MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Francisella sp. TX077308 chromosome

Total Repeats: 1516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015696	AAGAA	2	10	1327	1336	80 %	0 %	20 %	0 %	337754018
2	NC_015696	AAAAT	2	10	3837	3846	80 %	20 %	0 %	0 %	337754020
3	NC_015696	AAATG	2	10	5017	5026	60 %	20 %	20 %	0 %	337754021
4	NC_015696	AAATA	2	10	5917	5926	80 %	20 %	0 %	0 %	337754022
5	NC_015696	CATTT	2	10	6452	6461	20 %	60 %	0 %	20 %	337754023
6	NC_015696	ATTGT	2	10	7597	7606	20 %	60 %	20 %	0 %	337754025
7	NC_015696	ATATT	2	10	7762	7771	40 %	60 %	0 %	0 %	337754026
8	NC_015696	TAGCT	2	10	8098	8107	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_015696	TAATT	2	10	12446	12455	40 %	60 %	0 %	0 %	337754029
10	NC_015696	ATATC	2	10	19627	19636	40 %	40 %	0 %	20 %	337754036
11	NC_015696	AGATA	2	10	19866	19875	60 %	20 %	20 %	0 %	337754036
12	NC_015696	ATTTG	2	10	20892	20901	20 %	60 %	20 %	0 %	337754037
13	NC_015696	AAAGA	2	10	21610	21619	80 %	0 %	20 %	0 %	337754037
14	NC_015696	TACTC	2	10	22031	22040	20 %	40 %	0 %	40 %	337754038
15	NC_015696	CCACA	2	10	26018	26027	40 %	0 %	0 %	60 %	337754039
16	NC_015696	GTATG	2	10	26698	26707	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015696	TCAGC	2	10	28246	28255	20 %	20 %	20 %	40 %	337754042
18	NC_015696	ATATA	2	10	30777	30786	60 %	40 %	0 %	0 %	337754044
19	NC_015696	TTGAT	2	10	32148	32157	20 %	60 %	20 %	0 %	337754045
20	NC_015696	TTTCT	2	10	33901	33910	0 %	80 %	0 %	20 %	337754047
21	NC_015696	TTTTC	2	10	33995	34004	0 %	80 %	0 %	20 %	337754047
22	NC_015696	AAAAG	2	10	37067	37076	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015696	CTTTT	2	10	42607	42616	0 %	80 %	0 %	20 %	337754057
24	NC_015696	AATTT	2	10	43590	43599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015696	ATGGG	2	10	44266	44275	20 %	20 %	60 %	0 %	337754059
26	NC_015696	AATTT	2	10	45233	45242	40 %	60 %	0 %	0 %	337754059
27	NC_015696	TAATT	2	10	45328	45337	40 %	60 %	0 %	0 %	337754059
28	NC_015696	ATAAA	2	10	45579	45588	80 %	20 %	0 %	0 %	337754059
29	NC_015696	CACTA	2	10	46161	46170	40 %	20 %	0 %	40 %	337754060
30	NC_015696	CTAAA	2	10	47016	47025	60 %	20 %	0 %	20 %	337754061
31	NC_015696	GATAA	2	10	47918	47927	60 %	20 %	20 %	0 %	337754062
32	NC_015696	AGTGA	2	10	48813	48822	40 %	20 %	40 %	0 %	337754062
33	NC_015696	ATGAC	2	10	48867	48876	40 %	20 %	20 %	20 %	337754062
34	NC_015696	TGGAT	2	10	49057	49066	20 %	40 %	40 %	0 %	337754062
35	NC_015696	TAGTT	2	10	50843	50852	20 %	60 %	20 %	0 %	337754064
36	NC_015696	TTTGC	2	10	50991	51000	0 %	60 %	20 %	20 %	337754064
37	NC_015696	TTGCA	2	10	51185	51194	20 %	40 %	20 %	20 %	337754064
38	NC_015696	ATAAG	2	10	51928	51937	60 %	20 %	20 %	0 %	337754065
39	NC_015696	AAACC	2	10	53158	53167	60 %	0 %	0 %	40 %	337754066
40	NC_015696	GATTT	2	10	56459	56468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015696	TCTAG	2	10	56955	56964	20 %	40 %	20 %	20 %	337754069
42	NC_015696	TTCAT	2	10	57390	57399	20 %	60 %	0 %	20 %	337754069
43	NC_015696	TCTTT	2	10	58882	58891	0 %	80 %	0 %	20 %	337754069
44	NC_015696	TTTAG	2	10	60643	60652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015696	TCAAC	2	10	61031	61040	40 %	20 %	0 %	40 %	337754072
46	NC_015696	TTAAA	2	10	62021	62030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015696	TGAAA	2	10	63295	63304	60 %	20 %	20 %	0 %	337754075
48	NC_015696	CTTCT	2	10	63352	63361	0 %	60 %	0 %	40 %	337754075
49	NC_015696	CAACC	2	10	63834	63843	40 %	0 %	0 %	60 %	337754075
50	NC_015696	AGCTA	2	10	65803	65812	40 %	20 %	20 %	20 %	337754079
51	NC_015696	TCAGA	2	10	66509	66518	40 %	20 %	20 %	20 %	337754080
52	NC_015696	TTGTT	2	10	69894	69903	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015696	CTATA	2	10	69905	69914	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015696	AAAAT	2	10	69929	69938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015696	ATATT	2	10	70541	70550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015696	TTAAA	2	10	70558	70567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015696	TCAAG	2	10	72664	72673	40 %	20 %	20 %	20 %	337754086
58	NC_015696	ACAAT	2	10	73257	73266	60 %	20 %	0 %	20 %	337754086
59	NC_015696	ATGTG	2	10	74540	74549	20 %	40 %	40 %	0 %	337754087
60	NC_015696	TAAAA	2	10	75960	75969	80 %	20 %	0 %	0 %	337754088
61	NC_015696	GATAA	2	10	76970	76979	60 %	20 %	20 %	0 %	337754089
62	NC_015696	TAATG	2	10	77535	77544	40 %	40 %	20 %	0 %	337754090
63	NC_015696	ATTGG	2	10	78071	78080	20 %	40 %	40 %	0 %	337754091
64	NC_015696	TAAGG	2	10	78436	78445	40 %	20 %	40 %	0 %	337754091
65	NC_015696	GCAAG	2	10	79480	79489	40 %	0 %	40 %	20 %	337754092
66	NC_015696	TAGAT	2	10	80254	80263	40 %	40 %	20 %	0 %	337754092
67	NC_015696	TGTTT	2	10	80723	80732	0 %	80 %	20 %	0 %	337754094
68	NC_015696	CATTG	2	10	80741	80750	20 %	40 %	20 %	20 %	337754094
69	NC_015696	TTGTG	2	10	82442	82451	0 %	60 %	40 %	0 %	337754095
70	NC_015696	AATTT	2	10	87249	87258	40 %	60 %	0 %	0 %	337754100
71	NC_015696	TTATT	2	10	89085	89094	20 %	80 %	0 %	0 %	337754103
72	NC_015696	ATAGT	2	10	89129	89138	40 %	40 %	20 %	0 %	337754103
73	NC_015696	TTGAT	2	10	90421	90430	20 %	60 %	20 %	0 %	337754104
74	NC_015696	AGAGT	2	10	90672	90681	40 %	20 %	40 %	0 %	337754104
75	NC_015696	AGCAT	2	10	91602	91611	40 %	20 %	20 %	20 %	337754105
76	NC_015696	AGGCT	2	10	91727	91736	20 %	20 %	40 %	20 %	337754106
77	NC_015696	ATTCA	2	10	91922	91931	40 %	40 %	0 %	20 %	337754106
78	NC_015696	TAGGA	2	10	92295	92304	40 %	20 %	40 %	0 %	337754106
79	NC_015696	AGTAT	2	10	96785	96794	40 %	40 %	20 %	0 %	337754112
80	NC_015696	ATTGT	2	10	97082	97091	20 %	60 %	20 %	0 %	337754112
81	NC_015696	TGAAA	2	10	99044	99053	60 %	20 %	20 %	0 %	337754114
82	NC_015696	TGCTT	2	10	104949	104958	0 %	60 %	20 %	20 %	337754119
83	NC_015696	ATTTT	2	10	106403	106412	20 %	80 %	0 %	0 %	337754121
84	NC_015696	GCCCT	2	10	107056	107065	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_015696	TAGAA	2	10	108041	108050	60 %	20 %	20 %	0 %	337754122
86	NC_015696	TTTAT	2	10	108837	108846	20 %	80 %	0 %	0 %	337754123
87	NC_015696	ATATT	2	10	111812	111821	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015696	CTAAA	2	10	111829	111838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015696	ACATC	2	10	112044	112053	40 %	20 %	0 %	40 %	337754126
90	NC_015696	TGTAA	2	10	112409	112418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015696	CTTAG	2	10	112502	112511	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_015696	TTGTT	2	10	112586	112595	0 %	80 %	20 %	0 %	337754127
93	NC_015696	TGAAG	2	10	113174	113183	40 %	20 %	40 %	0 %	337754128
94	NC_015696	GTTAG	2	10	114122	114131	20 %	40 %	40 %	0 %	337754129
95	NC_015696	AGCTA	2	10	116512	116521	40 %	20 %	20 %	20 %	337754132
96	NC_015696	TGGTT	2	10	116593	116602	0 %	60 %	40 %	0 %	337754132
97	NC_015696	TTATG	2	10	117220	117229	20 %	60 %	20 %	0 %	337754133
98	NC_015696	TTTGA	2	10	119141	119150	20 %	60 %	20 %	0 %	337754134
99	NC_015696	TTGTA	2	10	121433	121442	20 %	60 %	20 %	0 %	337754135
100	NC_015696	TTTGA	2	10	121956	121965	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015696	ATTAA	2	10	122086	122095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015696	TTAAT	2	10	123792	123801	40 %	60 %	0 %	0 %	337754138
103	NC_015696	AGATA	2	10	126217	126226	60 %	20 %	20 %	0 %	337754140
104	NC_015696	AGAGA	2	10	127154	127163	60 %	0 %	40 %	0 %	337754140
105	NC_015696	ATTCC	2	10	127814	127823	20 %	40 %	0 %	40 %	337754141
106	NC_015696	TATGC	2	10	128831	128840	20 %	40 %	20 %	20 %	337754141
107	NC_015696	ATATG	2	10	128920	128929	40 %	40 %	20 %	0 %	337754141
108	NC_015696	ATTTT	2	10	129280	129289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015696	TTTCT	2	10	129656	129665	0 %	80 %	0 %	20 %	337754142
110	NC_015696	AAATT	2	10	132536	132545	60 %	40 %	0 %	0 %	337754144
111	NC_015696	AAGAT	2	10	132860	132869	60 %	20 %	20 %	0 %	337754144
112	NC_015696	TTTAG	2	10	134241	134250	20 %	60 %	20 %	0 %	337754146
113	NC_015696	TTTTA	2	10	134346	134355	20 %	80 %	0 %	0 %	337754146
114	NC_015696	ATAAA	2	10	135637	135646	80 %	20 %	0 %	0 %	337754149
115	NC_015696	TTTAC	2	10	138055	138064	20 %	60 %	0 %	20 %	337754152
116	NC_015696	AGATG	2	10	138822	138831	40 %	20 %	40 %	0 %	337754152
117	NC_015696	GTTTT	2	10	144077	144086	0 %	80 %	20 %	0 %	337754157
118	NC_015696	AGCAA	2	10	147556	147565	60 %	0 %	20 %	20 %	337754161
119	NC_015696	GATTT	2	10	148889	148898	20 %	60 %	20 %	0 %	337754162
120	NC_015696	ACATC	2	10	152780	152789	40 %	20 %	0 %	40 %	337754165
121	NC_015696	TAACT	2	10	153892	153901	40 %	40 %	0 %	20 %	337754165
122	NC_015696	TGCTG	2	10	156386	156395	0 %	40 %	40 %	20 %	337754168
123	NC_015696	TTAAC	2	10	157519	157528	40 %	40 %	0 %	20 %	337754169
124	NC_015696	ATGTA	2	10	158496	158505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015696	TTATC	2	10	158506	158515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_015696	ATTGC	2	10	159208	159217	20 %	40 %	20 %	20 %	337754171
127	NC_015696	GGTAG	2	10	159238	159247	20 %	20 %	60 %	0 %	337754171
128	NC_015696	TATGA	2	10	160140	160149	40 %	40 %	20 %	0 %	337754172
129	NC_015696	TAATG	2	10	160637	160646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015696	GCTAA	2	10	161687	161696	40 %	20 %	20 %	20 %	337754173
131	NC_015696	AATTT	2	10	163224	163233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015696	ATCAA	2	10	164514	164523	60 %	20 %	0 %	20 %	337754176
133	NC_015696	ATCTA	2	10	165289	165298	40 %	40 %	0 %	20 %	337754177
134	NC_015696	TATGC	2	10	165568	165577	20 %	40 %	20 %	20 %	337754177
135	NC_015696	AAATA	2	10	170330	170339	80 %	20 %	0 %	0 %	337754180
136	NC_015696	TTTAA	2	10	170555	170564	40 %	60 %	0 %	0 %	337754181
137	NC_015696	TACTC	2	10	171339	171348	20 %	40 %	0 %	40 %	337754182
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