MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Frankia symbiont of Datisca glomerata chromosome

Total Repeats: 5484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015656	CGCGC	2	10	73	82	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_015656	GCGGG	2	10	720	729	0 %	0 %	80 %	20 %	336176140
3	NC_015656	GGCCT	2	10	1294	1303	0 %	20 %	40 %	40 %	336176141
4	NC_015656	GCAGC	2	10	2524	2533	20 %	0 %	40 %	40 %	336176142
5	NC_015656	GCACG	2	10	3363	3372	20 %	0 %	40 %	40 %	336176144
6	NC_015656	CGGTG	2	10	3661	3670	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015656	ACCAC	2	10	5168	5177	40 %	0 %	0 %	60 %	336176145
8	NC_015656	CTCGG	2	10	6736	6745	0 %	20 %	40 %	40 %	336176146
9	NC_015656	GGGCA	2	10	7337	7346	20 %	0 %	60 %	20 %	336176147
10	NC_015656	CCGCG	2	10	7474	7483	0 %	0 %	40 %	60 %	336176147
11	NC_015656	CGGGC	2	10	7506	7515	0 %	0 %	60 %	40 %	336176147
12	NC_015656	GCCGC	2	10	10459	10468	0 %	0 %	40 %	60 %	336176149
13	NC_015656	GATCC	2	10	10711	10720	20 %	20 %	20 %	40 %	336176149
14	NC_015656	GCCGC	2	10	15348	15357	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_015656	GGAGC	2	10	17125	17134	20 %	0 %	60 %	20 %	336176152
16	NC_015656	CGACC	2	10	17253	17262	20 %	0 %	20 %	60 %	336176152
17	NC_015656	TCGGC	2	10	17310	17319	0 %	20 %	40 %	40 %	336176153
18	NC_015656	CGGCC	2	10	18296	18305	0 %	0 %	40 %	60 %	336176153
19	NC_015656	CCCGG	2	10	18541	18550	0 %	0 %	40 %	60 %	336176153
20	NC_015656	GCCGC	2	10	18776	18785	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_015656	GCCCG	2	10	18804	18813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015656	GACCA	2	10	19023	19032	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_015656	GCCGC	2	10	19287	19296	0 %	0 %	40 %	60 %	336176154
24	NC_015656	GCGGA	2	10	19931	19940	20 %	0 %	60 %	20 %	336176154
25	NC_015656	GGCAG	2	10	20277	20286	20 %	0 %	60 %	20 %	336176154
26	NC_015656	CGACC	2	10	20425	20434	20 %	0 %	20 %	60 %	336176154
27	NC_015656	TCCTC	2	10	20505	20514	0 %	40 %	0 %	60 %	336176154
28	NC_015656	GCCCC	2	10	20862	20871	0 %	0 %	20 %	80 %	336176155
29	NC_015656	GGCCG	2	10	22551	22560	0 %	0 %	60 %	40 %	336176156
30	NC_015656	GCGGT	2	10	22670	22679	0 %	20 %	60 %	20 %	336176157
31	NC_015656	CGCGC	2	10	23762	23771	0 %	0 %	40 %	60 %	336176158
32	NC_015656	GACGC	2	10	24829	24838	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_015656	CCGGT	2	10	26806	26815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_015656	TCGAG	2	10	29714	29723	20 %	20 %	40 %	20 %	336176163
35	NC_015656	AGAGA	2	10	30046	30055	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015656	CCCGC	2	10	31533	31542	0 %	0 %	20 %	80 %	336176164
37	NC_015656	CCGTA	2	10	33450	33459	20 %	20 %	20 %	40 %	336176166
38	NC_015656	CGCGG	2	10	35372	35381	0 %	0 %	60 %	40 %	336176167
39	NC_015656	GGGCC	2	10	37330	37339	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_015656	CCACC	2	10	37411	37420	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_015656	TTTTC	2	10	37598	37607	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_015656	GGCTG	2	10	38400	38409	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015656	GTGCC	2	10	39411	39420	0 %	20 %	40 %	40 %	336176172
44	NC_015656	CGGCC	2	10	41106	41115	0 %	0 %	40 %	60 %	336176174
45	NC_015656	CGAGC	2	10	42564	42573	20 %	0 %	40 %	40 %	336176175
46	NC_015656	GCCCA	2	10	43565	43574	20 %	0 %	20 %	60 %	336176176
47	NC_015656	GCCGG	2	10	44132	44141	0 %	0 %	60 %	40 %	336176176
48	NC_015656	CGGCT	2	10	44428	44437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015656	TCGCC	2	10	45808	45817	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_015656	CGGGC	2	10	47328	47337	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_015656	GCTGG	2	10	48062	48071	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015656	GACCG	2	10	48897	48906	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_015656	CCGAC	2	10	49491	49500	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_015656	CCGAC	2	10	49948	49957	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_015656	GGGCC	2	10	50156	50165	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
56	NC_015656	CCGGC	2	10	51010	51019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_015656	GCCGA	2	10	54942	54951	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_015656	CGGCC	2	10	54959	54968	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_015656	CGGGG	2	10	56761	56770	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015656	TGGTC	2	10	56833	56842	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015656	CCCTG	2	10	58183	58192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_015656	CGGCG	2	10	58625	58634	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_015656	CGACC	2	10	58946	58955	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_015656	TCTGC	2	10	62441	62450	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_015656	GGCCG	2	10	62648	62657	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_015656	GCCGA	2	10	63339	63348	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015656	CCCGG	2	10	63701	63710	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
68	NC_015656	GCCGG	2	10	64383	64392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015656	TCCGC	2	10	64564	64573	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_015656	GCGTC	2	10	65285	65294	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_015656	ACGTC	2	10	65344	65353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015656	CCTCG	2	10	66695	66704	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015656	GCCGA	2	10	67098	67107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_015656	ACCGG	2	10	69019	69028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_015656	CTGGG	2	10	69343	69352	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015656	CTGGG	2	10	69358	69367	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015656	CGGGA	2	10	69845	69854	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_015656	ACTGG	2	10	69950	69959	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015656	GCCGG	2	10	70262	70271	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_015656	CCCGG	2	10	70523	70532	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_015656	CCCGG	2	10	70787	70796	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015656	CGGGC	2	10	71663	71672	0 %	0 %	60 %	40 %	336176177
83	NC_015656	TCTTT	2	10	71922	71931	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_015656	GGCCG	2	10	72479	72488	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015656	CGGCG	2	10	72704	72713	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015656	AGGTC	2	10	73488	73497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_015656	GGCCG	2	10	74882	74891	0 %	0 %	60 %	40 %	336176179
88	NC_015656	CGCGG	2	10	75047	75056	0 %	0 %	60 %	40 %	336176179
89	NC_015656	GATCA	2	10	75428	75437	40 %	20 %	20 %	20 %	336176179
90	NC_015656	GCGCG	2	10	75679	75688	0 %	0 %	60 %	40 %	336176179
91	NC_015656	CGTCC	2	10	76237	76246	0 %	20 %	20 %	60 %	336176179
92	NC_015656	GGTCG	2	10	77018	77027	0 %	20 %	60 %	20 %	336176180
93	NC_015656	TGGAG	2	10	77113	77122	20 %	20 %	60 %	0 %	336176180
94	NC_015656	AGTTA	2	10	77909	77918	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015656	CCTAA	2	10	78042	78051	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_015656	CGTCC	2	10	80461	80470	0 %	20 %	20 %	60 %	336176183
97	NC_015656	CCGCG	2	10	80514	80523	0 %	0 %	40 %	60 %	336176183
98	NC_015656	CGACG	2	10	82250	82259	20 %	0 %	40 %	40 %	336176184
99	NC_015656	GCAGG	2	10	83803	83812	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015656	GCGGG	2	10	84339	84348	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015656	CCGGC	2	10	86078	86087	0 %	0 %	40 %	60 %	336176187
102	NC_015656	GACCC	2	10	86141	86150	20 %	0 %	20 %	60 %	336176187
103	NC_015656	TCCAC	2	10	88310	88319	20 %	20 %	0 %	60 %	336176188
104	NC_015656	GCCCG	2	10	88906	88915	0 %	0 %	40 %	60 %	336176189
105	NC_015656	GCCGC	2	10	89089	89098	0 %	0 %	40 %	60 %	336176189
106	NC_015656	TACGG	2	10	90258	90267	20 %	20 %	40 %	20 %	336176190
107	NC_015656	GCCGC	2	10	91319	91328	0 %	0 %	40 %	60 %	336176191
108	NC_015656	TGGCG	2	10	95369	95378	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_015656	GGGCC	2	10	96425	96434	0 %	0 %	60 %	40 %	336176196
110	NC_015656	ACATA	2	10	99004	99013	60 %	20 %	0 %	20 %	336176197
111	NC_015656	AGGCG	2	10	99517	99526	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_015656	GGCCG	2	10	100699	100708	0 %	0 %	60 %	40 %	336176198
113	NC_015656	CCTCG	2	10	101829	101838	0 %	20 %	20 %	60 %	336176199
114	NC_015656	GGCCG	2	10	102031	102040	0 %	0 %	60 %	40 %	336176199
115	NC_015656	GGCGC	2	10	102276	102285	0 %	0 %	60 %	40 %	336176199
116	NC_015656	GCGGG	2	10	103725	103734	0 %	0 %	80 %	20 %	336176200
117	NC_015656	TGCCA	2	10	104183	104192	20 %	20 %	20 %	40 %	336176200
118	NC_015656	GGTGG	2	10	104240	104249	0 %	20 %	80 %	0 %	336176200
119	NC_015656	AAAAC	2	10	105467	105476	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015656	GCGCG	2	10	105809	105818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015656	GGTTG	2	10	107102	107111	0 %	40 %	60 %	0 %	336176202
122	NC_015656	CGTCG	2	10	107954	107963	0 %	20 %	40 %	40 %	336176202
123	NC_015656	GGAGA	2	10	108243	108252	40 %	0 %	60 %	0 %	336176202
124	NC_015656	CGACC	2	10	108371	108380	20 %	0 %	20 %	60 %	336176202
125	NC_015656	TGCGC	2	10	109170	109179	0 %	20 %	40 %	40 %	336176203
126	NC_015656	GCTGA	2	10	109221	109230	20 %	20 %	40 %	20 %	336176203
127	NC_015656	ACGAG	2	10	111056	111065	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015656	CGGCG	2	10	111455	111464	0 %	0 %	60 %	40 %	336176206
129	NC_015656	CCCGG	2	10	111466	111475	0 %	0 %	40 %	60 %	336176206
130	NC_015656	CCGGC	2	10	112359	112368	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_015656	CGCTG	2	10	112697	112706	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_015656	GTGTG	2	10	113546	113555	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015656	TGGTG	2	10	116347	116356	0 %	40 %	60 %	0 %	336176209
134	NC_015656	CGGGC	2	10	116516	116525	0 %	0 %	60 %	40 %	336176209
135	NC_015656	TTCGG	2	10	118141	118150	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015656	CTGTG	2	10	119977	119986	0 %	40 %	40 %	20 %	336176210
137	NC_015656	CGGCG	2	10	120011	120020	0 %	0 %	60 %	40 %	336176210
138	NC_015656	GCCGC	2	10	120490	120499	0 %	0 %	40 %	60 %	336176210
139	NC_015656	AGCGG	2	10	123866	123875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_015656	AGAGC	2	10	124582	124591	40 %	0 %	40 %	20 %	336176215
141	NC_015656	GCCGA	2	10	124919	124928	20 %	0 %	40 %	40 %	336176215
142	NC_015656	CGGGA	2	10	127483	127492	20 %	0 %	60 %	20 %	336176216
143	NC_015656	TGCCG	2	10	129735	129744	0 %	20 %	40 %	40 %	336176216
144	NC_015656	CTGGG	2	10	130582	130591	0 %	20 %	60 %	20 %	336176216
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251	NC_015656	CCGGC	2	10	231846	231855	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
252	NC_015656	ACCGA	2	10	232190	232199	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
253	NC_015656	TGTGC	2	10	232618	232627	0 %	40 %	40 %	20 %	336176301
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255	NC_015656	GTCGC	2	10	235018	235027	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
256	NC_015656	CAGCC	2	10	237721	237730	20 %	0 %	20 %	60 %	336176305
257	NC_015656	TGCCG	2	10	238101	238110	0 %	20 %	40 %	40 %	336176305
258	NC_015656	CCGGC	2	10	239453	239462	0 %	0 %	40 %	60 %	336176306
259	NC_015656	ACAAA	2	10	240861	240870	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_015656	GCCGG	2	10	242549	242558	0 %	0 %	60 %	40 %	336176308
261	NC_015656	AGGCC	2	10	242706	242715	20 %	0 %	40 %	40 %	336176308
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269	NC_015656	CGACA	2	10	248324	248333	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
270	NC_015656	CCACG	2	10	248407	248416	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
271	NC_015656	CTGCC	2	10	248624	248633	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
272	NC_015656	GCAGA	2	10	249068	249077	40 %	0 %	40 %	20 %	336176314
273	NC_015656	CGGAA	2	10	249490	249499	40 %	0 %	40 %	20 %	336176314
274	NC_015656	CGGCC	2	10	250644	250653	0 %	0 %	40 %	60 %	336176315
275	NC_015656	GGGCC	2	10	251249	251258	0 %	0 %	60 %	40 %	336176316
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277	NC_015656	CGGCC	2	10	257153	257162	0 %	0 %	40 %	60 %	336176321
278	NC_015656	GCCAT	2	10	258195	258204	20 %	20 %	20 %	40 %	336176323
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281	NC_015656	GGACG	2	10	259995	260004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_015656	CGGAC	2	10	269729	269738	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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300	NC_015656	AGCCG	2	10	282926	282935	20 %	0 %	40 %	40 %	336176343
301	NC_015656	GTCCG	2	10	285267	285276	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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308	NC_015656	GGTGG	2	10	292830	292839	0 %	20 %	80 %	0 %	336176352
309	NC_015656	TCCGG	2	10	294352	294361	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
310	NC_015656	GCGGG	2	10	295748	295757	0 %	0 %	80 %	20 %	336176355
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403	NC_015656	CGGTC	2	10	390743	390752	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
404	NC_015656	GGACA	2	10	392678	392687	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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