MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella sp. TX077308 chromosome

Total Repeats: 993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015696	CAAGAT	2	12	867	878	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754018
2	NC_015696	TTTGAT	2	12	5119	5130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337754021
3	NC_015696	TATACT	2	12	5766	5777	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	337754022
4	NC_015696	CCACAG	2	12	6233	6244	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	337754023
5	NC_015696	TAAAAG	2	12	11455	11466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015696	AAAACA	2	12	11774	11785	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	337754029
7	NC_015696	GTAAAA	2	12	13398	13409	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337754029
8	NC_015696	TAGAGA	2	12	13743	13754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754030
9	NC_015696	TTTCGG	2	12	18658	18669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337754035
10	NC_015696	TGCATA	2	12	18707	18718	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754035
11	NC_015696	TAAAAA	2	12	20707	20718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015696	AAATGT	2	12	26187	26198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754039
13	NC_015696	TTATTT	2	12	26911	26922	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015696	TATTTA	2	12	28666	28677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754042
15	NC_015696	TTTTAT	2	12	33957	33968	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337754047
16	NC_015696	CTTAAT	2	12	43447	43458	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_015696	TATGGT	2	12	45466	45477	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	337754059
18	NC_015696	ACATTT	2	12	51219	51230	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	337754064
19	NC_015696	TCTTTC	2	12	52300	52311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337754065
20	NC_015696	CTTGAG	2	12	53611	53622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337754066
21	NC_015696	AGTGAA	2	12	61616	61627	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754073
22	NC_015696	TTTCAG	2	12	62768	62779	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337754074
23	NC_015696	TTTTTA	2	12	64651	64662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337754076
24	NC_015696	TTCTTT	2	12	65303	65314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	337754078
25	NC_015696	TTGATC	2	12	67394	67405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337754081
26	NC_015696	TGATGT	2	12	68302	68313	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	337754082
27	NC_015696	AAAATA	2	12	70726	70737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337754085
28	NC_015696	TGGTAA	2	12	71148	71159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754085
29	NC_015696	AAAGCT	2	12	72649	72660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754086
30	NC_015696	ATTTTA	2	12	73318	73329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754086
31	NC_015696	ATTAGA	2	12	78097	78108	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754091
32	NC_015696	TAAAGT	2	12	81568	81579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754095
33	NC_015696	AACTGG	2	12	87513	87524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337754100
34	NC_015696	AATATG	2	12	88282	88293	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754101
35	NC_015696	ATCATA	2	12	88443	88454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337754101
36	NC_015696	TACCAA	2	12	90707	90718	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	337754104
37	NC_015696	GCTTGG	2	12	91392	91403	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	337754105
38	NC_015696	TAAATA	2	12	93497	93508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754108
39	NC_015696	GCAGTT	2	12	95457	95468	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337754109
40	NC_015696	ACTGAT	2	12	96521	96532	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754111
41	NC_015696	TCAATC	2	12	102607	102618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754116
42	NC_015696	TTTCAA	2	12	103120	103131	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	337754117
43	NC_015696	TATAGT	2	12	104876	104887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754119
44	NC_015696	TATCAT	2	12	107401	107412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	337754122
45	NC_015696	TAGCTT	2	12	108394	108405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337754122
46	NC_015696	AGGTAA	2	12	109010	109021	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754123
47	NC_015696	TGCAAA	2	12	110102	110113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754123
48	NC_015696	AAAATA	2	12	112966	112977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337754127
49	NC_015696	TTCAAA	2	12	113017	113028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337754128
50	NC_015696	TTTGAT	2	12	114939	114950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337754130
51	NC_015696	TGGTTG	2	12	121378	121389	0 %	50 %	50 %	0 %	337754135
52	NC_015696	ATTTTT	2	12	125507	125518	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015696	CAAATT	2	12	126546	126557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337754140
54	NC_015696	AGCTAA	2	12	128692	128703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754141
55	NC_015696	TAGAAA	2	12	130294	130305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337754143
56	NC_015696	GAGTTA	2	12	130410	130421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754143
57	NC_015696	ATCTGG	2	12	138096	138107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337754152
58	NC_015696	AATATT	2	12	139324	139335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015696	TTTGAT	2	12	140071	140082	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337754153
60	NC_015696	TGCTGG	2	12	140418	140429	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	337754153
61	NC_015696	ATATTG	2	12	141102	141113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754154
62	NC_015696	GATAAA	2	12	145210	145221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337754157
63	NC_015696	AGCTAT	2	12	146226	146237	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754159
64	NC_015696	TTGATA	2	12	146677	146688	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754160
65	NC_015696	AGTTAG	2	12	152481	152492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754165
66	NC_015696	AACTTC	2	12	157418	157429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754169
67	NC_015696	ATTTCC	2	12	158414	158425	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015696	CTATGA	2	12	159624	159635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754171
69	NC_015696	TGGCTA	2	12	161016	161027	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337754173
70	NC_015696	ACCATC	2	12	163017	163028	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	337754174
71	NC_015696	ATTCTG	2	12	164819	164830	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337754176
72	NC_015696	TGTGGC	24	144	165584	165727	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	337754177
73	NC_015696	TCAATC	2	12	166619	166630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337754177
74	NC_015696	TCAGGT	2	12	167449	167460	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	337754178
75	NC_015696	GATATT	2	12	167734	167745	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754178
76	NC_015696	CAGGAG	2	12	167789	167800	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	337754178
77	NC_015696	CAAAGT	2	12	167866	167877	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754178
78	NC_015696	AATACA	2	12	168073	168084	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	337754178
79	NC_015696	AGGTAT	2	12	169849	169860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754179
80	NC_015696	TGAAGA	2	12	170305	170316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754180
81	NC_015696	AGATGA	2	12	175162	175173	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754185
82	NC_015696	ATCAGT	2	12	177674	177685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754187
83	NC_015696	CAGATA	2	12	178333	178344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754187
84	NC_015696	TTAAAA	2	12	178400	178411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015696	AATTAA	2	12	180574	180585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015696	CATTAG	2	12	180801	180812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754190
87	NC_015696	AGGCTA	2	12	185049	185060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337754194
88	NC_015696	TCCTGC	2	12	185557	185568	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	337754195
89	NC_015696	TAGTAT	2	12	186369	186380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754196
90	NC_015696	TAAAAA	2	12	189018	189029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	337754199
91	NC_015696	ATCTTT	2	12	191577	191588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337754201
92	NC_015696	CACCAA	2	12	195761	195772	50 %	0 %	0 %	50 %	337754204
93	NC_015696	TTTTAT	2	12	196699	196710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	337754205
94	NC_015696	ATTTTC	2	12	201233	201244	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337754212
95	NC_015696	TGTTTT	2	12	202260	202271	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	337754213
96	NC_015696	CTAAAT	2	12	204662	204673	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	337754214
97	NC_015696	TATATT	2	12	204735	204746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754215
98	NC_015696	ACTGCT	2	12	208960	208971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	337754219
99	NC_015696	TTGCAT	2	12	212216	212227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337754220
100	NC_015696	ACTAGA	2	12	213654	213665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754223
101	NC_015696	AGCATT	2	12	215640	215651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337754225
102	NC_015696	ATTTAG	2	12	216176	216187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754225
103	NC_015696	TTTTGA	2	12	221685	221696	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	337754230
104	NC_015696	TTAGCT	2	12	225556	225567	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	337754233
105	NC_015696	GAGAAT	2	12	227409	227420	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754235
106	NC_015696	AGAAGC	2	12	228455	228466	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	337754237
107	NC_015696	AAAGAA	2	12	231040	231051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337754240
108	NC_015696	TTTTTG	2	12	232025	232036	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	337754242
109	NC_015696	TGGTGT	2	12	232068	232079	0 %	50 %	50 %	0 %	337754242
110	NC_015696	GAGCAA	2	12	235033	235044	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	337754247
111	NC_015696	ATGAAG	2	12	235429	235440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754247
112	NC_015696	CTGTTG	2	12	236117	236128	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337754247
113	NC_015696	AGGTTG	2	12	236729	236740	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	337754247
114	NC_015696	ATTAGA	2	12	237031	237042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754248
115	NC_015696	AGAGCG	2	12	238306	238317	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	337754250
116	NC_015696	GTAAAG	2	12	241436	241447	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754256
117	NC_015696	AATTGA	2	12	243933	243944	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754263
118	NC_015696	TTGGTG	2	12	244115	244126	0 %	50 %	50 %	0 %	337754263
119	NC_015696	GAATGA	2	12	251853	251864	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	337754277
120	NC_015696	TGGTAT	2	12	251928	251939	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	337754277
121	NC_015696	GGTATG	2	12	253384	253395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	337754277
122	NC_015696	TTTATC	2	12	254980	254991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337754279
123	NC_015696	TCTGTT	2	12	260627	260638	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	337754284
124	NC_015696	TAGATA	2	12	262083	262094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	337754286
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126	NC_015696	GATTTA	2	12	265208	265219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337754287
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128	NC_015696	AAAGTA	2	12	265914	265925	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_015696	AAATAT	2	12	267124	267135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015696	GGAATT	2	12	268090	268101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754290
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190	NC_015696	AATGGC	2	12	389614	389625	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337754426
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218	NC_015696	AAATTA	2	12	434365	434376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
219	NC_015696	TAATGG	2	12	437821	437832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754476
220	NC_015696	TGGTAA	2	12	438811	438822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337754476
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230	NC_015696	TTGCTG	2	12	450599	450610	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	337754489
231	NC_015696	GATGGT	2	12	452417	452428	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	337754492
232	NC_015696	CTTTTA	2	12	452631	452642	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337754492
233	NC_015696	TGGTTG	2	12	453283	453294	0 %	50 %	50 %	0 %	337754493
234	NC_015696	TTGGTG	2	12	453319	453330	0 %	50 %	50 %	0 %	337754493
235	NC_015696	TAAATA	2	12	453679	453690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337754494
236	NC_015696	ATTCTT	2	12	454190	454201	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	337754494
237	NC_015696	CTTTTT	2	12	455260	455271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	337754495
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239	NC_015696	CAATAA	2	12	465619	465630	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	337754498
240	NC_015696	TAAATT	2	12	468265	468276	50 %	50 %	0 %	0 %	337754500
241	NC_015696	ATGGTT	2	12	468500	468511	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	337754501
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350	NC_015696	ATATTT	2	12	708817	708828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754720
351	NC_015696	TTAATT	2	12	713211	713222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337754723
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353	NC_015696	ATTATA	2	12	716786	716797	50 %	50 %	0 %	0 %	337754726
354	NC_015696	AGCAAT	2	12	717320	717331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	337754727
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455	NC_015696	GTATTG	2	12	920395	920406	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	337754903
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457	NC_015696	AAAAGC	2	12	922867	922878	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	337754906
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462	NC_015696	AAAATT	2	12	931859	931870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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