MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Filifactor alocis ATCC 35896 chromosome

Total Repeats: 905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016630	CATTGA	2	12	3389	3400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307322
2	NC_016630	GCAGGA	2	12	3823	3834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374307322
3	NC_016630	TGTGAC	2	12	9398	9409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374307324
4	NC_016630	CGGAAT	2	12	11581	11592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307326
5	NC_016630	AAAAAT	2	12	16494	16505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016630	CCGATG	2	12	19602	19613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374307331
7	NC_016630	GAAAAA	2	12	21337	21348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307332
8	NC_016630	ATGAAA	2	12	23132	23143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307334
9	NC_016630	TATCAT	2	12	27640	27651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307340
10	NC_016630	ATTAAA	2	12	28006	28017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016630	TAAAAG	2	12	28103	28114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016630	CCTTCC	2	12	30864	30875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374307342
13	NC_016630	TGATAC	2	12	31620	31631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016630	GTTGAT	2	12	34876	34887	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307344
15	NC_016630	GTTTTT	2	12	35326	35337	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374307344
16	NC_016630	TTTTCT	2	12	35712	35723	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016630	TGGAAA	2	12	35790	35801	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307345
18	NC_016630	TCATAT	2	12	39196	39207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307347
19	NC_016630	TGAGAG	2	12	42553	42564	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016630	GACAGT	2	12	45536	45547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307353
21	NC_016630	TCATAA	2	12	47472	47483	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307355
22	NC_016630	TTGACA	2	12	49510	49521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307358
23	NC_016630	TTGGAA	2	12	51498	51509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307360
24	NC_016630	TCAAAA	2	12	53961	53972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374307362
25	NC_016630	AGGTTG	2	12	54402	54413	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374307362
26	NC_016630	TTACAA	2	12	59468	59479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307366
27	NC_016630	AGGGAG	2	12	59694	59705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016630	ATGAAT	2	12	61268	61279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307369
29	NC_016630	GATAGA	2	12	63327	63338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307371
30	NC_016630	AAAGGA	2	12	63581	63592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374307372
31	NC_016630	TATTTT	2	12	63662	63673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374307372
32	NC_016630	ATCAGA	2	12	68685	68696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374307376
33	NC_016630	TGGCAA	2	12	72974	72985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307377
34	NC_016630	TTGACA	2	12	75030	75041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307378
35	NC_016630	TTGACA	2	12	76669	76680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307380
36	NC_016630	TTTGTT	2	12	76837	76848	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374307380
37	NC_016630	GGAAAT	2	12	77894	77905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307381
38	NC_016630	GCTATT	2	12	80201	80212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307382
39	NC_016630	GGATTT	2	12	81902	81913	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307384
40	NC_016630	TCGAGA	2	12	85722	85733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307386
41	NC_016630	CCTATG	2	12	86989	87000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374307388
42	NC_016630	CGGAAA	2	12	91344	91355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374307391
43	NC_016630	TATCAA	2	12	93529	93540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307394
44	NC_016630	TAAAAG	2	12	94766	94777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307394
45	NC_016630	GATAGG	2	12	97688	97699	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374307398
46	NC_016630	ATAGGA	2	12	98472	98483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307398
47	NC_016630	AAATTG	2	12	101075	101086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016630	ATGAGT	2	12	101335	101346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016630	TAAAAG	2	12	103144	103155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307403
50	NC_016630	AAGAGA	2	12	105575	105586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016630	TTTTTG	2	12	112399	112410	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374307411
52	NC_016630	GATTTT	2	12	112452	112463	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307411
53	NC_016630	CCATAA	2	12	115913	115924	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374307413
54	NC_016630	CTGTTT	2	12	118574	118585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016630	TTTGGT	4	24	118589	118612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016630	ATTTTT	2	12	118672	118683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016630	TATGAC	2	12	121294	121305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307417
58	NC_016630	CTTTGA	2	12	123209	123220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307419
59	NC_016630	TTGAAT	2	12	126800	126811	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307422
60	NC_016630	TAAAAA	2	12	129964	129975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016630	TGATAA	2	12	135167	135178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307430
62	NC_016630	TTTCTG	2	12	135961	135972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	374307431
63	NC_016630	AATGAA	2	12	138835	138846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307435
64	NC_016630	CTCATA	2	12	139026	139037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307435
65	NC_016630	ATTCAT	2	12	139454	139465	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307435
66	NC_016630	GCTATT	2	12	141950	141961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307438
67	NC_016630	TGCAAG	2	12	151750	151761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307447
68	NC_016630	AAAATG	2	12	152831	152842	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016630	ATCGGA	2	12	154993	155004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307451
70	NC_016630	GTTCCG	2	12	155629	155640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374307451
71	NC_016630	AGATGT	2	12	157001	157012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307452
72	NC_016630	ATATCG	2	12	158158	158169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307454
73	NC_016630	GAAAAA	2	12	158816	158827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307454
74	NC_016630	AAAGTA	2	12	161602	161613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307455
75	NC_016630	AGAATT	2	12	168374	168385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307460
76	NC_016630	GAAAAA	2	12	175040	175051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307466
77	NC_016630	ATTTTT	2	12	176264	176275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374307468
78	NC_016630	AAAGAA	2	12	176306	176317	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307468
79	NC_016630	GATGTA	2	12	178857	178868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307470
80	NC_016630	TAGAAG	2	12	181894	181905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307472
81	NC_016630	TTAAAA	2	12	184235	184246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374307474
82	NC_016630	ATTTTA	2	12	189867	189878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374307476
83	NC_016630	ATATGA	2	12	193703	193714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307478
84	NC_016630	ATGGAT	2	12	194195	194206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307479
85	NC_016630	TGAAGA	2	12	196408	196419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307480
86	NC_016630	TTGAAA	2	12	197895	197906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307482
87	NC_016630	ATGAGT	2	12	201345	201356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307485
88	NC_016630	TGTATT	2	12	201907	201918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307485
89	NC_016630	ATTTGG	2	12	205366	205377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307489
90	NC_016630	GATTGT	2	12	206524	206535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016630	ATAGAA	2	12	213446	213457	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016630	TGAAAT	2	12	216329	216340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307499
93	NC_016630	TTCATT	2	12	220921	220932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016630	TGAATA	2	12	223119	223130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307505
95	NC_016630	GTACTT	2	12	223704	223715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307505
96	NC_016630	TGAAAT	2	12	227562	227573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307508
97	NC_016630	TAAAAA	2	12	227732	227743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374307509
98	NC_016630	GGAAGA	2	12	228219	228230	50 %	0 %	50 %	0 %	374307509
99	NC_016630	TTTTGA	2	12	230722	230733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307512
100	NC_016630	GTAGAA	2	12	232529	232540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307514
101	NC_016630	GGAAAA	2	12	235664	235675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374307518
102	NC_016630	TTATTT	2	12	235971	235982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374307519
103	NC_016630	TTTGAA	2	12	236046	236057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307519
104	NC_016630	AAATTG	2	12	238463	238474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307522
105	NC_016630	TAGAGT	2	12	241051	241062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307524
106	NC_016630	TTCATT	2	12	244827	244838	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374307528
107	NC_016630	TTGGAT	2	12	245341	245352	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307528
108	NC_016630	CTTACG	2	12	247638	247649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374307531
109	NC_016630	GAAAAA	2	12	250328	250339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307532
110	NC_016630	GAACAA	2	12	251571	251582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374307533
111	NC_016630	CAAAGA	2	12	253589	253600	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374307534
112	NC_016630	AGAAAA	2	12	256071	256082	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307537
113	NC_016630	TATTGT	2	12	256442	256453	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307537
114	NC_016630	ATTCGG	2	12	258854	258865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374307539
115	NC_016630	AAATTC	2	12	264778	264789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307543
116	NC_016630	AAAATA	2	12	268667	268678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016630	GTAAAA	2	12	270067	270078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307547
118	NC_016630	ATATCA	2	12	270209	270220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307547
119	NC_016630	GAAAAA	2	12	271369	271380	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307547
120	NC_016630	AAGTAA	2	12	273350	273361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307548
121	NC_016630	AATTTG	2	12	275537	275548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307550
122	NC_016630	AAAAGA	2	12	276690	276701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307552
123	NC_016630	TCGCTT	2	12	278227	278238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374307553
124	NC_016630	AAGATA	2	12	279208	279219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307555
125	NC_016630	GTATTT	2	12	281595	281606	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016630	TATCCA	2	12	287270	287281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307563
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129	NC_016630	TAACGT	2	12	293403	293414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307566
130	NC_016630	TTTTAC	2	12	293574	293585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374307566
131	NC_016630	CCATCG	2	12	294280	294291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374307567
132	NC_016630	TTAAAA	2	12	295455	295466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016630	TATACT	2	12	295507	295518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_016630	TCCTGT	2	12	296871	296882	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374307568
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140	NC_016630	TTTAAG	2	12	310123	310134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307581
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147	NC_016630	TTTCTT	2	12	334167	334178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374307603
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220	NC_016630	TCCAAT	2	12	484018	484029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307743
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227	NC_016630	TTTCTT	2	12	494468	494479	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
228	NC_016630	TATTCT	2	12	495119	495130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374307754
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231	NC_016630	TCTCTT	2	12	498544	498555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374307755
232	NC_016630	CCATCA	2	12	501392	501403	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374307755
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234	NC_016630	AAAAGA	2	12	505036	505047	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307755
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236	NC_016630	TCAAGT	2	12	509861	509872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307758
237	NC_016630	TACTTA	2	12	510624	510635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
238	NC_016630	TTCTTT	2	12	515720	515731	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374307763
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240	NC_016630	GTATCC	2	12	520690	520701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374307767
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340	NC_016630	TCTGCA	2	12	711202	711213	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374307944
341	NC_016630	CTTTGC	2	12	711687	711698	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374307945
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344	NC_016630	TCGCTT	2	12	718385	718396	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
345	NC_016630	CTTTCG	2	12	718795	718806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
346	NC_016630	AATTTC	2	12	722465	722476	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307948
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350	NC_016630	ATGGCA	2	12	725249	725260	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307950
351	NC_016630	AAAGAA	2	12	725858	725869	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307951
352	NC_016630	ATAAGG	2	12	726119	726130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
353	NC_016630	GCTATT	2	12	726863	726874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307952
354	NC_016630	TGAATT	2	12	729377	729388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
355	NC_016630	ATAAAT	2	12	730198	730209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374307953
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357	NC_016630	ATTCTC	2	12	735151	735162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
358	NC_016630	GAATCA	2	12	735343	735354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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472	NC_016630	AATGCA	2	12	961839	961850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374308129
473	NC_016630	CAATAA	2	12	962594	962605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374308129
474	NC_016630	GGTGCT	3	18	963003	963020	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374308130
475	NC_016630	TTCTAC	2	12	963089	963100	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374308130
476	NC_016630	TCTTTT	2	12	968910	968921	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374308135
477	NC_016630	TGCATT	2	12	969005	969016	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374308135
478	NC_016630	ATCCTC	2	12	972431	972442	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	374308136
479	NC_016630	TGAAAA	2	12	973144	973155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
480	NC_016630	CTGTTG	2	12	978666	978677	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	374308140
481	NC_016630	TTGTTC	2	12	981837	981848	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_016630	ATAATC	2	12	984810	984821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374308144
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499	NC_016630	CTTTTC	5	30	1019864	1019893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_016630	TTAATT	2	12	1020071	1020082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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