	5780	25 %	50 %	25 %	0 %	385805057
118	NC_017461	GA	3	6	5798	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	385805057
119	NC_017461	ATG	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385805057
120	NC_017461	TCAT	2	8	5864	5871	25 %	50 %	0 %	25 %	385805057
121	NC_017461	TC	3	6	5951	5956	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
122	NC_017461	CAG	2	6	6001	6006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805057
123	NC_017461	CT	3	6	6038	6043	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
124	NC_017461	GA	3	6	6059	6064	50 %	0 %	50 %	0 %	385805057
125	NC_017461	TCG	2	6	6068	6073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805057
126	NC_017461	TAAGC	2	10	6083	6092	40 %	20 %	20 %	20 %	385805057
127	NC_017461	AAC	2	6	6106	6111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
128	NC_017461	GAG	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385805057
129	NC_017461	CAA	2	6	6147	6152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
130	NC_017461	AT	3	6	6182	6187	50 %	50 %	0 %	0 %	385805057
131	NC_017461	GTC	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385805057
132	NC_017461	TA	3	6	6211	6216	50 %	50 %	0 %	0 %	385805057
133	NC_017461	T	6	6	6221	6226	0 %	100 %	0 %	0 %	385805057
134	NC_017461	ACA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
135	NC_017461	AGC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385805057
136	NC_017461	AAG	2	6	6328	6333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385805057
137	NC_017461	TC	3	6	6356	6361	0 %	50 %	0 %	50 %	385805057
138	NC_017461	CAA	2	6	6414	6419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385805057
139	NC_017461	TTC	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
140	NC_017461	ACT	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805057
141	NC_017461	CTT	2	6	6496	6501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805057
142	NC_017461	ATA	2	6	6532	6537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385805057
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181	NC_017461	A	6	6	8097	8102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_017461	TTATAA	2	12	11905	11916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_017461	TAAT	2	8	12100	12107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017461	TA	3	6	12175	12180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017461	ATG	2	6	12231	12236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
261	NC_017461	AAGG	2	8	12237	12244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017461	CAT	2	6	12409	12414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385805065
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266	NC_017461	TAC	2	6	12632	12637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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268	NC_017461	AATG	2	8	12665	12672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017461	TCC	2	6	12706	12711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385805066
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274	NC_017461	TCT	2	6	12817	12822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805066
275	NC_017461	CCTTAT	2	12	12854	12865	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385805066
276	NC_017461	TCT	2	6	12875	12880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385805066
277	NC_017461	ACC	2	6	12924	12929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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279	NC_017461	A	6	6	12950	12955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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