MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Fluviicola taffensis DSM 16823 chromosome

Total Repeats: 97750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015321	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015321	AAC	2	6	154	159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402012
3	NC_015321	T	7	7	187	193	0 %	100 %	0 %	0 %	327402012
4	NC_015321	CATTA	2	10	211	220	40 %	40 %	0 %	20 %	327402012
5	NC_015321	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	327402012
6	NC_015321	A	6	6	241	246	100 %	0 %	0 %	0 %	327402012
7	NC_015321	CAA	2	6	339	344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402012
8	NC_015321	AAAG	2	8	429	436	75 %	0 %	25 %	0 %	327402012
9	NC_015321	CTG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402012
10	NC_015321	GGA	2	6	544	549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327402012
11	NC_015321	GTT	2	6	564	569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402012
12	NC_015321	CGG	2	6	576	581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327402012
13	NC_015321	CAAA	2	8	644	651	75 %	0 %	0 %	25 %	327402012
14	NC_015321	TCAT	2	8	728	735	25 %	50 %	0 %	25 %	327402012
15	NC_015321	TGAT	2	8	746	753	25 %	50 %	25 %	0 %	327402012
16	NC_015321	TGA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402012
17	NC_015321	TTC	2	6	778	783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402012
18	NC_015321	GAAAA	2	10	788	797	80 %	0 %	20 %	0 %	327402012
19	NC_015321	A	6	6	794	799	100 %	0 %	0 %	0 %	327402012
20	NC_015321	TTC	2	6	811	816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402012
21	NC_015321	ATT	2	6	853	858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402012
22	NC_015321	TGT	2	6	908	913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402012
23	NC_015321	CTG	2	6	935	940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402012
24	NC_015321	GAAAA	2	10	982	991	80 %	0 %	20 %	0 %	327402012
25	NC_015321	GTT	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402012
26	NC_015321	CTT	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402012
27	NC_015321	TAAA	2	8	1109	1116	75 %	25 %	0 %	0 %	327402012
28	NC_015321	A	6	6	1114	1119	100 %	0 %	0 %	0 %	327402012
29	NC_015321	TGAT	2	8	1148	1155	25 %	50 %	25 %	0 %	327402012
30	NC_015321	ATT	2	6	1217	1222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402012
31	NC_015321	GTT	2	6	1270	1275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402012
32	NC_015321	ATC	2	6	1320	1325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402012
33	NC_015321	GGA	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327402012
34	NC_015321	TTC	2	6	1373	1378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402012
35	NC_015321	AGAC	2	8	1409	1416	50 %	0 %	25 %	25 %	327402012
36	NC_015321	AAT	2	6	1466	1471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402012
37	NC_015321	A	6	6	1587	1592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015321	ATC	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015321	CTT	2	6	1614	1619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015321	AC	3	6	1633	1638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015321	ATT	2	6	1761	1766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015321	TA	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015321	ATA	2	6	2090	2095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015321	T	7	7	2104	2110	0 %	100 %	0 %	0 %	327402013
45	NC_015321	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	327402013
46	NC_015321	AAT	2	6	2159	2164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402013
47	NC_015321	AAT	2	6	2169	2174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402013
48	NC_015321	T	6	6	2205	2210	0 %	100 %	0 %	0 %	327402013
49	NC_015321	TTC	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402013
50	NC_015321	CTT	2	6	2251	2256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402014
51	NC_015321	TGT	3	9	2435	2443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402014
52	NC_015321	T	6	6	2559	2564	0 %	100 %	0 %	0 %	327402014
53	NC_015321	GTC	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402014
54	NC_015321	A	6	6	2585	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	327402014
55	NC_015321	ATG	2	6	2669	2674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402014
56	NC_015321	TTA	2	6	2677	2682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402014
57	NC_015321	TC	3	6	2766	2771	0 %	50 %	0 %	50 %	327402014
58	NC_015321	ACA	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402014
59	NC_015321	ATT	2	6	2799	2804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402014
60	NC_015321	AAC	2	6	2807	2812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402014
61	NC_015321	T	6	6	2817	2822	0 %	100 %	0 %	0 %	327402014
62	NC_015321	GAAAT	2	10	2834	2843	60 %	20 %	20 %	0 %	327402014
63	NC_015321	ACA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402014
64	NC_015321	ATT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402014
65	NC_015321	CAT	2	6	3007	3012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402014
66	NC_015321	ATT	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402014
67	NC_015321	GTCC	2	8	3193	3200	0 %	25 %	25 %	50 %	327402014
68	NC_015321	CAA	2	6	3208	3213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402014
69	NC_015321	ATA	2	6	3233	3238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402014
70	NC_015321	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	327402014
71	NC_015321	CAA	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402014
72	NC_015321	T	6	6	3457	3462	0 %	100 %	0 %	0 %	327402014
73	NC_015321	TCA	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402014
74	NC_015321	CAT	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402014
75	NC_015321	TGA	2	6	3502	3507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402014
76	NC_015321	ATT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402014
77	NC_015321	GTT	2	6	3578	3583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402014
78	NC_015321	TCG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402014
79	NC_015321	C	6	6	3748	3753	0 %	0 %	0 %	100 %	327402014
80	NC_015321	AAT	2	6	3804	3809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402014
81	NC_015321	TCA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402014
82	NC_015321	GTATA	2	10	3876	3885	40 %	40 %	20 %	0 %	327402014
83	NC_015321	TATAA	2	10	3918	3927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015321	TAA	2	6	3984	3989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402015
85	NC_015321	GTTT	2	8	4006	4013	0 %	75 %	25 %	0 %	327402015
86	NC_015321	AC	3	6	4023	4028	50 %	0 %	0 %	50 %	327402015
87	NC_015321	T	6	6	4058	4063	0 %	100 %	0 %	0 %	327402015
88	NC_015321	TCT	2	6	4073	4078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402015
89	NC_015321	T	6	6	4164	4169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015321	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015321	CTA	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015321	TTG	2	6	4223	4228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015321	GATTTA	2	12	4235	4246	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015321	ATA	2	6	4258	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015321	TAAT	2	8	4281	4288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015321	CT	3	6	4289	4294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015321	TTC	2	6	4333	4338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015321	AGA	3	9	4455	4463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402016
99	NC_015321	TGTT	2	8	4515	4522	0 %	75 %	25 %	0 %	327402016
100	NC_015321	A	7	7	4546	4552	100 %	0 %	0 %	0 %	327402016
101	NC_015321	TGA	2	6	4566	4571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402016
102	NC_015321	CTG	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402016
103	NC_015321	AACA	2	8	4632	4639	75 %	0 %	0 %	25 %	327402016
104	NC_015321	TTA	2	6	4659	4664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402016
105	NC_015321	TGG	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327402016
106	NC_015321	TGG	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327402016
107	NC_015321	AAG	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402016
108	NC_015321	CAA	2	6	4739	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402016
109	NC_015321	AAG	2	6	4754	4759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402016
110	NC_015321	TTA	2	6	4769	4774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402016
111	NC_015321	CTT	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402016
112	NC_015321	CTT	3	9	4933	4941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402016
113	NC_015321	GAA	2	6	4945	4950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402016
114	NC_015321	TCA	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402017
115	NC_015321	CGA	2	6	5032	5037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327402017
116	NC_015321	A	6	6	5074	5079	100 %	0 %	0 %	0 %	327402017
117	NC_015321	CA	3	6	5103	5108	50 %	0 %	0 %	50 %	327402017
118	NC_015321	CA	3	6	5178	5183	50 %	0 %	0 %	50 %	327402017
119	NC_015321	TGG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327402017
120	NC_015321	A	6	6	5242	5247	100 %	0 %	0 %	0 %	327402017
121	NC_015321	TCG	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402017
122	NC_015321	TGA	2	6	5304	5309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402017
123	NC_015321	CAAC	2	8	5326	5333	50 %	0 %	0 %	50 %	327402017
124	NC_015321	TGAT	2	8	5361	5368	25 %	50 %	25 %	0 %	327402017
125	NC_015321	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	327402017
126	NC_015321	GAA	2	6	5516	5521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402017
127	NC_015321	AAT	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402017
128	NC_015321	AC	3	6	5612	5617	50 %	0 %	0 %	50 %	327402017
129	NC_015321	AGG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327402017
130	NC_015321	TGC	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402017
131	NC_015321	TTCT	2	8	5694	5701	0 %	75 %	0 %	25 %	327402017
132	NC_015321	CTG	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402017
133	NC_015321	GATT	2	8	5791	5798	25 %	50 %	25 %	0 %	327402017
134	NC_015321	AGA	2	6	5818	5823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402017
135	NC_015321	A	6	6	5855	5860	100 %	0 %	0 %	0 %	327402017
136	NC_015321	TGAT	2	8	5874	5881	25 %	50 %	25 %	0 %	327402017
137	NC_015321	ATT	2	6	5934	5939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402018
138	NC_015321	TTC	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402018
139	NC_015321	AAGAAT	2	12	6121	6132	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	327402018
140	NC_015321	CTT	2	6	6142	6147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402018
141	NC_015321	ACT	2	6	6183	6188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402018
142	NC_015321	A	6	6	6250	6255	100 %	0 %	0 %	0 %	327402018
143	NC_015321	AAATA	2	10	6272	6281	80 %	20 %	0 %	0 %	327402018
144	NC_015321	TCA	2	6	6286	6291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402018
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146	NC_015321	T	6	6	6315	6320	0 %	100 %	0 %	0 %	327402019
147	NC_015321	TGC	2	6	6329	6334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327402019
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149	NC_015321	A	6	6	6401	6406	100 %	0 %	0 %	0 %	327402019
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160	NC_015321	TCAAA	2	10	6970	6979	60 %	20 %	0 %	20 %	327402019
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162	NC_015321	TTC	2	6	7055	7060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402019
163	NC_015321	TTC	2	6	7095	7100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402019
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166	NC_015321	CATC	2	8	7206	7213	25 %	25 %	0 %	50 %	327402019
167	NC_015321	T	7	7	7289	7295	0 %	100 %	0 %	0 %	327402019
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170	NC_015321	TTTC	2	8	7410	7417	0 %	75 %	0 %	25 %	327402019
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181	NC_015321	TGT	2	6	8093	8098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402020
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240	NC_015321	ATT	2	6	10627	10632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402022
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263	NC_015321	TTC	2	6	11736	11741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402022
264	NC_015321	TTAT	2	8	11775	11782	25 %	75 %	0 %	0 %	327402022
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266	NC_015321	ATA	2	6	11801	11806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402022
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268	NC_015321	GAATC	2	10	11830	11839	40 %	20 %	20 %	20 %	327402022
269	NC_015321	ATT	2	6	11945	11950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402022
270	NC_015321	ATA	2	6	12029	12034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402022
271	NC_015321	TAA	2	6	12220	12225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327402022
272	NC_015321	GCA	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327402022
273	NC_015321	GAAA	2	8	12249	12256	75 %	0 %	25 %	0 %	327402022
274	NC_015321	ACT	2	6	12285	12290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402022
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277	NC_015321	GTT	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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405	NC_015321	TCAA	2	8	18355	18362	50 %	25 %	0 %	25 %	327402027
406	NC_015321	GAT	2	6	18384	18389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402027
407	NC_015321	CAA	2	6	18423	18428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402027
408	NC_015321	A	6	6	18604	18609	100 %	0 %	0 %	0 %	327402028
409	NC_015321	ACA	2	6	18639	18644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327402028
410	NC_015321	TTC	2	6	18736	18741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402028
411	NC_015321	A	6	6	18746	18751	100 %	0 %	0 %	0 %	327402028
412	NC_015321	GGA	2	6	18796	18801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327402028
413	NC_015321	CAT	2	6	18810	18815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402028
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418	NC_015321	GCAT	2	8	19244	19251	25 %	25 %	25 %	25 %	327402028
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434	NC_015321	GAT	2	6	20153	20158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327402029
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437	NC_015321	CAT	2	6	20317	20322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327402029
438	NC_015321	ATT	2	6	20353	20358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402029
439	NC_015321	ATT	2	6	20486	20491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402029
440	NC_015321	GTT	2	6	20528	20533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402029
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442	NC_015321	A	6	6	20570	20575	100 %	0 %	0 %	0 %	327402029
443	NC_015321	AAT	2	6	20591	20596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015321	AGA	2	6	20753	20758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327402030
445	NC_015321	CT	3	6	20772	20777	0 %	50 %	0 %	50 %	327402030
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447	NC_015321	CAGAG	2	10	20873	20882	40 %	0 %	40 %	20 %	327402030
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449	NC_015321	A	6	6	20970	20975	100 %	0 %	0 %	0 %	327402030
450	NC_015321	TTG	2	6	21004	21009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327402030
451	NC_015321	AGATT	2	10	21042	21051	40 %	40 %	20 %	0 %	327402030
452	NC_015321	T	7	7	21129	21135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015321	ATT	2	6	21153	21158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015321	ACA	2	6	21171	21176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_015321	ATA	2	6	21177	21182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015321	CTT	2	6	21209	21214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327402031
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472	NC_015321	T	6	6	21868	21873	0 %	100 %	0 %	0 %	327402031
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475	NC_015321	AT	3	6	22027	22032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_015321	A	6	6	22033	22038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_015321	CTG	2	6	22044	22049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_015321	A	7	7	22069	22075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_015321	A	8	8	22148	22155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_015321	A	6	6	22206	22211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015321	AAT	2	6	22215	22220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015321	ATA	2	6	22258	22263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_015321	GTT	2	6	22289	22294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_015321	TAAA	2	8	22779	22786	75 %	25 %	0 %	0 %	327402032
494	NC_015321	TATT	2	8	22809	22816	25 %	75 %	0 %	0 %	327402033
495	NC_015321	TTA	2	6	22860	22865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327402033
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