MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fibrobacter succinogenes subsp. succinogenes S85 chromosome

Total Repeats: 72129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017448	TCA	2	6	240041	240046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789241
4502	NC_017448	AT	3	6	240051	240056	50 %	50 %	0 %	0 %	385789241
4503	NC_017448	TCG	2	6	240101	240106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_017448	CTTT	2	8	240112	240119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_017448	T	6	6	240174	240179	0 %	100 %	0 %	0 %	385789242
4506	NC_017448	GAA	2	6	240201	240206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789242
4507	NC_017448	ATC	3	9	240237	240245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789242
4508	NC_017448	ATT	2	6	240246	240251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789242
4509	NC_017448	CTT	2	6	240278	240283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789242
4510	NC_017448	T	6	6	240350	240355	0 %	100 %	0 %	0 %	385789242
4511	NC_017448	GTA	2	6	240462	240467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789242
4512	NC_017448	TAA	2	6	240577	240582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789242
4513	NC_017448	AAC	2	6	240618	240623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789242
4514	NC_017448	TCT	2	6	240628	240633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789242
4515	NC_017448	T	6	6	240633	240638	0 %	100 %	0 %	0 %	385789242
4516	NC_017448	AAG	2	6	240660	240665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789242
4517	NC_017448	CTT	2	6	240683	240688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789242
4518	NC_017448	TTC	2	6	240714	240719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789242
4519	NC_017448	CAT	2	6	240761	240766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789242
4520	NC_017448	AAT	2	6	240774	240779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789242
4521	NC_017448	GCA	2	6	240868	240873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789242
4522	NC_017448	TTGC	2	8	241042	241049	0 %	50 %	25 %	25 %	385789242
4523	NC_017448	AT	3	6	241076	241081	50 %	50 %	0 %	0 %	385789242
4524	NC_017448	GAAT	2	8	241138	241145	50 %	25 %	25 %	0 %	385789242
4525	NC_017448	GCT	2	6	241220	241225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789242
4526	NC_017448	CA	3	6	241238	241243	50 %	0 %	0 %	50 %	385789242
4527	NC_017448	GAT	2	6	241281	241286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789242
4528	NC_017448	TCG	2	6	241333	241338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789242
4529	NC_017448	ACA	2	6	241349	241354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789242
4530	NC_017448	T	6	6	241355	241360	0 %	100 %	0 %	0 %	385789242
4531	NC_017448	CAT	2	6	241386	241391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789242
4532	NC_017448	CGG	2	6	241410	241415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789242
4533	NC_017448	AAT	2	6	241638	241643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789242
4534	NC_017448	TGC	2	6	241691	241696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789242
4535	NC_017448	AG	3	6	241751	241756	50 %	0 %	50 %	0 %	385789242
4536	NC_017448	ATT	2	6	241884	241889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789242
4537	NC_017448	CTG	2	6	241994	241999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789242
4538	NC_017448	ACCAAT	2	12	242025	242036	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385789242
4539	NC_017448	AAG	2	6	242096	242101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789242
4540	NC_017448	CGG	2	6	242162	242167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789242
4541	NC_017448	T	6	6	242194	242199	0 %	100 %	0 %	0 %	385789242
4542	NC_017448	CAT	2	6	242201	242206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789242
4543	NC_017448	CCA	2	6	242275	242280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789242
4544	NC_017448	ATC	2	6	242308	242313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789242
4545	NC_017448	TTC	2	6	242364	242369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789242
4546	NC_017448	GT	3	6	242411	242416	0 %	50 %	50 %	0 %	385789242
4547	NC_017448	AGG	2	6	242463	242468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385789242
4548	NC_017448	ATT	2	6	242604	242609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789242
4549	NC_017448	TATT	2	8	242623	242630	25 %	75 %	0 %	0 %	385789242
4550	NC_017448	GTTG	2	8	242673	242680	0 %	50 %	50 %	0 %	385789242
4551	NC_017448	AAC	2	6	242694	242699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789242
4552	NC_017448	ATT	2	6	242748	242753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385789242
4553	NC_017448	T	6	6	242785	242790	0 %	100 %	0 %	0 %	385789242
4554	NC_017448	AG	3	6	242867	242872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017448	T	6	6	242876	242881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017448	ACA	2	6	242913	242918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_017448	ATAAA	2	10	242919	242928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017448	A	6	6	242974	242979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017448	TAA	2	6	243032	243037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017448	A	6	6	243055	243060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017448	GCG	2	6	243086	243091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_017448	CGA	2	6	243099	243104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_017448	A	6	6	243113	243118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017448	TCT	2	6	243173	243178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789243
4565	NC_017448	TTC	2	6	243194	243199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789243
4566	NC_017448	CGG	2	6	243219	243224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385789243
4567	NC_017448	TTC	2	6	243233	243238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789243
4568	NC_017448	CAT	2	6	243254	243259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789243
4569	NC_017448	TGCCAA	2	12	243294	243305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385789243
4570	NC_017448	GCT	2	6	243315	243320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789243
4571	NC_017448	AATG	2	8	243332	243339	50 %	25 %	25 %	0 %	385789243
4572	NC_017448	GTCA	2	8	243380	243387	25 %	25 %	25 %	25 %	385789243
4573	NC_017448	CCCCT	2	10	243517	243526	0 %	20 %	0 %	80 %	385789243
4574	NC_017448	TA	3	6	243657	243662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_017448	A	7	7	243718	243724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_017448	TA	3	6	243937	243942	50 %	50 %	0 %	0 %	385789244
4577	NC_017448	GTC	2	6	244020	244025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789244
4578	NC_017448	AAC	2	6	244088	244093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789244
4579	NC_017448	ACGAC	2	10	244128	244137	40 %	0 %	20 %	40 %	385789244
4580	NC_017448	T	6	6	244230	244235	0 %	100 %	0 %	0 %	385789244
4581	NC_017448	CTG	2	6	244265	244270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789244
4582	NC_017448	ATC	2	6	244287	244292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789244
4583	NC_017448	AT	3	6	244342	244347	50 %	50 %	0 %	0 %	385789244
4584	NC_017448	AGA	2	6	244351	244356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789244
4585	NC_017448	T	6	6	244375	244380	0 %	100 %	0 %	0 %	385789244
4586	NC_017448	AAT	2	6	244447	244452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385789244
4587	NC_017448	TTC	2	6	244717	244722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_017448	ACA	2	6	244763	244768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_017448	GAT	2	6	244889	244894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789245
4590	NC_017448	AG	3	6	244898	244903	50 %	0 %	50 %	0 %	385789245
4591	NC_017448	CTT	2	6	244964	244969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
4592	NC_017448	TAG	2	6	245016	245021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789245
4593	NC_017448	CCTT	2	8	245049	245056	0 %	50 %	0 %	50 %	385789245
4594	NC_017448	TGT	2	6	245134	245139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789245
4595	NC_017448	GTT	2	6	245180	245185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789245
4596	NC_017448	AGA	2	6	245212	245217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789245
4597	NC_017448	AGT	2	6	245272	245277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789245
4598	NC_017448	TGT	2	6	245284	245289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789245
4599	NC_017448	GGA	2	6	245302	245307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385789245
4600	NC_017448	TGG	2	6	245424	245429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789245
4601	NC_017448	TGG	2	6	245440	245445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385789245
4602	NC_017448	GAC	2	6	245449	245454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789245
4603	NC_017448	AGCG	2	8	245545	245552	25 %	0 %	50 %	25 %	385789245
4604	NC_017448	TTC	2	6	245567	245572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
4605	NC_017448	CAC	2	6	245664	245669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385789245
4606	NC_017448	CAG	2	6	245719	245724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789245
4607	NC_017448	TTG	2	6	245739	245744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385789245
4608	NC_017448	GAA	2	6	245774	245779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789245
4609	NC_017448	GTC	2	6	245840	245845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789245
4610	NC_017448	AGCC	2	8	245991	245998	25 %	0 %	25 %	50 %	385789245
4611	NC_017448	TCG	2	6	246000	246005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789245
4612	NC_017448	CGAG	2	8	246006	246013	25 %	0 %	50 %	25 %	385789245
4613	NC_017448	CTT	2	6	246041	246046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
4614	NC_017448	GAG	2	6	246050	246055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385789245
4615	NC_017448	TTC	2	6	246098	246103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
4616	NC_017448	CTT	2	6	246248	246253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
4617	NC_017448	ATG	2	6	246267	246272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789245
4618	NC_017448	ACG	2	6	246285	246290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385789245
4619	NC_017448	TGGT	2	8	246441	246448	0 %	50 %	50 %	0 %	385789245
4620	NC_017448	TCT	2	6	246459	246464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
4621	NC_017448	AGA	2	6	246473	246478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385789245
4622	NC_017448	CTT	2	6	246545	246550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385789245
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4624	NC_017448	CAT	2	6	246598	246603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385789245
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4871	NC_017448	TGGCA	2	10	259952	259961	20 %	20 %	40 %	20 %	385789260
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4883	NC_017448	AGT	2	6	260645	260650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385789261
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4952	NC_017448	CAT	2	6	263522	263527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4963	NC_017448	TCC	2	6	264099	264104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4964	NC_017448	TGTTTT	2	12	264122	264133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4965	NC_017448	T	6	6	264130	264135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4966	NC_017448	TACA	2	8	264244	264251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4970	NC_017448	A	8	8	264333	264340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4971	NC_017448	TCGC	2	8	264430	264437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4972	NC_017448	T	6	6	264447	264452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4973	NC_017448	T	6	6	264540	264545	0 %	100 %	0 %	0 %	385789263
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4995	NC_017448	GTAC	2	8	266182	266189	25 %	25 %	25 %	25 %	385789264
4996	NC_017448	GCAG	2	8	266219	266226	25 %	0 %	50 %	25 %	385789264
4997	NC_017448	CAA	2	6	266252	266257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385789264
4998	NC_017448	GTC	2	6	266268	266273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385789264
4999	NC_017448	CTC	2	6	266349	266354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385789264
5000	NC_017448	GGAG	2	8	266360	266367	25 %	0 %	75 %	0 %	385789264

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