MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 3237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016510	ATGGT	2	10	2047	2056	20 %	40 %	40 %	0 %	386262267
2	NC_016510	TGAAG	2	10	3819	3828	40 %	20 %	40 %	0 %	365959089
3	NC_016510	TTGTT	2	10	5293	5302	0 %	80 %	20 %	0 %	365959090
4	NC_016510	TTTTA	2	10	7056	7065	20 %	80 %	0 %	0 %	365959092
5	NC_016510	TGAGT	2	10	7257	7266	20 %	40 %	40 %	0 %	365959092
6	NC_016510	TTCTT	2	10	7483	7492	0 %	80 %	0 %	20 %	365959092
7	NC_016510	ATTTT	2	10	7511	7520	20 %	80 %	0 %	0 %	365959092
8	NC_016510	TTGTT	2	10	9848	9857	0 %	80 %	20 %	0 %	365959095
9	NC_016510	AAGAA	2	10	10615	10624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016510	AATCA	2	10	12623	12632	60 %	20 %	0 %	20 %	365959098
11	NC_016510	AATCG	2	10	16469	16478	40 %	20 %	20 %	20 %	365959103
12	NC_016510	ATTTA	2	10	16825	16834	40 %	60 %	0 %	0 %	365959103
13	NC_016510	GAAGA	2	10	17077	17086	60 %	0 %	40 %	0 %	365959103
14	NC_016510	TTTAG	2	10	23049	23058	20 %	60 %	20 %	0 %	365959111
15	NC_016510	ATTAA	2	10	23532	23541	60 %	40 %	0 %	0 %	365959111
16	NC_016510	AATGT	2	10	24219	24228	40 %	40 %	20 %	0 %	365959111
17	NC_016510	TAAAT	2	10	24391	24400	60 %	40 %	0 %	0 %	365959111
18	NC_016510	AATCA	2	10	25602	25611	60 %	20 %	0 %	20 %	365959112
19	NC_016510	ATTTA	2	10	26496	26505	40 %	60 %	0 %	0 %	365959114
20	NC_016510	GAGTA	2	10	31902	31911	40 %	20 %	40 %	0 %	365959116
21	NC_016510	GGATT	2	10	34320	34329	20 %	40 %	40 %	0 %	365959119
22	NC_016510	TCTTT	2	10	38016	38025	0 %	80 %	0 %	20 %	365959122
23	NC_016510	AAATG	2	10	39954	39963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016510	TATTT	2	10	40235	40244	20 %	80 %	0 %	0 %	386262270
25	NC_016510	TTTTC	2	10	41367	41376	0 %	80 %	0 %	20 %	365959124
26	NC_016510	ATAGT	2	10	41842	41851	40 %	40 %	20 %	0 %	365959124
27	NC_016510	TCTAT	2	10	42686	42695	20 %	60 %	0 %	20 %	365959124
28	NC_016510	GGGTA	2	10	46526	46535	20 %	20 %	60 %	0 %	365959127
29	NC_016510	CAGTA	2	10	48774	48783	40 %	20 %	20 %	20 %	365959128
30	NC_016510	ATACC	2	10	49185	49194	40 %	20 %	0 %	40 %	365959128
31	NC_016510	AAATA	2	10	49755	49764	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016510	GAAAA	2	10	52284	52293	80 %	0 %	20 %	0 %	365959129
33	NC_016510	TTGGA	2	10	53742	53751	20 %	40 %	40 %	0 %	386262271
34	NC_016510	ACAAT	2	10	54224	54233	60 %	20 %	0 %	20 %	386262271
35	NC_016510	TAAAA	2	10	54536	54545	80 %	20 %	0 %	0 %	386262271
36	NC_016510	CATAG	2	10	55006	55015	40 %	20 %	20 %	20 %	365959131
37	NC_016510	TAAAA	2	10	59222	59231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016510	TAATG	2	10	59555	59564	40 %	40 %	20 %	0 %	365959135
39	NC_016510	GTTGT	2	10	60504	60513	0 %	60 %	40 %	0 %	365959136
40	NC_016510	GTTTT	2	10	61273	61282	0 %	80 %	20 %	0 %	365959137
41	NC_016510	AGAAC	2	10	62289	62298	60 %	0 %	20 %	20 %	365959138
42	NC_016510	AAATT	2	10	62605	62614	60 %	40 %	0 %	0 %	365959138
43	NC_016510	ATCAA	2	10	67821	67830	60 %	20 %	0 %	20 %	365959142
44	NC_016510	TATGG	2	10	68600	68609	20 %	40 %	40 %	0 %	365959142
45	NC_016510	GATTT	2	10	69006	69015	20 %	60 %	20 %	0 %	365959142
46	NC_016510	AAAAG	2	10	69943	69952	80 %	0 %	20 %	0 %	365959142
47	NC_016510	GGAGC	2	10	71968	71977	20 %	0 %	60 %	20 %	365959145
48	NC_016510	GTTTG	2	10	75562	75571	0 %	60 %	40 %	0 %	365959147
49	NC_016510	TTAAT	2	10	77005	77014	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016510	CAATA	2	10	77112	77121	60 %	20 %	0 %	20 %	365959149
51	NC_016510	TTAAT	2	10	77134	77143	40 %	60 %	0 %	0 %	365959149
52	NC_016510	TTGTT	2	10	77506	77515	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016510	AAAAT	2	10	81801	81810	80 %	20 %	0 %	0 %	365959153
54	NC_016510	GTTTG	2	10	82825	82834	0 %	60 %	40 %	0 %	365959154
55	NC_016510	TAGTT	2	10	85302	85311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016510	TTTTA	2	10	85517	85526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016510	TCAAA	2	10	86076	86085	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016510	ACCAT	2	10	87743	87752	40 %	20 %	0 %	40 %	365959158
59	NC_016510	TCAAA	2	10	88776	88785	60 %	20 %	0 %	20 %	365959159
60	NC_016510	AAGTA	2	10	88786	88795	60 %	20 %	20 %	0 %	365959159
61	NC_016510	TATTT	2	10	91314	91323	20 %	80 %	0 %	0 %	365959160
62	NC_016510	TAAAA	2	10	94014	94023	80 %	20 %	0 %	0 %	365959161
63	NC_016510	TAATT	2	10	95472	95481	40 %	60 %	0 %	0 %	365959163
64	NC_016510	TGATC	2	10	95610	95619	20 %	40 %	20 %	20 %	365959163
65	NC_016510	TGCTT	2	10	95751	95760	0 %	60 %	20 %	20 %	365959163
66	NC_016510	ATTTT	2	10	95931	95940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016510	ACCAT	2	10	96283	96292	40 %	20 %	0 %	40 %	365959164
68	NC_016510	TTAAT	2	10	96630	96639	40 %	60 %	0 %	0 %	365959164
69	NC_016510	CTCGT	2	10	99217	99226	0 %	40 %	20 %	40 %	365959167
70	NC_016510	ATTTA	2	10	100762	100771	40 %	60 %	0 %	0 %	365959168
71	NC_016510	TATTT	2	10	102243	102252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016510	TCTTT	2	10	102451	102460	0 %	80 %	0 %	20 %	365959169
73	NC_016510	TGTAA	2	10	104313	104322	40 %	40 %	20 %	0 %	365959171
74	NC_016510	TAAAA	2	10	107083	107092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016510	CAAAT	2	10	107129	107138	60 %	20 %	0 %	20 %	365959173
76	NC_016510	ACAAT	2	10	108390	108399	60 %	20 %	0 %	20 %	365959174
77	NC_016510	AGAAA	2	10	109406	109415	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016510	ATTAA	2	10	110733	110742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016510	ATTTA	2	10	111498	111507	40 %	60 %	0 %	0 %	365959176
80	NC_016510	TAAAA	2	10	111780	111789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016510	ATTAT	2	10	112327	112336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016510	TCAAC	2	10	113101	113110	40 %	20 %	0 %	40 %	365959178
83	NC_016510	CAAAT	2	10	114198	114207	60 %	20 %	0 %	20 %	365959179
84	NC_016510	TTGTT	2	10	118046	118055	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016510	GTTTG	2	10	118121	118130	0 %	60 %	40 %	0 %	365959184
86	NC_016510	AATCA	2	10	119084	119093	60 %	20 %	0 %	20 %	365959185
87	NC_016510	AGGAA	2	10	119912	119921	60 %	0 %	40 %	0 %	365959185
88	NC_016510	TTAAC	2	10	121339	121348	40 %	40 %	0 %	20 %	365959186
89	NC_016510	ATTTG	2	10	122006	122015	20 %	60 %	20 %	0 %	365959186
90	NC_016510	TCTTG	2	10	122055	122064	0 %	60 %	20 %	20 %	365959186
91	NC_016510	CTTGT	2	10	122302	122311	0 %	60 %	20 %	20 %	365959186
92	NC_016510	TAAAA	2	10	122339	122348	80 %	20 %	0 %	0 %	365959186
93	NC_016510	GAAAT	2	10	122868	122877	60 %	20 %	20 %	0 %	365959187
94	NC_016510	AATAA	2	10	126827	126836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016510	CATTT	2	10	126871	126880	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016510	ATAAA	2	10	128166	128175	80 %	20 %	0 %	0 %	365959189
97	NC_016510	AAACA	2	10	128178	128187	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016510	AAATA	2	10	131675	131684	80 %	20 %	0 %	0 %	365959192
99	NC_016510	ATTAT	2	10	131932	131941	40 %	60 %	0 %	0 %	365959192
100	NC_016510	TTTTA	2	10	132332	132341	20 %	80 %	0 %	0 %	365959192
101	NC_016510	CAAAG	2	10	132505	132514	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016510	TTTTG	2	10	132524	132533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016510	TCAAA	2	10	133758	133767	60 %	20 %	0 %	20 %	365959194
104	NC_016510	TAAAT	2	10	133903	133912	60 %	40 %	0 %	0 %	365959194
105	NC_016510	ATTTA	2	10	134116	134125	40 %	60 %	0 %	0 %	365959194
106	NC_016510	AATAA	2	10	135043	135052	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016510	AAAGT	2	10	136089	136098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016510	TTTGT	2	10	136431	136440	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016510	ATTTT	2	10	136550	136559	20 %	80 %	0 %	0 %	365959197
110	NC_016510	TTTTA	2	10	136607	136616	20 %	80 %	0 %	0 %	365959197
111	NC_016510	TGCAT	2	10	138255	138264	20 %	40 %	20 %	20 %	365959199
112	NC_016510	CTGTA	2	10	138827	138836	20 %	40 %	20 %	20 %	365959200
113	NC_016510	GTGTG	2	10	139119	139128	0 %	40 %	60 %	0 %	365959200
114	NC_016510	TGTAA	2	10	139179	139188	40 %	40 %	20 %	0 %	365959200
115	NC_016510	ATAAA	2	10	140970	140979	80 %	20 %	0 %	0 %	365959201
116	NC_016510	CACAA	2	10	141561	141570	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016510	AAAAT	2	10	141966	141975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016510	TTTTA	2	10	142060	142069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016510	ATACC	2	10	143468	143477	40 %	20 %	0 %	40 %	365959203
120	NC_016510	ATTAA	2	10	143877	143886	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016510	AATTA	2	10	146493	146502	60 %	40 %	0 %	0 %	365959205
122	NC_016510	AATTT	2	10	146720	146729	40 %	60 %	0 %	0 %	365959205
123	NC_016510	TAAAA	2	10	147498	147507	80 %	20 %	0 %	0 %	365959206
124	NC_016510	AATTT	2	10	149026	149035	40 %	60 %	0 %	0 %	365959207
125	NC_016510	GCATT	2	10	149638	149647	20 %	40 %	20 %	20 %	365959208
126	NC_016510	AAATA	2	10	149828	149837	80 %	20 %	0 %	0 %	365959208
127	NC_016510	AAAGA	2	10	150193	150202	80 %	0 %	20 %	0 %	365959208
128	NC_016510	ACAAA	2	10	151422	151431	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016510	TTCTT	2	10	153291	153300	0 %	80 %	0 %	20 %	365959210
130	NC_016510	AAAAT	2	10	153887	153896	80 %	20 %	0 %	0 %	365959210
131	NC_016510	TAATT	2	10	154375	154384	40 %	60 %	0 %	0 %	365959210
132	NC_016510	GAAAA	2	10	154482	154491	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016510	ACGTA	2	10	155039	155048	40 %	20 %	20 %	20 %	365959211
134	NC_016510	TTTCT	2	10	155795	155804	0 %	80 %	0 %	20 %	365959212
135	NC_016510	AAGAT	2	10	157274	157283	60 %	20 %	20 %	0 %	365959215
136	NC_016510	TCAAA	2	10	157427	157436	60 %	20 %	0 %	20 %	365959215
137	NC_016510	TCGGG	2	10	159317	159326	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016510	AAAAC	2	10	159427	159436	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016510	AAAAC	2	10	159510	159519	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016510	TGTAG	2	10	160641	160650	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016510	TCGGA	2	10	161256	161265	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016510	CTGAA	2	10	162243	162252	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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147	NC_016510	TCGGA	2	10	166855	166864	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016510	CTGAA	2	10	167842	167851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_016510	AGAAA	2	10	168937	168946	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016510	ATTGA	2	10	169551	169560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_016510	TTGTT	2	10	259573	259582	0 %	80 %	20 %	0 %	365959289
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270	NC_016510	TAAAA	2	10	275425	275434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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