MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Frateuria aurantia DSM 6220 chromosome

Total Repeats: 58849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017033	GAA	2	6	2	7	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017033	CGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
3	NC_017033	GAA	2	6	67	72	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315352
4	NC_017033	GAT	2	6	106	111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315352
5	NC_017033	CGG	2	6	297	302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315352
6	NC_017033	CGA	2	6	309	314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
7	NC_017033	TCC	2	6	317	322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315352
8	NC_017033	TGC	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
9	NC_017033	GGC	2	6	508	513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315352
10	NC_017033	CGC	2	6	543	548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
11	NC_017033	TCG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
12	NC_017033	GAT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315352
13	NC_017033	GCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
14	NC_017033	CGA	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
15	NC_017033	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315352
16	NC_017033	ACC	2	6	727	732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315352
17	NC_017033	GAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315352
18	NC_017033	TTC	2	6	742	747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315352
19	NC_017033	AGC	2	6	776	781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
20	NC_017033	GCC	2	6	901	906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
21	NC_017033	CGT	2	6	936	941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
22	NC_017033	CGA	2	6	948	953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
23	NC_017033	TGC	2	6	962	967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
24	NC_017033	GCC	2	6	1024	1029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
25	NC_017033	CTG	2	6	1090	1095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315352
26	NC_017033	AGA	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315352
27	NC_017033	CCG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315352
28	NC_017033	ACT	2	6	1148	1153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315352
29	NC_017033	GCG	2	6	1185	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315352
30	NC_017033	CAC	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315352
31	NC_017033	AGC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315352
32	NC_017033	CGC	2	6	1413	1418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017033	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017033	ACA	2	6	1602	1607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017033	ACC	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017033	AGC	2	6	1634	1639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017033	GTC	2	6	1705	1710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
38	NC_017033	CTG	2	6	1753	1758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
39	NC_017033	GAT	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315353
40	NC_017033	TGC	2	6	2054	2059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
41	NC_017033	TTA	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315353
42	NC_017033	TGC	2	6	2126	2131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
43	NC_017033	CAG	3	9	2143	2151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315353
44	NC_017033	TCA	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315353
45	NC_017033	GTC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
46	NC_017033	GTG	2	6	2492	2497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315353
47	NC_017033	ATC	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315353
48	NC_017033	CTG	2	6	2626	2631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315353
49	NC_017033	CCT	2	6	2939	2944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017033	CGA	2	6	3006	3011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017033	TGC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017033	GTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017033	TGC	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017033	GGT	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017033	TGC	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017033	CCT	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017033	TCA	2	6	3412	3417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017033	CAC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017033	AGG	2	6	3774	3779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315354
60	NC_017033	GCT	2	6	3886	3891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
61	NC_017033	GAG	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315354
62	NC_017033	CGT	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
63	NC_017033	GGC	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315354
64	NC_017033	AAC	2	6	3980	3985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315354
65	NC_017033	TGC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
66	NC_017033	ATG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315354
67	NC_017033	CCG	2	6	4083	4088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315354
68	NC_017033	TGC	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
69	NC_017033	GTG	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315354
70	NC_017033	TTG	2	6	4138	4143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315354
71	NC_017033	AGC	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315354
72	NC_017033	GTG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315354
73	NC_017033	TGG	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315354
74	NC_017033	CAA	2	6	4450	4455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315354
75	NC_017033	GCT	2	6	4467	4472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315354
76	NC_017033	TCC	2	6	4512	4517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315354
77	NC_017033	CGG	2	6	4518	4523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315354
78	NC_017033	CGA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
79	NC_017033	CAC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315355
80	NC_017033	TGA	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315355
81	NC_017033	GAA	2	6	4956	4961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315355
82	NC_017033	GTG	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315355
83	NC_017033	CGG	2	6	5003	5008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315355
84	NC_017033	CGT	2	6	5106	5111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
85	NC_017033	CAG	2	6	5127	5132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
86	NC_017033	ACG	2	6	5184	5189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
87	NC_017033	CAT	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315355
88	NC_017033	CGC	2	6	5404	5409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
89	NC_017033	CAA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315355
90	NC_017033	TTC	2	6	5699	5704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315355
91	NC_017033	CTG	2	6	5784	5789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
92	NC_017033	GGC	2	6	5852	5857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315355
93	NC_017033	TGC	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
94	NC_017033	CCG	2	6	6094	6099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
95	NC_017033	GAC	2	6	6144	6149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
96	NC_017033	TGC	2	6	6229	6234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
97	NC_017033	CTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315355
98	NC_017033	GCC	2	6	6296	6301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
99	NC_017033	CAG	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
100	NC_017033	TGG	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315355
101	NC_017033	GGC	2	6	6614	6619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315355
102	NC_017033	GCT	2	6	6731	6736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315355
103	NC_017033	GAT	2	6	6813	6818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315355
104	NC_017033	GCA	2	6	6907	6912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
105	NC_017033	AGC	2	6	6949	6954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315355
106	NC_017033	GCC	2	6	7020	7025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315355
107	NC_017033	CAT	2	6	7160	7165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017033	GTC	2	6	7189	7194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017033	TCA	2	6	7337	7342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017033	GCA	2	6	7393	7398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
111	NC_017033	CGG	2	6	7417	7422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
112	NC_017033	CAG	2	6	7541	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
113	NC_017033	AGA	2	6	7558	7563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315356
114	NC_017033	GCC	2	6	7584	7589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
115	NC_017033	TGC	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315356
116	NC_017033	CAG	2	6	7674	7679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
117	NC_017033	GGC	2	6	7719	7724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
118	NC_017033	CGG	2	6	7751	7756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
119	NC_017033	ATC	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315356
120	NC_017033	CCG	2	6	7882	7887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
121	NC_017033	CGC	2	6	7946	7951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
122	NC_017033	ACC	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315356
123	NC_017033	GCA	2	6	8060	8065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
124	NC_017033	GCC	2	6	8268	8273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
125	NC_017033	CAT	2	6	8312	8317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383315356
126	NC_017033	GAC	2	6	8319	8324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315356
127	NC_017033	GCC	2	6	8328	8333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
128	NC_017033	GCC	2	6	8355	8360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315356
129	NC_017033	GAT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315356
130	NC_017033	ATG	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315356
131	NC_017033	CTG	2	6	8457	8462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315356
132	NC_017033	GCG	2	6	8481	8486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383315356
133	NC_017033	AAG	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315356
134	NC_017033	ATG	2	6	8723	8728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315357
135	NC_017033	TGT	2	6	8802	8807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315357
136	NC_017033	GCA	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017033	AGC	2	6	9050	9055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315358
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140	NC_017033	CCG	3	9	9154	9162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
141	NC_017033	GGT	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315358
142	NC_017033	GCC	3	9	9183	9191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
143	NC_017033	GCC	4	12	9195	9206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
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145	NC_017033	CCG	2	6	9217	9222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315358
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152	NC_017033	GTC	2	6	9593	9598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017033	TTC	2	6	9642	9647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315359
154	NC_017033	CGC	3	9	9684	9692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315359
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157	NC_017033	TCG	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315359
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161	NC_017033	CGC	3	9	9951	9959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383315359
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163	NC_017033	TCG	2	6	10016	10021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315359
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197	NC_017033	TCC	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383315363
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223	NC_017033	GTG	2	6	14165	14170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_017033	GCA	2	6	15639	15644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315366
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252	NC_017033	GCT	2	6	15706	15711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315366
253	NC_017033	GAA	2	6	15814	15819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315366
254	NC_017033	GTA	2	6	15916	15921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315366
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256	NC_017033	ACC	2	6	15988	15993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383315366
257	NC_017033	CGA	2	6	15995	16000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315366
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279	NC_017033	TGC	2	6	17700	17705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315368
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288	NC_017033	GCA	2	6	18217	18222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315369
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