MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fervidicoccus fontis Kam940 chromosome

Total Repeats: 31089

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_017461	CCTT	2	8	1315420	1315427	0 %	50 %	0 %	50 %	385806428
31002	NC_017461	ATT	2	6	1315452	1315457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806428
31003	NC_017461	AGA	2	6	1315476	1315481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806428
31004	NC_017461	T	6	6	1315620	1315625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_017461	G	6	6	1315651	1315656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_017461	ACC	2	6	1315673	1315678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31007	NC_017461	ATT	2	6	1315740	1315745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806429
31008	NC_017461	T	6	6	1315757	1315762	0 %	100 %	0 %	0 %	385806429
31009	NC_017461	CT	3	6	1315787	1315792	0 %	50 %	0 %	50 %	385806429
31010	NC_017461	GAG	2	6	1315935	1315940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806429
31011	NC_017461	AGG	2	6	1315978	1315983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806429
31012	NC_017461	TTGC	2	8	1316004	1316011	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31013	NC_017461	AGC	2	6	1316022	1316027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31014	NC_017461	AGG	2	6	1316076	1316081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385806430
31015	NC_017461	GAA	2	6	1316091	1316096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806430
31016	NC_017461	ATC	2	6	1316106	1316111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806430
31017	NC_017461	AG	3	6	1316116	1316121	50 %	0 %	50 %	0 %	385806430
31018	NC_017461	GA	3	6	1316142	1316147	50 %	0 %	50 %	0 %	385806430
31019	NC_017461	TCC	2	6	1316158	1316163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806430
31020	NC_017461	AGC	2	6	1316186	1316191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31021	NC_017461	TGAG	2	8	1316215	1316222	25 %	25 %	50 %	0 %	385806431
31022	NC_017461	AGA	2	6	1316226	1316231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806431
31023	NC_017461	ATC	2	6	1316244	1316249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806431
31024	NC_017461	AAG	2	6	1316274	1316279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806431
31025	NC_017461	GCTC	2	8	1316312	1316319	0 %	25 %	25 %	50 %	385806431
31026	NC_017461	GATGT	2	10	1316345	1316354	20 %	40 %	40 %	0 %	385806431
31027	NC_017461	GAG	2	6	1316378	1316383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31028	NC_017461	AGG	2	6	1316460	1316465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31029	NC_017461	A	6	6	1316500	1316505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31030	NC_017461	ACC	2	6	1316551	1316556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31031	NC_017461	CTTT	2	8	1316618	1316625	0 %	75 %	0 %	25 %	385806432
31032	NC_017461	T	6	6	1316623	1316628	0 %	100 %	0 %	0 %	385806432
31033	NC_017461	TTC	2	6	1316641	1316646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806432
31034	NC_017461	CT	3	6	1316719	1316724	0 %	50 %	0 %	50 %	385806432
31035	NC_017461	AGAGGA	2	12	1316739	1316750	50 %	0 %	50 %	0 %	385806432
31036	NC_017461	GGGA	2	8	1316788	1316795	25 %	0 %	75 %	0 %	385806432
31037	NC_017461	AGC	2	6	1316831	1316836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806432
31038	NC_017461	CAA	2	6	1316841	1316846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806432
31039	NC_017461	ATT	2	6	1316871	1316876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31040	NC_017461	CAA	2	6	1316880	1316885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31041	NC_017461	TCA	2	6	1316951	1316956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385806433
31042	NC_017461	AAC	2	6	1317009	1317014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806433
31043	NC_017461	TAT	2	6	1317054	1317059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806433
31044	NC_017461	CGA	2	6	1317131	1317136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806433
31045	NC_017461	ATG	2	6	1317139	1317144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806433
31046	NC_017461	CTCG	2	8	1317186	1317193	0 %	25 %	25 %	50 %	385806433
31047	NC_017461	TAA	2	6	1317272	1317277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385806433
31048	NC_017461	TGG	2	6	1317382	1317387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806433
31049	NC_017461	TTA	2	6	1317407	1317412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806433
31050	NC_017461	CAA	2	6	1317419	1317424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385806433
31051	NC_017461	AGA	2	6	1317539	1317544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806433
31052	NC_017461	GAA	2	6	1317642	1317647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806433
31053	NC_017461	CCT	2	6	1317658	1317663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385806433
31054	NC_017461	AGA	2	6	1317706	1317711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31055	NC_017461	T	7	7	1317771	1317777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31056	NC_017461	CTT	2	6	1317905	1317910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31057	NC_017461	ATGC	2	8	1317966	1317973	25 %	25 %	25 %	25 %	385806434
31058	NC_017461	TCT	2	6	1318041	1318046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806434
31059	NC_017461	GCT	2	6	1318051	1318056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806434
31060	NC_017461	CT	3	6	1318055	1318060	0 %	50 %	0 %	50 %	385806434
31061	NC_017461	AGC	2	6	1318085	1318090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385806434
31062	NC_017461	GA	3	6	1318113	1318118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31063	NC_017461	GAA	2	6	1318131	1318136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31064	NC_017461	TAACAT	2	12	1318138	1318149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31065	NC_017461	TCCT	2	8	1318238	1318245	0 %	50 %	0 %	50 %	385806435
31066	NC_017461	GCT	2	6	1318274	1318279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806435
31067	NC_017461	TCT	2	6	1318368	1318373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385806435
31068	NC_017461	TTG	2	6	1318421	1318426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385806435
31069	NC_017461	CTG	2	6	1318454	1318459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385806435
31070	NC_017461	TGG	2	6	1318527	1318532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385806435
31071	NC_017461	AG	3	6	1318567	1318572	50 %	0 %	50 %	0 %	385806435
31072	NC_017461	C	6	6	1318600	1318605	0 %	0 %	0 %	100 %	385806435
31073	NC_017461	GAA	2	6	1318701	1318706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806435
31074	NC_017461	TAG	2	6	1318737	1318742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806435
31075	NC_017461	GAA	2	6	1318775	1318780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385806435
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31077	NC_017461	GAT	2	6	1318804	1318809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385806435
31078	NC_017461	TC	3	6	1318812	1318817	0 %	50 %	0 %	50 %	385806435
31079	NC_017461	TAT	2	6	1318879	1318884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806435
31080	NC_017461	TAAA	2	8	1318949	1318956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31081	NC_017461	TGAA	2	8	1318963	1318970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31082	NC_017461	TAT	2	6	1319043	1319048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806436
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31084	NC_017461	T	6	6	1319052	1319057	0 %	100 %	0 %	0 %	385806436
31085	NC_017461	A	6	6	1319073	1319078	100 %	0 %	0 %	0 %	385806436
31086	NC_017461	AT	3	6	1319088	1319093	50 %	50 %	0 %	0 %	385806436
31087	NC_017461	TAT	2	6	1319132	1319137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385806436
31088	NC_017461	A	6	6	1319170	1319175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31089	NC_017461	TC	3	6	1319186	1319191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.