MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata plasmid pFSYMDG01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015664	CGGC	2	8	60	67	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015664	GCGG	2	8	163	170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_015664	CGGA	2	8	304	311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015664	ACCC	2	8	334	341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_015664	CACG	2	8	472	479	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
6	NC_015664	ACCG	2	8	810	817	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
7	NC_015664	CGCA	2	8	847	854	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
8	NC_015664	GGGT	2	8	1200	1207	0 %	25 %	75 %	0 %	336176125
9	NC_015664	TGGA	2	8	1689	1696	25 %	25 %	50 %	0 %	336176125
10	NC_015664	CGAC	2	8	2386	2393	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
11	NC_015664	GCCG	2	8	2960	2967	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
12	NC_015664	CCGA	2	8	3015	3022	25 %	0 %	25 %	50 %	336176125
13	NC_015664	GGAC	2	8	3538	3545	25 %	0 %	50 %	25 %	336176125
14	NC_015664	CCGG	2	8	3716	3723	0 %	0 %	50 %	50 %	336176125
15	NC_015664	CGCT	2	8	3768	3775	0 %	25 %	25 %	50 %	336176125
16	NC_015664	GCCG	2	8	4926	4933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015664	GCCG	2	8	4944	4951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015664	GCCG	2	8	4962	4969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015664	AGGC	2	8	6076	6083	25 %	0 %	50 %	25 %	336176128
20	NC_015664	TCCG	2	8	6393	6400	0 %	25 %	25 %	50 %	336176128
21	NC_015664	GGTT	2	8	6501	6508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015664	CGTG	2	8	6978	6985	0 %	25 %	50 %	25 %	336176129
23	NC_015664	CCAC	2	8	7019	7026	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
24	NC_015664	CACC	2	8	7039	7046	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
25	NC_015664	CGGC	2	8	7074	7081	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
26	NC_015664	CCGG	2	8	7147	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
27	NC_015664	CCGG	2	8	7423	7430	0 %	0 %	50 %	50 %	336176129
28	NC_015664	GACG	2	8	7781	7788	25 %	0 %	50 %	25 %	336176129
29	NC_015664	CGTC	2	8	7962	7969	0 %	25 %	25 %	50 %	336176129
30	NC_015664	CCCA	2	8	8189	8196	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
31	NC_015664	CACC	2	8	8353	8360	25 %	0 %	0 %	75 %	336176129
32	NC_015664	CGGG	2	8	8642	8649	0 %	0 %	75 %	25 %	336176129
33	NC_015664	GTGG	2	8	9265	9272	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015664	CCGG	2	8	9392	9399	0 %	0 %	50 %	50 %	336176131
35	NC_015664	GGTC	2	8	9599	9606	0 %	25 %	50 %	25 %	336176131
36	NC_015664	CGTC	2	8	9973	9980	0 %	25 %	25 %	50 %	336176132
37	NC_015664	CCTG	2	8	10051	10058	0 %	25 %	25 %	50 %	336176132
38	NC_015664	CCAC	2	8	10108	10115	25 %	0 %	0 %	75 %	336176132
39	NC_015664	GACG	2	8	10190	10197	25 %	0 %	50 %	25 %	336176132
40	NC_015664	GGTC	2	8	10891	10898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_015664	GCGA	2	8	11271	11278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015664	GCCG	2	8	11306	11313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015664	GCCG	2	8	11946	11953	0 %	0 %	50 %	50 %	336176135
44	NC_015664	GCAA	2	8	12034	12041	50 %	0 %	25 %	25 %	336176135

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.